深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
1541	2025-11-02	Radiomics and Artificial Intelligence in Pulmonary Fibrosis 2025-Oct, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-024-01377-3 PMID:39762544	综述	本文通过范围综述探讨了放射组学与人工智能在特发性肺纤维化诊断和预后评估中的应用	系统评估了基于HRCT的深度学习方法在肺纤维化特征提取中的价值，并分析了定量评估纤维化程度的预后意义	纤维化程度定量评估的额外预后价值仍不确定，需要进一步研究验证	研究放射影像学和人工智能在特发性肺纤维化诊断和预后评估中的作用	特发性肺纤维化患者的HRCT影像数据	数字病理学	肺纤维化	高分辨率计算机断层扫描(HRCT)	深度学习	医学影像	NA	NA	NA	k折交叉验证	NA
1542	2025-11-02	Deep Learning Analysis of White Matter Hyperintensity and its Association with Comprehensive Vascular Factors in Two Large General Populations 2025-Oct, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-024-01372-8 PMID:39762547	研究论文	使用深度学习模型分析两个大规模普通人群中白质高信号与综合血管因素之间的关联	首次在两个大规模普通人群队列中系统评估综合血管因素与白质高信号体积的关联	横断面研究设计无法确定因果关系	探究血管因素与白质高信号体积在普通人群中的关联	两个普通人群队列：Asan医学中心健康检查人群(n=7471)和韩国基因组与流行病学研究队列(n=2511)	医学影像分析	脑血管疾病	磁共振成像	深度学习	医学影像	总计9982个样本(AMC:7471, KoGES:2511)	nnU-Net	nnU-Net	β系数, 95%置信区间, p值	NA
1543	2025-11-02	Multi-Class Brain Tumor Grades Classification Using a Deep Learning-Based Majority Voting Algorithm and Its Validation Using Explainable-AI 2025-Oct, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-024-01368-4 PMID:39779641	研究论文	开发基于MRI和集成深度学习的多类别脑肿瘤分级分类系统，并通过可解释AI验证结果	采用基于多数投票算法的集成深度学习框架，结合七种深度学习模型和七种机器学习模型，并首次在脑肿瘤分类中应用LIME可解释AI算法	NA	开发一种经济高效、非侵入性的MRI辅助诊断工具，用于准确快速识别脑肿瘤分级	脑肿瘤MRI图像	计算机视觉	脑肿瘤	MRI	CNN, 集成学习	医学图像	五个数据集：二分类(C2)、三分类(C3)、四分类(C4)、五分类(C5)和六分类(C6)	NA	EfficientNet, VGG16, ResNet18, GoogleNet, ResNet50, Inception-V3, DarkNet	准确率	NA
1544	2025-11-02	Application of Explainable Artificial Intelligence Based on Visual Explanation in Digestive Endoscopy 2025-Sep-30, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12101058 PMID:41155057	综述	系统回顾基于视觉解释的可解释人工智能在消化内镜图像分析中的研究进展与应用	首次系统梳理消化内镜领域视觉解释型XAI方法的应用现状，重点关注模型决策透明化	仅纳入34篇文献，样本量有限；未涉及非视觉解释方法	构建可信赖的AI辅助消化内镜诊疗系统	消化内镜图像（食管胃十二指肠镜、结肠镜、超声内镜、无线胶囊内镜）	计算机视觉	胃肠道疾病	消化内镜成像	深度学习	医学图像	34篇研究文献	NA	NA	NA	NA
1545	2025-11-02	Comparative Analysis of Foundational, Advanced, and Traditional Deep Learning Models for Hyperpolarized Gas MRI Lung Segmentation: Robust Performance in Data-Constrained Scenarios 2025-Sep-30, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12101062 PMID:41155061	研究论文	比较基础模型、先进大核架构和传统深度学习方法在超极化气体MRI肺部分割任务中不同数据量下的性能表现	首次系统比较基础模型、先进大核架构和传统深度学习在数据受限场景下的医学图像分割性能，发现基础模型和先进架构在极端数据稀缺情况下仍能保持稳定性能	研究仅针对超极化气体MRI肺部分割任务，样本量相对有限（205名参与者），需要进一步验证在其他医学影像任务中的泛化能力	评估不同深度学习模型在数据受限情况下对超极化气体MRI肺部分割的性能表现	慢性阻塞性肺疾病（COPD）患者的超极化气体MRI肺部图像	医学影像分析	慢性阻塞性肺疾病	超极化气体MRI（氦-3和氙-129）	基础模型,先进大核架构,传统深度学习模型	2D MRI图像	205名参与者的1640张2D MRI切片	NA	Segment Anything Model, MedSAM, UniRepLKNet, TransXNet, UNet with VGG19, Feature Pyramid Network with MIT-B5, DeepLabV3 with ResNet152	DSC（Dice相似系数）	NA
1546	2025-11-02	Wearable Flexible Wireless Pressure Sensor Based on Poly(vinyl alcohol)/Carbon Nanotube/MXene Composite for Health Monitoring 2025-Sep-30, Micromachines IF:3.0Q2 DOI:10.3390/mi16101132 PMID:41156378	研究论文	开发了一种基于PVA/碳纳米管/MXene复合材料的可穿戴柔性无线压力传感器，用于健康监测	采用PVA/单壁碳纳米管/MXene复合材料作为敏感材料，结合随机分布的皱纹结构，实现高精度压力监测	NA	开发高精度无线柔性传感器用于人体健康监测和人机界面应用	声带运动、弯曲手指和人体脉搏	NA	NA	压力传感技术	深度学习模型	压力数据	NA	NA	NA	准确率	无需额外计算设备
1547	2025-11-02	Voice-Based Early Diagnosis of Parkinson's Disease Using Spectrogram Features and AI Models 2025-Sep-29, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12101052 PMID:41155050	研究论文	本研究开发了一种基于语音信号和人工智能模型的帕金森病早期诊断系统	结合多种声学特征提取方法和深度学习架构，特别是双向LSTM模型在帕金森病语音分类中表现出优越性能	使用了相对较小的公开数据集（81个样本），且补充数据集（15个样本）未参与实验	开发基于语音分析的帕金森病自动诊断系统	帕金森病患者和非帕金森病个体的语音信号	机器学习	帕金森病	语音信号分析，MFCC，频谱图分析	SVM, XGBoost, 逻辑回归, DNN, CNN, LSTM, GRU, BiLSTM	语音信号	主要数据集81个样本（帕金森病患者和非患者语音录音）	NA	深度神经网络，卷积神经网络，长短期记忆网络，门控循环单元，双向长短期记忆网络	准确率，AUC	NA
1548	2025-11-02	Predicting Short-Term Outcome of COVID-19 Pneumonia Using Deep Learning-Based Automatic Detection Algorithm Analysis of Serial Chest Radiographs 2025-Sep-29, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12101054 PMID:41155053	研究论文	本研究使用基于深度学习的自动检测算法分析系列胸部X光片，预测COVID-19肺炎患者的短期临床结局	首次将商业深度学习自动检测算法与梯度加权类激活映射技术结合，通过量化系列影像中实变区域的变化率来预测COVID-19患者临床结局	研究样本量有限（391例患者），仅来自单一治疗中心，需要外部验证	评估基于深度学习的自动检测算法参数在预测COVID-19肺炎患者短期临床结局中的价值	COVID-19肺炎患者	计算机视觉	COVID-19肺炎	胸部X光摄影	深度学习	医学影像	391例COVID-19患者	NA	商业深度学习自动检测算法	C-index, AUROC, 集成校准指数	NA
1549	2025-11-02	AI-Enhanced Deep Learning Framework for Pulmonary Embolism Detection in CT Angiography 2025-Sep-29, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12101055 PMID:41155054	研究论文	提出一种用于CT肺动脉造影中肺栓塞检测的AI增强深度学习框架	引入了共识交集优化融合(CIOF)方法，通过K-of-M像素级掩码融合和训练患者投票阈值优化来最大化IoU	运行时间较高(约63.7秒每病例)，因为需要执行和融合所有十个模型	提高CT肺动脉造影中肺栓塞检测的准确性和鲁棒性	肺栓塞患者	计算机视觉	肺栓塞	CT肺动脉造影(CTPA)	全卷积网络(FCN)	医学影像	35名患者，12,034个切片	NA	Inception-ResNetV2, 全卷积网络	IoU, Dice系数, 假阴性率(FNR), 假阳性率(FPR), 延迟时间	NA
1550	2025-11-02	Ultrawidefield-to-Conventional Fundus Image Translation with Scaled Feature Registration and Distorted Vessel Correction 2025-Sep-28, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12101046 PMID:41155045	研究论文	提出一种改进的超广角眼底图像到常规眼底图像的转换方法，通过尺度特征配准和扭曲血管校正技术提升图像质量	采用尺度特征配准和扭曲血管校正方法，有效解决未配对学习中常见的畸变现象，显著提升图像转换质量	需要从同一患者同一天采集的配对UFI-CFI数据，数据收集存在限制	改进眼底图像模态转换方法，提升眼科深度学习模型的诊断支持能力	超广角眼底图像(UFI)和常规眼底图像(CFI)	计算机视觉	眼科疾病	眼底成像	生成模型	图像	NA	NA	NA	MSE, PSNR, SSIM	NA
1551	2025-11-02	Integrating Spatial Omics and Deep Learning: Toward Predictive Models of Cardiomyocyte Differentiation Efficiency 2025-Sep-27, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12101037 PMID:41155036	系统综述	通过整合空间多组学技术与深度学习，探索心肌细胞分化效率的预测模型	首次系统整合GNN和RNN等深度学习架构与空间多组学数据，推进心脏再生医学的AI应用	基于文献综述，缺乏原始实验验证	建立AI驱动的心脏再生医学预测模型，加速再生治疗的临床转化	心肌细胞分化过程及心脏组织	机器学习	心血管疾病	空间转录组学、表观基因组学、单细胞多组学	GNN, RNN	空间多组学数据、单细胞数据	88项PRISMA筛选研究（2015-2025年）	NA	图神经网络，循环神经网络	NA	NA
1552	2025-11-02	Artificial Intelligence-Based Methods and Omics for Mental Illness Diagnosis: A Review 2025-Sep-27, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12101039 PMID:41155039	综述	本文综述了基于人工智能和多组学技术在精神疾病诊断中的应用现状与发展前景	整合人工智能方法与多组学数据，为精神疾病提供个性化精准诊断新范式	精神疾病的异质性和复杂性仍是当前诊断方法的主要挑战	探索精神疾病的生物标志物并推进个性化精准诊断	焦虑障碍、抑郁症和双相情感障碍等主要精神疾病	机器学习	精神疾病	多组学数据整合分析	机器学习,深度学习,计算建模	临床数据,生物分析数据	NA	NA	NA	NA	NA
1553	2025-11-02	LLM-Enhanced Multimodal Framework for Drug-Drug Interaction Prediction 2025-Sep-26, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13102355 PMID:41153642	研究论文	提出一种融合多模态数据的深度学习框架用于药物相互作用预测	首次将领域专用大语言模型BioBERT的语义嵌入与化学结构和药理机制相结合，通过随机重启随机游走算法整合间接生物通路	未明确说明模型在不同类型药物相互作用上的泛化能力	开发可扩展且准确的药物相互作用预测方法以支持多重用药决策	药物相互作用	自然语言处理, 机器学习	NA	多模态深度学习, 随机重启随机游走算法	深度学习框架	化学结构数据, 文本嵌入, 蛋白质相互作用网络	NA	NA	BioBERT, 多模态融合架构	分类准确率	NA
1554	2025-11-02	Beyond PSA: The Future of Prostate Cancer Diagnosis Using Artificial Intelligence, Novel Biomarkers, and Advanced Imagery 2025-Sep-25, Life (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/life15101508 PMID:41157181	综述	本文全面分析人工智能、新型生物标志物和先进影像技术在提升前列腺癌诊断准确性和效率方面的应用前景	系统整合人工智能驱动影像解读、放射组学、基因组分类器和多模态数据融合等新兴技术，提出超越传统PSA检测的前列腺癌诊断新范式	存在技术实施、监管审批和伦理考量等临床转化挑战	探索前列腺癌诊断领域的技术革新和未来发展方向	前列腺癌诊断相关文献和研究	数字病理	前列腺癌	多参数MRI、组织病理学、基因组检测	机器学习、深度学习	医学影像、基因组数据、临床数据	NA	NA	NA	准确率、可重复性、诊断准确性	NA
1555	2025-11-02	Ultra-High Resolution 9.4T Brain MRI Segmentation via a Newly Engineered Multi-Scale Residual Nested U-Net with Gated Attention 2025-Sep-24, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12101014 PMID:41155013	研究论文	本文提出了一种专门针对9.4T超高分辨率脑MRI分割的新型深度学习模型GA-MS-UNet++	首个专门为9.4T脑MRI分割设计的深度学习模型，集成了多尺度残差块、门控跳跃连接和空间通道注意力机制	标注数据有限	开发适用于9.4T超高分辨率脑MRI的分割算法	脑部MRI图像	医学图像分析	神经系统疾病	MRI	CNN	图像	12名患者的UltraCortex 9.4T数据集	NA	GA-MS-UNet++, Multi-Scale Residual Nested U-Net	Dice系数, 准确率, 精确率, 召回率	NA
1556	2025-11-02	Deep Ensemble Learning and Explainable AI for Multi-Class Classification of Earthstar Fungal Species 2025-Sep-23, Biology DOI:10.3390/biology14101313 PMID:41154716	研究论文	本研究使用深度学习和可解释人工智能技术对八种形态相似的地星真菌物种进行多类别图像分类	首次在文献中同时评估八种形态相似的真菌物种，设计了两种混合集成模型（EfficientNet-B3 + DeiT 和 DenseNet121 + MaxViT-S），并强调分类准确性和模型可解释性的平衡	数据集仅包含特定物种，未来需要从不同生态区域扩展样本并在野外条件下测试方法	开发能够准确分类形态相似真菌物种并具有良好可解释性的深度学习框架	八种形态相似的宏观地星真菌物种	计算机视觉	NA	图像分析	CNN, Transformer	图像	NA	NA	EfficientNetV2-M, DenseNet121, MaxViT-S, DeiT, RegNetY-8GF, MobileNetV3, EfficientNet-B3, MnasNet	准确率, 精确率, 召回率, F1分数, 特异性, 对数损失, MCC	NA
1557	2025-11-02	Evaluation of UNeXt for Automatic Bone Surface Segmentation on Ultrasound Imaging in Image-Guided Pediatric Surgery 2025-Sep-23, Bioengineering (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/bioengineering12101008 PMID:41155007	研究论文	本研究开发了一种适用于儿科患者的超声图像骨表面自动分割模型，用于图像引导儿科手术中的患者配准	针对10岁以下儿童骨骼特征不明显的特殊需求，开发了专门适用于儿科患者的骨表面分割模型	研究样本量相对较小，仅包含16名儿科患者	开发自动骨表面分割模型以替代传统患者配准方法	儿科患者的四肢、骨盆和胸部骨骼	医学图像分析	儿科手术	超声成像	深度学习	超声图像	16名儿科患者的4309张超声图像	NA	UNeXt	平均中心线Dice系数, 平均表面距离	NA
1558	2025-11-02	An Automated Diagnosis of Myopia from an Optic Disc Image Using YOLOv11: A Feasible Approach for Non-Expert ECPs in Computer Vision 2025-Sep-23, Life (Basel, Switzerland) DOI:10.3390/life15101495 PMID:41157168	研究论文	本研究开发了一种基于YOLO架构的深度学习模型，通过分析眼底图像中的视盘区域实现近视的自动化诊断	首次将YOLOv8和YOLOv11模型应用于近视诊断，设计了专门面向非计算机专业眼科医生的可用流程	使用单中心数据集，样本量有限（730张增强图像），需要更多外部验证	开发适用于非专业眼科医生的自动化近视诊断工具	眼底图像中的视盘区域	计算机视觉	近视	眼底摄影	YOLO	图像	730张增强训练图像，98张内部验证图像，50张独立测试图像	YOLO	YOLOv8, YOLOv11-nano	准确率, 敏感度, F1分数, AUC	NA
1559	2025-11-02	Comparison of Machine Learning Methods to Predict Early Mortality After Evacuation of Chronic Subdural Hematoma 2025-Sep, Neurosurgery practice DOI:10.1227/neuprac.0000000000000151 PMID:41163647	研究论文	本研究开发并比较了六种机器学习模型，用于预测慢性硬膜下血肿清除术后早期死亡率	首次结合自动分割工具计算的术前术后血肿体积与临床信息，系统比较多种机器学习模型在预测慢性硬膜下血肿术后死亡率方面的性能	回顾性研究设计，样本量相对有限（731例患者），模型区分能力仅为中等水平	预测慢性硬膜下血肿清除术后30天死亡率	接受手术治疗的慢性硬膜下血肿患者	机器学习	慢性硬膜下血肿	深度学习分割工具，机器学习建模	逻辑回归，支持向量机，神经网络，决策树，朴素贝叶斯，XGBoost	临床数据，影像体积数据	731例患者	NA	NA	AUC，平衡准确率，召回率	NA
1560	2025-11-02	Global Growth and Distribution of CyberKnife Stereotactic Radiosurgery: A Bibliometric Analysis 2025-Sep, Neurosurgery practice DOI:10.1227/neuprac.0000000000000150 PMID:41163657	文献计量分析	通过文献计量方法分析射波刀立体定向放射外科的全球发展趋势和演变	首次对射波刀立体定向放射外科领域进行全面的文献计量分析，识别研究趋势和国际合作模式	仅基于Web of Science数据库，可能未涵盖所有相关文献；分析仅限于发表模式，未涉及临床效果评估	探索射波刀立体定向放射外科相关出版物的当前趋势和演变	射波刀立体定向放射外科相关学术出版物	医学信息学	神经外科疾病	文献计量分析，网络可视化	NA	文献数据	3980篇文章，来自12077位作者	R	NA	NA	NA