深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1181	2025-07-05	A narrative review of foundation models for medical image segmentation: zero-shot performance evaluation on diverse modalities 2025-Jun-06, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-2024-2826 PMID:40606341	综述	本文全面回顾了医学图像分割中的基础模型，评估了它们在多种数据集上的零样本性能，并评估了它们在临床环境中的实际适用性	通过系统性地分类基础模型并评估其在未见过的医学图像数据集上的零样本性能，为医学图像分割领域提供了新的见解	研究仅评估了六种基础模型，可能无法涵盖所有相关模型，且数据集的选择可能存在偏差	评估基础模型在医学图像分割中的零样本性能及其在临床环境中的适用性	医学图像分割中的基础模型	数字病理	NA	深度学习	基础模型	医学图像	63项研究系统回顾，31个未见过的医学图像数据集
1182	2025-07-05	A comparative analysis of sagittal, coronal, and axial magnetic resonance imaging planes in diagnosing anterior cruciate ligament and meniscal tears via a deep learning model: emphasizing the unexpected importance of the axial plane 2025-Jun-06, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-24-1808 PMID:40606344	research paper	比较分析矢状面、冠状面和轴向磁共振成像平面在通过深度学习模型诊断前交叉韧带和半月板撕裂中的作用，强调轴向平面的意外重要性	首次系统比较了不同MRI平面在深度学习模型中对前交叉韧带和半月板撕裂诊断的影响，并发现轴向平面在半月板撕裂检测中的重要性	研究仅使用了MRNet数据集，样本量相对有限，且未在外部数据集上进行验证	探究不同MRI平面在深度学习模型中对膝关节损伤诊断的影响	前交叉韧带(ACL)撕裂和半月板撕裂	digital pathology	骨科疾病	磁共振成像(MRI)	TripleMRNet (基于CNN的深度学习模型)	image	1,130训练病例和120验证病例
1183	2025-07-05	Deep learning-based rotational object detection algorithm for automatic Cobb angle measurement in X-ray images of scoliosis 2025-Jun-06, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-24-2138 PMID:40606352	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的旋转目标检测算法，用于自动测量脊柱侧凸X射线图像中的Cobb角	采用重新设计的YOLOv8-DSF模型，配备创新模块以提高旋转目标的检测能力，从而提升Cobb角测量的准确性	未提及模型在更广泛数据集上的泛化能力或实际临床环境中的验证	提高脊柱侧凸评估中Cobb角测量的准确性	脊柱侧凸患者的X射线图像	计算机视觉	脊柱侧凸	深度学习	YOLOv8-DSF	图像	整合了私有和公开数据的自定义数据集
1184	2025-07-05	Deep learning for automated grading of radiographic sacroiliitis 2025-Jun-06, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-2024-2742 PMID:40606355	研究论文	本研究开发并验证了一种基于深度学习的AI系统，用于从标准X射线图像中辅助医生评估和诊断骶髂关节炎	利用深度学习模型自动评估X射线图像中的骶髂关节炎分级，显著提高了诊断和分级的准确性	研究为回顾性设计，可能受到数据选择和标注偏差的影响	开发并验证AI系统以辅助骶髂关节炎的X射线图像分级评估	骶髂关节炎患者的骨盆X射线图像	数字病理	骶髂关节炎	深度学习	神经网络	图像	训练集465人（930个骶髂关节），验证集195人（390个骶髂关节），外部测试集223人（446个骶髂关节）
1185	2025-07-05	Dual-stage artificial intelligence-powered screening for accurate classification of thyroid nodules: enhancing fine needle aspiration biopsy precision 2025-Jun-06, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-24-2336 PMID:40606376	研究论文	本文介绍了一种新颖的双阶段深度学习架构，用于甲状腺结节的四分类，旨在提高诊断准确性并减少不必要的细针穿刺活检	提出了一种结合分割和分类的双阶段深度学习框架，用于甲状腺结节的四分类，相比传统的二分类方法提供更精确和一致的分析	未明确提及具体局限性	提高甲状腺结节诊断的准确性，减少不必要的细针穿刺活检	甲状腺结节	数字病理	甲状腺癌	深度学习	K-Net, MobileViT	医学影像	未明确提及具体样本量
1186	2025-07-05	Diagnosis of thyroid nodules using ultrasound images based on deep learning features: online dynamic nomogram and gradient-weighted class activation mapping 2025-Jun-06, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-2025-159 PMID:40606380	research paper	本研究开发了一种基于超声图像和深度学习特征的集成模型，用于区分甲状腺结节的良恶性	结合深度学习特征和超声图像特征构建集成模型，并利用Grad-CAM可视化敏感区域，同时开发了在线动态列线图供实际应用	研究为回顾性设计，样本来源仅限于两家医院	提高年轻放射科医生在甲状腺结节良恶性鉴别诊断中的能力	甲状腺结节患者	digital pathology	thyroid nodules	ultrasound imaging, deep learning	CNN (implied by ImageNet-pretrained models)	image	1,501张超声图像用于训练和验证，541名患者用于独立测试
1187	2025-07-05	U-Net benign prostatic hyperplasia-trained deep learning model for prostate ultrasound image segmentation in prostate cancer 2025-Jun-06, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-2024-2476 PMID:40606395	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的U-Net模型，用于前列腺超声图像分割，并验证其在良性前列腺增生（BPH）和前列腺癌（PCa）患者中的应用效果	首次证明基于BPH患者超声图像训练的深度学习模型可有效应用于PCa患者的前列腺分割	样本量相对较小，且仅使用了TRUS一种成像模态	开发并验证一种适用于前列腺癌诊断的前列腺超声图像自动分割方法	BPH和PCa患者的经直肠超声（TRUS）图像	数字病理	前列腺癌	深度学习	U-Net, LinkNet, PSPNet	超声图像	260例BPH患者（370张图像）和62例PCa患者（68张图像）
1188	2025-07-05	Stroke subtypes risk prediction and detection using retinal vascular structure and oxygen saturation analysis 2025-Jun-06, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-2024-2712 PMID:40606397	研究论文	本研究通过分析视网膜血管结构和氧饱和度，预测和检测中风亚型的风险	首次探索视网膜血管氧饱和度和结构在中风亚型中的差异，并利用机器学习和统计方法进行中风分类	样本量较小，缺血性和出血性中风患者分别只有29和23例	评估视网膜生物标志物在中风风险预测和分类中的潜在价值	缺血性和出血性中风患者以及健康对照者	数字病理学	心血管疾病	视网膜图像分析	随机森林分类器	图像	29例缺血性中风患者、23例出血性中风患者和82例健康对照者
1189	2025-07-05	Can diffusion-based generated magnetic resonance images predict glioma methylation accurately? 2025-Jun-06, Quantitative imaging in medicine and surgery IF:2.9Q2 DOI:10.21037/qims-24-1688 PMID:40606391	研究论文	本研究开发了一种基于扩散的生成模型，用于从加速的T1加权扫描中重建高质量的MRI序列，同时保留对胶质瘤诊断和MGMT预测至关重要的病理特征	提出了一种基于扩散的生成模型，能够在加速扫描条件下重建高质量的MRI图像，并保持病理细节和诊断特征	研究为回顾性研究，未来需要评估其临床应用效果	开发能够从加速T1加权扫描中重建高质量MRI序列的生成模型，以保留对胶质瘤诊断和MGMT预测至关重要的病理特征	胶质瘤患者的MRI图像	数字病理学	胶质瘤	扩散模型	扩散模型	MRI图像	1,480例（训练集785例，验证集695例）
1190	2025-07-05	READRetro web: A user-friendly platform for predicting plant natural product biosynthesis 2025-Jun-02, Molecules and cells IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.mocell.2025.100235 PMID:40466944	研究论文	介绍了一个用户友好的网络平台READRetro web，用于预测植物天然产物的生物合成路径	开发了一个基于现代网络技术的用户友好平台，使不具备深厚计算背景的研究者也能轻松使用深度学习模型进行逆合成预测	未提及平台在处理特定复杂天然产物时的预测准确性或局限性	促进天然产物的生物合成路径设计和药物发现	植物天然产物及其生物合成路径	机器学习	NA	深度学习	READRetro ML模型	化学结构数据	NA
1191	2025-04-03	Deep Learning Unlocks the Prognostic Importance of Thoracic Aortic Calcification 2025-Jun, AJR. American journal of roentgenology DOI:10.2214/AJR.25.33012 PMID:40172167	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1192	2025-07-05	Diagnostic performance of deep learning models in classifying mandibular third molar and mandibular canal contact status on panoramic radiographs: A systematic review and meta-analysis 2025-Jun, Imaging science in dentistry IF:1.7Q3 DOI:10.5624/isd.20240239 PMID:40607067	系统综述与荟萃分析	本文通过系统综述和荟萃分析评估了深度学习模型在全景X光片上分类下颌第三磨牙与下颌管接触状态的诊断性能	首次对深度学习模型在该特定诊断任务中的性能进行了系统评价，并识别了影响模型性能的关键因素	研究间存在高度异质性，患者选择标准不明确	评估深度学习模型在全景X光片上识别下颌第三磨牙与下颌管接触的诊断准确性	下颌第三磨牙与下颌管的接触状态	数字病理学	口腔疾病	深度学习	CNN（包括VGG-16、AlexNet等架构）	医学影像（全景X光片）	7项研究共4,955张全景X光片
1193	2025-07-05	Automated quality evaluation of dental panoramic radiographs using deep learning 2025-Jun, Imaging science in dentistry IF:1.7Q3 DOI:10.5624/isd.20240232 PMID:40607073	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的模型，用于自动评估牙科全景X光片的质量	首次使用YOLOv8模型对牙科全景X光片的多项质量指标进行自动化评估	模型在某些质量指标上的准确率仍有提升空间，如覆盖区域评估准确率为74.1%	开发自动化工具以提高牙科全景X光片质量评估的效率和一致性	牙科全景X光片	计算机视觉	NA	深度学习	YOLOv8	图像	1000张全景X光片
1194	2025-07-05	Single-shot reconstruction of three-dimensional morphology of biological cells in digital holographic microscopy using a physics-driven neural network 2025-May-24, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-60200-x PMID:40413181	research paper	提出了一种名为MorpHoloNet的深度学习模型，用于从单次拍摄的全息图中重建生物细胞的三维形态	通过整合物理驱动和基于坐标的神经网络，MorpHoloNet能够直接从单次拍摄的全息图中重建三维复杂光场和三维形态，无需多次相移全息图或角度扫描	NA	改进数字同轴全息显微镜（DIHM）中生物细胞的三维形态重建技术	生物细胞	digital pathology	NA	digital in-line holographic microscopy (DIHM)	physics-driven neural network, coordinate-based neural network	holograms	NA
1195	2025-07-05	Relevance of choroid plexus volumes in multiple sclerosis 2025-May-08, Fluids and barriers of the CNS IF:5.9Q1 DOI:10.1186/s12987-025-00656-7 PMID:40340923	研究论文	本研究探讨了脉络丛体积在多发性硬化症（MS）中的相关性及其与脑室周围组织损伤的关系	使用新型深度学习分割方法评估脉络丛体积，并揭示了其在复发缓解型多发性硬化症（RRMS）和原发性进展型多发性硬化症（PPMS）中的不同表现	研究为横断面设计，无法确定因果关系；样本量相对有限	阐明脉络丛在多发性硬化症神经炎症中的作用及其与脑室周围组织损伤的关系	复发缓解型多发性硬化症（RRMS）和原发性进展型多发性硬化症（PPMS）患者及健康对照	数字病理学	多发性硬化症	结构MRI和深度学习分割方法	深度学习	MRI图像	141名RRMS患者、64名PPMS患者和75名健康对照
1196	2025-07-05	Deep learning approaches for classification tasks in medical X-ray, MRI, and ultrasound images: a scoping review 2025-May-07, BMC medical imaging IF:2.9Q2 DOI:10.1186/s12880-025-01701-5 PMID:40335965	综述	本文探讨了深度学习在医学X射线、MRI和超声图像分类任务中的应用	总结了深度学习模型在医学图像分类中的使用情况、达到的准确率以及模型架构的细节	讨论了当前方法的局限性并提出了医学图像分类的未来方向	探索深度学习如何用于分类通过X射线、MRI或超声图像诊断的各种疾病	医学X射线、MRI和超声图像	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	NA
1197	2025-07-05	Using interpretable deep learning radiomics model to diagnose and predict progression of early AD disease spectrum: a preliminary [18F]FDG PET study 2025-May, European radiology IF:4.7Q1 DOI:10.1007/s00330-024-11158-9 PMID:39477837	研究论文	本研究提出了一种基于[18F]FDG PET图像的可解释深度学习放射组学（IDLR）模型，用于诊断阿尔茨海默病（AD）的临床谱系并预测从轻度认知障碍（MCI）到AD的进展	提出的IDLR模型结合了放射组学和深度学习特征，增强了传统深度学习模型的可解释性，并提高了分类准确性	研究为初步结果，需要进一步验证	诊断阿尔茨海默病的临床谱系并预测从轻度认知障碍到AD的进展	1962名来自不同种族的受试者（包括ADNI的高加索人群和中国两家医院的亚洲人群）	数字病理学	阿尔茨海默病	[18F]FDG PET成像	可解释深度学习放射组学（IDLR）模型	图像	1962名受试者（高加索和亚洲人群）
1198	2025-07-05	Combination of deep learning reconstruction and quantification for dynamic contrast-enhanced (DCE) MRI 2025-Apr, Magnetic resonance imaging IF:2.1Q2 DOI:10.1016/j.mri.2024.110310 PMID:39710009	研究论文	本研究提出了一种结合深度学习重建和量化的端到端深度学习流程，用于快速定量动态对比增强（DCE）MRI	提出了一种名为DCE-Movienet的新型深度重建网络，与之前开发的DCE-Qnet深度量化网络结合，显著缩短了重建时间并提高了量化性能	研究仅在健康志愿者和一名宫颈癌患者中进行了验证，样本量较小	提高动态对比增强MRI在临床中的速度和量化鲁棒性	动态对比增强MRI数据	数字病理学	宫颈癌	动态对比增强MRI	DCE-Movienet, DCE-Qnet	4D MRI数据	健康志愿者和一名宫颈癌患者
1199	2025-07-05	TonguExpert: A Deep Learning-Based Algorithm Platform for Fine-Grained Extraction and Classification of Tongue Phenotypes 2025-Apr, Phenomics (Cham, Switzerland) DOI:10.1007/s43657-024-00210-9 PMID:40606562	研究论文	介绍了一个名为TonguExpert的深度学习平台，用于舌象的精细提取和分类	提出了一个集成先进技术的深度学习框架，用于舌象分割和表型提取，并发布了最大的公开舌象数据集	现有方法难以捕捉细微细节，且缺乏大型数据集阻碍了稳健和泛化模型的开发	推进自动化舌诊，促进更广泛的临床应用	舌象图像	计算机视觉	NA	深度学习	CNN	图像	5992张舌象图像
1200	2025-07-05	Facial identity recognition using StyleGAN3 inversion and improved tiny YOLOv7 model 2025-Mar-17, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-93096-0 PMID:40097614	研究论文	本文提出了一种基于StyleGAN3反演和改进的tiny YOLOv7模型的面部身份识别方法	提出了一种结合StyleGAN3反演和改进的tiny YOLOv7模型的一步式解决方案，用于面部属性操作和检测，实现了在少样本和传统场景下的面部身份识别	数据集中仅包含20个独特身份和38个面部属性，可能限制了模型的泛化能力	解决计算机视觉领域中面部身份识别的挑战性问题	面部属性和身份识别	计算机视觉	NA	StyleGAN3反演，深度学习	FIR-Tiny YOLOv7（改进的Tiny YOLOv7模型）	图像	11,560张图像，包含20个独特身份和38个面部属性