深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1141	2025-06-08	A Dataset of Raman and Infrared Spectra as an Extension to the ChEMBL 2025-Jun-04, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-025-05289-x PMID:40467651	research paper	本文构建了一个包含拉曼光谱和红外光谱的数据集，作为ChEMBL的扩展，用于支持材料科学中的深度学习研究	应用Gaussian09构建了一个包含22万分子的拉曼和红外光谱数据集，扩展了现有量子化学数据集的广度和深度	数据集仍在不断增加和定期更新中，当前可能尚未覆盖所有分子类型	解决当前光谱数据集中数据不足的问题，支持下一代模型的训练和基准测试	从ChEMBL提取的分子及其光谱数据	material science	NA	Raman spectroscopy, Infrared spectroscopy, Gaussian09	NA	spectral data	220,000 molecules
1142	2025-06-08	A blockchain based deep learning framework for a smart learning environment 2025-Jun-04, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-03688-z PMID:40467714	研究论文	提出一个基于区块链和深度学习的智能框架，以增强智能学习过程并解决该领域的挑战	结合区块链和深度学习技术，确保学习者数据的安全性和完整性，同时预测学习者表现	未提及具体实施中的技术难点或潜在问题	提升智能学习过程的安全性和效率	教育机构和学习者	机器学习	NA	区块链、深度学习	深度神经网络	学习者数据	未明确提及具体样本数量
1143	2025-06-08	A neuromorphic electronic artist for robotic painting 2025-Jun-04, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-92081-x PMID:40467759	研究论文	介绍了一种基于神经形态电子技术的机器人绘画系统，能够生成动态笔触	首次将神经形态相机和混合信号神经形态处理器结合用于机器人绘画，实现了超低延迟的实时闭环自适应控制	仅展示了基础笔触生成能力，尚未实现复杂绘画作品	开发具有生物逼真动态响应能力的机器人绘画系统	6自由度机械臂、动态视觉传感器(DVS)相机、神经形态处理器	机器人技术	NA	动态视觉传感(DVS)、神经形态计算	脉冲神经网络(SNN)	事件流数据	NA
1144	2025-06-08	Optimization of deep learning architecture based on multi-path convolutional neural network algorithm 2025-Jun-04, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-03765-3 PMID:40467835	research paper	本研究针对多流卷积神经网络在路径协作、特征融合和资源利用方面的局限性，提出了一种基于动态路径协作机制和轻量级设计的优化模型	创新性地引入了路径注意力机制和特征共享模块，采用自注意力融合方法提升特征融合效率，并结合路径选择和模型剪枝技术实现模型性能与计算资源需求的平衡	未提及具体模型在更广泛数据集上的泛化能力测试	提升多流卷积神经网络的特征提取能力、计算效率和模型鲁棒性	多流卷积神经网络架构	computer vision	NA	deep learning	multi-path CNN	image	三个数据集（CIFAR-10、ImageNet和Custom Dataset）
1145	2025-06-08	A hybrid GAN-based deep learning framework for thermogram-based breast cancer detection 2025-Jun-04, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-04676-z PMID:40467954	research paper	提出了一种基于GAN和混合深度学习模型的乳腺癌检测框架，用于提高热成像图像的诊断准确性	结合GAN和混合深度学习模型，通过生成合成ROI增强数据集，提升分类性能	未提及具体临床验证的样本多样性及实际应用中的潜在限制	提高乳腺癌早期检测的准确性和效率	热成像图像中的乳腺癌检测	digital pathology	breast cancer	GAN, Hybrid Deep Learning	GAN, HDL	image	DMR-IR benchmark dataset（具体样本数量未提及）
1146	2025-06-08	Advancing blood cell detection and classification: performance evaluation of modern deep learning models 2025-Jun-04, BMC medical informatics and decision making IF:3.3Q2 DOI:10.1186/s12911-025-03027-2 PMID:40468312	研究论文	本文评估了现代深度学习模型在血细胞检测和分类中的性能	采用YOLO检测和混合CNN分类的两步方法，并在实时性能、计算效率和特征提取方面与其他先进模型进行了全面比较	未明确提及具体局限性	自动化血细胞计数过程，减少人工操作	血细胞	计算机视觉	贫血、白血病、感染	深度学习	YOLO、CNN、MobileNetV2、ShuffleNetV2、DarkNet	图像	包含多样化的血细胞图像数据集，具体数量未明确说明
1147	2025-06-08	The Application of Anisotropically Collapsing Gels, Deep Learning, and Optical Microscopy for Chemical Characterization of Nanoparticles and Nanoplastics 2025-Jun-03, Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids IF:3.7Q2 DOI:10.1021/acs.langmuir.5c00769 PMID:40387864	研究论文	本文提出了一种结合各向异性坍塌凝胶、深度学习和光学显微镜的精确方法，用于量化纳米颗粒和纳米塑料表面的羧基密度	结合各向异性坍塌琼脂糖凝胶固定纳米颗粒、荧光显微镜和酸碱滴定法，实现了对纳米颗粒表面羧基密度的精确量化	纳米颗粒浓度和滴定条件对检测性能有重要影响，荧光标记的聚苯乙烯纳米颗粒需要尼罗红染色以提高信噪比	开发一种精确表征纳米材料表面化学性质的方法，以研究其在技术和环境中的功能与命运	光子上转换纳米颗粒（UCNPs）和荧光标记的聚苯乙烯纳米颗粒（PNs）	纳米技术	NA	荧光显微镜、酸碱滴定	NA	图像	两种纳米颗粒（UCNPs和PNs）
1148	2025-06-08	Deep Learning-Enhanced Hand-Driven Microfluidic Chip for Multiplexed Nucleic Acid Detection Based on RPA/CRISPR 2025-Jun, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202414918 PMID:40163382	research paper	提出了一种便携式多重核酸检测系统R-CHIP，整合了RPA、CRISPR检测、手动微流控和人工智能平台，用于高风险人乳头瘤病毒(HR-HPV)的早期检测	结合了RPA/CRISPR技术、手动微流控和深度学习模型ResNet-18，提高了检测系统的读取效率和便利性	未提及系统在更广泛样本或不同环境下的适用性测试	开发一种便携、高效的HR-HPV检测平台，以改善资源有限地区的宫颈癌筛查	高风险人乳头瘤病毒(HR-HPV)，特别是HPV-16和HPV-18	digital pathology	cervical cancer	RPA, CRISPR	ResNet-18	image	300例临床样本
1149	2025-06-08	Reinforcement learning using neural networks in estimating an optimal dynamic treatment regime in patients with sepsis 2025-Jun, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.108754 PMID:40222267	研究论文	本研究提出了一种结合强化学习和神经网络的算法（RL-NN），用于优化脓毒症患者的动态治疗方案，特别是液体复苏剂量	利用深度学习的灵活性减轻模型误设，通过交叉验证和随机搜索进行超参数调优，提高了模型的鲁棒性和泛化能力	NA	确定脓毒症患者的最佳多阶段液体复苏剂量	脓毒症患者	机器学习	脓毒症	强化学习	神经网络（RL-NN）	电子健康记录（EHR）	MIMIC-III数据库中的脓毒症患者队列
1150	2025-06-08	SSA-sMLP: A venous thromboembolism risk prediction model using separable self-attention and spatial-shift multilayer perceptrons 2025-Jun, Thrombosis research IF:3.7Q1 DOI:10.1016/j.thromres.2025.109334 PMID:40344789	研究论文	本研究提出了一种结合可分离自注意力和空间移位多层感知器的深度学习模型SSA-sMLP，用于静脉血栓栓塞症（VTE）的风险预测	提出了一种新的深度学习模型SSA-sMLP，结合可分离自注意力模块和改进的空间移位多层感知器（S-MLPv2），有效建模多维医学特征间的高阶非线性交互和局部动态相关性	模型仅在单一医院数据集上进行验证，未在其他独立数据集上进行测试	提高静脉血栓栓塞症（VTE）风险预测的准确性和鲁棒性	113,836份临床记录	机器学习	静脉血栓栓塞症	深度学习	SSA-sMLP（结合可分离自注意力和S-MLPv2）	临床记录数据	113,836份临床记录
1151	2025-06-08	Comparing efficiency of an attention-based deep learning network with contemporary radiological workflow for pulmonary embolism detection on CTPA: A retrospective study 2025-Jun, European journal of radiology open IF:1.8Q3 DOI:10.1016/j.ejro.2025.100657 PMID:40469717	研究论文	本研究比较了基于注意力的深度学习网络与当代放射学工作流程在CTPA上检测肺栓塞的效率	提出了一个基于AI的肺栓塞分诊模型（AID-PE），旨在提高诊断准确性、效率和速度	研究为回顾性研究，可能受到数据选择偏差的影响	提高肺栓塞的诊断效率和准确性	肺栓塞（PE）患者	数字病理	心血管疾病	CTPA	基于注意力的深度学习网络（AID-PE）	图像	训练集7279例，测试集106例，效率评估数据集200例
1152	2025-06-08	Mexican dataset of digital mammograms (MEXBreast) with suspicious clusters of microcalcifications 2025-Jun, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2025.111587 PMID:40470344	research paper	介绍了一个名为MEXBreast的墨西哥数字乳腺X光片数据集，包含可疑微钙化簇的标注数据	提供了一个具有一致分辨率的标注微钙化簇的墨西哥乳腺X光片数据集，支持深度学习CNN的训练	数据集可能受限于样本来源的多样性和数量	支持深度学习CNN在乳腺X光片微钙化簇检测中的训练、验证和测试	乳腺X光片中的微钙化簇	digital pathology	breast cancer	mammography	CNN	image	NA
1153	2025-06-08	Updating high-resolution image dataset for the automatic classification of phenological stage and identification of racemes in Urochloa spp. hybrids with expanded images and annotations 2025-Jun, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2025.111593 PMID:40470345	research paper	该研究扩展了一个高分辨率RGB图像数据集，用于自动分类牧草杂交种的物候阶段和识别花序	数据集新增了139张图像和24,983个注释，增加了图像捕捉条件的多样性，包括不同地理位置、设备和视角	NA	支持牧草育种试验中的高通量表型分析(HTP)和深度学习模型的开发	Urochloa spp. 杂交种	computer vision	NA	High-Throughput Phenotyping (HTP)	Deep Learning (DL)	image	2539张图像，包含47,323个花序注释，覆盖200种基因型
1154	2025-06-08	IBERBIRDS: A dataset of flying bird species present in the Iberian Peninsula 2025-Jun, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2025.111610 PMID:40470349	research paper	本文介绍了IBERBIRDS数据集，一个专为伊比利亚半岛飞行鸟类自动检测和分类设计的公开数据集	该数据集专注于中远距离飞行鸟类的照片，提供了更真实和具有挑战性的场景，不同于现有数据集通常包含特写或理想条件下的图像	数据集仅包含10种鸟类，样本量相对较小，且仅限于伊比利亚半岛的鸟类	促进鸟类物种自动识别技术的发展，支持生态监测和保护工作	伊比利亚半岛的10种中型至大型飞行鸟类	computer vision	NA	deep learning	YOLO	image	4000张图像，涵盖10种鸟类
1155	2025-06-08	Artificial intelligence driven mental health diagnosis based on physiological signals 2025-Jun, MethodsX IF:1.6Q2 DOI:10.1016/j.mex.2025.103358 PMID:40475896	research paper	该研究利用生理信号和机器学习方法，开发了一种自动检测人类压力状况的模型	提出了一种基于机器学习的压力评估模型，使用多种生理信号进行压力和非压力状态的分类，并引入了深度学习框架进行比较分析	传统压力诊断方法依赖于患者自我报告，存在局限性	开发一种成本效益高且高效的压力检测方法，以实现早期诊断和干预	处于不同压力水平的个体	machine learning	mental health disorders	ECG, EMG, HR, RESP, Foot GSR, Hand GSR	Decision tree, kernel support vector machine, feed-forward artificial neural networks	physiological signals	NA
1156	2025-06-08	Prediction of the space group and cell volume by training a convolutional neural network with primitive 'ideal' diffraction profiles and its application to 'real' experimental data 2025-Jun-01, Journal of applied crystallography IF:5.2Q1 DOI:10.1107/S1600576725002419 PMID:40475932	研究论文	本研究提出了一种深度学习方法，通过卷积神经网络（CNN）从无机晶体的粉末X射线衍射图谱预测其空间群和晶胞体积	利用仅依赖于晶体结构固有特性的δ函数状'理想'X射线衍射图谱训练CNN模型，无需考虑入射X射线波长或谱线形状	在应用于'真实'X射线图谱时存在部分不匹配情况，可能源于特定材料状态或实验数据质量	开发一种无需模拟实验衍射图谱即可预测晶体结构信息的深度学习方法	无机晶体（如TiO、LiNiO和LiMnO等11种材料）的粉末X射线衍射图谱	机器学习	NA	粉末X射线衍射	CNN	X射线衍射图谱	11种无机晶体材料
1157	2025-06-08	Application of the Bidirectional Encoder Representations from Transformers Model for Predicting the Abbreviated Injury Scale in Patients with Trauma: Algorithm Development and Validation Study 2025-May-29, JMIR formative research IF:2.0Q4 DOI:10.2196/67311 PMID:40440586	研究论文	本研究应用BERT模型预测创伤患者的AIS评分，以提高创伤评估的准确性	采用BERT预训练方法嵌入患者诊断信息等关键特征，构建预测模型，其准确率比先前研究提高了10个百分点	外部验证数据集样本量较小（n=244），可能影响模型泛化能力的全面评估	利用深度学习技术基于易获取的诊断信息预测AIS编码，改进创伤评估	创伤患者	自然语言处理	创伤	BERT预训练方法	BERT	文本（诊断信息、损伤描述等）	26,810例创伤患者（主要数据集）+244例外部验证数据
1158	2025-06-08	Mechanisms and management of self-resolving lumbar disc herniation: bridging molecular pathways to non-surgical clinical success 2025-May-27, Journal of orthopaedic surgery and research IF:2.8Q1 DOI:10.1186/s13018-025-05959-x PMID:40426259	research paper	本文探讨了腰椎间盘突出（LDH）自发性吸收的机制及其非手术治疗的成功案例	通过系统文献回顾，识别了LDH自发性吸收的多种机制，并提出了未来研究方向，包括分子机制、炎症反应调控及基于机器学习的个性化治疗策略	研究仅基于一名患者的案例，样本量较小，且缺乏对照组	探讨LDH自发性吸收的机制及非手术治疗的有效性	一名40岁女性患者，患有严重的L5/S1腰椎间盘突出	医学研究	腰椎间盘突出	MRI成像、NSAIDs、热疗、按摩疗法、针灸、运动疗法	NA	临床数据、MRI图像	1名患者
1159	2025-06-08	The Role of Artificial Intelligence in Chronic Liver Diseases and Liver Transplantation 2025-May-22, Gastroenterology IF:25.7Q1 DOI:10.1053/j.gastro.2025.05.012 PMID:40412666	综述	本文探讨了人工智能在慢性肝病和肝移植中的应用及其潜力	深入分析了人工智能如何通过机器学习和深度学习等技术，模拟临床医生的决策过程，为肝病患者提供个性化建议	需要多中心合作收集无偏数据，并通过临床试验和工作流程整合来验证AI工具的可靠性和有效性	评估人工智能在肝病学中的诊断、预后和治疗应用	慢性肝病和肝移植患者	机器学习	肝病	机器学习、深度学习、大语言模型	NA	实验室数据和临床特征	NA
1160	2025-06-08	Assessing Algorithmic Fairness With a Multimodal Artificial Intelligence Model in Men of African and Non-African Origin on NRG Oncology Prostate Cancer Phase III Trials 2025-May, JCO clinical cancer informatics IF:3.3Q2 DOI:10.1200/CCI-24-00284 PMID:40344545	research paper	评估多模态人工智能模型在前列腺癌三期临床试验中非洲与非非洲裔男性中的算法公平性	使用多模态AI深度学习系统结合数字组织病理学和临床数据，评估算法在不同种族亚组中的普适性	研究中存在种族信息缺失的病例（0.5%）	评估人工智能工具在临床决策中的公平性，避免因偏见加剧健康不平等	非洲裔和非非洲裔前列腺癌患者	digital pathology	prostate cancer	multimodal AI (MMAI) deep learning system	深度学习	digital histopathology and clinical data	5,708名患者（包括948名非洲裔和4,731名非非洲裔）