深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
12561	2024-12-15	Performance enhancement in hydroponic and soil compound prediction by deep learning techniques 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.2101 PMID:39669468	研究论文	本文提出了一种利用深度学习技术预测水培和土壤化合物动态的创新方法，以提高作物生产的可持续性和效率	本文创新性地利用深度学习技术预测水培和土壤化合物动态，采用迭代辅助增强母优化算法（IEMOA）获取权重特征，并通过多尺度特征融合卷积自编码器与门控循环单元（MS-CAGRU）网络进行预测	本文未提及具体的实验验证或实际应用效果，仅通过与传统模型的对比展示系统效能	开发数值模型以全面描述植物和土壤中化学物质的传输和反应，制定有效的缓解策略	水培和土壤化合物动态	机器学习	NA	深度学习	MS-CAGRU	数据	数据来自在线资源，具体样本量未提及
12562	2024-12-15	Demand prediction for urban air mobility using deep learning 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.1946 PMID:39669473	研究论文	本文研究了城市空中交通（UAM）需求预测问题，提出了一种基于深度学习的时间序列预测模型	本文首次使用Transformer模型进行UAM需求预测，并展示了其高性能	本文仅使用了单一的基准数据集，可能无法全面反映不同城市和地区的实际情况	探讨市场是否能够支持UAM的部署，并通过需求预测为决策者提供投资可行性和可行性分析	城市空中交通（UAM）的需求预测	机器学习	NA	深度学习	Transformer	时间序列数据	150,000条记录
12563	2024-12-15	A bigura-based real time sentiment analysis of new media 2024, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.2069 PMID:39669474	研究论文	本文提出了一种基于BiGura多层模型的实时情感检测技术，用于新媒体数据的情感分析	本文采用了深度学习技术，相较于传统的贝叶斯和KNN分类器，在情感分析中表现出显著优势，分类准确率分别提高了3.88%和4.33%	NA	实现更准确和实时的公众情感监测和舆论监控	新媒体数据中的文本和视频内容的情感分析	自然语言处理	NA	深度学习	BiGura	文本和视频	涉及不同病毒事件的案例，如加沙的入侵事件
12564	2024-12-15	LRMAHpan: a novel tool for multi-allelic HLA presentation prediction using Resnet-based and LSTM-based neural networks 2024, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2024.1478201 PMID:39669561	研究论文	本文介绍了一种名为LRMAHpan的新工具，用于使用基于Resnet和LSTM的神经网络进行多等位基因HLA呈递预测	LRMAHpan整合了LSTM网络和ResNet_CA网络，采用了一种新的pHLA编码方法，能够将新抗原预测任务集成到计算机视觉方法中，并有效捕捉结合信号	NA	开发一种能够准确预测多等位基因HLA呈递的工具，以促进新抗原疫苗设计	多等位基因HLA呈递预测和新抗原预测	计算机视觉	黑色素瘤	质谱数据	ResNet, LSTM	图像	转移性黑色素瘤患者队列
12565	2024-12-15	Integrative computational analyses implicate regulatory genomic elements contributing to spina bifida 2024, Genetics in medicine open DOI:10.1016/j.gimo.2024.101894 PMID:39669613	研究论文	本研究通过整合计算分析，揭示了与脊柱裂相关的调控基因组元件	本研究采用了一种无靶向的全基因组方法，结合深度学习优先框架，识别了与脊柱裂相关的罕见单核苷酸和拷贝数变异，并揭示了这些变异对基因表达和功能通路的影响	本研究主要集中在罕见变异和调控区域的分析，可能忽略了其他类型的遗传变异对脊柱裂的影响	旨在揭示脊柱裂病理生理学背后的全基因组调控特征	脊柱裂患者和健康对照组的基因组调控区域	基因组学	脊柱裂	深度学习	NA	基因组数据	脊柱裂患者和健康对照组的样本
12566	2024-12-15	Explainable light-weight deep learning pipeline for improved drought stress identification 2024, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2024.1476130 PMID:39670267	研究论文	本文提出了一种用于识别马铃薯作物干旱胁迫的可解释轻量级深度学习管道	创新点在于结合预训练网络与精心设计的自定义层，并集成了基于梯度的可视化技术（如Grad-CAM），增强了模型的可解释性	NA	旨在提高作物干旱胁迫的识别精度，并为实时农业应用提供可解释的深度学习模型	马铃薯作物的干旱胁迫	计算机视觉	NA	深度学习	DenseNet121	图像	NA
12567	2024-12-15	Enhancing diagnosis of Hirschsprung's disease using deep learning from histological sections of post pull-through specimens: preliminary results 2023-Nov-29, Pediatric surgery international IF:1.5Q3 DOI:10.1007/s00383-023-05590-z PMID:38019366	研究论文	本研究利用深度学习技术从回拉手术后的组织学切片中识别Hirschsprung病中的神经节细胞和肥大神经，以提高诊断准确性	首次使用AI技术基于U-net模型识别Hirschsprung病中的神经节细胞和肥大神经	研究样本量较小，且仅限于回拉手术后的组织学切片	开发一种基于人工智能的方法来提高Hirschsprung病的组织学诊断准确性	Hirschsprung病中的神经节细胞和肥大神经	数字病理学	Hirschsprung病	深度学习	U-net	图像	108个标注样本，数据增强后生成19,600张图像，最终用于训练和验证的图像为1945张
12568	2024-12-15	Shared computational principles for language processing in humans and deep language models 2022-03, Nature neuroscience IF:21.2Q1 DOI:10.1038/s41593-022-01026-4 PMID:35260860	研究论文	本文探讨了人类大脑与自回归深度语言模型在处理语言时共享的计算原则	本文首次提供了人类大脑与自回归深度语言模型在处理自然叙事时共享三个基本计算原则的实证证据	NA	研究人类大脑与自回归深度语言模型在语言处理中的计算原则	人类大脑和自回归深度语言模型	自然语言处理	NA	ECoG	自回归深度语言模型	文本	9名参与者
12569	2024-12-15	Multimodality Imaging and Artificial Intelligence for Tumor Characterization: Current Status and Future Perspective 2020-Nov, Seminars in nuclear medicine IF:4.6Q1 DOI:10.1053/j.semnuclmed.2020.07.003 PMID:33059823	研究论文	本文探讨了多模态影像与人工智能在肿瘤特征分析中的应用现状及未来展望	人工智能通过机器学习和深度学习，能够整合大量异质性数据进行分析，提供自动化和可重复的定量影像生物标志物	需要设定质量标准，包括影像采集的标准化、模型开发的透明性、验证和测试的高质量过程以及算法的更好可解释性	研究多模态影像与人工智能在肿瘤特征分析中的应用，以实现精准肿瘤学	肿瘤的特征分析和分子表达的非侵入性监测	计算机视觉	NA	机器学习，深度学习	NA	影像	NA
12570	2024-12-15	Nano-opto-electro-mechanical switches operated at CMOS-level voltages 2019-11-15, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.aay8645 PMID:31727832	研究论文	本文展示了在微米尺度的混合光子-等离子体结构中，利用光电机械效应在CMOS电压下实现光开关	本文首次展示了在CMOS电压下通过纳米级静电扰动实现快速光开关，并结合了光子和等离子体效应以最小化光学损耗	本文未详细讨论该技术的实际应用场景和大规模集成可能面临的挑战	探索在CMOS电压下实现光开关的技术，为集成光电子学提供新平台	微米尺度的混合光子-等离子体结构	NA	NA	光电机械效应	NA	NA	NA
12571	2024-12-14	Brain structural connectomic topology predicts medication response in youth with bipolar disorder: A randomized clinical trial 2025-Feb-15, Journal of affective disorders IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.jad.2024.11.061 PMID:39577502	研究论文	本研究探讨了大脑结构连接组拓扑结构在预测双相情感障碍青少年药物反应中的作用	首次研究了大脑结构连接组拓扑结构在预测双相情感障碍青少年药物反应中的价值，并提出了基于深度学习的预测模型	需要独立重复实验来验证初步发现	研究大脑结构连接组拓扑结构在预测双相情感障碍青少年药物反应中的作用	双相情感障碍青少年患者的大脑结构连接组拓扑结构	神经影像学	双相情感障碍	结构磁共振成像（MRI）	深度学习模型	图像	121名未接受过精神药物治疗的双相情感障碍I型青少年
12572	2024-12-14	A multi-perspective deep learning framework for enhancer characterization and identification 2025-Feb, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2024.108284 PMID:39577030	研究论文	本研究介绍了一种用于增强子特征化和识别的多视角深度学习框架MPDL-Enhancer	创新的双尺度深度神经网络和独特的特征表示策略	NA	准确识别和表征增强子，以理解基因调控网络及相关疾病的发展	增强子序列	机器学习	NA	dna2vec模型	双尺度深度神经网络	DNA序列	独立测试数据集
12573	2024-12-14	Investigating streetscape environmental characteristics associated with road traffic crashes using street view imagery and computer vision 2025-Feb, Accident; analysis and prevention DOI:10.1016/j.aap.2024.107851 PMID:39581057	研究论文	本研究利用街景图像和计算机视觉技术，结合语义分割和目标检测网络，分析了街道环境特征与道路交通事故之间的关系	本研究通过结合语义分割和目标检测网络，全面测量街道环境特征，克服了传统方法仅依赖语义分割的局限性	本研究主要基于百度街景图像，可能无法完全代表所有地区的街道环境特征	探讨街道环境特征与道路交通事故之间的关系，为提升道路安全提供依据	街道环境特征（如道路、人行道、建筑物等）与三种交通事故类型（车辆-车辆碰撞、车辆-行人碰撞、单车事故）	计算机视觉	NA	深度学习	语义分割网络和目标检测网络	图像	NA
12574	2024-12-14	IoT based healthcare system using fractional dung beetle optimization enabled deep learning for breast cancer classification 2025-Feb, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2024.108277 PMID:39586227	研究论文	本文提出了一种基于物联网的医疗系统，利用分数阶蜣螂优化算法支持的深度学习进行乳腺癌分类	创新点在于结合了物联网技术和分数阶蜣螂优化算法，通过SqueezeNet_Fractional Dung Beetle Optimization (Squeeze_FDBO)提高了乳腺癌分类的准确性和路由性能	NA	旨在提高乳腺癌分类的准确性，从而促进早期检测和治疗	乳腺癌的分类和诊断	计算机视觉	乳腺癌	分数阶蜣螂优化算法	SqueezeNet	图像	NA
12575	2024-12-14	VAEEG: Variational auto-encoder for extracting EEG representation 2024-Dec-15, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120946 PMID:39571641	研究论文	本文提出了一种基于变分自编码器（VAE）的EEG信号自监督学习模型VAEEG，用于提取脑活动的有用表示	VAEEG模型在EEG信号的重建性能上表现出色，并能有效提取与青少年脑发育、癫痫发作和睡眠阶段分类相关的潜在特征	NA	研究如何从复杂的EEG信号中提取更直观、简洁且有用的脑活动表示	EEG信号及其在青少年脑发育、癫痫发作和睡眠阶段分类中的应用	机器学习	NA	变分自编码器（VAE）	变分自编码器（VAE）	脑电图（EEG）信号	NA
12576	2024-12-14	Deep learning applied to the segmentation of rodent brain MRI data outperforms noisy ground truth on full-fledged brain atlases 2024-Dec-15, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120934 PMID:39577575	研究论文	本文研究了深度学习模型在啮齿动物脑部MRI数据分割中的应用，发现其性能优于基于噪声标签的全脑图谱	本文首次展示了深度学习模型在啮齿动物脑部MRI数据分割中的应用，能够处理不同动物品系和尺寸的变化，并提供了不确定性估计和可解释性机制	本文仅在啮齿动物脑部MRI数据上进行了验证，尚未在其他类型的脑部图像或其他物种上进行测试	研究深度学习模型在啮齿动物脑部MRI数据分割中的应用，以提高定量分析的准确性	啮齿动物脑部MRI图像的自动分割	计算机视觉	NA	MRI	U-Net, Attention-U-Net, DeepLab	图像	超过10,000张啮齿动物脑部MRI图像
12577	2024-12-14	Generative modeling of the Circle of Willis using 3D-StyleGAN 2024-Dec-15, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120936 PMID:39586344	研究论文	本文使用3D-StyleGAN生成Circle of Willis的Time-of-Flight磁共振血管成像（TOF MRA）数据，以解决医学数据稀缺问题	本文首次将StyleGANv2架构应用于3D，生成高质量且多样化的TOF MRA数据，并在下游任务中展示了其效用	本文未提及生成数据在其他病理数据集或不同医学成像模式中的应用效果	开发一种生成模型，用于合成Circle of Willis的3D TOF MRA数据，以提高深度学习模型在脑血管疾病诊断和治疗中的应用	Circle of Willis的脑血管结构	计算机视觉	脑血管疾病	3D-StyleGAN	StyleGANv2	图像	1782个TOF MRA扫描数据
12578	2024-12-14	Differentiating atypical parkinsonian syndromes with hyperbolic few-shot contrastive learning 2024-Dec-15, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120940 PMID:39586345	研究论文	本文提出了一种新的少样本学习框架，用于在有限的训练数据下区分多系统萎缩帕金森型（MSA-P）和进行性核上性麻痹（PSP）	本文引入了超曲面空间嵌入技术，通过识别非目标分类类别的铁积累模式特征区域，增强了模型的稳定性	本文的实验结果主要基于特定的数据集和模型，可能需要进一步验证其在其他数据集和场景中的泛化能力	解决在有限训练数据下区分非典型帕金森综合征（APS）中不同亚型的挑战	多系统萎缩帕金森型（MSA-P）和进行性核上性麻痹（PSP）	机器学习	神经退行性疾病	少样本学习	对比学习	图像	少量数据样本
12579	2024-12-14	Endomicroscopic AI-driven morphochemical imaging and fs-laser ablation for selective tumor identification and selective tissue removal 2024-Dec-13, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.ado9721 PMID:39661684	研究论文	本文研究了利用多模态非线性光学显微镜结合深度学习技术进行头颈部肿瘤的早期检测和选择性组织切除	本文创新性地将多模态非线性光学显微镜与深度学习相结合，实现了无标记的组织形态化学成分评估，并首次将飞秒激光消融技术集成到内窥镜中，实现了术中“寻找并治疗”的先进手术方法	本文为临床前研究，样本量较小，且未在临床环境中验证	开发一种用于头颈部肿瘤早期检测和选择性组织切除的新型诊断和治疗技术	头颈部肿瘤的早期检测和选择性组织切除	数字病理学	头颈部癌症	多模态非线性光学显微镜（CARS、TPEF、SHG）、飞秒激光消融	深度学习语义分割模型	图像	15名患者
12580	2024-12-14	Development of Periapical Index Score Classification System in Periapical Radiographs Using Deep Learning 2024-Dec-13, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-024-01360-y PMID:39671050	研究论文	本研究开发并比较了用于牙周指数评分系统的二分类方法，以提高牙周炎早期阶段的评分准确性	提出了将牙周指数评分1和2归为同一类别的健康-疾病分类方法，显著提高了分类准确性	研究仅使用了三种卷积神经网络模型，未来可以探索更多模型以进一步提高准确性	开发和验证基于深度学习的牙周指数评分系统，以提高牙周炎早期阶段的评分准确性	牙周指数评分系统在牙周炎早期阶段的分类准确性	计算机视觉	牙周炎	卷积神经网络	CNN	图像	2266个牙周根区域来自520张牙周X光片