深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
11621	2024-12-13	Enhancing AI Research for Breast Cancer: A Comprehensive Review of Tumor-Infiltrating Lymphocyte Datasets 2024-Dec, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-024-01043-8 PMID:38806950	综述	本文综述了与肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）相关的公开数据集，旨在为乳腺癌研究中的计算机辅助病理学（CAP）工具的训练和验证提供资源	本文的创新点在于系统地回顾了公开的TIL数据集，为TIL研究社区提供了宝贵的资源	本文的局限性在于仅限于公开可用的数据集，可能无法涵盖所有相关的TIL数据	本文的研究目的是为乳腺癌研究中的计算机辅助病理学工具的训练和验证提供资源	本文的研究对象是与肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）相关的公开数据集	数字病理学	乳腺癌	深度学习	NA	图像	NA
11622	2024-12-13	Identification of lineage-specific cis-trans regulatory networks related to kiwifruit ripening initiation 2024-Dec, The Plant journal : for cell and molecular biology DOI:10.1111/tpj.17093 PMID:39462454	研究论文	本研究使用可解释的深度学习框架预测启动子序列中的顺式调控元件（CREs）表达模式，识别了影响猕猴桃成熟过程的特定谱系CRE-TF相互作用	首次使用可解释的深度学习方法识别了猕猴桃成熟过程中新的顺反调控关系，揭示了特定谱系的CRE-TF相互作用	研究仅限于猕猴桃，未探讨其他水果的适用性	识别与猕猴桃成熟启动相关的特定谱系顺反调控网络	猕猴桃成熟过程中的顺式调控元件（CREs）和转录因子（TFs）相互作用	机器学习	NA	深度学习	深度学习框架	DNA序列	未明确提及样本数量
11623	2024-12-13	Correlating Personality Traits With Acute Stress Responses in Earthquake Simulations: An HRV and RESP Analysis 2024-Dec, Stress and health : journal of the International Society for the Investigation of Stress IF:3.0Q2 DOI:10.1002/smi.3510 PMID:39584748	研究论文	本研究探讨了人格特质与地震模拟中急性应激反应（ASR）之间的关联，通过心率变异性（HRV）和呼吸信号分析，结合深度学习模型进行预测	本研究首次将人格特质与急性应激反应的预测相结合，提出了一种基于人格的地震应激管理新方法	研究样本量较小，且仅限于特定人格类型的参与者，未来需要更大规模的研究来验证结果	研究人格特质与急性应激反应之间的关联，并开发基于人格的应激反应预测模型	参与者的人格特质、心率变异性和呼吸信号在地震模拟中的变化	机器学习	NA	多变量方差分析（MANOVA）、Toeplitz逆协方差聚类方法、卷积神经网络（CNN）和长短期记忆网络（LSTM）	CNN-LSTM	心率变异性（HRV）、呼吸信号	参与者数量未明确提及
11624	2024-12-13	A patch-based deep learning MRI segmentation model for improving efficiency and clinical examination of the spinal tumor 2024-Dec, Journal of bone oncology IF:3.1Q2 DOI:10.1016/j.jbo.2024.100649 PMID:39659517	研究论文	本研究提出了一种基于补丁的深度学习MRI分割模型，用于提高脊柱肿瘤的效率和临床检查	本研究的创新点在于提出了一种全自动的脊柱MRI图像分割方法，利用卷积-反卷积神经网络和基于补丁的深度学习技术，显著提高了分割效率和准确性	NA	本研究的目的是提出一种全自动的脊柱MRI图像分割方法，以提高分割效率，满足临床诊断和治疗计划的需求	本研究的研究对象是脊柱MRI图像中的肿瘤	计算机视觉	脊柱疾病	卷积神经网络	卷积神经网络	图像	NA
11625	2024-12-13	A hybrid deep learning model-based LSTM and modified genetic algorithm for air quality applications 2024-Nov-27, Environmental monitoring and assessment IF:2.9Q3 DOI:10.1007/s10661-024-13447-8 PMID:39601991	研究论文	本文提出了一种基于LSTM和改进遗传算法的混合深度学习模型，用于多步PM预测	引入了名为EFS-GA-LSTM的新型混合深度学习模型，并使用改进的遗传算法优化其架构	未提及具体的研究局限性	利用历史数据构建LSTM模型，并通过改进的遗传算法优化其架构，以提高多步PM预测的准确性	多步PM预测	机器学习	NA	深度学习	LSTM	数据	输入数据包括每小时的PM浓度、气象变量和时间变量
11626	2024-12-13	Artificial Intelligence Classification for Detecting and Grading Lumbar Intervertebral Disc Degeneration 2024-Nov-27, Spine surgery and related research IF:1.2Q3 DOI:10.22603/ssrr.2024-0154 PMID:39659374	研究论文	本研究开发并验证了一种基于卷积神经网络（CNN）和YOLO架构的人工智能模型，用于基于磁共振成像（MRI）扫描对腰椎间盘退变进行分类和分级	本研究首次使用YOLO架构的CNN模型对腰椎间盘退变进行分类和分级，显著提高了诊断的精确性和可靠性	尽管模型表现出色，但仍需进一步的临床验证才能将其整合到常规实践中	开发和验证一种人工智能模型，用于精确检测和分级腰椎间盘退变	腰椎间盘退变	计算机视觉	脊柱疾病	卷积神经网络（CNN）	YOLO架构	图像	训练集1000例，测试集500例，外部验证集500例
11627	2024-12-13	Long-Term Efficacy of an AI-Based Health Coaching Mobile App in Slowing the Progression of Nondialysis-Dependent Chronic Kidney Disease: Retrospective Cohort Study 2024-Nov-25, Journal of medical Internet research IF:5.8Q1 DOI:10.2196/54206 PMID:39402012	研究论文	本研究评估了基于AI的健康指导移动应用KidneyOnline在减缓非透析依赖性慢性肾病进展方面的长期疗效	本研究首次通过回顾性队列研究验证了基于AI的移动应用在减缓慢性肾病进展中的有效性	本研究为回顾性研究，可能存在选择偏倚和混杂因素的影响	评估KidneyOnline智能护理系统在减缓非透析依赖性慢性肾病进展方面的长期疗效	使用KidneyOnline应用的慢性肾病患者和接受常规护理的患者	NA	慢性肾病	深度学习光学字符识别	NA	健康数据	12,297名患者，其中808名患者通过1:1倾向评分匹配分为KidneyOnline护理系统组和常规护理组各404名
11628	2024-12-13	Evaluation of machine learning and deep learning models for daily air quality index prediction in Delhi city, India 2024-Nov-19, Environmental monitoring and assessment IF:2.9Q3 DOI:10.1007/s10661-024-13351-1 PMID:39557698	研究论文	本文评估了机器学习和深度学习模型在印度德里市每日空气质量指数预测中的表现	本文引入了XGBoost算法和随机森林（RF）模型，并结合特征重要性分析和Shapley加性解释（SHAP）方法，以提高空气质量指数预测的准确性	本文未详细讨论模型在不同天气条件或季节变化下的表现	开发和评估用于预测德里市每日空气质量指数的高级模型，以帮助城市规划和空气污染控制	德里市的空气质量指数预测	机器学习	NA	机器学习算法（XGBoost、随机森林、人工神经网络）	XGBoost、随机森林、人工神经网络	空气质量数据	NA
11629	2024-12-13	A lightweight intelligent laryngeal cancer detection system for rural areas 2024 Nov-Dec, American journal of otolaryngology IF:1.8Q2 DOI:10.1016/j.amjoto.2024.104474 PMID:39137696	研究论文	本文介绍了一种轻量级的智能喉癌检测系统（ILCDS），旨在为资源有限的农村地区提供有效的喉癌筛查	提出了一个专门为农村地区设计的智能喉癌检测系统，结合了多种深度学习模型进行评估和选择，最终选择了适合农村环境的模型	未提及具体的局限性	开发一种适合农村地区的智能喉癌检测系统，以提高喉癌筛查的准确性和效率	喉癌的早期诊断和筛查	计算机视觉	喉癌	深度学习	AlexNet, VGG, ResNet, DenseNet, MobileNet, ShuffleNet, Vision Transformer, Swin Transformer	图像	2023张喉镜图像
11630	2024-12-13	Analysis of international publication trends in artificial intelligence in skin cancer 2024 Nov-Dec, Clinics in dermatology IF:2.3Q2 DOI:10.1016/j.clindermatol.2024.09.012 PMID:39260460	研究论文	使用文献计量方法分析2010年至2022年间人工智能在皮肤癌领域的国际出版趋势	揭示了人工智能在皮肤癌研究中的出版趋势和未来方向，并通过共被引网络分析识别了该领域的经典文献	研究仅基于Web of Science数据库中的英文文献，可能存在数据偏倚	探索人工智能在皮肤癌研究中的出版趋势和未来发展方向	2010年至2022年间人工智能在皮肤癌领域的出版物	机器学习	皮肤癌	文献计量方法	NA	文本	989篇出版物
11631	2024-12-13	Entomopathogenic nematode detection and counting model developed based on A-star algorithm 2024-Nov, Journal of invertebrate pathology IF:3.6Q1 DOI:10.1016/j.jip.2024.108196 PMID:39260520	研究论文	本文提出了一种基于A*算法的新方法，用于检测和量化显微镜图像中的斯氏线虫，以提高检测精度并简化操作流程	本文提出的A*算法在检测精度上显著优于YOLO-V5m、YOLO-V7m和YOLO-V8m，并且在处理重叠线虫时表现尤为出色	NA	开发一种高效的方法用于检测和计数实验室中的斯氏线虫，以替代传统的人工计数方法	斯氏线虫（Steinernema feltiae）的检测和计数	计算机视觉	NA	A*算法	NA	图像	NA
11632	2024-12-13	Harnessing Artificial Intelligence (AI) in Anaesthesiology: Enhancing Patient Outcomes and Clinical Efficiency 2024-Nov, Cureus DOI:10.7759/cureus.73383 PMID:39659330	综述	本文系统回顾了人工智能（AI）在麻醉学领域的进展及其潜在应用	探讨了AI在麻醉学中的创新应用，如个性化药物剂量、实时生命体征监测、自动化麻醉输送系统和不良事件预测分析	讨论了AI在麻醉学应用中的局限性和缺陷，并强调了伦理考量	研究AI在麻醉学领域的现状及未来潜在应用	AI在麻醉学中的应用及其对患者结果和临床效率的影响	NA	NA	机器学习（ML）、深度学习（DL）、神经网络	NA	NA	NA
11633	2024-12-13	Deep learning modeling of RNA ac4C deposition reveals the importance of plant alternative splicing 2024-Oct-28, Plant molecular biology IF:3.9Q1 DOI:10.1007/s11103-024-01512-2 PMID:39467957	研究论文	本文利用深度学习技术iac4C预测植物mRNA中的ac4C位点，揭示了ac4C在植物选择性剪接中的重要性	本文首次使用深度学习技术iac4C预测植物mRNA中的ac4C位点，并揭示了ac4C与植物选择性剪接之间的关联	NA	研究ac4C在植物选择性剪接中的作用	植物mRNA中的ac4C位点	机器学习	NA	深度学习	BiGRU和自注意力机制	RNA序列	NA
11634	2024-08-07	DeepCCR: large-scale genomics-based deep learning method for improving rice breeding 2024-Oct, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1 DOI:10.1111/pbi.14384 PMID:38805625	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
11635	2024-12-13	Artificial intelligence in respiratory care: perspectives on critical opportunities and challenges 2024-Oct, Breathe (Sheffield, England) DOI:10.1183/20734735.0189-2023 PMID:39660082	评论	本文探讨了人工智能在呼吸护理中的应用及其带来的机遇与挑战	本文提出了在算法共同设计中促进透明度和优先考虑包容性及易理解性的战略努力	本文未提供具体的技术细节或实验结果，主要集中在讨论和展望上	探讨人工智能在呼吸护理中的应用及其对临床医生、患者和社会的影响	人工智能在呼吸护理中的应用及其对临床医生、患者和社会的影响	NA	呼吸系统疾病	NA	NA	NA	NA
11636	2024-12-13	German CheXpert Chest X-ray Radiology Report Labeler 2024-09, RoFo : Fortschritte auf dem Gebiete der Rontgenstrahlen und der Nuklearmedizin DOI:10.1055/a-2234-8268 PMID:38295825	研究论文	本研究开发了一种算法，用于从德语胸腔放射学报告中自动提取注释，以训练基于深度学习的胸部X光分类模型	开发了一种基于CheXpert架构的自动标签提取模型，用于德语胸腔放射学报告，并创建了一个网络化的多读者注释界面以生成真实数据	自动提取标签的不确定性检测F1分数较低，表明在处理不确定情况时仍存在局限性	开发一种自动从德语胸腔放射学报告中提取注释的算法，以提高胸部X光分类模型的训练效率	德语胸腔放射学报告和胸部X光图像	数字病理学	NA	深度学习	DenseNet-121	文本和图像	1086份回顾性收集的放射学报告（数据集1）和6434张胸部X光图像及相应报告（数据集2）
11637	2024-12-13	Dual-Mode Imaging System for Early Detection and Monitoring of Ocular Surface Diseases 2024-08, IEEE transactions on biomedical circuits and systems IF:3.8Q2 DOI:10.1109/TBCAS.2024.3411713 PMID:38875082	研究论文	本文介绍了一种基于深度学习的双模态成像系统，用于自动化、客观和可靠地评估干眼症、结膜炎和结膜下出血等三种代表性眼表疾病	该系统结合了红外（IR）和可见光（RGB）图像的双模态处理技术，并采用多阶段深度学习模型，显著提高了诊断的准确性和一致性	NA	开发一种自动化、准确且便携的成像系统，用于早期检测和持续监测眼表疾病	干眼症、结膜炎、结膜下出血以及睑板腺功能障碍	计算机视觉	眼科疾病	深度学习	多阶段深度学习模型	图像	NA
11638	2024-12-13	sEMG-Driven Hand Dynamics Estimation With Incremental Online Learning on a Parallel Ultra-Low-Power Microcontroller 2024-08, IEEE transactions on biomedical circuits and systems IF:3.8Q2 DOI:10.1109/TBCAS.2024.3415392 PMID:38885102	研究论文	本文提出了一种基于表面肌电图（sEMG）的增量在线学习策略，用于在超低功耗微控制器上进行多指力估计	本文的创新点在于提出了一种增量在线学习策略，能够在嵌入式设备上进行实时训练，并实现了跨天的多指力估计	本文的局限性在于仅在HYSER数据集上进行了验证，未来需要在更多数据集上进行测试	研究目的是开发一种能够在嵌入式设备上进行实时训练的sEMG驱动控制策略	研究对象是基于sEMG的多指力估计	机器学习	NA	表面肌电图（sEMG）	时间卷积网络（Temporal Convolutional Network）	信号	HYSER数据集中的RANDOM数据集
11639	2024-12-13	Electrical Capacitance Tomography of Cell Cultures on a CMOS Microelectrode Array 2024-08, IEEE transactions on biomedical circuits and systems IF:3.8Q2 DOI:10.1109/TBCAS.2024.3415360 PMID:38885101	研究论文	本文介绍了一种基于CMOS微电极阵列的微尺度电容层析成像系统，并使用深度学习模型重建细胞培养的三维体积	引入了多目标损失函数，结合像素级损失函数、基于分布的损失函数和基于区域的损失函数，提高了模型的重建精度	未提及具体的局限性	开发一种低成本、低功耗、无标记的三维生物样本成像工具	细胞培养的三维体积重建	NA	NA	电容层析成像（ECT）	深度学习模型	电容测量数据	实验数据集包括细菌生物膜
11640	2024-12-13	Deep Learning for Face Detection and Pain Assessment in Japanese macaques (Macaca fuscata) 2024-07-01, Journal of the American Association for Laboratory Animal Science : JAALAS IF:1.2Q2 DOI:10.30802/AALAS-JAALAS-23-000056 PMID:38428929	研究论文	研究使用深度学习模型检测日本猕猴面部表情以评估其疼痛状态	首次使用深度学习模型对日本猕猴的面部表情进行疼痛检测，并通过预处理和微调提高了分类模型的准确性	分类准确率仍有提升空间，可能受到背景、光照、肤色等因素的影响	研究深度学习模型在动物疼痛评估中的应用	日本猕猴的面部表情	计算机视觉	NA	深度学习	ResNet50	视频	30到60分钟的日本猕猴腹腔手术视频，包括手术前和手术后一天的记录