深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1241	2025-06-01	Next-generation fall detection: harnessing human pose estimation and transformer technology 2025, Health systems (Basingstoke, England) DOI:10.1080/20476965.2024.2395574 PMID:40438315	research paper	该研究结合人体姿态估计框架和transformer深度学习模型，开发了一种轻量级、保护隐私的跌倒检测系统	结合三种领先的人体姿态估计框架和transformer模型，开发出可在低功耗设备上运行、无需穿戴设备且所有处理均在本地完成的隐私保护跌倒检测系统	未提及系统在极端光照条件或复杂背景环境下的表现	开发高精度、高效且保护隐私的老年人跌倒检测系统	老年人跌倒行为	computer vision	geriatric disease	human pose estimation, transformer deep learning	transformer	video	未提及具体样本数量，但进行了真实世界测试
1242	2025-06-01	Knowledge map of artificial intelligence in neurodegenerative diseases: a decade-long bibliometric and visualization study 2025, Frontiers in aging neuroscience IF:4.1Q2 DOI:10.3389/fnagi.2025.1586282 PMID:40438502	研究论文	通过文献计量和可视化方法分析过去十年神经退行性疾病领域AI研究的文献，挖掘该领域的核心期刊、机构、作者和国家，并分析关键词以推测未来研究趋势	首次使用文献计量和可视化方法系统分析神经退行性疾病AI研究领域的知识图谱，并预测未来四大研究趋势	仅基于Web of Science数据库的1921篇文献进行分析，可能未涵盖所有相关研究	分析神经退行性疾病领域AI研究的现状和发展趋势	2015-2025年间神经退行性疾病AI研究领域的1921篇文献	机器学习	神经退行性疾病	文献计量分析、知识图谱可视化	NA	文献数据	1921篇出版物
1243	2025-06-01	Comparative analysis of multi-zone peritumoral radiomics in breast cancer for predicting NAC response using ABVS-based deep learning models 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1586715 PMID:40438687	research paper	本研究通过基于ABVS的深度学习模型，比较分析乳腺癌多区域瘤周放射组学特征，以预测新辅助化疗（NAC）反应	首次系统比较不同瘤周厚度区域对NAC反应预测的准确性，并开发了结合瘤内和瘤周特征的AI模型	研究为回顾性分析，样本量相对有限（402例患者）	建立可临床实施的框架，通过标准化预测模型早期识别NAC无反应者	乳腺癌患者	digital pathology	breast cancer	Automated Breast Volume Scanning (ABVS), radiomics	TabNet	image	402例乳腺癌患者
1244	2025-06-01	MRI-based 2.5D deep learning radiomics nomogram for the differentiation of benign versus malignant vertebral compression fractures 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1603672 PMID:40438697	research paper	该研究开发并验证了一种基于MRI的列线图，结合临床和深度学习放射组学特征，用于区分良性与恶性椎体压缩性骨折	新颖的2.5D深度学习框架和全面的特征融合策略，显著提高了诊断准确性	研究为回顾性队列研究，样本量相对较小（234例患者）	区分良性与恶性椎体压缩性骨折	234例椎体压缩性骨折患者	digital pathology	椎体压缩性骨折	MRI, 深度学习放射组学	ResNet50, ExtraTrees	MRI图像	234例患者（训练集与测试集比例为7:3）
1245	2025-06-01	Reducing annotation effort in agricultural data: simple and fast unsupervised coreset selection with DINOv2 and K-means 2025, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2025.1546756 PMID:40438735	research paper	该研究提出了一种结合DINOv2和K-means的无监督核心集选择方法，以减少农业数据标注的工作量	结合了最新的基础模型DINOv2作为特征选择器与K-means聚类方法，提出了一种简单有效的核心集选择方法	未提及方法在大规模数据集上的扩展性或计算效率	减少农业应用中深度学习模型训练所需的标注数据量	农业数据	machine learning	NA	DINOv2, K-means	multiclass classification model	image	在两个不同数据集上进行了验证，具体样本量未提及
1246	2025-06-01	Deep learning-based anomaly detection for precision field crop protection 2025, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2025.1576756 PMID:40438741	research paper	提出了一种结合IMSFNet和AROS的新型框架，用于精准农业中的异常检测和资源优化	整合了多模态数据融合和时空建模的IMSFNet，以及基于实时环境反馈的AROS资源优化策略	未提及具体实验样本量和跨地区应用的普适性验证	优化精准农业中的作物保护和资源利用效率	农田作物健康异常（病虫害爆发、疾病传播、营养缺乏等）	精准农业	NA	多模态数据融合（无人机、卫星、地面传感器、气象站数据）	IMSFNet（集成多模态智能农业网络）	多源时空数据	NA
1247	2025-06-01	Optimizing drug synergy prediction through categorical embeddings in deep neural networks 2025, Biology methods & protocols IF:2.5Q3 DOI:10.1093/biomethods/bpaf033 PMID:40438791	研究论文	本文研究了在深度神经网络中使用分类嵌入来优化药物协同预测	利用分类嵌入捕捉类别元素间的相似性，特别是在数据稀缺情况下表现出优势	未提及具体的数据集规模或模型验证的局限性	提高药物协同作用的预测准确性	药物组合的协同作用	机器学习	癌症	深度神经网络	DNN	药物组合数据	NA
1248	2025-06-01	High resolution kinematic approach for quantifying impaired mobility of dystrophic zebrafish larvae 2024-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.12.05.627004 PMID:39713379	research paper	该研究开发了一种高分辨率运动学方法来量化营养不良斑马鱼幼虫的运动障碍	使用高速摄像技术和基于深度学习的无标记运动捕捉技术，开发了幼虫逃逸反应游泳的链接段模型	NA	评估营养不良斑马鱼幼虫的运动障碍，为早期治疗开发提供精确的生物标志物	营养不良斑马鱼幼虫	digital pathology	Duchenne muscular dystrophy	high speed videography, deep learning-based markerless motion capture	random forest, support vector machine	video	NA
1249	2025-06-01	sChemNET: a deep learning framework for predicting small molecules targeting microRNA function 2024-10-23, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-49813-w PMID:39443444	研究论文	本文介绍了一个名为sChemNET的深度学习框架，用于预测影响miRNA生物活性的小分子	sChemNET通过一个目标函数克服了稀疏化学信息的限制，使神经网络能够从大量未知影响miRNA的化学结构中学习化学空间	小分子-miRNA数据集规模较小	预测与miRNA相关的小分子，以调节与疾病相关的失调细胞过程	小分子和miRNA	机器学习	癌症	深度学习	神经网络	化学结构和序列信息	实验验证了针对miR-451或其靶点的小分子，并在斑马鱼胚胎发生期间测试了它们在红细胞成熟中的作用
1250	2025-06-01	Putting proteins in context 2024-Oct-16, Cell systems IF:9.0Q1 DOI:10.1016/j.cels.2024.09.009 PMID:39418999	研究论文	本文介绍了一种名为PINNACLE的几何深度学习方法，用于生成蛋白质的上下文表示	通过结合蛋白质相互作用和多器官单细胞转录组学分析，生成具有生物或环境背景的蛋白质表示	NA	解决蛋白质表示缺乏生物或环境背景的问题	蛋白质	机器学习	NA	单细胞转录组学	几何深度学习	蛋白质相互作用数据和单细胞转录组数据	NA
1251	2025-06-01	Integrating Deep Learning and Synthetic Biology: A Co-Design Approach for Enhancing Gene Expression via N-Terminal Coding Sequences 2024-09-20, ACS synthetic biology IF:3.7Q1 DOI:10.1021/acssynbio.4c00371 PMID:39229974	research paper	该论文介绍了一种结合深度学习和合成生物学的共设计方法，用于通过N端编码序列（NCS）优化基因表达	提出了一种深度学习和合成生物学共设计的少样本训练工作流程，显著提高了基因表达优化效率	需要进一步验证该方法在其他基因表达优化中的普适性	优化N端编码序列（NCS）以最大化基因表达	绿色荧光蛋白（GFP）和N-乙酰神经氨酸	synthetic biology	NA	deep learning, word2vec, attention mechanisms, time-series network	time-series network	genetic sequence data	六次迭代实验
1252	2025-06-01	Automated deep learning segmentation of neuritic plaques and neurofibrillary tangles in Alzheimer disease brain sections using a proprietary software 2024-Sep-01, Journal of neuropathology and experimental neurology IF:3.2Q2 DOI:10.1093/jnen/nlae048 PMID:38812098	研究论文	开发了一种深度学习工作流程，用于自动注释和分割阿尔茨海默病脑切片中的神经炎性斑块和神经纤维缠结	利用专有图像分析软件（Visiopharm）进行自动深度学习分割，显著提高了复杂神经病理特征的注释质量	研究仅分析了15张全切片图像，样本量较小	提高阿尔茨海默病神经病理特征的自动注释和分割精度	阿尔茨海默病脑切片中的神经炎性斑块和神经纤维缠结	数字病理学	阿尔茨海默病	深度学习	U-Net卷积神经网络	图像	15张全切片图像，来自4个生物库
1253	2025-06-01	Deep learning in the diagnosis for cystic lesions of the jaws: a review of recent progress 2024-06-28, Dento maxillo facial radiology DOI:10.1093/dmfr/twae022 PMID:38814810	综述	本文回顾了深度学习在颌骨囊性病变诊断中的最新进展	总结了深度学习在颌骨囊性病变诊断中的应用及其优于临床医生的判别性能	模型可解释性不足、缺乏多中心数据验证等问题限制了其临床应用	研究深度学习在颌骨囊性病变诊断中的性能	颌骨囊性病变	数字病理学	颌骨囊性病变	深度学习	DL	牙科放射影像	44项研究（初始搜索1862篇）
1254	2025-06-01	Deep learning with noisy labels in medical prediction problems: a scoping review 2024-Jun-20, Journal of the American Medical Informatics Association : JAMIA IF:4.7Q1 DOI:10.1093/jamia/ocae108 PMID:38814164	scoping review	本文对深度学习在医学预测问题中处理噪声标签的研究进行了全面的范围综述	全面综述了医学预测问题中噪声标签的管理方法，包括噪声检测、处理及评估	仅涵盖了2016年至2023年的60篇论文，可能未完全覆盖所有相关研究	探讨医学研究中噪声标签的来源、影响、检测及处理方法	医学预测问题中的噪声标签	machine learning	NA	深度学习	NA	NA	60篇论文
1255	2025-06-01	Disentangling developmental effects of play aspects in rat rough-and-tumble play 2024-05, Biology letters IF:2.8Q2 DOI:10.1098/rsbl.2024.0037 PMID:38808945	research paper	本研究探讨了大鼠粗野游戏中运动和社交方面对发育的不同影响	通过选择性减少大鼠粗野游戏中的运动或社交方面，揭示了不同游戏方面对发育影响的特异性	研究仅针对雄性大鼠，结果可能不适用于雌性或其他物种	理解动物游戏中不同方面对发育的具体贡献	发育中的雄性大鼠	动物行为学	NA	深度学习框架	NA	超声波发声(USVs)	NA
1256	2025-06-01	Segment anything with inception module for automated segmentation of endometrium in ultrasound images 2024-May, Journal of medical imaging (Bellingham, Wash.) DOI:10.1117/1.JMI.11.3.034504 PMID:38827779	research paper	该论文提出了一种名为SAIM的模型，专门用于超声图像中子宫内膜结构的自动分割	SAIM模型是对segment anything模型的专门改进，通过增强图像编码器结构和集成点提示来引导分割过程	NA	提高超声图像中子宫内膜分割的准确性和效率，以支持妇科诊断和治疗计划	超声图像中的子宫内膜结构	computer vision	妇科疾病	深度学习	SAIM (Segment Anything with Inception Module)	超声图像	接受宫腔镜手术的妇科患者的超声图像
1257	2025-06-01	Quantifying lung fissure integrity using a three-dimensional patch-based convolutional neural network on CT images for emphysema treatment planning 2024-May, Journal of medical imaging (Bellingham, Wash.) DOI:10.1117/1.JMI.11.3.034502 PMID:38817711	research paper	该研究提出了一种基于三维补丁的卷积神经网络（CNN）的深度学习方法，用于在CT图像上分割肺裂并定量评估肺裂完整性，以帮助肺气肿患者的治疗规划	使用三维补丁基础的CNN和nnU-Net配置来分割肺裂，并定量计算肺裂完整性评分（FIS），为肺气肿患者的EBV治疗提供辅助	测试集中不同肺裂的预测FIS与参考FIS之间的绝对百分比误差存在差异，尤其是右水平裂（RHF）的误差较大	评估肺气肿患者的肺裂完整性，以确定是否适合进行支气管内阀（EBV）治疗	严重肺气肿患者的CT扫描图像	digital pathology	lung cancer	CT扫描	CNN, nnU-Net	image	129例CT扫描（86例用于训练，43例用于测试）
1258	2025-05-31	MedScale-Former: Self-guided multiscale transformer for medical image segmentation 2025-Jul, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2025.103554 PMID:40209553	研究论文	提出了一种名为MedScale-Former的双分支Transformer网络，用于医学图像分割，通过自监督学习和多尺度策略提高分割准确性	引入了双分支Transformer网络，结合自监督学习和多尺度策略，提出选择性核区域注意力模块以增强对象边界定义	需要进一步验证在不同医学图像数据集上的泛化能力	提高医学图像分割的准确性，减少对大量标注数据的依赖	医学图像（皮肤病变、肺器官、多发性骨髓瘤浆细胞）	数字病理	皮肤病变、肺器官疾病、多发性骨髓瘤	自监督学习、多尺度Transformer	Transformer	医学图像	NA
1259	2025-05-31	Virtual lung screening trial (VLST): An in silico study inspired by the national lung screening trial for lung cancer detection 2025-Jul, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2025.103576 PMID:40209556	研究论文	本文介绍了一项名为虚拟肺部筛查试验（VLST）的计算机模拟研究，旨在通过模拟临床试验的关键元素来评估CT和胸部X光在肺癌筛查中的诊断性能	利用虚拟成像试验（VITs）模拟临床试验，减少实际试验的成本和伦理风险，并展示了深度学习模型作为虚拟阅读器的应用	研究基于模拟数据，可能无法完全反映真实临床环境的复杂性	评估虚拟成像试验平台在模拟主要临床试验（如NLST）关键元素方面的潜力，比较CT和胸部X光在肺癌筛查中的诊断性能	虚拟患者队列（294名受试者）及其模拟的癌性肺结节	数字病理	肺癌	计算机断层扫描（CT）、胸部X光（CXR）	深度学习模型（AI CT-Reader和AI CXR-Reader）	图像	294名虚拟受试者
1260	2025-05-31	Bi-variational physics-informed operator network for fractional flow reserve curve assessment from coronary angiography 2025-Jul, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2025.103564 PMID:40245779	研究论文	本文提出了一种基于双变分物理信息神经算子（BVPINO）的方法，用于从冠状动脉造影中评估分数流储备（FFR）曲线	结合变分机制指导基函数学习和残差评估，实现了FFR曲线评估在准确性和效率之间的最优平衡	未明确提及具体局限性	开发一种高效准确的方法，用于从冠状动脉造影中评估FFR曲线	冠状动脉造影图像及FFR曲线	数字病理学	心血管疾病	双变分物理信息神经算子（BVPINO）	神经算子	图像	184名受试者的215条血管的冠状动脉造影数据