深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
14481	2024-10-07	Repairing Noise-Contaminated Low-Frequency Vibrational Spectra with an Attention U-Net 2024-Oct-05, Journal of the American Chemical Society IF:14.4Q1 DOI:10.1021/jacs.4c10893 PMID:39367839	研究论文	本文开发了一种基于注意力增强U-net架构的深度学习去噪协议，用于修复低频振动光谱中的噪声污染	利用高频和低频振动模式之间的内在相关性，有效重建低频光谱特征	NA	解决低频振动光谱检测和分析中的挑战	低频振动模式在红外和拉曼光谱中的应用	机器学习	NA	深度学习	注意力U-net	光谱	实验中使用了吸附在Ag表面上的-1,2-双(4-吡啶基)乙烯(BPE)作为代表性系统
14482	2024-10-07	A comparative study of early stage Alzheimer's disease classification using various transfer learning CNN frameworks 2024-Oct-05, Network (Bristol, England) DOI:10.1080/0954898X.2024.2406946 PMID:39367861	研究论文	本文研究了使用多种迁移学习CNN框架对早期阿尔茨海默病进行分类的效果	通过在基础CNN架构中加入批量归一化、dropout和全连接层，提高了模型对阿尔茨海默病分类的准确性和效率	未提及具体限制	评估和比较不同迁移学习CNN框架在早期阿尔茨海默病分类中的性能	早期阿尔茨海默病的分类	计算机视觉	阿尔茨海默病	迁移学习	CNN	图像	训练图像5120张，测试图像1280张
14483	2024-10-07	Enhanced image quality and lesion detection in FLAIR MRI of white matter hyperintensity through deep learning-based reconstruction 2024-Oct-04, Asian journal of surgery IF:3.5Q1 DOI:10.1016/j.asjsur.2024.09.156 PMID:39368951	研究论文	研究深度学习重建（DLR）在3.0T扫描仪上对白质高信号（WMH）的评估是否能提高图像质量和病灶检测能力，并与传统重建（CR）进行比较	深度学习重建（DLR）在图像质量和病灶检测敏感性方面显著优于传统重建（CR）	NA	研究深度学习重建（DLR）在白质高信号（WMH）评估中的应用效果	白质高信号（WMH）的图像质量和病灶检测能力	计算机视觉	NA	深度学习重建（DLR）	NA	图像	131名参与者（平均年龄46岁±17；46名男性）
14484	2024-10-07	Computer vision and deep transfer learning for automatic gauge reading detection 2024-10-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-71270-0 PMID:39362865	研究论文	本文提出了一种使用深度学习和图像处理技术的自动模拟仪表读数检测系统	采用DenseNet 169、InceptionNet V3和VGG19等深度迁移学习模型进行自动读数检测，并展示了DenseNet 169在精度和泛化能力上的优势	VGG19模型存在过拟合问题，训练精度高但测试精度较低	开发一种自动化的模拟仪表读数检测系统，提高读数的准确性和效率	模拟仪表的读数检测	计算机视觉	NA	深度学习、机器学习、图像处理	DenseNet 169、InceptionNet V3、VGG19	图像	1011张标注图片，9个类别，读数范围从0到8
14485	2024-10-07	ChemAP: predicting drug approval with chemical structures before clinical trial phase by leveraging multi-modal embedding space and knowledge distillation 2024-10-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-72868-0 PMID:39362916	研究论文	本文介绍了一种名为ChemAP的新型深度学习方案，用于在药物发现早期阶段预测药物批准	首次展示了仅使用药物结构信息通过深度学习技术定义批准和未批准药物的化学空间，从而预测药物批准的可能性	NA	开发一种仅使用化学结构数据在药物开发早期阶段进行决策的计算模型	药物批准预测	机器学习	NA	深度学习	深度学习模型	化学结构数据	使用了药物批准基准数据集和包含2023年FDA批准药物及2024年临床试验失败药物的外部数据集
14486	2024-10-07	Enhancing human computer interaction with coot optimization and deep learning for multi language identification 2024-10-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-74327-2 PMID:39362948	研究论文	本文提出了一种结合Coot优化算法和深度学习的多语言识别技术，用于增强人机交互	开发了一种新的Coot优化算法与深度学习驱动的多语言识别和检测技术（COADL-MSLID），用于人机交互应用	NA	提高人机交互系统中多语言识别的准确性和效率	多语言识别技术在人机交互中的应用	自然语言处理	NA	深度学习	卷积神经网络（CNN）	音频	基准数据集
14487	2024-10-07	Integrative analysis of H&E and IHC identifies prognostic immune subtypes in HPV related oropharyngeal cancer 2024-Oct-03, Communications medicine IF:5.4Q1 DOI:10.1038/s43856-024-00604-w PMID:39363031	研究论文	本文通过整合H&E和IHC图像，利用深度学习技术识别HPV相关口咽癌中的预后免疫亚型	本文创新性地整合了H&E和IHC图像，以增强对肿瘤免疫微环境中细胞组成和功能特征的理解，并改善患者分层	本文的局限性在于其研究对象仅限于HPV阳性口咽鳞状细胞癌患者，且样本量相对较小	本文旨在通过整合H&E和IHC图像，提高对肿瘤免疫微环境中细胞组成和功能特征的理解，并改善患者分层	本文的研究对象为HPV阳性口咽鳞状细胞癌患者	数字病理学	口咽癌	深度学习	NA	图像	88例原发肿瘤和70例受累淋巴结组织图像
14488	2024-10-07	Synergistic application of digital outcrop characterization techniques and deep learning algorithms in geological exploration 2024-Oct-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-74903-6 PMID:39363057	研究论文	本研究开发了一个基于Cesium的野外数字露头可视化平台，结合改进的VGG19算法模型，提高了岩石纹理和复杂结构的识别精度	首次将数字露头表征技术与深度学习算法结合，提供了一种更快、更全面的野外地质条件理解手段	NA	开发一种新的技术平台，以提高地质学家在野外对露头数据的分析效率和易用性	地质露头数据及其在野外的可视化和分析	数字病理学	NA	UAV倾斜摄影	CNN	图像	NA
14489	2024-10-07	Postoperative facial prediction for mandibular defect based on surface mesh deformation 2024-Oct, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery DOI:10.1016/j.jormas.2024.101973 PMID:39089509	研究论文	本研究提出了一种基于表面网格变形的新型预测模型，用于预测下颌骨缺损患者的术后面部轮廓	本研究通过使用表面三角网格和Mesh Convolutional Restricted Boltzmann Machines模型，显著提高了几何信息保留和可解释性	NA	开发一种新的预测模型，以提高下颌骨缺损患者术后面部轮廓预测的准确性和可解释性	下颌骨缺损患者的术后面部轮廓	计算机视觉	NA	表面网格理论和深度学习	Mesh Convolutional Restricted Boltzmann Machines (MCRBM)	三维变形场	NA
14490	2024-10-07	A deep learning approach to detection of oral cancer lesions from intra oral patient images: A preliminary retrospective study 2024-Oct, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery DOI:10.1016/j.jormas.2024.101975 PMID:39043293	研究论文	本研究评估了一种基于深度学习算法的人工智能软件在检测口腔癌病变中的表现	首次使用YOLOv5架构进行口腔癌病变的检测	样本量较小，成功率有待提高	评估人工智能在口腔癌病变预诊断中的潜力	口腔鳞状细胞癌病变	计算机视觉	口腔癌	深度学习	YOLOv5	图像	65张匿名的回顾性口腔内患者图像
14491	2024-10-07	Automatic detection of midfacial fractures in facial bone CT images using deep learning-based object detection models 2024-Oct, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery DOI:10.1016/j.jormas.2024.101914 PMID:38750725	研究论文	本文研究了使用深度学习对象检测模型自动检测面部骨CT图像中的中面部骨折	利用深度学习技术自动检测中面部骨折，提高了诊断的准确性和速度	样本量较小，仅包括100张CT图像	开发一个能够快速准确诊断中面部骨折的系统，以帮助急诊医生和患者	中面部骨折的自动检测	计算机视觉	NA	深度学习	对象检测模型（SSD和YOLOv8）	CT图像	100张包含中面部骨折的CT图像，其中80张用于训练，20张用于验证
14492	2024-10-07	Accuracy of deep learning in the differential diagnosis of coronary artery stenosis: a systematic review and meta-analysis 2024-Sep-16, BMC medical imaging IF:2.9Q2 DOI:10.1186/s12880-024-01403-4 PMID:39285323	meta-analysis	本研究系统评价和荟萃分析了基于冠状动脉造影（CAG）或冠状动脉CT造影（CCTA）图像的深度学习模型在诊断冠状动脉狭窄中的准确性	首次系统性地评估了深度学习在冠状动脉狭窄诊断中的准确性	对于不同程度的狭窄，深度学习模型的准确性仍需进一步提高	评估基于CAG和CCTA图像的深度学习模型在诊断冠状动脉狭窄中的准确性	冠状动脉狭窄的诊断	machine learning	心血管疾病	深度学习	NA	image	3568名患者和13,362张图像
14493	2024-10-07	Inferring single-cell spatial gene expression with tissue morphology via explainable deep learning 2024-Jun-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.06.12.598686 PMID:38915550	研究论文	开发了一种基于视觉变换器（ViT）的框架，用于从组织形态学图像推断单细胞空间基因表达	提出了名为SPiRiT的框架，通过整合交叉验证和模型解释在超参数调优中，显著提高了预测准确性	NA	探索利用组织形态学图像推断单细胞空间基因表达的可行性	人类乳腺癌和小鼠幼崽的组织形态学图像	计算机视觉	乳腺癌	NA	视觉变换器（ViT）	图像	人类乳腺癌和小鼠幼崽的组织样本
14494	2024-10-07	Deep learned representations of the resting 12-lead electrocardiogram to predict at peak exercise 2024-Jan-25, European journal of preventive cardiology IF:8.4Q1 DOI:10.1093/eurjpc/zwad321 PMID:37798122	研究论文	利用深度学习分析静息12导联心电图以预测峰值运动氧消耗	首次使用深度学习从静息12导联心电图中估计峰值氧消耗，无需进行心肺运动测试	研究样本主要来自马萨诸塞州总医院，外部验证样本较少，可能影响结果的普适性	利用深度学习技术从静息12导联心电图中估计峰值氧消耗，以实现高效的心血管风险分层	静息12导联心电图和峰值氧消耗	机器学习	心血管疾病	深度学习	线性模型	心电图数据	1891名进行心肺运动测试的个体，验证集448人，外部样本1076人
14495	2024-10-07	A novel mean shape based post-processing method for enhancing deep learning lower-limb muscle segmentation accuracy 2024, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0308664 PMID:39365764	研究论文	本文提出了一种基于平均形状的后处理方法，用于提高深度学习在磁共振成像（MRI）扫描中下肢肌肉分割的准确性	本文提出了一种新颖的基于平均形状（MS）的后处理方法，利用统计形状建模（SSM）来微调分割输出，考虑肌肉解剖形状	NA	提高基于MRI扫描的下肢肌肉分割的准确性，这对肌肉骨骼疾病的诊断和治疗过程至关重要	下肢肌肉的分割	计算机视觉	NA	MRI扫描	U-Net深度学习神经网络	图像	两个队列的绝经后女性（10个训练样本，8个测试样本，体素大小1.0x1.0x1.0 mm³）
14496	2024-10-07	Performance comparison of TCR-pMHC prediction tools reveals a strong data dependency 2023, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2023.1128326 PMID:37143667	研究论文	本文比较了五种最先进的深度学习模型在TCR-pMHC预测工具中的性能，揭示了数据依赖性	提供了数据收集、预处理、分割和生成负样本的通用方法，并使用综合数据集比较了TCR-pMHC预测模型的性能	模型在未见过的肽段上泛化能力较差，且性能受数据平衡和大小影响较大	评估和比较不同TCR-pMHC预测模型的性能	TCR-pMHC结合预测模型	机器学习	NA	深度学习	深度学习模型（TITAN, NetTCR-2.0, ERGO, DLpTCR, ImRex）	TCR-pMHC结合数据	收集并整合了所有主要的公开可用TCR-pMHC结合数据
14497	2024-10-07	Multimodal deep learning models for early detection of Alzheimer's disease stage 2021-02-05, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-020-74399-w PMID:33547343	研究论文	本文利用深度学习技术整合影像、基因和临床测试数据，用于阿尔茨海默病早期阶段的分类	提出了一种新的数据解释方法，通过聚类和扰动分析识别深度模型学习到的顶级特征	未提及	开发多模态深度学习模型用于阿尔茨海默病早期阶段的检测	阿尔茨海默病、轻度认知障碍和对照组患者	机器学习	阿尔茨海默病	深度学习	3D-卷积神经网络	影像、基因和临床测试数据	使用阿尔茨海默病神经影像学倡议(ADNI)数据集
14498	2024-10-07	Classification of colorectal tissue images from high throughput tissue microarrays by ensemble deep learning methods 2021-01-27, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-021-81352-y PMID:33504830	研究论文	研究通过集成深度学习方法对高吞吐量组织微阵列中的结直肠组织图像进行分类	提出了使用软投票集成方法结合VGG和CapsNet模型，显著提高了分类准确率	未提及具体局限性	开发高准确率的算法用于结直肠组织分类，减少TMA核心评估中的错误	结直肠组织的H&E染色核心图像	计算机视觉	结直肠癌	深度学习	集成模型	图像	15,150个核心图像，包括2144个训练样本和13,006个测试样本
14499	2024-10-07	Natural Language Processing-Based Virtual Cofacilitator for Online Cancer Support Groups: Protocol for an Algorithm Development and Validation Study 2021-Jan-07, JMIR research protocols IF:1.4Q3 DOI:10.2196/21453 PMID:33410754	研究论文	本文介绍了一种基于自然语言处理技术的虚拟共同促进者，用于在线癌症支持小组，旨在实时分析文本消息以监测参与者的情感困扰	利用人工智能技术实时分析在线支持小组的文本数据，以识别和跟踪参与者的情感困扰，提供实时警报和个性化资源建议	NA	开发和评估一种基于人工智能的共同促进者原型，以实时监测在线支持小组参与者的情感困扰	在线癌症支持小组的参与者及其情感困扰	自然语言处理	NA	自然语言处理	NA	文本	NA
14500	2024-10-07	Deep neural network models for computational histopathology: A survey 2021-01, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2020.101813 PMID:33049577	综述	本文综述了深度学习在计算病理学中的应用	总结了当前最先进的深度学习方法在病理图像分析中的进展	指出了当前深度学习方法的局限性和未来研究的方向	综述深度学习在病理图像分析中的应用	病理图像和疾病预后模型	数字病理学	NA	深度学习	深度神经网络	图像	超过130篇相关论文