深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
13201	2024-12-01	Novel Approaches for the Early Detection of Glaucoma Using Artificial Intelligence 2024-Oct-28, Life (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/life14111386 PMID:39598184	研究论文	本文探讨了人工智能在青光眼早期检测中的应用，特别是机器学习和深度学习模型的优势和局限	本文介绍了卷积神经网络和其他深度学习算法在青光眼检测中的高灵敏度和特异性，展示了其在自动化筛查中的潜力	本文指出需要多样化的训练数据集、外部验证、决策透明度以及处理道德和法律问题等挑战	研究目的是探讨人工智能在青光眼早期诊断、治疗和检测中的应用，并评估不同AI模型和算法的优缺点	研究对象是青光眼的早期检测和治疗	机器学习	青光眼	机器学习、深度学习	卷积神经网络	图像	NA
13202	2024-12-01	Antiviral Peptide-Generative Pre-Trained Transformer (AVP-GPT): A Deep Learning-Powered Model for Antiviral Peptide Design with High-Throughput Discovery and Exceptional Potency 2024-Oct-25, Viruses DOI:10.3390/v16111673 PMID:39599788	研究论文	本文介绍了一种名为AVP-GPT的深度学习模型，用于高效设计抗病毒肽	AVP-GPT利用基于transformer的语言模型和多模态架构，显著提高了抗病毒肽的设计效率和成功率	未来研究可以探索AVP-GPT在其他病毒目标上的应用和不同的抗病毒肽设计策略	加速新型抗病毒药物的发现和开发	抗病毒肽的设计和筛选	机器学习	NA	深度学习	Transformer	文本	10,000个独特肽段
13203	2024-12-01	Patient-Specific Deep Learning Tracking Framework for Real-Time 2D Target Localization in Magnetic Resonance Imaging-Guided Radiation Therapy 2024-Oct-24, International journal of radiation oncology, biology, physics DOI:10.1016/j.ijrobp.2024.10.021 PMID:39461599	研究论文	提出了一种基于患者特异性深度学习模型的2D磁共振成像引导放射治疗中的肿瘤跟踪框架	使用患者特异性训练的深度学习模型（包括图像配准transformer和自动分割卷积神经网络）进行实时肿瘤定位	仅在胸部、腹部和骨盆区域进行了验证，未涵盖其他身体部位	开发一种在磁共振成像引导放射治疗中实现实时2D目标定位的深度学习跟踪框架	219名接受0.35 T MRI-linac治疗的患者的1,400,000帧cine MRI图像，以及35名患者的7500帧手动标注图像	计算机视觉	NA	磁共振成像（MRI）	transformer和卷积神经网络（CNN）	图像	219名患者和35名额外患者的MRI图像，共计1,407,500帧
13204	2024-12-01	Perception of First-Year MBBS Students Toward Virtual Dissection in Learning Anatomy: A Comparative Study Between High and Low Academic Achievers 2024-Oct, Cureus DOI:10.7759/cureus.72508 PMID:39606542	研究论文	研究了第一年MBBS学生对虚拟解剖学习的看法，并比较了高分和低分学生的反馈	探讨了虚拟解剖作为一种创新教学方法在解剖学教学中的应用	研究样本量较小，且仅限于特定机构的学生	评估第一年MBBS学生对虚拟解剖的看法，并比较高分和低分学生的反馈	第一年MBBS学生	NA	NA	NA	NA	问卷调查	99名学生，其中89名参与了调查
13205	2024-12-01	scEMB: Learning context representation of genes based on large-scale single-cell transcriptomics 2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.09.24.614685 PMID:39386549	研究论文	本文介绍了一种基于大规模单细胞转录组数据的深度学习模型scEMB，用于学习基因的上下文表示	scEMB采用了一种创新的binning策略，能够跨平台整合数据，有效保留基因表达层次和细胞类型特异性	NA	开发一种能够从大规模单细胞转录组数据中捕捉上下文感知基因嵌入的深度学习模型	基因的上下文表示	机器学习	NA	单细胞转录组技术	Transformer	基因表达数据	超过3000万单细胞转录组数据
13206	2024-12-01	MCMVDRP: a multi-channel multi-view deep learning framework for cancer drug response prediction 2024-Sep-01, Journal of integrative bioinformatics IF:1.5Q3 DOI:10.1515/jib-2024-0026 PMID:39238451	研究论文	本文提出了一种多通道多视角深度学习框架MCMVDRP，用于癌症药物反应预测	本文创新性地结合了三种不同类型的药物特征：分子图、SMILES字符串和分子指纹，以提高药物反应预测的准确性	NA	预测癌症患者对药物的反应	癌症药物反应	机器学习	NA	深度学习	MCMVDRP	分子图、SMILES字符串、分子指纹	NA
13207	2024-12-01	[Research on the classification model of chronic sinusitis based on VGG] 2024-Jul, Lin chuang er bi yan hou tou jing wai ke za zhi = Journal of clinical otorhinolaryngology head and neck surgery DOI:10.13201/j.issn.2096-7993.2024.07.013 PMID:38973043	研究论文	研究基于VGG的慢性鼻窦炎分类模型，并评估其有效性	利用深度学习技术构建基于VGG的慢性鼻窦炎计算机辅助诊断模型，具有较高的分类性能和诊断效果	NA	构建和评估基于VGG的慢性鼻窦炎计算机辅助诊断模型	慢性鼻窦炎的分类和诊断	计算机视觉	鼻窦炎	深度学习	VGG	图像	5000帧已诊断的鼻窦CT图像，包括1000帧正常组和4000帧异常组
13208	2024-12-01	stMMR: accurate and robust spatial domain identification from spatially resolved transcriptomics with multimodal feature representation 2024-Jan-02, GigaScience IF:11.8Q1 DOI:10.1093/gigascience/giae089 PMID:39607984	研究论文	本文介绍了一种名为stMMR的多模态几何深度学习方法，用于从空间转录组学数据中准确识别空间域	stMMR通过图卷积网络和自注意力模块进行深度特征嵌入，并结合相似性对比学习来整合多模态特征	NA	开发一种能够有效整合基因表达、空间位置和组织学信息的多模态方法，以准确识别空间域	空间转录组学数据中的空间域识别	机器学习	NA	图卷积网络、自注意力模块、相似性对比学习	图卷积网络、自注意力模块	空间转录组学数据	NA
13209	2024-12-01	Contrastive learning for neural fingerprinting from limited neuroimaging data 2024, Frontiers in nuclear medicine (Lausanne, Switzerland) DOI:10.3389/fnume.2024.1332747 PMID:39605927	研究论文	本文研究了在有限神经影像数据下使用对比学习进行神经指纹识别的方法	本文提出了一种基于对比学习的神经指纹识别方法，无需重新训练即可适应新受试者，并通过数据增强提高了模型在样本量有限情况下的鲁棒性	本文未详细讨论对比学习方法在不同数据集上的泛化能力	研究在有限样本量下提高神经指纹识别性能的方法	神经指纹识别的准确性和鲁棒性	机器学习	NA	对比学习	深度学习模型	功能连接数据	138名受试者的3特斯拉MRI和静息态fMRI扫描数据
13210	2024-12-01	A review on deep learning methods for heart sound signal analysis 2024, Frontiers in artificial intelligence IF:3.0Q2 DOI:10.3389/frai.2024.1434022 PMID:39605951	综述	本文综述了深度学习方法在心音信号分析中的应用	本文通过回顾和比较不同深度学习方法在心音分析中的应用，提供了对这些方法性能的全面理解	由于评估方法的不一致性，某些方法的优越性并不具有结论性	探讨深度学习方法在心音信号分析中的最新进展	心音信号的异常检测和定位	机器学习	心血管疾病	深度学习	CNN, LSTM	信号	NA
13211	2024-12-01	Foundations of automatic feature extraction at LHC-point clouds and graphs 2024, The European physical journal. Special topics DOI:10.1140/epjs/s11734-024-01306-z PMID:39605978	综述	本文综述了深度学习算法在大型强子对撞机（LHC）中的自动特征提取应用	探讨了物理启发式特征提取器的优势，超越了提高特征质量的理解	NA	系统探讨从现象学角度出发的自动特征提取及其物理启发架构的动机	LHC中的点云和图表示	机器学习	NA	深度学习算法	NA	点云和图	NA
13212	2024-12-01	Simple Imaging System for Label-Free Identification of Bacterial Pathogens in Resource-Limited Settings 2024, International journal of biomedical imaging IF:3.3Q2 DOI:10.1155/2024/6465280 PMID:39606275	研究论文	本文介绍了一种基于简单宽场无透镜成像系统的高通量方法，用于在资源有限的环境中无标签识别细菌病原体	提出了一种新的无透镜成像系统，结合监督深度学习算法，适用于资源有限的环境，无需移动机械部件或光学元件	尽管识别性能高，但仍存在一定的识别错误率，且未提及长期维护和实际应用中的稳定性	开发一种快速、准确且经济实惠的细菌识别方法，以改善资源有限环境中的感染治疗	五种常见细菌病原体的临床分离株	计算机视觉	NA	无透镜成像系统	深度学习算法	图像	252个临床分离株
13213	2024-12-01	Sensitive Quantification of Cerebellar Speech Abnormalities Using Deep Learning Models 2024, IEEE access : practical innovations, open solutions IF:3.4Q2 DOI:10.1109/access.2024.3393243 PMID:39606584	研究论文	本文开发了一种基于深度学习模型的方法，用于敏感地量化小脑性言语异常	使用卷积神经网络捕捉小脑共济失调的言语表型，并基于对数梅尔频谱图的时间和频率偏导数进行分类和回归建模	NA	开发能够准确识别和量化共济失调言语临床体征的模型	小脑共济失调患者的言语异常	机器学习	神经退行性疾病	卷积神经网络	CNN	音频	包括共济失调患者和健康对照组
13214	2024-12-01	Effective automatic classification methods via deep learning for myopic maculopathy 2024, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2024.1492808 PMID:39606624	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的系统，用于对病理性近视相关的黄斑病变进行自动分类	采用五种深度学习架构（ResNet50、EfficientNet-B0、Vision Transformer、Contrastive Language-Image Pre-Training和RETFound），并通过集成学习方法提升模型性能	未来工作可能需要扩展数据集、整合图像质量评估以及优化集成算法以提高效率和适用性	提高病理性近视相关黄斑病变分类的准确性和可靠性	病理性近视相关的黄斑病变	计算机视觉	眼科疾病	深度学习	集成学习	图像	2159张标注的眼底图像
13215	2024-12-01	Automated lung segmentation on chest MRI in children with cystic fibrosis 2024, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2024.1401473 PMID:39606627	研究论文	研究使用深度学习方法对患有囊性纤维化的儿童胸部MRI图像进行自动肺部分割	采用nnU-Net框架对胸部MRI图像进行自动肺部分割，展示了在不同疾病严重程度、患者年龄和尺寸下的高分割性能	在膈肌和背部区域存在不完全分割的挑战，需要进一步改进以增强模型的泛化能力	探索使用深度学习方法对囊性纤维化儿童的胸部MRI图像进行自动肺部分割的可行性和有效性	患有囊性纤维化的儿童的胸部MRI图像	计算机视觉	囊性纤维化	深度学习	nnU-Net	MRI图像	165个标准化年度监测MRI扫描，来自84名囊性纤维化患者
13216	2024-12-01	Employing Xception convolutional neural network through high-precision MRI analysis for brain tumor diagnosis 2024, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2024.1487713 PMID:39606635	研究论文	本文提出了一种基于Xception卷积神经网络的高精度MRI分析方法，用于脑肿瘤的诊断	引入了Xception架构，并结合批量归一化和dropout层来减少过拟合，通过迁移学习和定制的密集层设置提高了模型的泛化能力	NA	提高脑肿瘤诊断的准确性和可靠性	脑肿瘤的分类	计算机视觉	脑肿瘤	MRI分析	Xception卷积神经网络	图像	NA
13217	2024-12-01	Enhanced skin cancer diagnosis: a deep feature extraction-based framework for the multi-classification of skin cancer utilizing dermoscopy images 2024, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2024.1495576 PMID:39606634	研究论文	本文提出了一种基于深度特征提取的框架，用于利用皮肤镜图像对皮肤癌进行多分类诊断	本文提出了四种卷积神经网络（CNN）模型的变体，并结合支持向量机（SVM）、随机森林（RF）和逻辑回归（LR）进行皮肤癌分类，提高了诊断准确率	本文未提及如何处理数据不平衡问题以及模型的泛化能力	提高皮肤癌诊断的准确性，帮助医生进行诊断	皮肤癌的分类和预测	计算机视觉	皮肤癌	卷积神经网络（CNN）	卷积神经网络（CNN）	图像	10,015张皮肤镜图像
13218	2024-12-01	Bibliometric and visual analysis of radiomics for evaluating lymph node status in oncology 2024, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2024.1501652 PMID:39610679	研究论文	本文通过文献计量学和可视化方法分析了2012年至2023年间关于放射组学在评估肿瘤学中淋巴结状态的研究出版物，揭示了该领域的研究热点和未来趋势	本文首次通过文献计量学和可视化方法全面分析了放射组学在评估淋巴结状态中的应用，揭示了研究热点和未来趋势	本文主要基于文献计量学和可视化分析，未涉及具体实验或临床数据，因此缺乏对实际应用效果的深入探讨	分析放射组学在评估肿瘤学中淋巴结状态的研究出版物，揭示研究热点和未来趋势	2012年至2023年间发表的关于放射组学在评估淋巴结状态中的研究出版物	数字病理学	肿瘤学	文献计量学和可视化分析	NA	文本	898篇英文原创文章和综述
13219	2024-12-01	Drone-Based Digital Phenotyping to Evaluating Relative Maturity, Stand Count, and Plant Height in Dry Beans (Phaseolus vulgaris L.) 2024, Plant phenomics (Washington, D.C.) DOI:10.34133/plantphenomics.0278 PMID:39610705	研究论文	研究利用无人机RGB图像和深度学习方法评估干豆的相对成熟度、植株密度和植株高度	采用混合卷积神经网络和长短期记忆模型以及Faster R-CNN算法，提高了相对成熟度和植株密度测量的准确性和效率	在植株高度估计中，PC和DSM数据源的选择依赖于特定的环境和飞行条件	探索无人机图像和深度学习方法在干豆田间试验中测量相对成熟度、植株密度和植株高度的应用	干豆的相对成熟度、植株密度和植株高度	计算机视觉	NA	深度学习	混合卷积神经网络和长短期记忆模型、Faster R-CNN	图像	NA
13220	2024-12-01	RDA-MTE: an innovative model for emotion recognition in sports behavior decision-making 2024, Frontiers in neuroscience IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fnins.2024.1466013 PMID:39610868	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的模型RDA-MTE，用于在体育行为决策中进行情感识别	该模型结合了预训练的ResNet-50、双向注意力机制和多层Transformer编码器，提高了情感识别的准确性和鲁棒性	NA	研究情感刺激在体育行为决策中的作用	情感识别和体育行为决策	机器学习	NA	深度学习	RDA-MTE	图像	FER-2013数据集和CK+数据集