深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
11601	2024-12-08	GD-Net: An Integrated Multimodal Information Model Based on Deep Learning for Cancer Outcome Prediction and Informative Feature Selection 2024-Dec, Journal of cellular and molecular medicine IF:4.3Q2 DOI:10.1111/jcmm.70221 PMID:39628446	研究论文	本文介绍了一种基于深度学习的集成多模态信息模型GD-Net，用于癌症预后预测和信息特征选择	GD-Net通过早期融合多模态信息，结合可解释的轻量级XGBoost模块，提高了生存预测的准确性	NA	提高癌症预后预测的准确性，并识别新的多模态预后生物标志物	八种癌症数据集，特别是肝癌的差异基因、差异miRNA和甲基化差异基因	机器学习	NA	深度学习	图深度学习算法	多模态数据	八个癌症数据集，肝癌研究中涉及319个差异基因、15个差异miRNA和155个甲基化差异基因
11602	2024-12-08	Automated Segmentation of Fetal Intracranial Volume in Three-Dimensional Ultrasound Using Deep Learning: Identifying Sex Differences in Prenatal Brain Development 2024-Dec-01, Human brain mapping IF:3.5Q1 DOI:10.1002/hbm.70058 PMID:39629904	研究论文	本文开发了一种基于卷积神经网络（CNN）的自动化方法，用于从三维超声图像中分割胎儿颅内体积（ICV），并研究了胎儿性别差异对ICV发育的影响	本文首次使用深度学习技术自动分割胎儿颅内体积，并通过大规模纵向数据集验证了该方法的有效性	本文仅在特定年龄段的胎儿数据上进行了验证，未来需要在更多年龄段和不同人群中进行验证	研究胎儿颅内体积的自动化分割方法，并探讨性别差异对胎儿大脑发育的影响	胎儿颅内体积（ICV）和性别差异	计算机视觉	NA	卷积神经网络（CNN）	卷积神经网络（CNN）	三维超声图像	2235名个体，共43492张超声图像
11603	2024-12-08	Deep Learning and Minimally Invasive Endoscopy: Panendoscopic Detection of Pleomorphic Lesions 2024-Dec, GE Portuguese journal of gastroenterology IF:1.0Q4 DOI:10.1159/000539837 PMID:39633912	研究论文	本文开发了一种人工智能模型，用于在胶囊内镜检查中自动检测多种形态的病变	首次将卷积神经网络应用于胶囊内镜的全面检测，解决了不同品牌设备间的互操作性技术难题	NA	开发一种人工智能模型，用于在胶囊内镜检查中自动检测多种形态的病变	胶囊内镜检查中的多种形态病变，包括血管性病变、隆起性病变、血迹残留、溃疡和糜烂	计算机视觉	NA	卷积神经网络	CNN	图像	355,110张图像，来自8种不同的胶囊内镜和结肠胶囊内镜设备
11604	2024-12-08	PaveDistress: A comprehensive dataset of pavement distresses detection 2024-Dec, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.111111 PMID:39633980	研究论文	介绍了一个名为PaveDistress的综合路面病害检测数据集	提供了高分辨率的路面病害图像，包括裂缝、修补、坑洞等，支持深度学习模型的发展	NA	支持非破坏性检测道路缺陷的深度学习模型开发	路面病害图像数据集	计算机视觉	NA	NA	深度学习模型	图像	包含高分辨率图像，每张图像代表3.9m × 2.1m的实际道路覆盖面积
11605	2024-12-08	External validation of SpineNetV2 on a comprehensive set of radiological features for grading lumbosacral disc pathologies 2024-Dec, North American Spine Society journal DOI:10.1016/j.xnsj.2024.100564 PMID:39640208	研究论文	本文对SpineNetV2模型在腰椎间盘病理分级中的外部验证进行了研究	SpineNetV2是一个用于检测和分级腰椎间盘病理的先进开源模型，本文对其在不同患者群体和成像协议中的鲁棒性和泛化能力进行了验证	对于椎间孔狭窄和椎间盘突出的评估，SpineNetV2与专家评估的一致性较低，表明矢状位MR图像在这些条件下的评估存在局限性	验证SpineNetV2模型在腰椎间盘病理分级中的可靠性和适用性	1747个腰椎间盘的MRI图像，来自353名患者	计算机视觉	腰椎间盘疾病	MRI	SpineNetV2	图像	1747个腰椎间盘样本，来自353名患者
11606	2024-12-08	Aspect based sentiment analysis datasets for Bangla text 2024-Dec, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.111107 PMID:39640395	研究论文	本文开发了一个高质量的孟加拉语基于方面的情感分析（ABSA）标注数据集BANGLA_ABSA	本文的创新点在于创建了首个高质量的孟加拉语ABSA数据集，涵盖了四个开放领域	数据集的样本量相对较小，且仅涵盖四个领域	研究目的是为孟加拉语的基于方面的情感分析提供高质量的标注数据集	研究对象是孟加拉语的文本情感分析	自然语言处理	NA	基于方面的情感分析（ABSA）	NA	文本	数据集包含801、800、975和1149条评论，分别对应手机、电影、餐厅和汽车领域
11607	2024-12-08	A fine-grained labeled dataset for textual sentiment analysis in technical education 2024-Dec, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.111120 PMID:39640403	研究论文	本文介绍了一个为技术教育领域文本情感分析精心策划的数据集	这是首个公开可用的同类数据集，为现有模型的评估和新模型的开发提供了丰富的资源	数据收集过程存在局限性和伦理考虑	推进技术教育领域情感分析及相关领域的研究和应用	技术教育领域的文本情感分析	自然语言处理	NA	NA	NA	文本	14,272条记录
11608	2024-12-08	Anatomical recognition artificial intelligence for identifying the recurrent laryngeal nerve during endoscopic thyroid surgery: A single-center feasibility study 2024-Dec, Laryngoscope investigative otolaryngology IF:1.6Q2 DOI:10.1002/lio2.70049 PMID:39640517	研究论文	研究使用人工智能识别内镜甲状腺手术中喉返神经的可行性	首次应用人工智能模型进行内镜甲状腺手术中喉返神经的识别	研究仅限于单中心数据，样本量较小	评估人工智能在内镜甲状腺手术中识别喉返神经的可行性和准确性	喉返神经和气管在内镜甲状腺手术中的识别	计算机视觉	NA	语义分割深度学习方法	NA	视频	40个内镜甲状腺手术视频
11609	2024-12-08	Development and validation of the MRI-based deep learning classifier for distinguishing perianal fistulizing Crohn's disease from cryptoglandular fistula: a multicenter cohort study 2024-Dec, EClinicalMedicine IF:9.6Q1 DOI:10.1016/j.eclinm.2024.102940 PMID:39640934	研究论文	开发并验证了一种基于MRI的深度学习分类器，用于区分肛周瘘管性克罗恩病和腺性瘘管	首次使用深度卷积神经网络（DCNN）模型，通过迁移学习策略，基于MRI图像区分肛周瘘管性克罗恩病和腺性瘘管	研究仅限于中国三家三级转诊医院的数据，样本量有限，可能影响模型的泛化能力	开发并验证一种可靠的MRI图像分类器，用于早期区分肛周瘘管性克罗恩病和腺性瘘管	肛周瘘管性克罗恩病和腺性瘘管患者	计算机视觉	消化系统疾病	深度卷积神经网络（DCNN）	CNN	图像	1054名患者，包括532名肛周瘘管性克罗恩病患者和522名腺性瘘管患者
11610	2024-12-08	Development and validation of a deep learning pipeline to diagnose ovarian masses using ultrasound screening: a retrospective multicenter study 2024-Dec, EClinicalMedicine IF:9.6Q1 DOI:10.1016/j.eclinm.2024.102923 PMID:39640935	研究论文	开发并验证了一种基于超声筛查诊断卵巢肿块的深度学习管道，通过多中心回顾性研究评估其性能	提出了Ovarian Multi-Task Attention Network (OvaMTA)，用于卵巢和卵巢肿块的检测、分割和分类，以及基于超声筛查的卵巢肿块诊断	NA	开发一种自动化的深度学习框架，用于卵巢和卵巢肿块的检测、分割和分类，以及基于超声筛查的卵巢肿块诊断	卵巢和卵巢肿块的检测、分割和分类，以及卵巢肿块的诊断	计算机视觉	卵巢癌	深度学习	OvaMTA	图像和视频	训练和验证集包括6938张图像，内部测试集包括1584张图像，外部测试集包括1896张图像和159个视频
11611	2024-12-08	Deep learning-driven macroscopic AI segmentation model for brain tumor detection via digital pathology: Foundations for terahertz imaging-based AI diagnostics 2024-Nov-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e40452 PMID:39634425	研究论文	本文使用深度学习方法开发了一种能够自主描绘数字病理图像中癌变区域的AI模型	通过使用Image Crop with Mask技术和补丁生成方法，克服了计算资源有限的挑战，并成功开发了自主分割癌变区域的AI训练模型	NA	开发一种基于深度学习的AI模型，用于自动检测和分割脑肿瘤区域	数字病理图像中的脑肿瘤区域	数字病理学	脑肿瘤	深度学习	AI模型	图像	187张H&E染色图像
11612	2024-12-08	Reveal the potent antidepressant effects of Zhi-Zi-Hou-Pu Decoction based on integrated network pharmacology and DDI analysis by deep learning 2024-Nov-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38726 PMID:39641032	研究论文	本研究通过综合网络药理学和深度学习方法，揭示了知子厚朴汤的抗抑郁作用及其潜在机制	首次系统性地探讨了知子厚朴汤的活性成分及其与抑郁症的药理学机制，并利用深度学习模型预测药物相互作用	研究主要基于体外实验和计算机模拟，缺乏体内实验验证	探讨知子厚朴汤的抗抑郁机制及其药物相互作用	知子厚朴汤的活性成分及其与抑郁症的药理学机制	药物相互作用	NA	网络药理学、分子对接、UPLC-Q-TOF-MS/MS、深度学习	深度学习模型	化合物数据	LPS诱导的神经母细胞瘤细胞
11613	2024-12-08	Discovery of antibiotics in the archaeome using deep learning 2024-Nov-16, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.11.15.623859 PMID:39605719	研究论文	利用深度学习技术从古菌组中发现新型抗生素	首次利用深度学习技术系统地探索古菌组，发现具有潜在抗菌活性的新分子，命名为archaeasins，这些新发现的肽化合物具有独特的组成特征	NA	寻找新型抗生素以应对抗微生物药物耐药性	古菌组中的抗菌分子	机器学习	NA	深度学习	NA	蛋白质组数据	233个古菌蛋白质组，合成了80种archaeasins
11614	2024-12-08	External Validation of a Previously Developed Deep Learning-based Prostate Lesion Detection Algorithm on Paired External and In-House Biparametric MRI Scans 2024-Nov, Radiology. Imaging cancer DOI:10.1148/rycan.240050 PMID:39400232	研究论文	评估一个基于深度学习的AI模型在检测外部和内部双参数MRI扫描中的前列腺病变的表现	使用先前开发的基于深度学习的AI模型进行外部验证，评估其在不同数据集上的表现	研究为单中心回顾性研究，样本量有限，且仅限于男性患者	评估AI模型在检测前列腺癌阳性病变中的表现，并比较外部和内部MRI数据集的差异	前列腺癌阳性病变	计算机视觉	前列腺癌	深度学习	AI模型	MRI图像	201名男性患者
11615	2024-12-08	A deep learning model for estimating sedation levels using heart rate variability and vital signs: a retrospective cross-sectional study at a center in South Korea 2024-Nov, Acute and critical care IF:1.7Q3 DOI:10.4266/acc.2024.01200 PMID:39600246	研究论文	本研究开发了一种基于心率变异性（HRV）参数和生命体征的深度学习模型，用于预测儿科患者的镇静水平	首次将HRV参数和生命体征结合，利用深度学习模型预测儿科患者的镇静水平，提供了一种自动化和连续监测镇静状态的方法	研究结果需要多中心验证以确保其广泛适用性	开发一种能够有效且安全地预测儿科患者镇静水平的深度学习模型	儿科重症监护病房的患者	机器学习	NA	心率变异性（HRV）参数提取	1D ResNet	心电图波形和生命体征数据	324名患者，4193个特征集
11616	2024-12-08	Automatic detection of temporomandibular joint osteoarthritis radiographic features using deep learning artificial intelligence. A Diagnostic accuracy study 2024-Oct-31, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery DOI:10.1016/j.jormas.2024.102124 PMID:39488247	研究论文	研究使用深度学习人工智能模型自动检测颞下颌关节骨关节炎的放射学特征，并评估其诊断准确性	首次使用YOLO深度学习模型进行颞下颌关节骨关节炎放射学特征的自动检测，并展示了其与经验丰富的放射科医生的诊断结果具有高度一致性	研究中AI模型在检测皮质下囊肿时与放射科医生的诊断存在显著差异	评估神经网络人工智能模型在颞下颌关节骨关节炎放射学确认中的诊断性能	颞下颌关节骨关节炎的放射学特征	计算机视觉	颞下颌关节疾病	深度学习	YOLO	影像	包含符合颞下颌关节紊乱诊断标准决策树的成年患者的锥束CT影像
11617	2024-12-08	An approach for classification of breast cancer using lightweight deep convolution neural network 2024-Oct-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38524 PMID:39640611	研究论文	本文提出了一种使用轻量级深度卷积神经网络进行乳腺癌分类的方法	本文创新性地使用了轻量级卷积神经网络（LWCNN）来自动提取特征，实现了端到端的乳腺癌分类	NA	研究如何利用深度学习技术提高乳腺癌筛查的准确性	乳腺癌筛查乳腺X光片	计算机视觉	乳腺癌	深度学习	轻量级卷积神经网络（LWCNN）	图像	两个实验中分别使用了两个案例的原始和增强数据集
11618	2024-12-08	Transformer-based models for chemical SMILES representation: A comprehensive literature review 2024-Oct-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39038 PMID:39640612	综述	本文综述了基于Transformer的化学语言模型在化学信息学中的应用现状	探讨了Transformer模型在化学信息学中的创新应用，特别是在处理化学SMILES数据方面的优势	分析了当前化学语言Transformer模型面临的挑战和局限性	旨在回顾和分析基于Transformer的化学语言模型在化学信息学中的最新进展	化学语言模型在处理化学SMILES数据中的应用	自然语言处理	NA	Transformer	Transformer	文本	NA
11619	2024-12-07	3D microstructure reconstruction and characterization of porous materials using a cross-sectional SEM image and deep learning 2024-Oct-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e39185 PMID:39640653	研究论文	本文提出了一种利用生成对抗网络（GAN）从单个横截面扫描电镜（SEM）图像重建多孔材料三维微观结构的方法	与需要3D图像作为训练数据的现有GAN模型不同，本文提出的模型仅需要单个横截面图像即可进行3D重建	NA	准确评估多孔材料和设备中的三维孔隙特征	多孔陶瓷电极材料	计算机视觉	NA	生成对抗网络（GAN）	GAN	图像	NA
11620	2024-12-08	Introducing a novel dataset for facial emotion recognition and demonstrating significant enhancements in deep learning performance through pre-processing techniques 2024-Oct-30, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e38913 PMID:39640693	研究论文	本文介绍了一种新的面部情感识别数据集，并通过预处理技术显著提升了深度学习模型的性能	开发了新的面部情感识别数据集，并提出了基于EfficientNetB7和CBAM-4CNN的混合模型，显著提高了情感识别的准确性	面临GPU内存限制等挑战	提高面部情感识别模型的准确性	面部情感识别数据集和深度学习模型	计算机视觉	NA	深度学习	卷积神经网络 (CNN)	图像	新的面部情感识别数据集，包括FER13和扩展的CK+数据集