深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
121	2025-09-20	Muti-band Morlet mutual information functional connectivity for classifying Alzheimer's disease and frontotemporal dementia with a deep learning technique 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.111041 PMID:40902468	研究论文	提出一种基于多频段Morlet小波互信息功能连接和3D-CNN的深度学习框架，用于区分阿尔茨海默病、额颞叶痴呆和健康对照	首次将多频段Morlet小波互信息功能连接与改进VGG架构的3D-CNN结合，实现了超过90%的分类准确率，并识别出默认模式网络中的EEG生物标志物	NA	通过脑电图功能连接特征实现阿尔茨海默病和额颞叶痴呆的准确分类	阿尔茨海默病患者、额颞叶痴呆患者和健康对照人群	数字病理学	老年疾病	脑电图（EEG）、多频段Morlet小波互信息功能连接	3D-CNN（基于改进的VGG架构）	脑电图信号	NA
122	2025-09-20	CISCA and CytoDArk0: A cell instance segmentation and classification method for histo(patho)logical image Analyses and a new, open, Nissl-stained dataset for brain cytoarchitecture studies 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.111018 PMID:40902464	研究论文	提出一种用于组织病理学图像细胞实例分割与分类的深度学习框架CISCA，并发布首个尼氏染色脑组织标注数据集CytoDArk0	提出三头轻量化U-Net架构，集成边界分类、方向距离图回归与细胞分类功能，首次提供公开的尼氏染色脑细胞标注数据集	NA	开发自动细胞实例分割与分类方法以推动数字病理和脑细胞架构研究	组织切片中的单个细胞（神经元与胶质细胞）	数字病理	神经系统疾病	深度学习，尼氏染色，H&E染色	U-Net with three heads	图像	4个公开数据集（CoNIC/PanNuke/MoNuSeg）及包含近4万个标注细胞的CytoDArk0数据集
123	2025-09-20	Automated detection of lameness in dairy cattle through computer vision analysis of back shape characteristics 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.111038 PMID:40915069	研究论文	通过计算机视觉分析奶牛背部形状特征实现奶牛跛行的自动检测	首次使用关键点检测算法和深度学习模型对奶牛背部三个区域（颅侧、中间、尾侧）进行曲率分析，实现高精度跛行分类	仅使用侧视单相机采集数据，颅侧区域对跛行检测贡献度较低（η=0.02）	开发客观的自动化奶牛跛行检测方法以提高动物福利和农场生产效率	260头荷斯坦-弗里斯兰奶牛	计算机视觉	NA	关键点检测算法、曲率分析、深度学习	深度学习模型	图像	260头奶牛
124	2025-09-20	Emulating visual evaluations in the microscopic agglutination test with deep learning 2025-Oct, Journal of microbiological methods IF:1.7Q4 DOI:10.1016/j.mimet.2025.107249 PMID:40915619	研究论文	本研究使用深度学习模拟显微镜凝集试验中的人类专家评估，以提高诊断一致性和客观性	利用预训练DenseNet121网络将主观视觉评估转化为可重复的数值输出，并通过UMAP可视化增强模型可解释性	仅使用内部数据集进行验证，需要进一步外部验证和临床整合研究	提高人畜共患钩端螺旋体病诊断的客观性和一致性	显微镜凝集试验图像	计算机视觉	钩端螺旋体病	深度学习，UMAP降维技术	DenseNet121	图像	内部数据集（具体数量未说明）
125	2025-09-20	Self-supervised representation learning with continuous training data improves the feel and performance of myoelectric control 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.111029 PMID:40921113	研究论文	本研究探讨使用连续动态数据和自监督学习改进基于肌电信号模式识别的控制性能	采用连续动态训练数据和自监督预训练技术(VICReg)提升肌电控制器的时序建模能力	NA	提高肌电控制系统的实用性和用户体验	肌电信号模式识别与控制	机器学习	NA	自监督学习(VICReg)	LSTM, LDA	肌电信号时序数据	20名参与者
126	2025-09-20	MRS-Sim: Open-Source Framework for Simulating In Vivo-Like Magnetic Resonance Spectra 2025-Oct, NMR in biomedicine IF:2.7Q1 DOI:10.1002/nbm.70130 PMID:40955682	研究论文	介绍了一个用于模拟体内磁共振波谱的开源框架MRS-Sim，旨在生成具有已知真实值的合成数据	包含两个新颖组件：3D场图模拟器用于模拟场不均匀性，以及半参数生成器模拟未充分表征的残余水区域和基线贡献	NA	开发和验证磁共振波谱方法，提供真实合成数据支持	磁共振波谱数据	医学影像分析	NA	磁共振波谱(MRS)	半参数生成器	光谱数据	NA
127	2025-09-20	Application of artificial intelligence in microbial drug discovery: Unlocking new frontiers in biotechnology 2025-Oct, Journal of microbiological methods IF:1.7Q4 DOI:10.1016/j.mimet.2025.107232 PMID:40846079	综述	本文综述了人工智能在微生物药物发现中的应用及其对生物技术领域的推动作用	整合生成对抗网络、强化学习和自然语言处理等AI技术，实现从分子设计到临床加速的全流程创新	数据质量不一致、模型可解释性有限以及伦理法律问题尚未解决	利用人工智能技术加速抗微生物药物的发现与开发	细菌、真菌和病毒病原体相关的药物发现	计算生物学	传染病	深度学习、机器学习、大数据分析、NLP	GAN、强化学习模型	生物医学大数据、文献文本	NA
128	2025-09-20	Deep learning-based feature discovery for decoding phenotypic plasticity in pediatric high-grade gliomas single-cell transcriptomics 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110971 PMID:40848317	研究论文	利用基于深度学习和图机器学习的方法，从儿童高级别胶质瘤单细胞转录组数据中识别表型可塑性的关键调控特征	通过复杂网络动态和基于图的机器学习，揭示了IDHWT胶质母细胞瘤和K27M突变型中线胶质瘤中亚型特异性可塑性的关键决定因素，并发现跨子系统的过渡基因和中枢基因	NA	解码儿童高级别胶质瘤（pHGGs）中的表型可塑性机制	儿童高级别胶质瘤（pHGGs）的单细胞转录组数据，包括IDHWT胶质母细胞瘤和K27M突变型中线胶质瘤亚型	生物信息学	儿童高级别胶质瘤	单细胞转录组测序，基于图的机器学习	深度学习，图机器学习	单细胞转录组数据	NA
129	2025-09-20	Deep learning ensemble for abdominal aortic calcification scoring from lumbar spine X-ray and DXA images 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110961 PMID:40848321	研究论文	提出一种基于深度学习集成模型的方法，用于从腰椎X射线和DXA图像中自动量化腹主动脉钙化评分	将AAC评分视为正态分布随机变量以考虑人工评分变异性，并采用集成CNN模型预测可能的AAC评分分布	NA	开发自动化AAC评分方法以识别心血管疾病高风险个体	腹主动脉钙化（AAC）	计算机视觉	心血管疾病	深度学习，卷积神经网络	CNN集成模型	X射线图像，DXA图像	NA
130	2025-09-20	OpenSpindleNet: An open-source deep learning network for reliable sleep spindle detection in scalp and intracranial EEG 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110854 PMID:40857816	研究论文	介绍一种名为OpenSpindleNet的开源深度学习网络，用于在头皮和颅内脑电图中可靠检测睡眠纺锤波	采用双头架构的新型自动检测方法，在性能和鲁棒性上优于现有方法如SUMO、A7和YASA	NA	开发精确自动的睡眠纺锤波检测方法，以促进对睡眠状态生理学和脑健康的研究	头皮脑电图(EEG)和颅内脑电图(iEEG)数据	机器学习	神经系统疾病	深度学习	双头架构神经网络	脑电图信号	在iEEG数据集和公开的DREAMS头皮EEG数据集上进行测试
131	2025-09-20	Squat errors classification based on National Academy of Sports Medicine guidelines using IMU and deep learning algorithms 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110962 PMID:40857817	研究论文	基于NASM指南，利用IMU和深度学习算法对深蹲错误进行分类	结合多种混合深度学习架构（如CNN-GRU）并探索单IMU传感器的最优放置策略，实现高精度自动化分类	样本量较小（20名运动员），未提及模型泛化能力到更广泛人群的验证	开发自动化深蹲错误分类方法以替代主观视觉评估	运动员的深蹲动作（包括正确和四种错误形式）	运动科学	NA	惯性测量单元（IMU）数据采集	CNN, GRU, TabNet及混合架构（如CNN-GRU, CNN-TabNet）	运动学传感器数据	20名运动员（10男10女），每人完成5种深蹲变式
132	2025-09-20	Polyp segmentation in colonoscopy images using DeepLabV3+ 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110986 PMID:40876416	研究论文	本研究提出了一种基于DeepLabV3+改进的DeepLabV3++模型，用于提高结肠镜图像中息肉分割的精度和鲁棒性	在编码器中采用EfficientNetV2S减少可训练参数，并集成了多尺度金字塔池化(MSPP)和并行注意力聚合模块(PAAB)，重新设计了解码器结构	仅在三个公开数据集上进行验证，未提及临床实际应用环境的测试结果	提升结肠镜图像中息肉分割的准确性和鲁棒性，辅助结直肠癌的早期识别与诊断	结肠镜图像中的息肉区域	计算机视觉	结直肠癌	深度学习图像分割	DeepLabV3++, EfficientNetV2S	图像	三个公开数据集(CVC-ColonDB, CVC-ClinicDB, Kvasir-SEG)
133	2025-09-20	LUNAR: Periodicity-aware time-series analysis framework for LUNg Auscultation Respiratory detection 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110947 PMID:40876419	研究论文	提出一种周期性感知的深度学习框架LUNAR，用于自动检测肺听诊信号中的呼吸周期	集成新型呼吸周期性感知模块(RPAM)与CNN，显式建模呼吸周期的重复特性，无需依赖专家手动标注	NA	开发自动化呼吸周期检测方法以辅助呼吸系统疾病诊断	肺听诊信号	数字病理	呼吸系统疾病（哮喘、COPD、肺炎）	深度学习	CNN	时间序列信号	训练集279例，验证集ICBHI 126例和SNUCH_Lung 203例
134	2025-09-20	Advancements in biomedical rendering: A survey on AI-based denoising techniques 2025-Oct, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1 DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110979 PMID:40882480	综述	本文调查了基于AI的去噪技术在生物医学渲染中的应用，并通过专业医护人员问卷分析其主观评价与定量指标的不一致性	通过专业医护人员的主观评价调查，揭示AI去噪技术在CT图像渲染中定量指标与主观感知之间的差异	样本量相对较小（74人），且依赖作者专业网络进行抽样，可能存在选择偏差	探究深度学习去噪技术在CT体积可视化中的主观评价与定量结果不一致的原因	放射科医师、住院医师、骨科外科医生和兽医等医疗专业人员	计算机视觉	NA	蒙特卡洛路径追踪，AI去噪	深度学习	CT图像，视频	74名医疗专业人员（经验<1年11人，1-3年27人，3-5年12人，>5年24人）
135	2025-09-20	Designing Buchwald-Hartwig Reaction Graph for Yield Prediction 2025-Sep-19, The Journal of organic chemistry IF:3.3Q1 DOI:10.1021/acs.joc.5c01400 PMID:40929732	研究论文	设计了一种用于Buchwald-Hartwig反应产率预测的新型反应图表示方法	提出Buchwald-Hartwig反应图，通过将每个反应物表示为图中的独立节点来模拟多组分相互作用，同时捕获单分子和分子间关系特征	NA	开发基于图神经网络的化学反应产率预测模型	Buchwald-Hartwig反应体系	机器学习	NA	图神经网络(GNN)	BH-RGNN (B-H Reaction Graph Neural Network)	化学反应数据	高通量B-H反应数据集
136	2025-09-20	PWLS-SOM: alternative PWLS reconstruction for limited-view CT by strategic optimization of a deep learning model 2025-Sep-19, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/adffe0 PMID:40865562	研究论文	提出一种结合深度学习先验与数据一致性的新型有限视角CT重建方法PWLS-SOM	引入显著性评分机制量化模型参数贡献，并采用三阶段策略优化实现DL先验与PWLS自适应的融合	NA	改善有限视角CT中的条纹伪影抑制与鲁棒重建	CT投影数据	医学影像重建	NA	惩罚加权最小二乘(PWLS)重建、深度学习	深度学习网络	CT投影数据	大规模配对数据集（具体数量未说明）及死亡大鼠真实实验
137	2025-09-20	Full-Spectrum phototherapy in hair loss management: a systematic review of wavelength-dependent mechanisms, clinical efficacy, and future directions 2025-Sep-19, Lasers in medical science IF:2.1Q2 DOI:10.1007/s10103-025-04616-3 PMID:40968340	综述	本文系统综述了全光谱光疗在脱发管理中的波长依赖性机制、临床疗效及未来发展方向	提出新型'波长-穿透深度-靶向机制'模型，阐明全光谱光疗对毛囊再生的多层次调控作用	存在治疗窗口窄、患者反应差异大和组织穿透有限等未解决挑战	探讨光疗作为精准无创治疗方式在脱发管理中的应用潜力	脱发患者（包括斑秃和雄激素性脱发）的毛囊再生机制	医学光疗	脱发疾病	全光谱光疗（紫外到中红外波长）	NA	临床研究数据	NA
138	2025-09-20	MorphoITH: a framework for deconvolving intra-tumor heterogeneity using tissue morphology 2025-Sep-19, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-025-01504-x PMID:40968388	研究论文	提出MorphoITH框架，利用组织形态学从病理切片推断肿瘤内异质性	开发了一种任务无关的自监督深度学习相似性度量方法，从多维度量化表型多样性	NA	研究肿瘤内异质性和肿瘤进化，支持精准肿瘤学	透明细胞肾细胞癌（ccRCC）	数字病理学	肾癌	深度学习，多区域测序	自监督深度学习	组织病理学切片图像	NA
139	2025-09-20	Research progress and future prospects in intelligent lung sound diagnosis: models, lightweight design, and hardware platform implementation 2025-Sep-19, Biomedizinische Technik. Biomedical engineering DOI:10.1515/bmt-2025-0197 PMID:40968576	综述	本文系统回顾了基于深度学习的肺音智能识别技术，重点关注模型构建、轻量化设计及硬件平台部署的最新进展	深入探讨了肺音识别模型在嵌入式系统和FPGA等硬件平台的部署路径，特别是软硬件协同设计在边缘计算中的应用前景	NA	推动肺音智能识别技术在医疗辅助诊断领域的发展，实现低延迟本地推理	肺音信号	数字病理	呼吸系统疾病	深度学习	深度学习模型	音频信号	NA
140	2025-09-20	Cross-Modal Interaction-Aware Progressive Fusion Network for Drug-Target Interaction Prediction 2025-Sep-19, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.5c01429 PMID:40970765	研究论文	提出一种用于药物-靶点相互作用预测的跨模态交互感知渐进融合网络（CIPFN）	引入双向交互感知模块精确对齐药物与蛋白质间的细粒度交互，并开发包含门控和卷积融合块的渐进融合网络	NA	改进药物-靶点相互作用（DTI）预测的准确性和效率	药物和蛋白质之间的相互作用	机器学习	NA	深度学习	CIPFN（包含门控和卷积融合块的融合网络）	跨模态数据（药物和蛋白质的交互信息）	五个基准数据集