深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
12601	2025-10-07	Conotoxins: Classification, Prediction, and Future Directions in Bioinformatics 2025-Feb-09, Toxins IF:3.9Q1 DOI:10.3390/toxins17020078 PMID:39998095	综述	本文探讨机器学习与深度学习在芋螺毒素分类、预测和生物信息学研究中的应用进展	系统比较了关键数据库、特征提取技术和分类模型，并提出整合多模态数据和改进预测框架的未来方向	NA	推动芋螺毒素的计算分类、功能预测和新型肽设计研究	芋螺毒素（来自芋螺毒液的二硫键丰富肽类家族）	生物信息学	NA	机器学习，深度学习	NA	序列数据，多模态数据	NA	NA	NA	NA	NA
12602	2025-10-07	A Novel Deep Learning-Based (3D U-Net Model) Automated Pulmonary Nodule Detection Tool for CT Imaging 2025-Feb-08, Current oncology (Toronto, Ont.) DOI:10.3390/curroncol32020095 PMID:39996895	研究论文	开发基于3D U-Net的深度学习算法，用于CT影像中肺结节的自动检测	提出新型3D U-Net模型用于肺结节自动检测，并在多机构数据集上进行验证	NA	开发辅助放射科医生进行肺结节检测的自动化工具	CT扫描中的肺结节	计算机视觉	肺癌	CT成像	3D U-Net	CT影像	491次扫描，包含5669个经放射科医生标注的肺结节	NA	3D U-Net	灵敏度, 假阳性率, FROC曲线, CPM分数, 特异性	NA
12603	2025-10-07	Retinal Arteriovenous Information Improves the Prediction Accuracy of Deep Learning-Based baPWV Index From Color Fundus Photographs 2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1 DOI:10.1167/iovs.66.2.63 PMID:39998460	研究论文	本研究通过深度学习模型从彩色眼底照片预测肱踝脉搏波传导速度，并验证视网膜动静脉信息对预测准确性的提升效果	首次将视网膜动静脉概率图作为通道注意力机制应用于baPWV预测，基于改进的深度U-net架构HURVS模型自动提取血管分割信息	回顾性研究设计，样本量相对有限（696名参与者），未进行外部验证	比较不同深度学习模型从彩色眼底照片预测baPWV的准确性	696名接受健康检查的参与者，收集其baPWV测量值和彩色眼底照片	计算机视觉	心血管疾病	彩色眼底摄影，视网膜血管分割	U-net, 深度卷积神经网络	图像	696名参与者	NA	深度U-net, HURVS模型	相关系数R	NA
12604	2025-05-11	Automated Detection of Retinal Detachment Using Deep Learning-Based Segmentation on Ocular Ultrasonography Images 2025-Feb-03, Translational vision science & technology IF:2.6Q2 DOI:10.1167/tvst.14.2.26 PMID:40014336	research paper	开发了一种基于深度学习的自动化流程，用于从B型眼超声图像中检测视网膜脱离	提出了一种结合编码器-解码器分割网络和机器学习分类器的计算流程，显著提高了视网膜脱离的检测性能	样本量相对较小，仅包含279张B型眼超声图像	提高视网膜脱离在B型眼超声图像中的自动化检测准确率	B型眼超声图像中的视网膜脱离	digital pathology	retinal detachment	deep learning-based segmentation	encoder-decoder segmentation network, ResNet-50, MobileNetV3, UNet	image	279张B型眼超声图像（来自204名患者，包括66张视网膜脱离图像、36张后玻璃体脱离图像和177张健康对照图像）	NA	NA	NA	NA
12605	2025-10-07	Biomechanical Risk Classification in Repetitive Lifting Using Multi-Sensor Electromyography Data, Revised National Institute for Occupational Safety and Health Lifting Equation, and Deep Learning 2025-Feb-01, Biosensors DOI:10.3390/bios15020084 PMID:39996986	研究论文	本研究结合多传感器肌电数据、修订版NIOSH举重方程和深度学习技术，开发了重复举重任务中的生物力学风险分类系统	首次将可穿戴EMG传感器与深度学习模型相结合，实现精确、实时的动态风险评估	样本量相对较小（25名参与者），研究环境为受控实验室条件	开发准确的生物力学风险评估方法以改善职业安全	重复举重任务中的肌肉活动和风险水平	机器学习	职业性肌肉骨骼疾病	肌电图（EMG），修订版NIOSH举重方程（RNLE）	CNN, MLP, LSTM	时间序列EMG数据	25名参与者，超过700万个数据点	NA	卷积神经网络，多层感知机，长短期记忆网络	精确度，召回率	NA
12606	2025-10-07	Automated CT Measurement of Total Kidney Volume for Predicting Renal Function Decline after 177Lu Prostate-specific Membrane Antigen-I&T Radioligand Therapy 2025-Feb, Radiology IF:12.1Q1 DOI:10.1148/radiol.240427 PMID:39998377	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的自动CT肾脏体积测量方法，用于预测前列腺癌患者在接受177Lu-PSMA-I&T放射性配体治疗后肾功能下降的风险	首次将基于nnU-Net框架的深度学习模型TotalSegmentator应用于标准护理CT图像的自动肾脏体积测量，并证明其在预测肾功能恶化方面优于传统参数	回顾性研究设计，样本量相对有限（121例患者），仅包含接受至少4个治疗周期的患者	识别接受Lu-PSMA-I&T放射性配体治疗患者肾功能显著恶化的预测标志物	转移性去势抵抗性前列腺癌患者	数字病理	前列腺癌	CT成像，深度学习分割	深度学习	CT图像	121例患者（平均年龄76±7岁）	nnU-Net	TotalSegmentator	AUC, 敏感性, 特异性	NA
12607	2025-10-07	[Research Progress and Prospects of Minimally Invasive Surgical Instrument Segmentation Methods Based on Artificial Intelligence] 2025-Jan-30, Zhongguo yi liao qi xie za zhi = Chinese journal of medical instrumentation DOI:10.12455/j.issn.1671-7104.240436 PMID:39993977	综述	本文系统综述了基于人工智能的微创手术器械分割方法的研究进展与发展前景	深入分析了基于Segment Anything Model的方法，并对训练算法监督方法、网络结构改进和注意力机制进行了系统总结	NA	总结微创手术器械分割技术的研究现状并展望未来发展	微创手术器械分割方法	计算机视觉	NA	深度学习	NA	内窥镜图像，手术视频	NA	NA	Segment Anything Model	NA	NA
12608	2025-10-07	Impact of Deep Learning 3D CT Super-Resolution on AI-Based Pulmonary Nodule Characterization 2025-Jan-27, Tomography (Ann Arbor, Mich.) DOI:10.3390/tomography11020013 PMID:39997996	研究论文	本研究提出基于深度学习的超分辨率技术，将厚层CT图像转换为薄层CT图像，以提高肺结节表征的准确性	首次将深度学习超分辨率技术应用于CT图像层厚优化，显著提升AI肺结节分类准确率	未说明研究样本的具体来源和多样性，缺乏多中心验证	提高肺结节体积测量和分类的准确性	肺结节	计算机视觉	肺癌	CT成像	深度学习	CT图像	NA	NA	超分辨率网络	分类准确率	NA
12609	2025-10-07	Improving spleen segmentation in ultrasound images using a hybrid deep learning framework 2025-01-11, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-85632-9 PMID:39799236	研究论文	提出一种用于超声图像脾脏分割的混合深度学习框架	首次提出结合SegFormer和Pix2Pix的两阶段训练方法，并创建了该领域首个脾脏超声图像数据集Spleenex	NA	改进超声图像中的脾脏分割精度	脾脏超声图像	计算机视觉	NA	超声成像	CNN, GAN	图像	450张脾脏超声图像	NA	SegFormerB0, Pix2Pix	mIoU, mDice, MPLE	NA
12610	2025-10-07	Advanced deep learning algorithms in oral cancer detection: Techniques and applications 2025, Journal of environmental science and health. Part C, Toxicology and carcinogenesis DOI:10.1080/26896583.2024.2445957 PMID:39819195	综述	本文全面分析了基于人工智能的口腔癌检测方法，重点关注深度学习模型和图像处理技术	提供了对最新AI方法在口腔癌检测中的综合分析，包括卷积神经网络等深度学习模型	NA	推进口腔癌的早期诊断，改善患者预后并减轻医疗系统负担	口腔癌检测方法和技术	计算机视觉	口腔癌	图像预处理，图像分割，特征提取	CNN	医学图像	NA	NA	卷积神经网络	分类准确率	NA
12611	2025-10-07	Ventilator pressure prediction employing voting regressor with time series data of patient breaths 2025 Jan-Mar, Health informatics journal IF:2.2Q3 DOI:10.1177/14604582241295912 PMID:39988551	研究论文	提出一种基于投票回归器的混合呼吸机压力预测方法，用于精确预测患者呼吸过程中的呼吸机压力	开发了新型混合呼吸机压力预测器（H-VPP），通过分析肺部属性R和C在初始时间步的高值对呼吸机压力的影响	NA	预测呼吸机呼吸回路中的气道压力	COVID-19患者呼吸过程中的呼吸机压力数据	机器学习	COVID-19	时间序列数据分析	投票回归器	时间序列数据	NA	NA	混合呼吸机压力预测器（H-VPP）	R平方, 平均绝对误差, 均方误差	NA
12612	2025-10-07	Evaluation of stroke sequelae and rehabilitation effect on brain tumor by neuroimaging technique: A comparative study 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0317193 PMID:39992898	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的SWI-BITR-UNet模型，用于脑卒中后遗症评估和脑肿瘤康复效果的神经影像分析	结合SWIN Transformer的局部感受野和移位机制与U-Net架构的有效特征融合策略，专门针对3D医学影像数据设计	未提及具体样本量大小和外部验证结果	提高脑损伤区域在多模态MRI扫描中的分割精度，改善脑卒中后遗症评估和康复效果监测	脑卒中损伤区域和脑肿瘤区域	医学影像分析	脑卒中,脑肿瘤	多模态MRI扫描,神经影像技术	CNN,Transformer,U-Net	3D医学影像	NA	NA	SWI-BITR-UNet,3D CNN编码器-解码器,SWIN Transformer,U-Net	召回率,精确率,F1分数,Kappa系数,平均交并比,ROC-AUC,豪斯多夫距离,DICE系数	NA
12613	2025-10-07	Optimizing Bi-LSTM networks for improved lung cancer detection accuracy 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0316136 PMID:39992919	研究论文	本研究比较了传统手工特征和深度学习Bi-LSTM网络在肺癌检测中的性能	结合手工特征提取与优化的双向长短期记忆网络(Bi-LSTM)进行肺癌检测，在准确率和AUC指标上均取得优异表现	未提及具体数据集规模和多样性限制	提高肺癌检测准确率，改进计算机辅助诊断系统	肺癌医学图像	计算机视觉	肺癌	医学图像分析	Bi-LSTM, SVM	医学图像	NA	NA	Bidirectional Long Short-Term Memory	准确率, AUC	NA
12614	2025-10-07	Trustworthy diagnosis of Electrocardiography signals based on out-of-distribution detection 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0317900 PMID:39999066	研究论文	提出一种基于分布外检测的心电图信号可信诊断方法	结合CNN和注意力机制增强特征提取，并采用Energy和ReAct技术识别分布外心脏病	NA	提高心电图诊断的可靠性，特别是对未知类型心脏病的识别能力	心电图信号	机器学习	心血管疾病	心电图信号分析	CNN, Attention机制	心电图信号	MIT-BIH心律失常数据库和INCART 12导联心律失常数据库	NA	CNN结合注意力机制	灵敏度, 特异性	NA
12615	2025-10-07	Author name disambiguation based on heterogeneous graph neural network 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0310992 PMID:40009590	研究论文	提出基于异构图注意力神经网络的作者姓名消歧方法，通过改进特征表示和聚类算法提升消歧性能	提出结合关系图异质注意力神经网络的作者消歧方法，引入多重注意力机制改进节点交互学习，并优化传统层次聚类算法	未明确说明方法在其他数据集上的泛化能力，实验仅基于Aminer数据集进行验证	解决学术论文作者姓名消歧问题，准确将新发表论文分配给对应作者	学术论文作者及其发表文献	自然语言处理	NA	图神经网络，注意力机制	GNN, 注意力神经网络	文本数据，图结构数据	Aminer数据集	NA	关系图异质注意力神经网络，图卷积嵌入模块	F1-score	NA
12616	2025-10-07	Untrained perceptual loss for image denoising of line-like structures in MR images 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0318992 PMID:40009630	研究论文	本研究提出一种用于3D MR图像中线状结构去噪的未训练感知损失方法	将感知损失扩展到3D数据，使用未训练网络的特征图进行比较，特别适用于线状结构的图像去噪	主要针对线状结构图像，对其他类型图像效果未验证	开发适用于线状结构MR图像去噪的深度学习方法	脑部血管MR图像和植物根系MR图像	计算机视觉	脑血管疾病	磁共振成像	CNN	3D图像	536张植物根系MR图像和450张脑部血管MR图像	NA	自定义CNN, VGG19	SSIM	NA
12617	2025-05-11	Enhancing nnUNetv2 Training with Autoencoder Architecture for Improved Medical Image Segmentation 2025, Head and Neck Tumor Segmentation for MR-Guided Applications : First MICCAI Challenge, HNTS-MRG 2024, held in conjunction with MICCAI 2024, Marrakesh, Morocco, October 17, 2024, proceedings DOI:10.1007/978-3-031-83274-1_17 PMID:40337098	研究论文	本研究开发了一种基于nnUNetv2框架并结合自动编码器架构的新型深度学习模型，用于提高头颈癌MRI引导放疗图像中肿瘤体积的自动分割准确性	在nnUNetv2框架中引入自动编码器架构，将原始训练图像作为额外输入通道，并采用MSE损失函数以提高分割精度	研究仅针对头颈癌患者，样本量相对有限（150名训练患者和50名测试患者）	提高MRI引导放疗图像中肿瘤体积的自动分割准确性，优化放射肿瘤学临床工作流程	头颈癌患者的MRI引导放疗图像	数字病理学	头颈癌	MRI	nnUNetv2结合自动编码器	医学图像	150名训练患者和50名测试患者	NA	NA	NA	NA
12618	2025-10-07	[Identification of kidney stone types by deep learning integrated with radiomics features] 2024-Dec-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi DOI:10.7507/1001-5515.202310043 PMID:40000211	研究论文	提出结合影像组学和深度学习的框架，用于术前自动识别肾脏结石类型	首次将三维卷积神经网络浅层提取的影像组学特征与深层特征融合，并采用LASSO正则化和LightGBM进行结石分类	准确率为84.5%仍有提升空间，未提及模型在其他数据集上的泛化能力	实现肾脏结石类型的术前自动高精度分类	感染性和非感染性肾脏结石	计算机视觉	肾脏疾病	影像组学分析	CNN, LightGBM	三维医学影像	NA	NA	三维卷积神经网络	准确率	NA
12619	2025-10-07	[Cardiac magnetic resonance image segmentation based on lightweight network and knowledge distillation strategy] 2024-Dec-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi DOI:10.7507/1001-5515.202312015 PMID:40000210	研究论文	提出一种轻量级扩张并行卷积U-Net和知识蒸馏策略用于心脏磁共振图像分割	提出轻量级DPU-Net网络结构和多尺度适应向量知识蒸馏策略，通过独特的卷积通道变化方式减少参数数量	NA	解决深度学习网络在心脏MRI图像分割中参数过多和计算量大的问题	心脏磁共振图像	医学图像分割	心血管疾病	心脏磁共振成像	U-Net, CNN	医学图像	自动心脏诊断挑战赛公共数据集	NA	DPU-Net, U-Net, 残差块, 扩张卷积	Dice系数	NA
12620	2025-10-07	[Research progress on endoscopic image diagnosis of gastric tumors based on deep learning] 2024-Dec-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi DOI:10.7507/1001-5515.202404004 PMID:40000222	综述	本文综述了深度学习在胃肿瘤内镜图像分类、目标检测和分割中的应用进展	系统总结了胃肿瘤相关的计算机辅助诊断系统和多模态算法，并指出了当前深度学习方法存在的问题	未涉及具体实验验证和性能对比分析	促进深度学习方法在胃肿瘤内镜诊断中的临床应用	胃肿瘤内镜图像	计算机视觉	胃癌	内镜检查	深度学习	内镜图像	NA	NA	NA	NA	NA