深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
12721	2026-04-02	Artificial intelligence-powered pharmacovigilance: A review of machine and deep learning in clinical text-based adverse drug event detection for benchmark datasets 2024-04, Journal of biomedical informatics IF:4.0Q2 DOI:10.1016/j.jbi.2024.104621 PMID:38447600	综述	本文综述了机器学习和深度学习方法在临床文本基准数据集中用于药物不良事件检测的有效性，重点关注命名实体识别和关系分类任务	系统比较了机器学习和深度学习在药物不良事件提取任务中的优缺点，并扩展了数据源范围至生物医学文献、社交媒体数据和药品标签	仅纳入了12篇文献进行综述，可能未覆盖所有相关研究	评估机器学习和深度学习方法在药物不良事件提取中的效果，推动药物警戒领域发展	临床文本基准数据集中的药物不良事件	自然语言处理	NA	命名实体识别, 关系分类	机器学习, 深度学习	文本	NA	NA	BERT, 梯度提升, 多层感知机, 随机森林	NA	NA
12722	2026-04-02	Deep learning for detecting and elucidating human T-cell leukemia virus type 1 integration in the human genome 2023-Feb-10, Patterns (New York, N.Y.) DOI:10.1016/j.patter.2022.100674 PMID:36873907	研究论文	本文开发了首个用于预测人类T细胞白血病病毒1型整合位点的深度学习框架DeepHTLV	首次应用深度学习框架进行HTLV-1病毒整合位点预测，并实现特征表示的高效性和可解释性	NA	开发高精度、高通量的HTLV-1病毒整合位点检测方法，以辅助疾病预防和治疗	人类T细胞白血病病毒1型在人类基因组中的整合位点	机器学习	白血病	基因组测序	深度学习	基因组序列	NA	NA	NA	准确率	NA
12723	2026-04-02	Spatio-temporal classification for polyp diagnosis 2023-Feb-01, Biomedical optics express IF:2.9Q2 DOI:10.1364/BOE.473446 PMID:36874484	研究论文	本文研究利用时空信息改进结肠息肉分类为腺瘤或非腺瘤的性能	提出使用时空信息来增强息肉分类的稳定性和准确性，通过两种方法在内部和公开数据集上验证性能提升	未明确说明具体的数据集大小或模型泛化能力的详细限制	提高结肠息肉自动分类的准确性和鲁棒性，以支持临床决策	结肠息肉（腺瘤与非腺瘤）	计算机视觉	结直肠癌	深度学习	NA	视频（时空序列）	NA	NA	NA	NA	NA
12724	2026-04-02	A deep learning diagnostic platform for diffuse large B-cell lymphoma with high accuracy across multiple hospitals 2020-11-26, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-020-19817-3 PMID:33244018	研究论文	本文建立了一个高精度的深度学习平台，用于诊断弥漫性大B细胞淋巴瘤，并在多家医院验证了其接近100%的诊断准确率	开发了一个基于多个卷积神经网络的深度学习平台，能够使用较小数据集实现高精度诊断，并成功处理了跨医院样本制备和图像采集的变异性	未明确说明模型在其他类型血液恶性肿瘤或更广泛数据集上的泛化能力，以及临床部署的具体挑战	开发一个高准确率的深度学习诊断平台，用于弥漫性大B细胞淋巴瘤的病理图像分类	人类弥漫性大B细胞淋巴瘤和非DLBCL的病理图像	数字病理学	弥漫性大B细胞淋巴瘤	病理切片图像分析	CNN	图像	来自三家医院的病理图像数据集	NA	多个卷积神经网络	诊断准确率	NA
12725	2026-04-02	Mutation effect estimation on protein-protein interactions using deep contextualized representation learning 2020-Jun, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1 DOI:10.1093/nargab/lqaa015 PMID:32166223	研究论文	提出一个名为MuPIPR的端到端深度学习框架，用于预测蛋白质突变对蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）特性的影响	结合了氨基酸的上下文表示机制来放大点突变在长蛋白质序列中的细微变化，并采用孪生残差循环卷积神经编码器来编码野生型和突变型蛋白质对	仅使用序列信息，未结合结构或能量特征，且在SKEMPI v2数据集上的性能仅与现有方法相当	量化蛋白质突变对蛋白质-蛋白质相互作用特性的影响	蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）	机器学习	NA	深度学习	CNN, 多层感知机	蛋白质序列	SKEMPI v1 和 SKEMPI v2 数据集	NA	孪生残差循环卷积神经编码器	结合亲和力变化和埋藏表面积变化的预测性能	NA
12726	2026-04-01	Machine learning models enhance detection of arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy 2026-Jun-30, Machine learning. Health DOI:10.1088/3049-477X/ae451a PMID:41884351	研究论文	本研究旨在通过机器学习模型提升致心律失常性右心室心肌病的检测能力，并探索其在诊断路径中的角色	首次系统比较了八种机器学习模型在ARVC检测中的性能，并提出了一个基于梯度提升树的分层诊断策略，包括仅使用心电图的早期分诊模型和多模态确认模型	研究基于单一机构的注册数据，可能存在选择偏倚，且需要在前瞻性外部临床环境中进一步验证	识别最优的机器学习策略以增强致心律失常性右心室心肌病的检测，并定义其在诊断路径中的作用	来自约翰霍普金斯ARVC注册库的688名患者	机器学习	心血管疾病	临床评估、心电图、影像学、遗传学变量分析	梯度提升树, 随机森林, 决策树, TabNet	结构化临床数据	688名患者	NA	梯度提升树, 随机森林, 决策树, TabNet	AUC, 准确率, 灵敏度, 特异性	NA
12727	2026-04-01	Cross-validation strategies under data dependency: An example with anemia prediction in sheep using ocular conjunctiva images 2026-Jun, Preventive veterinary medicine IF:2.2Q1 DOI:10.1016/j.prevetmed.2026.106843 PMID:41797013	研究论文	本文评估了三种交叉验证策略在绵羊贫血预测任务中的表现，以探究数据依赖性对深度学习模型性能评估的影响	首次在畜牧业计算机视觉应用中系统比较了随机划分、基于动物个体划分和基于农场划分三种交叉验证策略对模型泛化能力评估的影响	研究仅基于三个农场的有限样本，且仅使用VGG19单一模型架构，可能无法完全代表所有畜牧业应用场景	评估不同交叉验证策略在数据依赖条件下对深度学习模型性能评估的影响，为畜牧业健康监测模型开发提供验证方法指导	绵羊贫血状态预测	计算机视觉	贫血	智能手机图像采集	CNN	图像	来自3个农场186只动物的1176张图像	NA	U-Net, VGG19	准确率, 精确率, 召回率, F1分数, 特异性	NA
12728	2026-04-01	Utility of augmented reality in endoscopic surgery for stones: European Association of Urology endourology up-to-date review 2026-May-01, Current opinion in urology IF:2.1Q2 DOI:10.1097/MOU.0000000000001378 PMID:41823304	综述	本文回顾了增强现实技术在泌尿系结石内镜手术中的发展历程、当前应用趋势及其临床益处	系统梳理了增强现实从可视化工具向融合超声/CT与深度学习、主动优化手术精度与安全性的智能系统演进，并强调了其在逆行手术中作为认知与导航平台的新兴角色	NA	确定增强现实技术在泌尿内镜手术中的发展时间线及其在当前临床实践中的趋势	增强现实技术在经皮肾镜取石术、输尿管镜术及逆行肾内手术中的应用	数字病理	前列腺癌	超声/CT融合，深度学习	NA	医学影像（如超声、CT）	NA	NA	NA	穿刺时间减少，并发症发生率降低	NA
12729	2026-04-01	Deep learning of wrist accelerometry from UK Biobank data identifies early movement signatures of knee osteoarthritis up to 5 years before diagnosis 2026-Apr, Knee surgery, sports traumatology, arthroscopy : official journal of the ESSKA DOI:10.1002/ksa.70332 PMID:41700483	研究论文	本研究利用英国生物银行数据，通过深度学习分析手腕加速度计数据，旨在识别膝骨关节炎（KOA）的早期运动特征，可在诊断前长达5年预测风险	首次将手腕加速度计数据与深度学习结合，用于识别膝骨关节炎的早期运动特征，并能在诊断前长达5年预测风险，突出了可穿戴设备在人群筛查中的潜力	研究为回顾性病例对照设计，属于二级分析而非前瞻性设计的预后试验；模型性能中等，区分前驱期与确诊KOA的能力接近随机水平	测试手腕加速度计数据结合深度学习是否能区分健康个体与膝骨关节炎患者、分离前驱期与确诊KOA，并预测未来5年内被诊断为KOA的个体	英国生物银行参与者，包括健康个体、膝骨关节炎患者（前驱期和确诊期），基于ICD-10代码识别，并控制BMI、年龄和性别等因素	机器学习	膝骨关节炎	手腕加速度计监测	CNN	加速度计时间序列数据	总参与者102,120人，其中KOA患者7,262人；具体任务中平衡队列样本量分别为3,677、1,596 vs. 2,081、1,369每类	NA	1D卷积神经网络	准确率, 宏F1分数, 宏灵敏度, AUC	NA
12730	2026-04-01	Head radiotherapy positioning guidance system based on feature recognition and automatic annotation: Clinical validation and error analysis 2026-Apr, Medical physics IF:3.2Q1 DOI:10.1002/mp.70405 PMID:41904706	研究论文	本研究开发了一种基于RGB-D相机和深度学习算法的放疗定位引导系统，用于头颈部肿瘤放疗的精准定位	将DeepLab-Opt和FFMD算法整合到放疗工作流中，实现基于表面轮廓和面部标志点的粗-精两级定位，并通过实时反馈系统提高定位精度	研究样本量较小（22例患者），且仅针对头颈部肿瘤进行验证，未涉及其他部位肿瘤	探索基于特征识别和自动标注的放疗定位引导系统的可行性，并分析其在头颈部放疗中的定位误差	头颈部肿瘤患者	计算机视觉	头颈部肿瘤	RGB-D成像，深度学习算法	CNN	彩色图像，深度图像	22例头颈部肿瘤患者，共246次定位案例	NA	DeepLab-Opt, Fast Face Marker Detector (FFMD)	定位误差（横向、纵向、垂直方向及旋转角度），定位时间	NA
12731	2026-04-01	Interpreting the Effects of Environmental Variables on a Multistep Deep Learning Model for Algal Bloom Prediction Using Explainable Artificial Intelligence 2026-Apr, Water environment research : a research publication of the Water Environment Federation IF:2.5Q2 DOI:10.1002/wer.70339 PMID:41911833	研究论文	本研究开发了一个序列到序列深度学习模型来预测叶绿素a浓度，并应用可解释人工智能方法分析环境变量对模型性能的影响	首次将可解释人工智能方法应用于藻华预测的深度学习模型，定量解释不同预测时间步长下环境变量的影响	模型在长期预测（如28天）时性能显著下降，NSE从0.908降至0.255	开发并评估用于藻华预测的深度学习模型，并分析环境变量对预测性能的影响	叶绿素a浓度（作为藻华的定量指标）	机器学习	NA	深度学习建模，可解释人工智能分析	Seq2Seq	时间序列数据	NA	NA	序列到序列模型	Nash-Sutcliffe效率	NA
12732	2026-04-01	Global Sensitivity Analysis for Robust XAI: Quantifying Clinical Risk and Prediction Instability in Dermoscopic Image Classification 2026-Apr, Risk analysis : an official publication of the Society for Risk Analysis IF:3.0Q1 DOI:10.1111/risa.70237 PMID:41913512	研究论文	本文提出并利用全局敏感性分析来量化卷积神经网络在皮肤镜图像分类中对关键光学图像参数的鲁棒性，以评估模型在临床环境中的诊断风险	将全局敏感性分析应用于深度学习模型，以量化其在皮肤镜图像分类中对光学参数变化的敏感性和诊断风险，超越了传统准确性评估	仅考虑了五种光学图像参数，可能未涵盖所有影响模型稳定性的临床变量	评估深度学习模型在皮肤镜图像分类中的鲁棒性，量化其诊断风险，以支持AI诊断系统的临床安全部署	皮肤镜图像分类模型	计算机视觉	皮肤癌	NA	CNN	图像	NA	NA	NA	准确性	NA
12733	2026-04-01	Deep Learning-Enhanced Resonance Frequency Analysis for Dental Implant Stability Assessment 2026-Apr, Clinical and experimental dental research IF:1.7Q3 DOI:10.1002/cre2.70342 PMID:41914428	研究论文	本研究开发并评估了一种深度学习增强的共振频率分析框架，用于提高牙科植入物稳定性评估的准确性和信号质量	提出了一种结合去噪卷积神经网络和元数据感知预测网络的深度学习增强RFA框架，显著提升了信号质量和ISQ预测精度	目前仅作为概念验证，需进行多中心前瞻性验证，纳入真实世界噪声分析和临床结果评估，才能投入临床应用	开发并评估一种深度学习增强的共振频率分析框架，以提高牙科植入物稳定性评估的准确性和信号质量	牙科植入物的共振频率分析信号	数字病理	NA	共振频率分析	CNN	信号	100个植入物（300个信号样本，每个植入物采集三次）	NA	去噪卷积神经网络，元数据感知预测网络	MAE, RMSE, R2, 容忍精度（±3 ISQ单位内）	NA
12734	2026-04-01	Fluorescence Machine Vision-Based Rapid Quantitative Characterization of Microplastics 2026-Mar-31, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.6c00407 PMID:41830590	研究论文	本研究开发了一种基于荧光显微成像和YOLO v11深度学习模型的微塑料快速定量检测方法，并构建了名为FluoPlastVision的商业化AI辅助检测平台	采用香豆素6（C6）进行稳定广谱染色获得高质量图像数据，并在YOLO v11模型中引入轻量级注意力机制以增强模型鲁棒性和准确性	未明确说明模型在复杂环境样本或不同染色条件下的泛化能力，也未提供与其他先进方法的直接对比数据	开发一种快速、低成本、高精度的微塑料定量检测技术	经香豆素6染色的微塑料荧光显微图像	计算机视觉	NA	荧光显微成像	CNN	图像	NA	NA	YOLO v11	NA	NA
12735	2026-04-01	Novel Deep-Learning Unsupervised Domain Adaptation Method for Mitigating Batch, Strain, and Instrument Variations to Enhance Raman Spectroscopy-Based Bacterial Pathogen Identification 2026-Mar-31, Analytical chemistry IF:6.7Q1 DOI:10.1021/acs.analchem.5c07113 PMID:41842761	研究论文	本文提出了一种名为Raman Spectral Classification Discrepancy Model (RSCDM)的新型无监督域适应方法，旨在通过对抗性特征对齐来减轻拉曼光谱中由仪器、批次和菌株差异引起的域偏移，从而增强基于拉曼光谱的细菌病原体识别	提出了一种利用任务特定分类器之间的输出差异动态识别远离源域特征分布的目标样本的新型域适应框架，不同于依赖固定域假设的传统方法，实现了任务驱动的域对齐	NA	增强基于拉曼光谱的细菌病原体识别的鲁棒性，以应对仪器异质性、批次变异性和菌株多样性带来的挑战	七种细菌物种的拉曼光谱数据，包括商业光谱仪和自制光谱仪采集的临床分离株	机器学习	细菌感染	拉曼光谱	深度学习	光谱数据	七种细菌物种的多个批次和菌株样本，以及六种临床分离株	NA	Raman Spectral Classification Discrepancy Model (RSCDM)	分类准确率	NA
12736	2026-04-01	A deep learning approach for analyzing brainwave signals during audio meditation in expectant mothers: variational mode decomposition with a CNN-BiLSTM model 2026-Mar-31, Biomedical physics & engineering express IF:1.3Q3 DOI:10.1088/2057-1976/ae55a8 PMID:41871464	研究论文	本研究提出了一种基于EEG信号和深度学习的方法，用于分析孕妇在音频冥想期间的大脑活动变化	结合变分模态分解与CNN-BiLSTM混合模型，首次针对孕妇短期音频冥想的神经效应进行客观量化分析	研究样本量有限，且仅针对特定类型的音频冥想，未考虑个体差异和长期效应	客观评估孕妇在短期音频冥想期间的神经活动变化，为产前护理提供科学依据	孕妇的脑电图信号	机器学习	NA	脑电图	CNN, BiLSTM	脑电图信号	未明确指定样本数量，但涉及孕妇在不同心理状态下的EEG数据	未明确指定，但可能基于TensorFlow或PyTorch	VMD-CNN-BiLSTM混合架构	准确率, 损失值	NA
12737	2026-04-01	Neurosurgical Application of Artificial Intelligence in Pediatric Neuro-Oncology 2026-Mar-31, Journal of Korean Neurosurgical Society IF:1.4Q3 DOI:10.3340/jkns.2026.0085 PMID:41913971	综述	本文综述了人工智能在儿童神经肿瘤学围手术期的应用，包括术前分子分型、术中快速诊断和术后预后评估	系统性地阐述了AI在儿童神经肿瘤围手术期全流程的整合应用，并探讨了如何通过AI解决该领域因疾病多样性带来的临床挑战	数据稀缺性和算法的“黑箱”特性仍然是主要限制	探讨人工智能如何解决儿童神经肿瘤学围手术期未满足的临床需求	儿童中枢神经系统肿瘤	数字病理学	儿童神经肿瘤	Oxford Nanopore测序，刺激拉曼组织学	神经网络分类器，深度学习模型	影像，基因组数据，临床数据	NA	NA	NA	NA	NA
12738	2026-04-01	Hypoxia-related and immune phenotype-related fusion model for non-invasive prognostication of hepatocellular carcinoma treated by TACE: a multicentre study 2026-Mar-30, Gut IF:23.0Q1 DOI:10.1136/gutjnl-2025-337938 PMID:41856522	研究论文	本研究开发并验证了一个多模态预后模型，用于精确评估接受TACE治疗的肝细胞癌患者的生存结果	结合深度学习和传统影像组学，构建早期和晚期融合模型，并通过整合临床变量形成临床-影像学模型，实现更精细的风险分层	研究依赖于回顾性数据，且模型在外部验证中的泛化能力仍需进一步确认	开发并验证一个多模态预后模型，用于精确评估接受TACE治疗的肝细胞癌患者的生存结果	肝细胞癌患者	数字病理学	肝细胞癌	单细胞RNA测序，对比增强CT成像	深度学习，传统影像组学	图像，转录组数据	1448名肝细胞癌患者（包括TACE队列1349人，随机试验生物标志物子集41人，单细胞RNA测序队列和TCGA肝细胞癌队列50人）	NA	早期融合模型，晚期融合模型	生存分层，风险分层	NA
12739	2026-04-01	Inverse treatment planning using deep learning-based organs at risk in radiotherapy for head and neck cancer: a prospective planning study 2026-Mar-30, Strahlentherapie und Onkologie : Organ der Deutschen Rontgengesellschaft ... [et al] IF:2.7Q2 DOI:10.1007/s00066-026-02519-y PMID:41912924	研究论文	本研究评估了在头颈癌放疗中，使用基于深度学习的危及器官自动分割进行逆向治疗计划的可行性和临床可接受性	首次前瞻性地将基于深度学习的危及器官自动分割应用于头颈癌放疗的逆向治疗计划中，并评估其临床可行性	单中心研究，样本量较小（25名患者），需要更大规模研究来验证结果并推进全自动化工作流程	评估基于深度学习的危及器官自动分割在头颈癌放疗逆向治疗计划中的临床可行性和效果	头颈鳞状细胞癌患者	数字病理学	头颈癌	放射治疗计划，深度学习自动分割	深度学习模型	医学影像数据	25名接受根治性或术后（化疗）放疗的头颈癌患者	NA	NA	剂量学参数（D95%, D98%, D2%, Dmean），临床可接受性评分	NA
12740	2026-04-01	Attention-Driven Deep Learning for Hydrocephalus: Preliminary Benchmarking of Multiscale 3D Attention Against Conventional 3D CNN Models Using Ventricular Enlargement on CT 2026-Mar-30, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-026-01948-6 PMID:41912959	研究论文	本研究开发并比较了一种多尺度注意力3D卷积神经网络（MSA3DNet）与常规3D-CNN模型，用于基于脑室扩大的CT图像进行脑积水分类	首次将多尺度编码与注意力机制结合应用于3D CNN，以提升脑积水分类的敏感性和稳定性，同时保持特异性	样本量较小（仅98例儿科CT扫描），且为回顾性研究，可能限制模型的泛化能力	开发并评估一种基于深度学习的自动化3D CT图像分类方法，用于儿科脑积水的筛查	儿科头部CT扫描图像（0-15岁患者）	计算机视觉	脑积水	CT成像	CNN	3D图像	98例匿名儿科头部CT检查（48例脑积水，50例正常）	NA	MSA3DNet, 3D-CNN	准确率, 敏感性, 特异性, F1分数, Matthews相关系数, AUC	NA