深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1141	2025-07-23	LONGL-Net: temporal correlation structure guided deep learning model to predict longitudinal age-related macular degeneration severity 2022-Mar, PNAS nexus IF:2.2Q1 DOI:10.1093/pnasnexus/pgab003 PMID:35360552	研究论文	提出了一种名为LONGL-Net的深度学习模型，用于同时评估当前年龄相关性黄斑变性（AMD）的严重程度并预测其纵向进展	设计了基于时间相关性结构的生成对抗网络模型，能够学习连续时间点CFP图像中的时间变化相互关系，并为分类器的决策提供可解释性	模型仅在特定数据集上进行了验证，可能需要更多样化的数据来证明其泛化能力	开发自动化方法以预测AMD的纵向进展，帮助识别易患晚期AMD的个体	年龄相关性黄斑变性（AMD）患者	数字病理学	年龄相关性黄斑变性	深度学习	GAN	图像	来自4,628名参与者的约30,000张CFP图像
1142	2025-07-22	Accelerating 3D radial MPnRAGE using a self-supervised deep factor model 2025-Sep, Magnetic resonance in medicine IF:3.0Q2 DOI:10.1002/mrm.30549 PMID:40457622	研究论文	开发了一种自监督且内存高效的深度学习图像重建方法，用于高分辨率和多参数维度的4D非笛卡尔MRI	提出了深度因子模型（DFM），通过神经网络表示多对比图像序列，并采用自监督单次学习（SSL）方式从k空间数据中学习模型参数，同时开发了兼容的迁移学习（TL）方法以减少重建时间	在训练神经网络时，若无专用高端GPU阵列，计算需求可能较高	开发高效的多对比MRI图像重建方法	4D非笛卡尔MRI图像	医学影像处理	NA	MRI	DFM（深度因子模型）	图像	幻影和体内实验
1143	2025-07-22	Ensemble learning approach for detecting breast invasive ductal carcinoma from histopathological images 2025-Aug, Pathology, research and practice DOI:10.1016/j.prp.2025.156041 PMID:40460639	研究论文	本文提出了一种集成学习方法，用于从组织病理学图像中检测乳腺浸润性导管癌	结合多种深度学习模型的优势，提出加权平均集成算法，显著提高诊断准确性和鲁棒性	未提及模型在临床环境中的实际应用验证及对不同分辨率图像的普适性	提高乳腺浸润性导管癌的诊断准确率	乳腺组织病理学切片图像	数字病理学	乳腺癌	深度学习集成方法	ResNet50, Xception, MobileNetV2, VGG16, VGG19的集成模型	图像	未明确提及具体样本数量
1144	2025-07-22	READRetro web: A user-friendly platform for predicting plant natural product biosynthesis 2025-Aug, Molecules and cells IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.mocell.2025.100235 PMID:40466944	research paper	介绍了一个用户友好的网络平台READRetro web，用于预测植物天然产物的生物合成路径	开发了一个基于现代网络技术的用户友好平台，使不具备深厚计算背景的研究人员也能轻松使用高级机器学习驱动的逆合成预测	未提及具体的技术局限性或平台适用范围	促进天然产物的大规模生产，通过预测其生物合成路径	植物天然产物及其生物合成路径	machine learning	NA	deep learning-based retrosynthesis models	READRetro ML model	chemical compounds data	NA
1145	2025-07-22	Machine learning-based histopathological features of histological slides and clinical characteristics as a novel prognostic indicator in diffuse large B-cell lymphoma 2025-Aug, Pathology, research and practice DOI:10.1016/j.prp.2025.156071 PMID:40499499	研究论文	本研究开发并验证了一种基于临床和组织病理学特征的深度学习模型，用于预测弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）的预后	结合临床特征和组织病理学特征，开发了一种新型的非侵入性预后预测方法	样本量相对较小（194例患者），且仅基于单一机构的回顾性数据	预测弥漫性大B细胞淋巴瘤（DLBCL）患者的预后	194例DLBCL患者的全切片图像和临床特征	数字病理学	弥漫性大B细胞淋巴瘤	深度学习，Cox回归分析，AUC分析，校准曲线，决策曲线分析（DCA）	深度学习模型	图像（全切片图像），临床数据	194例患者
1146	2025-07-22	A Deep Learning Approach to Assessing Cell Identity in Stem Cell-Based Embryo Models 2025-Jul-22, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) DOI:10.1007/7651_2025_654 PMID:40690128	research paper	该研究利用深度学习技术评估干细胞胚胎模型中细胞身份	开发了一个整合早期人类发育的深度学习模型，能够对体外细胞类型进行身份鉴定并提供分类可靠性评分	未提及具体样本量或模型验证的详细限制	评估干细胞胚胎模型中细胞身份与真实胚胎细胞的相似性	胚胎干细胞(ESCs)和体外培养的细胞类型	machine learning	NA	scRNA-seq, scvi-tools	DL	RNA-seq数据	NA
1147	2025-07-22	CoxKAN: Kolmogorov-Arnold networks for interpretable, High-Performance survival analysis 2025-Jul-21, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btaf413 PMID:40685627	研究论文	介绍了一种名为CoxKAN的可解释高性能生存分析模型，结合了Cox比例风险模型和Kolmogorov-Arnold网络的优势	提出了一种结合可解释性和高性能的生存分析方法，能够揭示预测变量之间的复杂相互作用并提供符号公式	未提及具体局限性	开发一种既保持高性能又具有可解释性的生存分析模型	生存分析模型在医学中的应用	机器学习	NA	Kolmogorov-Arnold Networks (KANs)	CoxKAN	临床数据和基因组生物标志物数据	四个合成数据集和九个真实数据集（包括五个临床数据队列和四个基因组生物标志物队列）
1148	2025-07-22	Colorimetric detection of bisphenol A in water: a smartphone-based sensor using inverse opal molecularly imprinted photonic crystal hydrogel 2025-Jul-21, The Analyst DOI:10.1039/d4an01426j PMID:40685994	研究论文	本研究开发了一种基于智能手机的逆蛋白石分子印迹光子晶体水凝胶传感器，用于水中双酚A的高灵敏度和高选择性检测	结合智能手机和深度学习回归模型，实现了实时、便携的双酚A定量检测	NA	开发一种高灵敏度、高选择性的双酚A检测方法	水样中的双酚A	传感器技术	NA	分子印迹技术、光子晶体技术	深度学习回归模型	图像	NA
1149	2025-07-22	Noninvasive Deep Learning System for Preoperative Diagnosis of Follicular-Like Thyroid Neoplasms Using Ultrasound Images: A Multicenter, Retrospective Study 2025-Jul-21, Annals of surgery IF:7.5Q1 DOI:10.1097/SLA.0000000000006841 PMID:40689491	research paper	提出一种基于深度学习的非侵入性系统，用于利用常规超声图像对滤泡状甲状腺肿瘤进行术前诊断	开发了一种深度学习系统，能够比ACR TI-RADS更准确地诊断滤泡状甲状腺肿瘤，并减少不必要的侵入性干预	研究为回顾性研究，可能受到数据收集时的偏差影响	提高滤泡状甲状腺肿瘤的术前诊断准确性	滤泡状甲状腺肿瘤患者	digital pathology	thyroid cancer	ultrasound imaging	Inception-v3, ResNet50, Inception-ResNet-v2, DenseNet161	image	3634名患者，来自11个中心，包括1748例甲状腺滤泡腺瘤、299例滤泡癌和1587例乳头状甲状腺癌滤泡变异型
1150	2025-07-22	SOLeNNoID: A Deep Learning Pipeline For Solenoid Residue Detection in Protein Structures 2025-Jul-21, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btaf415 PMID:40689530	研究论文	介绍了一种基于深度学习的管道SOLeNNoID，用于预测蛋白质结构中的螺线管残基	利用CNN架构分析蛋白质距离矩阵，准确识别螺线管区域，覆盖所有三种螺线管亚类，并在性能上优于现有方法	未明确提及具体限制	开发一种结构基础的螺线管残基检测方法，以解决序列基础方法的局限性	蛋白质结构中的螺线管残基	生物信息学	NA	深度学习	CNN	蛋白质距离矩阵	整个Protein Data Bank (PDB)数据库
1151	2025-07-22	Fully automated pedicle screw manufacturer identification in plain radiograph with deep learning methods 2025-Jul-21, European spine journal : official publication of the European Spine Society, the European Spinal Deformity Society, and the European Section of the Cervical Spine Research Society IF:2.6Q1 DOI:10.1007/s00586-025-09167-3 PMID:40689982	研究论文	开发了一种基于深度学习的算法，用于从普通X光片中识别椎弓根螺钉的制造商	首次提出使用深度学习方法自动识别椎弓根螺钉制造商，且准确率与经验丰富的脊柱外科医生相当	研究仅涉及三家国际制造商的椎弓根螺钉，可能无法涵盖所有制造商	开发一种自动识别椎弓根螺钉制造商的算法，以辅助翻修手术规划	276名接受胸腰椎手术并使用椎弓根螺钉的患者	计算机视觉	脊柱疾病	深度学习	CNN, YOLO	X光片	276名患者的1,887个椎弓根螺钉
1152	2025-07-22	GraphCellNet: A deep learning method for integrated single-cell and spatial transcriptomic analysis with applications in development and disease 2025-Jul-21, Journal of molecular medicine (Berlin, Germany) DOI:10.1007/s00109-025-02575-4 PMID:40690004	研究论文	提出了一种名为GraphCellNet的深度学习方法，用于整合单细胞和空间转录组分析，应用于发育和疾病研究	结合细胞类型解卷积和空间域识别的模型，采用Kolmogorov-Arnold Network层（KAN）增强非线性特征表示和上下文整合	NA	提高空间转录组分析的精确度，理解组织结构和功能	心肌梗死、果蝇发育和人类心脏发育	数字病理学	心血管疾病	空间转录组学（ST）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）	GraphCellNet、KAN	基因表达数据、空间位置数据	NA
1153	2025-07-22	Automatic measuring of coronary atherosclerosis from medicolegal autopsy photographs based on deep learning techniques 2025-Jul-21, Forensic science, medicine, and pathology DOI:10.1007/s12024-025-01045-0 PMID:40690102	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的算法，用于快速准确地评估冠状动脉粥样硬化，并识别影响模型预测粥样硬化严重程度的因素	首次利用深度学习技术自动测量法医尸检照片中的冠状动脉粥样硬化，提高了诊断的准确性和效率	模型在中等程度粥样硬化等级上的表现最低，且分解、支架植入和血栓对评估无显著影响	开发一种快速准确的冠状动脉粥样硬化评估工具，以辅助法医病理学诊断	法医尸检照片中的冠状动脉粥样硬化	数字病理学	心血管疾病	深度学习	深度学习算法	图像	3,717张数字照片，来自1,920例法医尸检
1154	2025-07-22	[A multi-feature fusion-based model for fetal orientation classification from intrapartum ultrasound videos] 2025-Jul-20, Nan fang yi ke da xue xue bao = Journal of Southern Medical University DOI:10.12122/j.issn.1673-4254.2025.07.24 PMID:40673320	研究论文	本研究构建了一种基于多特征融合的智能分析模型，用于分类产时超声视频中的胎儿方位	结合Yolov8、CBAM、ECA、PSA注意力机制和AIFI特征交互模块进行特征提取，提高了分类准确性	NA	开发一种高效准确的胎儿方位分类模型	产时超声视频中的胎儿方位	计算机视觉	NA	深度学习	Yolov8结合CBAM、ECA、PSA注意力机制和AIFI特征交互模块	超声视频	NA
1155	2025-07-22	Deep learning-based eye sign communication system for people with speech impairments 2025-Jul-20, Disability and rehabilitation. Assistive technology DOI:10.1080/17483107.2025.2532698 PMID:40684450	研究论文	提出一种基于深度学习的眼动符号通信系统，帮助言语障碍人士通过标准网络摄像头进行交流	系统无需校准，能在不同光照条件下有效工作，并集成了文本预测功能	研究仅针对18至35岁年龄段的参与者，未涵盖更广泛年龄范围或其他潜在用户群体	开发一种无需校准、适应性强且高效的辅助通信系统，以改善言语障碍人士的交流能力	言语障碍或瘫痪人士	计算机视觉	言语障碍	深度学习	NA	图像	18至35岁的参与者
1156	2025-07-22	Dual-Dielectric-Layer-Based Iontronic Pressure Sensor Coupling Ultrahigh Sensitivity and Wide-Range Detection for Temperature/Pressure Dual-Mode Sensing 2025-Jul-20, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202503926 PMID:40685692	研究论文	本文提出了一种新型的双介电层离子电子压力传感器（DLIPS），结合高和低介电常数层，实现了超高灵敏度和宽范围检测的温度/压力双模式传感	提出了一种新型的双介电层离子电子压力传感器结构，结合高和低介电常数层，实现了超高灵敏度（72548.7 kPa）、宽工作压力范围（0.001-420 kPa）、极低检测限（0.832 Pa）和超过5000次循环的卓越耐久性	NA	开发一种具有超高灵敏度和宽范围检测能力的温度/压力双模式传感器	双介电层离子电子压力传感器（DLIPS）	传感器技术	NA	离子凝胶和开孔聚氨酯泡沫作为介电层	深度学习回归模型	压力和温度信号	NA
1157	2025-07-22	Effect of arc length on the deep learning prediction of monitor units in lung stereotactic ablative radiation therapy treatment 2025-Jul-19, Physica medica : PM : an international journal devoted to the applications of physics to medicine and biology : official journal of the Italian Association of Biomedical Physics (AIFB) DOI:10.1016/j.ejmp.2025.105018 PMID:40684542	research paper	研究弧长对深度学习预测肺部立体定向消融放射治疗中监测单位的影响	首次研究了弧长对深度学习预测监测单位的影响，并比较了不同弧长训练集对预测准确性的影响	研究仅基于单一机构的患者数据，样本量相对有限	提高多病灶肺部立体定向消融放射治疗中监测单位的预测准确性	肺部立体定向消融放射治疗中的监测单位预测	digital pathology	lung cancer	deep learning	DL	clinical treatment data	60,720 samples from 295 treatments of 257 patients
1158	2025-07-22	Machine learning-assisted tacrolimus dose optimization in childhood- onset systemic lupus erythematosus through population pharmacokinetic modeling 2025-Jul-19, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110782 PMID:40684660	research paper	本研究通过机器学习算法结合群体药代动力学模型，优化儿童系统性红斑狼疮患者的他克莫司剂量	首次将机器学习算法与药代动力学参数结合，用于预测儿童系统性红斑狼疮患者的个体化他克莫司剂量	样本量较小（86名患者），且仅基于回顾性数据	优化儿童系统性红斑狼疮患者的他克莫司治疗剂量	儿童系统性红斑狼疮患者	machine learning	systemic lupus erythematosus	population pharmacokinetic modeling	XGBoost	clinical variables and pharmacokinetic parameters	86名儿童系统性红斑狼疮患者的480个他克莫司谷浓度数据
1159	2025-07-22	Automatic Point Cloud Patching of Intraoral Three-Dimensional Scanning Based on Deep Learning 2025-Jul-19, International dental journal IF:3.2Q1 DOI:10.1016/j.identj.2025.100911 PMID:40684681	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的自动修复口腔内三维扫描点云缺失区域的方法，以提高数字正畸工作流程的准确性和效率	采用Point Fractal Network架构自动修复口腔内三维扫描点云的缺失区域，实现了高几何保真度和近实时处理	缺失数据是通过随机移除点云部分模拟的，可能与实际临床环境中的缺失模式存在差异	开发并评估一种深度学习方法，用于自动修复口腔内三维扫描点云的缺失区域	口腔内扫描（IOS）数据	计算机视觉	NA	深度学习	Point Fractal Network	三维点云	314个IOS扫描和4162颗单独牙齿
1160	2025-07-22	Predicting arterial pressure without prejudice: towards effective hypotension prediction models 2025-Jul-19, British journal of anaesthesia IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.bja.2025.06.016 PMID:40685291	research paper	本文探讨了选择偏差对低血压预测模型的影响，并通过深度学习模型在偏差和无偏差数据选择下的表现进行了分析	揭示了无偏差训练数据如何帮助算法学习更多信息，而偏差数据则显著扭曲并夸大了阳性预测值	未具体说明模型在其他临床环境中的泛化能力	开发有效的低血压预测算法	动脉波形数据	machine learning	cardiovascular disease	deep learning	深度学习预测模型	波形数据	NA