深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
101	2025-08-10	Expanding genomic prediction in plant breeding: harnessing big data, machine learning, and advanced software 2025-07, Trends in plant science IF:17.3Q1 DOI:10.1016/j.tplants.2024.12.009 PMID:39890501	综述	本文回顾了基因组选择（GS）在植物育种中提高遗传增益的关键因素，重点关注统计机器学习（ML）方法和软件	强调了深度学习（DL）模型在基因组预测（GP）中的独特优势，并介绍了支持GS方法的最新数据管理工具	NA	提高基因组选择在植物育种中的效率	植物育种中的基因组预测	机器学习	NA	基因组选择（GS）	深度学习（DL）	基因组数据	NA
102	2025-08-10	Artificial intelligence in pediatric otolaryngology: A state-of-the-art review of opportunities and pitfalls 2025-Jul, International journal of pediatric otorhinolaryngology IF:1.2Q3 DOI:10.1016/j.ijporl.2025.112369 PMID:40334638	review	本文综述了人工智能在儿科耳鼻喉科中的应用现状、挑战及未来方向	强调了针对儿童独特生理和发育特征定制AI应用的必要性，并指出了当前知识空白	成人训练数据的泛化能力不足及儿科数据相对缺乏	探讨AI在儿科耳鼻喉科中的潜在应用及面临的挑战	儿科耳鼻喉科疾病及手术场景	machine learning	otitis media, adenoid hypertrophy, pediatric obstructive sleep apnea	deep learning-based image analysis, predictive modeling	deep learning, large language models	image, clinical data	NA
103	2025-08-10	Artificial intelligence for radiotherapy dose prediction: A comprehensive review 2025-Jul, Cancer radiotherapie : journal de la Societe francaise de radiotherapie oncologique IF:1.5Q3 DOI:10.1016/j.canrad.2025.104630 PMID:40513223	综述	本文全面回顾了基于深度学习的放射治疗剂量预测方法，重点关注卷积神经网络	深入分析了深度学习在放射治疗剂量预测中的应用潜力，特别是在自动化剂量预测过程方面	仅涵盖了2018年至2024年间发表的文献，可能未包括最新的研究进展	评估深度学习技术在放射治疗剂量预测中的效果和应用潜力	放射治疗中的剂量预测方法	数字病理学	NA	深度学习	CNN	NA	NA
104	2025-08-10	Qualitative evaluation of automatic liver segmentation in computed tomography images for clinical use in radiation therapy 2025-Jul, Cancer radiotherapie : journal de la Societe francaise de radiotherapie oncologique IF:1.5Q3 DOI:10.1016/j.canrad.2025.104648 PMID:40517449	研究论文	本研究评估了基于人工智能的肝脏自动分割在CT图像中的临床应用价值，并探讨了几何指标与临床医生评估之间的相关性	首次系统研究了几何分割指标与临床医生主观评估之间的相关性，揭示了现有评估方法的局限性	研究仅针对肝脏单一器官进行，且样本量有限	评估人工智能分割系统在放射治疗工作流程中的临床适用性	CT图像中的肝脏分割	数字病理	NA	CT成像	U-Net	医学图像	公开数据集中的CT图像
105	2025-08-10	Multitask deep learning for the emulation and calibration of an agent-based malaria transmission model 2025-Jul, PLoS computational biology IF:3.8Q1 DOI:10.1371/journal.pcbi.1013330 PMID:40743314	研究论文	本文提出了一种多任务深度学习方法，用于模拟和校准基于代理的疟疾传播模型	利用多任务深度学习模拟复杂的基于代理的疟疾传播模型，并通过参数估计技术校准模型	模型依赖于大量模拟数据进行训练，可能在实际应用中存在计算资源需求高的问题	开发一种高效的方法来模拟和校准基于代理的疟疾传播模型	基于代理的疟疾传播模型及其免疫学参数与流行病学结果之间的关系	机器学习	疟疾	多任务深度学习	神经网络模拟器	模拟数据	八个撒哈拉以南非洲研究地点的年龄分层发病率和流行率数据
106	2025-08-10	Enhancing the Performance of Pathological Voice Quality Assessment System Through the Attention-Mechanism Based Neural Network 2025-Jul, Journal of voice : official journal of the Voice Foundation IF:2.5Q1 DOI:10.1016/j.jvoice.2022.12.026 PMID:36732109	研究论文	本文提出了一种基于自注意力机制的神经网络系统，用于提高病理嗓音质量评估的准确性	采用自注意力机制的双向长短期记忆网络（SA BiLSTM），并结合不同音高和元音，模拟专业医生的高维度评估方式	未提及具体样本量及数据来源的多样性，可能影响模型的泛化能力	开发一种计算机化的病理嗓音质量评估系统，以提高评估的准确性和一致性	病理嗓音的质量评估	数字病理	嗓音疾病	深度学习	SA BiLSTM	音频	NA
107	2025-08-10	Radiomics-Based Artificial Intelligence and Machine Learning Approach for the Diagnosis and Prognosis of Idiopathic Pulmonary Fibrosis: A Systematic Review 2025-Jul, Cureus DOI:10.7759/cureus.87461 PMID:40772136	系统综述	本文系统综述了基于放射组学的人工智能和机器学习方法在特发性肺纤维化（IPF）诊断和预后中的应用	AI衍生的参数在预后方面优于传统的视觉CT评分，并发现了新的预后生物标志物	研究设计多为回顾性，样本量有限，以男性为主，外部验证不足	评估人工智能和机器学习在IPF诊断和预后中的应用	特发性肺纤维化（IPF）患者	数字病理学	特发性肺纤维化	CT成像	深度学习（DL）、支持向量机（SVM）、集成方法	图像	8项研究（2017-2024年发表）
108	2025-08-10	Advancements in Caries Diagnostics Using Bitewing Radiography: A Systematic Review of Deep Learning Approaches 2025-Jun-22, Caries research IF:2.9Q1 DOI:10.1159/000546448 PMID:40544827	系统性综述	本文通过系统性综述评估了深度学习在咬翼X光片中龋齿诊断的应用	总结了深度学习在龋齿诊断中的最新进展，并识别了当前研究中的挑战和局限性	方法学异质性、缺乏标准化、数据集多样性有限、临床验证不足以及偏见和数据透明度问题	评估深度学习在咬翼X光片中龋齿诊断的应用效果	咬翼X光片中的龋齿检测、分割和严重程度分类	计算机视觉	龋齿	深度学习	ResNet, YOLO	图像	112至8,539张图像
109	2025-08-10	Deep structural brain imaging via computational three-photon microscopy 2025-04, Journal of biomedical optics IF:3.0Q2 DOI:10.1117/1.JBO.30.4.046002 PMID:40161251	研究论文	本文介绍了一种名为LRDM-3PM的计算深度三光子显微镜方法，用于提高深层组织的成像质量	结合了低秩扩散模型、定制聚集诱导发射纳米探针和自监督深度学习，实现了在1.5毫米深度下信号背景比超过100的高质量成像	目前仅在活体小鼠脑部进行了验证，尚未扩展到其他组织或更大型动物	开发一种在不影响采集速度、不增加激发功率或额外光学组件的情况下提高深层组织成像质量的技术	活体小鼠脑部海马体	生物医学成像	NA	三光子显微镜(3PM)、低秩扩散模型(LRDM)、自监督深度学习	低秩扩散模型(LRDM)	3D图像	活体小鼠脑部样本
110	2025-08-10	Artificial Intelligence in Cardiovascular Imaging: Current Landscape, Clinical Impact, and Future Directions 2025 Apr-Jun, Discoveries (Craiova, Romania) DOI:10.15190/d.2025.10 PMID:40771296	综述	本文综述了人工智能在心血管影像学中的当前应用、临床影响及未来发展方向	总结了卷积神经网络在实时超声心动图解读、深度学习在冠状动脉钙化评分中的应用，以及AI驱动的斑块量化和狭窄检测的最新进展	存在算法偏见、可解释性、数据隐私、监管异质性和医疗法律责任等持续性问题	探讨人工智能如何优化心血管影像诊断流程和临床治疗	心血管影像学技术（超声心动图、CT、MRI和核医学成像）	数字病理学	心血管疾病	卷积神经网络（CNN）、深度学习	CNN	医学影像	NA
111	2025-08-10	Assessing the Reporting Quality of Machine Learning Algorithms in Head and Neck Oncology 2025-Feb, The Laryngoscope DOI:10.1002/lary.31756 PMID:39258420	研究论文	评估头颈肿瘤学文献中机器学习算法的报告质量	使用TRIPOD-AI标准评估机器学习算法的报告质量，并提出改进建议	当前机器学习算法的报告质量不足，影响了临床应用和可重复性	评估头颈肿瘤学中机器学习算法的报告质量	头颈肿瘤学文献中的机器学习算法	机器学习	头颈肿瘤	NA	NA	文献数据	NA
112	2025-08-10	Complex conjugate removal in optical coherence tomography using phase aware generative adversarial network 2025-02, Journal of biomedical optics IF:3.0Q2 DOI:10.1117/1.JBO.30.2.026001 PMID:39963188	research paper	该研究提出了一种基于生成对抗网络的深度学习方法，用于消除光学相干断层扫描中的复共轭伪影	利用相位图像增强深度学习模型的伪影去除能力，无需额外硬件组件	研究仅在特定样本（仿体、人皮肤和小鼠眼睛）上进行了验证	开发一种软件解决方案来消除FD-OCT中的复共轭伪影	光学相干断层扫描图像	computer vision	NA	OCT	GAN	image	仿体、人皮肤和小鼠眼睛的体内成像样本
113	2025-08-10	Machine learning for diabetic foot care: accuracy trends and emerging directions in healthcare AI 2025, Frontiers in public health IF:3.0Q2 DOI:10.3389/fpubh.2025.1613946 PMID:40756392	review	本文系统分析了机器学习在糖尿病足研究中的应用趋势、重点领域和方法学方法	首次系统综述了机器学习在糖尿病足研究中的应用，识别了关键趋势和新兴方向	仅纳入了2020-2024年间发表的25篇研究文章，样本量有限	分析机器学习在糖尿病足研究中的应用趋势和方法	糖尿病足相关研究和机器学习应用	machine learning	diabetes	thermal imaging, IoT, smart insoles	deep learning, large language models	image, structured clinical data, IoT sensor data	25篇研究文章
114	2025-08-10	Mangrove species classification using a proposed ensemble U-Net model and Planet satellite imagery: A case study in Ngoc Hien district, Ca Mau province, Vietnam 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0327315 PMID:40768506	研究论文	本研究提出了一种集成U-Net模型，结合Planet卫星影像，用于越南Ca Mau省Ngoc Hien地区的红树林物种分类	采用先进的深度学习解决方案（集成U-Net模型）和高分辨率Planet卫星影像（5米×5米）进行红树林物种分类	研究仅针对越南Ca Mau省Ngoc Hien地区的特定红树林物种，可能不具备广泛适用性	通过深度学习和卫星影像技术实现红树林物种的高效分类	红树林物种（Avicennia alba、Rhizophora apiculate和混合红树林）	计算机视觉	NA	深度学习、卫星影像分析	集成U-Net模型（包含MobileNet、SEResNeXt-101和Efficientnet-B7）	卫星影像	NA
115	2025-08-10	MSMCE: A novel representation module for classification of raw mass spectrometry data 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0321239 PMID:40768503	research paper	提出了一种名为MSMCE的新型多通道嵌入表示模块，用于提高原始质谱数据的分类性能	MSMCE模块通过建模通道间依赖关系生成多通道表示，并结合特征融合机制显著提升分类性能	未提及具体的数据集规模限制或跨数据集泛化能力的详细验证	解决质谱数据高维复杂性带来的特征提取与分类挑战	原始质谱数据	machine learning	NA	质谱分析(MS)	深度学习模型（未指定具体类型）	质谱数据	四个公共数据集（未提具体样本量）
116	2025-08-10	Artificial intelligence in personalized nutrition and food manufacturing: a comprehensive review of methods, applications, and future directions 2025, Frontiers in nutrition IF:4.0Q2 DOI:10.3389/fnut.2025.1636980 PMID:40771216	综述	本文全面回顾了人工智能在个性化营养和食品制造中的方法、应用及未来方向	将AI技术应用于个性化营养和食品制造，实现实时膳食建议、基于生物标志物的餐食规划以及食品生产中的质量控制与废物最小化	涉及算法透明度、数据隐私和公平获取等关键挑战	探讨AI在营养和食品系统中的创新应用，以支持精准健康和可持续发展	个性化营养和食品制造	人工智能	NA	深度学习、联邦学习、计算机视觉	NA	NA	NA
117	2025-08-10	A hybrid approach for pattern recognition and interpretation in age-related false memory 2025, Frontiers in psychology IF:2.6Q2 DOI:10.3389/fpsyg.2025.1579259 PMID:40771329	研究论文	本文开发了一种结合优化机器学习技术与大规模基于transformer的语言模型的混合方法，用于识别年轻人和老年人中区分真实记忆与错误记忆的行为模式	提出了一种改进的LightGBM模型，结合语言模型增强可解释性，用于研究年龄相关的错误记忆机制	当前用于研究年龄相关认知变化的方法存在局限性	探究年龄相关认知衰退，特别是错误记忆形成的潜在机制	年轻人和老年人的记忆行为模式	机器学习	老年疾病	机器学习	改进的LightGBM	行为数据	NA
118	2025-08-10	gamUnet: designing global attention-based CNN architectures for enhanced oral cancer detection and segmentation 2025, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2025.1582439 PMID:40771464	研究论文	提出了一种名为gamUnet的新型CNN架构，用于增强口腔癌的检测和分割	集成了全局注意力机制(GAM)以增强模型捕获全局跨模态信息的能力，并引入了gamResNet进一步改进口腔癌检测性能	未提及具体的数据集规模或模型在临床环境中的验证情况	开发一种能够更准确检测和分割口腔鳞状细胞癌(OSCC)的深度学习模型	口腔鳞状细胞癌(OSCC)的组织病理学图像	数字病理学	口腔癌	深度学习	CNN, gamUnet, gamResNet	图像	NA
119	2025-08-10	Advances in ocular aging: combining deep learning, imaging, and liquid biopsy biomarkers 2025, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2025.1591936 PMID:40771477	综述	本文探讨了结合深度学习、成像技术和液体活检生物标志物在眼部衰老研究中的进展	整合深度学习与先进成像及液体活检生物标志物，为理解眼部衰老及其对全身健康的影响提供了新视角	未提及具体实验数据或样本量，可能缺乏实证支持	探索眼部衰老作为全身衰老相关疾病和死亡率的标志物的直接关系	眼部衰老及其与全身健康的关系	数字病理学	老年疾病	液体活检、眼部成像	深度学习	图像、生物标志物数据	NA
120	2025-08-10	Applications and advances of multi-omics technologies in gastrointestinal tumors 2025, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2025.1630788 PMID:40771479	综述	本文系统综述了多组学技术在胃肠道肿瘤研究中的最新进展及其在早期筛查、生物标志物发现和治疗优化中的应用	整合了基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学等多维数据，构建多尺度框架，为分子分型和靶向治疗开辟了新路径	数据异质性、算法泛化能力不足以及高成本等问题限制了临床转化	探讨多组学技术在胃肠道肿瘤研究中的应用与进展	胃肠道肿瘤	多组学技术	胃肠道肿瘤	基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表观基因组学、宏基因组学、脂质组学	NA	多组学数据	NA