深度学习在生物医药领域中的应用
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 24162 篇文献，本页显示第 13321 - 13340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 13321 | 2024-10-24 |
REVEALS: an open-source multi-camera GUI for rodent behavior acquisition
2024-Oct-03, Cerebral cortex (New York, N.Y. : 1991)
DOI:10.1093/cercor/bhae421
PMID:39420472
|
研究论文 | 开发了一个名为REVEALS的开源多摄像头图形用户界面，用于采集啮齿动物行为数据 | REVEALS提供了一个用户友好的界面，支持同时从多个摄像头采集数据，并能高效地收集和分析大型数据集 | NA | 开发一种有效、经济且易于获取啮齿动物行为数据的方法 | 啮齿动物行为数据 | 计算机视觉 | NA | NA | NA | 视频 | NA |
| 13322 | 2024-10-24 |
Massive experimental quantification of amyloid nucleation allows interpretable deep learning of protein aggregation
2024-Oct-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.13.603366
PMID:39071305
|
研究论文 | 本文通过实验量化了超过10万种蛋白质序列的淀粉样核形成，并训练了一个卷积-注意力混合神经网络CANYA，以准确预测淀粉样核形成 | 本文通过大规模实验数据集解决了现有计算方法在小且有偏数据集上训练和评估的问题，并提出了CANYA模型，该模型能够解释其决策过程和学习到的语法 | NA | 解决蛋白质聚集预测中的数据短缺问题，并开发一个可解释的神经网络模型来预测淀粉样核形成 | 超过10万种蛋白质序列的淀粉样核形成 | 机器学习 | NA | NA | 卷积-注意力混合神经网络 | 序列 | 超过10万种蛋白质序列 |
| 13323 | 2024-10-24 |
A deep learning algorithm for the detection of aortic dissection on non-contrast-enhanced computed tomography via the identification and segmentation of the true and false lumens of the aorta
2024-Oct-01, Quantitative imaging in medicine and surgery
IF:2.9Q2
DOI:10.21037/qims-24-533
PMID:39429578
|
研究论文 | 本文开发了一种基于深度学习的算法，用于在非对比增强CT扫描中检测主动脉夹层，并通过识别和分割主动脉的真假腔来确定主动脉夹层的存在 | 本文的创新点在于开发了一种基于深度学习的算法，能够在非对比增强CT扫描中准确识别和分割主动脉的真假腔，从而提高主动脉夹层的诊断准确性 | 本文的局限性在于研究样本仅来自三家医院，且为回顾性研究，未来需要更大规模的前瞻性研究来验证算法的有效性 | 本研究的目的是开发一种能够准确检测主动脉夹层的深度学习算法，并评估其在临床实践中的应用潜力 | 本研究的对象是疑似急性主动脉综合征的患者，通过分析其非对比增强CT扫描图像来检测主动脉夹层 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 非对比增强CT (NCE-CT) | 三维全分辨率U-Net | 图像 | 320名患者，其中160名患有主动脉夹层，160名未患有主动脉夹层 |
| 13324 | 2024-10-24 |
Radiomics and Clinical Features for Distinguishing Kidney Stone-Associated Urinary Tract Infection: A Comprehensive Analysis of Machine Learning Classification
2024-Oct, Open forum infectious diseases
IF:3.8Q2
DOI:10.1093/ofid/ofae581
PMID:39435322
|
研究论文 | 研究通过放射组学和临床特征模型区分肾结石相关尿路感染的能力 | 结合放射组学和临床特征，使用多层感知器（MLP）模型进行分类，显示出较高的分类准确性 | 研究基于单中心数据集，样本量有限 | 评估放射组学和临床特征在区分肾结石相关尿路感染中的有效性 | 肾结石患者的CT扫描图像和临床信息 | 机器学习 | 泌尿系统疾病 | CT扫描 | 多层感知器（MLP） | 图像和临床数据 | 461名肾结石患者 |
| 13325 | 2024-10-24 |
Development of Machine Learning-Based Mpox Surveillance Models in a Learning Health System
2024-Sep-27, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2024.09.25.24314318
PMID:39399027
|
研究论文 | 开发基于机器学习的猴痘监测模型，用于学习健康系统中的临床笔记识别 | 使用Lasso回归模型在识别猴痘病例时优于深度学习模型，特别是在减少假阳性方面表现出色 | 未提及具体限制 | 开发和评估用于识别猴痘病例的机器学习和深度学习模型 | 临床笔记中的猴痘病例 | 机器学习 | NA | 机器学习、深度学习 | Lasso回归、深度学习模型 | 文本 | 未提及具体样本数量 |
| 13326 | 2024-10-24 |
Local Mean Suppression Filter for Effective Background Identification in Fluorescence Images
2024-Sep-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.25.614955
PMID:39386682
|
研究论文 | 本文提出了一种用于荧光显微图像中有效背景识别的非线性滤波器 | 该滤波器基于像素强度与其局部邻域平均强度的比较，通过改变邻域大小生成多个标签并累积决定最终像素标签，性能优于现有的图像处理、机器学习和深度学习方法 | NA | 开发一种有效的背景识别方法，适用于荧光显微图像中的密集和低对比度前景 | 荧光显微图像中的背景和前景识别 | 计算机视觉 | NA | 非线性滤波 | NA | 图像 | NA |
| 13327 | 2024-10-24 |
Exploring 7β-amino-6-nitrocholestens as COVID-19 antivirals: in silico, synthesis, evaluation, and integration of artificial intelligence (AI) in drug design: assessing the cytotoxicity and antioxidant activity of 3β-acetoxynitrocholestane
2024-Sep-26, RSC medicinal chemistry
IF:4.1Q2
DOI:10.1039/d4md00257a
PMID:39430952
|
研究论文 | 研究探索了7β-氨基-6-硝基胆甾烯作为COVID-19抗病毒药物的潜力，并通过计算机模拟、合成、评估以及人工智能（AI）在药物设计中的整合，评估了3β-乙酰氧基硝基胆甾烷的细胞毒性和抗氧化活性 | 本研究创新性地将人工智能辅助的深度学习应用于药物设计，生成了60种AI设计的分子，并进行了分子对接分析以筛选最佳候选分子 | 研究中合成的部分化合物未能满足Lipinski规则和ADMET性质，且显示出致突变性或生殖/发育毒性 | 旨在开发针对SARS-CoV-2的有效治疗药物 | 7β-氨基胆甾烯衍生物和3β-乙酰氧基-6-硝基胆甾-4,6-二烯 | 药物设计 | COVID-19 | 分子对接、分子动力学模拟 | 深度学习 | 化合物结构数据 | 合成了多种胆甾烯衍生物，并进行了虚拟筛选和AI辅助设计 |
| 13328 | 2024-10-24 |
INSPIRE: interpretable, flexible and spatially-aware integration of multiple spatial transcriptomics datasets from diverse sources
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.23.614539
PMID:39386646
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为INSPIRE的深度学习方法，用于整合来自不同来源的多个空间转录组数据集 | INSPIRE通过图神经网络和对抗学习机制，实现了对不同来源数据的空间感知和适应性整合，并利用非负矩阵分解揭示了可解释的空间因子及其对应的基因程序 | NA | 解决来自不同样本、技术和发育阶段的空间转录组数据的有效整合和解释问题 | 人类大脑皮层切片、小鼠大脑切片、小鼠海马体和胚胎切片以及时空器官发生图谱 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 图神经网络 | 空间转录组数据 | 涉及超过50万个空间点的时空器官发生图谱 |
| 13329 | 2024-10-24 |
Small metal artifact detection and inpainting in cardiac CT images
2024-Sep-25, ArXiv
PMID:39398205
|
研究论文 | 本文开发了一种自动检测和修复心脏CT图像中金属伪影的方法 | 提出了基于深度学习的2D U-Net模型用于金属伪影检测，以及3D图像修复模型用于伪影区域的修复 | 仅在合成数据和少量患者数据上进行了验证，需要在更多临床数据上进行进一步验证 | 开发一种自动检测和修复心脏CT图像中金属伪影的方法，以提高心脏运动分析的准确性 | 心脏CT图像中的金属伪影 | 计算机视觉 | 心血管疾病 | 深度学习 | U-Net | 图像 | 12名接受心脏放射治疗的患者，以及148名患者的无伪影心脏CT图像 |
| 13330 | 2024-10-24 |
PharmRL: Pharmacophore elucidation with Deep Geometric Reinforcement Learning
2024-Sep-24, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5033986/v1
PMID:39399689
|
研究论文 | 本文开发了一种深度几何强化学习方法，用于在没有配体的情况下识别蛋白质结合位点中的药效团 | 提出了一种新的深度学习方法，能够在没有配体的情况下识别药效团，并在虚拟筛选中表现出更好的性能 | NA | 开发一种新的深度学习方法，用于在没有配体的情况下识别蛋白质结合位点中的药效团 | 蛋白质结合位点中的药效团 | 机器学习 | NA | 深度几何Q-学习算法 | CNN | 蛋白质结合位点数据 | 使用了DUD-E、LIT-PCBA和COVID moonshot数据集进行实验 |
| 13331 | 2024-10-24 |
A Novel Technique for Fluorescence Lifetime Tomography
2024-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.19.613888
PMID:39345436
|
研究论文 | 本文介绍了一种用于荧光寿命断层成像的新技术 | 提出了一种基于深度学习的方法AUTO-FLI，用于在深层组织中进行三维强度和定量寿命重建 | NA | 开发一种在深层组织中进行三维荧光寿命成像的新技术 | 深层组织的荧光寿命成像 | 计算机视觉 | NA | 深度学习 | 深度神经网络 | 图像 | 实验幻影 |
| 13332 | 2024-10-24 |
Vocal Call Locator Benchmark (VCL) for localizing rodent vocalizations from multi-channel audio
2024-Sep-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.20.613758
PMID:39345431
|
研究论文 | 本文介绍了用于定位啮齿动物发声的VCL基准，提供了大规模的多通道音频和视频数据集 | 首次提出了用于生物声学领域声源定位算法评估的大规模数据集VCL基准 | 现有方法在实验室环境中定位动物发声的能力有限 | 促进神经科学和声学机器学习领域的知识转移，解决声源定位问题 | 啮齿动物的社会发声定位 | 机器学习 | NA | 声源定位 | NA | 音频和视频 | 767,295个声音样本，涵盖9种条件 |
| 13333 | 2024-10-24 |
Real-space heterogeneous reconstruction, refinement, and disentanglement of CryoEM conformational states with HetSIREN
2024-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.16.613176
PMID:39345408
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于深度学习的新方法HetSIREN，用于在真实空间中重建和细化CryoEM构象状态，并解耦姿态和CTF信息 | HetSIREN引入了新的网络架构，使用元正弦激活函数，能够在真实空间中进行空间聚焦分析，并能同时细化图像的姿态参数，解耦姿态和CTF信息 | NA | 开发一种新的深度学习方法，用于在真实空间中重建和细化CryoEM构象状态，并解决结构异质性估计中的混淆问题 | CryoEM图像的构象状态重建和细化，以及SARS-CoV-2 Spike蛋白的结构和动力学 | 计算机视觉 | NA | Cryo-electron microscopy (CryoEM) | 深度学习模型 | 图像 | 包括计算机模拟数据、EMPIAR公共数据以及实验室正在研究的实验系统数据 |
| 13334 | 2024-10-24 |
Dissection of core promoter syntax through single nucleotide resolution modeling of transcription initiation
2024-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.13.583868
PMID:38559255
|
研究论文 | 本文介绍了CLIPNET模型，通过单核苷酸分辨率建模转录起始，揭示了核心启动子区域的复杂调控语法 | CLIPNET模型能够以单核苷酸分辨率更准确地预测转录起始的位置和数量，揭示了核心启动子区域的复杂调控语法 | NA | 研究DNA序列如何编码转录起始模式 | 核心启动子区域的DNA序列和转录起始模式 | 机器学习 | NA | NA | 深度学习模型 | DNA序列 | 群体规模的PRO-cap数据 |
| 13335 | 2024-10-24 |
Comparison of Explainable AI Models for MRI-based Alzheimer's Disease Classification
2024-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.17.613560
PMID:39345522
|
研究论文 | 本文比较了可解释AI模型在基于MRI的阿尔茨海默病分类中的应用 | 本文引入了遮挡敏感性分析（OSA）和梯度加权类激活映射（Grad-CAM）来提高深度学习模型的可解释性 | 研究主要基于北美和欧洲祖先的数据集，未充分考虑其他种族的数据 | 评估在不同数据集上训练的深度学习模型在阿尔茨海默病分类中的泛化能力和可解释性 | 基于3D T1加权脑部MRI扫描的阿尔茨海默病分类 | 计算机视觉 | 阿尔茨海默病 | 遮挡敏感性分析（OSA）、梯度加权类激活映射（Grad-CAM） | 卷积神经网络（CNN） | MRI图像 | 包括来自阿尔茨海默病神经影像学倡议（ADNI）、国家阿尔茨海默病协调中心（NACC）和印度NIMHANS队列的数据集 |
| 13336 | 2024-10-24 |
G2PDeep-v2: a web-based deep-learning framework for phenotype prediction and biomarker discovery using multi-omics data
2024-Sep-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.10.612292
PMID:39314346
|
研究论文 | G2PDeep-v2 是一个基于深度学习的网络平台，用于从多组学数据中进行表型预测和生物标志物发现 | 提供了一个交互式界面，用户可以通过该界面创建深度学习模型，并使用自动化超参数调优算法在高性能计算资源上训练这些模型 | NA | 开发一个基于深度学习的平台，用于从多组学数据中进行表型预测和生物标志物发现 | 人类、植物、动物和病毒的多组学数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习模型 | 多组学数据 | NA |
| 13337 | 2024-10-24 |
Robust Real-time Segmentation of Bio-Morphological Features in Human Cherenkov Imaging during Radiotherapy via Deep Learning
2024-Sep-09, ArXiv
PMID:39314506
|
研究论文 | 本文提出了一种基于深度学习的实时生物形态特征分割框架，用于放射治疗期间的人体切伦科夫成像 | 首次将深度学习应用于切伦科夫成像中的生物形态特征分割，实现了视频帧率处理，并采用了迁移学习策略以解决标注数据有限的问题 | 研究样本量较小，仅包括19名乳腺癌患者的治疗数据 | 开发一种能够在放射治疗期间实时分割生物形态特征的深度学习框架 | 放射治疗期间切伦科夫成像中的生物形态特征，如血管、皮下静脉、疤痕和色素皮肤 | 计算机视觉 | 乳腺癌 | 深度学习 | ResNet | 图像 | 19名乳腺癌患者的1,483张切伦科夫图像 |
| 13338 | 2024-10-24 |
Enhancing Vaxign-DL for Vaccine Candidate Prediction with added ESM-Generated Features
2024-Sep-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.04.611295
PMID:39282385
|
研究论文 | 本研究通过添加ESM生成的特征，改进了Vaxign-DL疫苗候选预测模型 | 首次展示了蛋白质折叠特征在疫苗抗原预测中的附加价值 | NA | 改进疫苗候选预测模型的性能 | 细菌保护性抗原的预测 | 机器学习 | NA | 深度学习 | DL | 蛋白质序列 | 10种细菌病原体 |
| 13339 | 2024-10-24 |
Enhancing rural healthcare through internet-based remote collaborative outpatient services: A comprehensive evaluation in Changzhi, Shanxi Province
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039614
PMID:39252255
|
研究论文 | 本文评估了基于互联网的远程协作门诊服务在山西省长治市农村地区的应用效果 | 通过整合云计算和移动健康技术，提出了基于互联网的协作门诊服务，以改善农村地区的医疗保健 | NA | 评估基于互联网的远程协作门诊服务在农村地区的可行性和效果 | 山西省长治市4个县的495个农村社区和5000多名农村居民 | NA | NA | 深度学习算法 | 深度学习 | 医疗数据 | 5000多名农村居民 |
| 13340 | 2024-10-24 |
Study of obesity research using machine learning methods: A bibliometric and visualization analysis from 2004 to 2023
2024-Sep-06, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000039610
PMID:39252327
|
研究论文 | 本研究通过文献计量学和可视化分析，系统评估了2004年至2023年间使用机器学习方法进行肥胖研究的出版物 | 首次利用文献计量学工具揭示了机器学习在肥胖研究中的内在关系和发展模式 | 仅限于英文出版物，可能忽略了其他语言的重要研究 | 量化、可视化和分析使用机器学习方法进行肥胖研究的出版物 | 2004年至2023年间使用机器学习方法进行肥胖研究的出版物 | 机器学习 | 肥胖 | 文献计量学 | NA | 文本 | 3286篇符合条件的出版物 |