深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
14801	2024-10-04	The Number and Size of Individual Kidney Medullary Pyramids is Associated with Clinical Characteristics, Kidney Biopsy Findings, and CKD Outcomes among Kidney Donors 2023-10-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1 DOI:10.1681/ASN.0000000000000203 PMID:37562061	研究论文	本文开发并验证了一种深度学习算法，用于快速、准确和可重复地分割肾脏髓质锥体，并探讨了锥体数量和大小与临床特征、肾活检结果及慢性肾脏病（CKD）结局的关系	首次使用深度学习算法自动分割肾脏髓质锥体，并研究其与临床特征和CKD结局的关联	NA	研究肾脏髓质锥体的数量和大小与临床特征、肾活检结果及CKD结局的关系	肾脏髓质锥体的数量和大小	数字病理学	慢性肾脏病	深度学习算法	深度学习模型	图像	2876名活体肾脏捐赠者
14802	2024-10-04	DeepAFP: An effective computational framework for identifying antifungal peptides based on deep learning 2023-10, Protein science : a publication of the Protein Society IF:4.5Q1 DOI:10.1002/pro.4758 PMID:37595093	研究论文	本文开发了一种基于深度学习的计算框架DeepAFP，用于高效识别抗真菌肽	DeepAFP利用多分支卷积神经网络和双向长短期记忆层的组合核，结合迁移学习策略，提高了模型性能	NA	开发一种高效识别抗真菌肽的计算框架，以加速抗真菌肽的开发和真菌感染的治疗	抗真菌肽的识别	机器学习	NA	深度学习	卷积神经网络（CNN）和双向长短期记忆网络（LSTM）	序列数据	DeepAFP-Main数据集
14803	2024-10-04	CardioVision: A fully automated deep learning package for medical image segmentation and reconstruction generating digital twins for patients with aortic stenosis 2023-10, Computerized medical imaging and graphics : the official journal of the Computerized Medical Imaging Society IF:5.4Q1 DOI:10.1016/j.compmedimag.2023.102289 PMID:37633032	研究论文	开发了一个全自动的深度学习工具，用于医学图像分割和重建，生成主动脉瓣狭窄患者的数字孪生体	利用U-Net架构的深度学习模型实现了全自动的医学图像分割，显著减少了计算成本并提高了精度	NA	优化新兴设备，预测临床结果，并模拟虚拟介入手术	主动脉瓣狭窄患者的数字孪生体	计算机视觉	心血管疾病	深度学习	U-Net	图像	NA
14804	2024-10-04	Automatic Localization of the Pons and Vermis on Fetal Brain MR Imaging Using a U-Net Deep Learning Model 2023-10, AJNR. American journal of neuroradiology DOI:10.3174/ajnr.A7978 PMID:37652583	研究论文	本文开发了一种基于U-Net深度学习模型的方法，用于在胎儿脑部MRI图像中自动定位脑桥和小脑蚓部	首次使用U-Net深度学习模型自动识别胎儿脑部MRI图像中的解剖标志，并生成模型预测的置信度分数	仅使用了55例胎儿脑部MRI图像进行训练和验证，样本量较小	开发一种自动化的深度学习模型和流程，用于在胎儿脑部MRI图像中识别解剖标志，以提高测量脑桥和小脑蚓部的准确性	胎儿脑部MRI图像中的脑桥和小脑蚓部	计算机视觉	NA	深度学习	U-Net	图像	55例胎儿脑部MRI图像
14805	2024-10-04	Open-Source Automated Segmentation of Neuronal Structures in Corneal Confocal Microscopy Images of the Subbasal Nerve Plexus With Accuracy on Par With Human Segmentation 2023-Oct-01, Cornea IF:1.9Q2 DOI:10.1097/ICO.0000000000003319 PMID:37669422	研究论文	本文研究了在角膜共聚焦显微镜图像中自动分割神经结构的方法	提出了一种基于深度学习的两阶段算法，能够自动分割角膜神经和其他结构，准确度与人工分割相当	NA	实现角膜神经和其他结构在角膜共聚焦显微镜图像中的自动分割	角膜神经和其他结构在角膜共聚焦显微镜图像中的自动分割	计算机视觉	眼表疾病	深度学习	生成对抗网络	图像	训练和验证集包含来自73个个体每层的470张图像，测试集包含来自43个眼表疾病患者的207张手动分割的图像
14806	2024-10-04	Deep Learning-Based Feature Extraction from Whole-Body PET/CT Employing Maximum Intensity Projection Images: Preliminary Results of Lung Cancer Data 2023-Oct, Nuclear medicine and molecular imaging IF:1.3Q3 DOI:10.1007/s13139-023-00802-9 PMID:37720886	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的方法，利用全身PET/CT生成的最大强度投影图像进行特征提取，并应用于肺癌数据的初步结果	本文创新地使用最大强度投影图像作为输入，避免了直接使用3D PET体积数据，从而减少了数据处理难度和资源需求	本文仅提供了初步结果，尚未在大规模数据集上验证其有效性	探索基于深度学习的特征提取方法在全身PET/CT图像分析中的应用	肺癌患者的全身PET/CT图像及其临床病理因素	计算机视觉	肺癌	最大强度投影	卷积神经网络	图像	562例肺癌患者的[18F]FDG PET/CT图像及其临床病理因素
14807	2024-10-04	3D Convolution neural network with multiscale spatial and temporal cues for motor imagery EEG classification 2023-Oct, Cognitive neurodynamics IF:3.1Q2 DOI:10.1007/s11571-022-09906-y PMID:37786651	研究论文	本文提出了一种基于3D卷积神经网络的多尺度时空特征提取方法，用于提高运动想象脑电信号分类的准确性	本文创新性地提出了一个端到端的3D CNN模型，能够自适应地分配权重给与运动相关的空间通道和时间采样提示，从而减少生物和环境噪声的影响	NA	提高运动想象脑电信号分类的准确性	运动想象脑电信号	机器学习	NA	3D卷积神经网络	3D CNN	脑电信号	两个常用数据集，分别达到93.06%和97.05%的平均分类准确率
14808	2024-10-04	Expanding Role of Advanced Image Analysis in CT-detected Indeterminate Pulmonary Nodules and Early Lung Cancer Characterization 2023-10, Radiology IF:12.1Q1 DOI:10.1148/radiol.222904 PMID:37815447	综述	本文综述了在胸部CT中使用先进的图像分析技术对不确定的肺结节和早期肺癌进行分类和特征化的方法	介绍了机器学习模型和深度学习架构在CT衍生的放射组学特征中的应用	方法学挑战和技术障碍，如异质性成像参数、最佳特征选择、模型选择以及训练和验证所需的良好注释图像数据集	探讨如何通过早期检测和干预来提高肺癌护理水平	不确定的肺结节和早期肺癌	计算机视觉	肺癌	CT	机器学习模型和深度学习架构	图像	NA
14809	2024-10-04	MRI-based Deep Learning Assessment of Amyloid, Tau, and Neurodegeneration Biomarker Status across the Alzheimer Disease Spectrum 2023-10, Radiology IF:12.1Q1 DOI:10.1148/radiol.222441 PMID:37815445	研究论文	本文利用深度学习技术，通过MRI数据预测PET确定的阿尔茨海默病谱系中的淀粉样蛋白、Tau蛋白和神经退行性变生物标志物状态	本文首次使用MRI数据结合深度学习技术，非侵入性地预测阿尔茨海默病谱系中的ATN生物标志物状态	本文的研究样本量有限，且仅限于阿尔茨海默病影像学倡议的数据集	利用深度学习技术，通过MRI和现有诊断数据预测PET确定的ATN生物标志物状态	阿尔茨海默病谱系中的淀粉样蛋白、Tau蛋白和神经退行性变生物标志物	计算机视觉	阿尔茨海默病	深度学习	卷积神经网络	MRI图像	2099个淀粉样蛋白样本，557个Tau蛋白样本，2768个FDG PET和MRI配对样本
14810	2024-10-04	The Impact of Changing Step 1 to Pass/Fail Reporting on Anxiety, Learning Approaches, and Curiosity 2023-Oct, Medical science educator IF:1.9Q2 DOI:10.1007/s40670-023-01878-w PMID:37886271	研究论文	研究了美国医学执照考试（USMLE）Step 1从三位数评分改为通过/不通过评分对学生焦虑、学习方法和好奇心的影响	首次探讨了USMLE Step 1评分方式改变对学生心理和学习策略的具体影响	样本仅来自三所医学院的预科学生，可能限制了研究结果的普适性	探讨USMLE Step 1评分方式改变对医学生焦虑、学习方法和好奇心的影响	预科医学生的焦虑、学习方法和好奇心	NA	NA	Mann-Whitney U检验和多元回归路径分析	NA	问卷调查数据	86名三位数评分考生和154名通过/不通过评分考生
14811	2024-10-04	Fast Reconstruction for Deep Learning PET Head Motion Correction 2023-Oct, Medical image computing and computer-assisted intervention : MICCAI ... International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention DOI:10.1007/978-3-031-43999-5_67 PMID:38174207	研究论文	本文提出了一种新的头部运动校正框架，利用快速重建作为输入，用于脑部PET成像中的运动校正	采用高分辨率短帧快速重建工作流程，开发了一种新的PET数据表示提取编码器，并实施了数据增强技术	NA	提高脑部PET成像中头部运动校正的准确性和效率	脑部PET成像中的头部运动	计算机视觉	NA	深度学习	编码器	图像	多受试者研究，使用F-FPEB数据集
14812	2024-10-04	Deep learning image analysis quantifies tumor heterogeneity and identifies microsatellite instability in colon cancer 2023-Mar, Journal of surgical oncology IF:2.0Q2 DOI:10.1002/jso.27118 PMID:36251352	研究论文	本文利用深度学习技术分析结直肠癌的肿瘤异质性并识别微卫星不稳定性	提出了肿瘤异质性评分（THS），并发现其与微卫星不稳定性状态相关	需要扩展训练集以开发预测微卫星不稳定性的工具	研究深度学习在结直肠癌肿瘤异质性和微卫星不稳定性识别中的应用	结直肠癌的肿瘤异质性和微卫星不稳定性	数字病理学	结直肠癌	卷积神经网络（CNN）	CNN	图像	313名患者的苏木精-伊红染色（H&E）图像，生成534,771个切片
14813	2024-10-04	Automatic deep learning method for third lumbar selection and body composition evaluation on CT scans of cancer patients 2023, Frontiers in nuclear medicine (Lausanne, Switzerland) DOI:10.3389/fnume.2023.1292676 PMID:39355015	研究论文	开发并验证了一种深度学习算法，用于自动选择和分割癌症患者CT扫描中的第三腰椎以及评估身体成分	首次使用深度学习算法自动选择第三腰椎并分割腹部肌肉、内脏脂肪和皮下脂肪，减少了手动操作的时间和复杂性	仅在两个癌症中心的352例CT扫描中进行了验证，可能需要进一步的多中心验证以确保广泛适用性	开发一种自动化的深度学习方法，用于癌症患者CT扫描中的第三腰椎选择和身体成分评估	癌症患者的CT扫描图像，特别是第三腰椎及其周围的身体成分	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	352例CT扫描
14814	2024-10-04	Coupling analysis of heart rate variability and cortical arousal using a deep learning algorithm 2023, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0284167 PMID:37023117	研究论文	本研究使用深度学习算法分析了心率变异性与皮质觉醒之间的耦合关系	首次在多民族人群中研究了皮质觉醒与心率变异性的即时关联	研究仅限于多民族动脉粥样硬化研究数据集中的1069名受试者	探讨皮质觉醒与心率变异性之间的关联及其在不同性别和睡眠阶段中的差异	心率变异性与皮质觉醒的关联	心血管疾病	NA	深度学习	深度学习算法	心电信号	1069名受试者的整夜心电信号
14815	2024-10-04	Current trends on the application of artificial intelligence in medical sciences 2022, Bioinformation DOI:10.6026/973206300181050 PMID:37693078	综述	本文综述了人工智能在医学科学中的应用现状、面临的挑战以及未来的发展方向	本文系统地总结了人工智能在医疗领域的应用，并提出了未来研究的方向	本文主要集中在综述和总结，未提供具体的实验数据或模型	探讨人工智能在医学科学中的应用及其未来发展	人工智能在医疗领域的应用、面临的挑战及伦理责任	机器学习	NA	机器学习 (ML) 和深度学习 (DL)	NA	NA	NA
14816	2024-10-04	Automatic detection and delineation of pediatric gliomas on combined [18F]FET PET and MRI 2022, Frontiers in nuclear medicine (Lausanne, Switzerland) DOI:10.3389/fnume.2022.960820 PMID:39354975	研究论文	本文提出了一种深度学习方法，用于自动检测和描绘儿童中枢神经系统肿瘤的[18F]FET PET和MRI图像	本文首次将深度学习应用于儿童中枢神经系统肿瘤的自动描绘，提高了描绘的准确性和一致性	研究样本量较小，仅包括66名患者，未来需要在大规模多中心研究中验证其有效性	开发一种自动描绘儿童中枢神经系统肿瘤的方法，以提高诊断和治疗计划的准确性	儿童中枢神经系统肿瘤的[18F]FET PET和MRI图像	计算机视觉	中枢神经系统肿瘤	深度学习	人工神经网络 (ANN)	图像	66名儿童患者的109次[18F]FET PET和MRI扫描
14817	2024-10-04	Deep learning and medical image processing for coronavirus (COVID-19) pandemic: A survey 2021-Feb, Sustainable cities and society IF:10.5Q1 DOI:10.1016/j.scs.2020.102589 PMID:33169099	综述	本文综述了深度学习在COVID-19医学图像处理中的应用现状	本文总结了2020年初以来大量关于深度学习在COVID-19医学图像处理中的研究工作	本文讨论了深度学习在COVID-19医学图像处理中实施的几个挑战和问题	总结和探讨深度学习在COVID-19医学图像处理中的应用	COVID-19医学图像处理	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	NA
14818	2024-10-04	Artificial intelligence neuropathologist for glioma classification using deep learning on hematoxylin and eosin stained slide images and molecular markers 2021-01-30, Neuro-oncology IF:16.4Q1 DOI:10.1093/neuonc/noaa163 PMID:32663285	研究论文	本文开发了一种基于深度学习的人工智能神经病理学家，用于通过苏木精-伊红染色切片图像和分子标记对胶质瘤进行分类	开发了一种新的挤压和激励块DenseNet模型，命名为SD-Net_WCE，用于胶质瘤分类任务	NA	确定深度学习是否可以应用于胶质瘤分类	胶质瘤的病理诊断和分类	数字病理学	脑肿瘤	深度学习	卷积神经网络 (CNN)	图像	79,990个组织切片图像来自267名患者，56名患者的17,262个组织切片图像用于独立测试
14819	2024-10-04	Augmenting Interpretation of Chest Radiographs With Deep Learning Probability Maps 2020-Sep, Journal of thoracic imaging IF:2.0Q3 DOI:10.1097/RTI.0000000000000505 PMID:32205817	研究论文	本文探讨了使用深度学习语义分割方法在胸部X光片上突出显示肺炎潜在焦点，以辅助诊断的可行性	提出了一种基于语义分割的深度学习方法，用于生成肺炎的概率图，以辅助诊断	研究为回顾性研究，使用的是公开数据集，且样本量有限	探索深度学习在胸部X光片上辅助诊断肺炎的可行性	胸部X光片上的肺炎诊断	计算机视觉	肺部疾病	卷积神经网络 (CNN)	U-net	图像	22,000张胸部X光片，其中3684张用于独立验证
14820	2024-10-04	NuSeT: A deep learning tool for reliably separating and analyzing crowded cells 2020-09, PLoS computational biology IF:3.8Q1 DOI:10.1371/journal.pcbi.1008193 PMID:32925919	研究论文	本文介绍了一种基于深度学习的细胞核分割工具NuSeT，用于在显微镜图像中准确分割拥挤的细胞核	NuSeT结合了U-Net和区域提议网络（RPN），并通过分水岭步骤进一步优化，显著提高了在复杂2D和3D图像中检测和描绘细胞核边界的能力	NA	开发一种能够准确分割拥挤细胞核的深度学习工具	显微镜图像中的细胞核	计算机视觉	NA	深度学习	U-Net和区域提议网络（RPN）	图像	多种类型的荧光成像数据