深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
15921	2024-10-27	Implementation of deep learning artificial intelligence in vision-threatening disease screenings for an underserved community during COVID-19 2024-Dec, Journal of telemedicine and telecare IF:3.5Q1 DOI:10.1177/1357633X231158832 PMID:36908254	研究论文	研究探讨了在COVID-19期间，深度学习人工智能在学生主导的非散瞳筛查中对未受充分服务社区的视觉威胁性疾病的应用	首次在前瞻性研究中应用深度学习人工智能于学生主导的非散瞳筛查，特别是在未受充分服务的社区中	深度学习人工智能标记了38.9%的眼睛为不可评估，远高于人类标准的2.6%	评估深度学习人工智能在视觉威胁性疾病筛查中的应用效果	年龄相关性黄斑变性、糖尿病视网膜病变和青光眼等视觉威胁性疾病	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	385只眼睛，来自195名筛查参与者
15922	2024-10-27	Deep learning and its associated factors among Chinese nursing undergraduates: A cross-sectional study 2024-11, Nurse education today IF:3.6Q1 DOI:10.1016/j.nedt.2024.106356 PMID:39167874	研究论文	研究了中国护理本科生的深度学习水平及其相关因素	首次探讨了中国护理本科生的深度学习及其相关因素	研究采用横断面设计，无法确定因果关系	描述中国护理本科生的深度学习水平并探索其相关因素	中国护理本科生	NA	NA	NA	NA	NA	271名护理本科生
15923	2024-10-20	Designed with interactome-based deep learning 2024-Nov, Nature chemical biology IF:12.9Q1 DOI:10.1038/s41589-024-01754-7 PMID:39424957	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
15924	2024-10-27	Identification of nitric oxide-mediated necroptosis as the predominant death route in Parkinson's disease 2024-Oct-24, Molecular biomedicine IF:6.3Q1 DOI:10.1186/s43556-024-00213-y PMID:39443410	研究论文	本研究通过RNA测序和深度学习算法Scaden，识别了帕金森病中一氧化氮介导的坏死性凋亡作为主要的细胞死亡途径	首次揭示了一氧化氮介导的坏死性凋亡在帕金森病进展中的主导作用，并发现其在其他神经退行性疾病中的普遍性	研究主要基于体外实验和模型动物，需要进一步的人体临床验证	探讨帕金森病进展中主要的细胞死亡途径	帕金森病中的神经细胞死亡途径	神经科学	帕金森病	RNA测序	深度学习算法Scaden	基因表达数据	多个脑组织样本
15925	2024-10-27	Optimising ovarian tumor classification using a novel CT sequence selection algorithm 2024-10-23, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-75555-2 PMID:39443517	研究论文	本研究旨在通过应用先进的深度学习方法和开发一种新的CT序列选择算法来提高卵巢肿瘤分类的准确性	本研究开发了一种新的CT序列选择算法，用于优化CT图像的使用，以更精确地分类卵巢肿瘤	NA	提高卵巢肿瘤分类的准确性，特别是区分恶性肿瘤和早期病例	卵巢肿瘤的分类	计算机视觉	妇科疾病	深度学习	ResNet50V2FPN	图像	使用公开的CT扫描数据进行训练和评估
15926	2024-10-27	Automated deep learning-based bone mineral density assessment for opportunistic osteoporosis screening using various CT protocols with multi-vendor scanners 2024-10-23, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-73709-w PMID:39443535	研究论文	本研究评估了基于深度学习的自动化骨密度测量方法在不同CT协议和多厂商扫描仪下的诊断效能	提出了基于深度学习的自动化骨密度测量方法，并展示了其在不同CT协议和多厂商扫描仪下的准确性和可靠性	研究为回顾性研究，样本量和数据类型有限	评估基于深度学习的骨密度测量方法在骨质疏松筛查中的诊断效能	422个来自四个厂商的CT数据集，包括159个胸部、156个腹部和107个腰椎数据集	计算机视觉	骨质疏松	深度学习	NA	CT图像	422个CT数据集，包括159个胸部、156个腹部和107个腰椎数据集
15927	2024-10-27	Leveraging weak complementary labels enhances semantic segmentation of hepatocellular carcinoma and intrahepatic cholangiocarcinoma 2024-10-23, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-75256-w PMID:39443575	研究论文	本文提出了一种利用弱互补标签增强肝细胞癌和肝内胆管癌语义分割的深度学习方法	通过引入互补标签，利用临床诊断中的弱信息来改进模型训练，从而提高分割性能和鲁棒性	NA	提高肝细胞癌和肝内胆管癌的语义分割准确性和鲁棒性	肝细胞癌和肝内胆管癌的病理图像	计算机视觉	肝癌	深度学习	NA	图像	165名患者的病理图像
15928	2024-10-27	Automating cancer diagnosis using advanced deep learning techniques for multi-cancer image classification 2024-10-23, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-75876-2 PMID:39443621	研究论文	本文利用深度学习模型自动化癌症诊断，特别是针对多癌症图像分类	本文首次评估了多种深度学习模型在七种癌症图像分类中的表现，并发现DenseNet121模型在验证准确性和损失方面表现最佳	本文仅评估了特定类型的癌症图像，未涵盖所有癌症类型	提高癌症检测的效率和准确性	七种癌症的图像数据	计算机视觉	NA	深度学习	CNN	图像	七种癌症的图像数据
15929	2024-10-27	Improving the accuracy of dynamic inclination measurement by machine learning 2024-Oct-23, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-76032-6 PMID:39443645	研究论文	本文提出了一种结合钻具姿态传感器数据和人工神经网络的方法，以提高动态倾角测量的准确性	本文首次将机器学习技术应用于钻具姿态测量，通过深度学习模型反演x和y轴加速度信号，实现了高精度的动态倾角测量	本文仅在模拟测量条件下进行了实验，尚未在实际钻井环境中验证	提高钻井过程中动态倾角测量的准确性	钻具姿态传感器数据和动态倾角	机器学习	NA	机器学习	LSTM	传感器信号	不同转速下的模拟测量条件
15930	2024-10-27	Comparing SMILES and SELFIES tokenization for enhanced chemical language modeling 2024-10-23, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-76440-8 PMID:39443676	研究论文	研究比较了SMILES和SELFIES的tokenization方法在化学语言模型中的应用效果	提出了Atom Pair Encoding (APE)方法，显著提高了化学语言模型的分类准确性	NA	评估不同tokenization技术对化学语言模型在生物物理学和生理学分类任务中性能的影响	SMILES和SELFIES的tokenization方法	自然语言处理	NA	Byte Pair Encoding (BPE), Atom Pair Encoding (APE)	BERT	文本	使用了三个不同的数据集：HIV、毒理学和血脑屏障渗透
15931	2024-10-27	Detection of hypertension from pharyngeal images using deep learning algorithm in primary care settings in Japan 2024-Oct-23, BMJ health & care informatics IF:4.1Q2 DOI:10.1136/bmjhci-2023-100824 PMID:39448071	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习算法的人工智能模型，用于通过咽喉图像检测高血压	利用咽喉图像中的血管形态信息，结合深度学习算法，实现了无需物理接触或额外设备的高血压早期检测	研究数据仅来自日本的多所初级护理诊所，样本量和地域限制可能影响模型的普适性	开发一种基于深度学习的高血压检测算法，以提高远程医疗时代的护理质量	咽喉图像和患者的人口统计信息	计算机视觉	心血管疾病	深度学习	多实例卷积神经网络	图像	7710名患者，来自64家诊所
15932	2024-10-27	Generating Protein Structures for Pathway Discovery Using Deep Learning 2024-Oct-22, Journal of chemical theory and computation IF:5.7Q1 DOI:10.1021/acs.jctc.4c00816 PMID:39388723	研究论文	本文提出了一种基于表示学习的解决方案，通过在抽象表示空间中进行插值和外推来合成潜在的过渡状态，并使用分子动力学模拟进行自动验证，以实现路径发现	本文创新性地使用表示学习方法来合成潜在的过渡状态，并通过迭代框架进行目标路径采样	本文的实验仅限于RAS-RAF蛋白域从无膜到与膜相互作用的过渡，未涵盖更广泛的应用场景	解决分子水平上生物现象的复杂细节解析问题，特别是路径发现中的过渡状态合成	RAS-RAF蛋白域从无膜到与膜相互作用的过渡过程	生物信息学	NA	分子动力学模拟	表示学习	蛋白质结构	NA
15933	2024-10-27	Automated volumetric analysis of the inner ear fluid space from hydrops magnetic resonance imaging using 3D neural networks 2024-10-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-76035-3 PMID:39433848	研究论文	本文使用3D神经网络模型对内耳积液空间进行自动体积分析	提出了一种基于3D深度神经网络模型的内耳积液空间自动分割和体积比计算方法	NA	开发一种准确且自动化的方法来计算内耳积液的体积比，以帮助诊断内耳疾病	内耳的耳蜗、前庭和半规管的积液空间	计算机视觉	NA	磁共振成像（MRI）	3D深度神经网络	图像	包含耳蜗、前庭和半规管的积液空间分割标签的MR cisternography (MRC) 和 HYDROPS-Mi2 数据集
15934	2024-10-27	Blockchain-enabled verification of medical records using soul-bound tokens and cloud computing 2024-Oct-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-75708-3 PMID:39438519	研究论文	本文提出了一种基于区块链和灵魂绑定令牌（SBT）的医疗记录验证机制，结合云计算提高验证效率	使用区块链技术和灵魂绑定令牌（SBT）实现医疗记录的自动化验证，并通过云计算访问去中心化数据库以减少验证时间	本文未详细讨论系统的可扩展性和在其他行业的潜在应用	提高医疗记录验证的效率和安全性	医疗记录的验证过程	区块链技术	NA	区块链技术、灵魂绑定令牌（SBT）、云计算	NA	医疗记录	NA
15935	2024-10-27	Integrated image-based deep learning and language models for primary diabetes care 2024-Oct, Nature medicine IF:58.7Q1 DOI:10.1038/s41591-024-03139-8 PMID:39030266	研究论文	开发了一种结合图像深度学习和语言模型的集成系统，用于初级糖尿病护理和糖尿病视网膜病变筛查	结合了大型语言模型和图像深度学习，提供个性化的糖尿病管理建议，并在实际应用中显示出改善患者自我管理和遵从性的效果	仅在一个中心进行了真实世界的研究，需要进一步的多中心验证	提高初级糖尿病护理和糖尿病视网膜病变筛查的效率和质量	初级糖尿病护理和糖尿病视网膜病变筛查	机器学习	糖尿病	深度学习	Transformer	图像和文本	397名未辅助的初级保健医生患者和372名辅助的初级保健医生患者
15936	2024-10-27	Traversing chemical space with active deep learning for low-data drug discovery 2024-Oct, Nature computational science IF:12.0Q1 DOI:10.1038/s43588-024-00697-2 PMID:39333789	研究论文	本文研究了在低数据药物发现中使用主动深度学习进行化学空间探索	提出了一种结合主动学习和深度学习的方法，用于在低数据情况下进行药物发现，并展示了其在命中率上的显著提升	研究中存在一些未知的限制因素，如最佳计算策略、与传统非迭代方法的比较以及在低数据场景中的应用	探讨在低数据药物发现中使用主动深度学习的有效性	分析了六种主动学习策略与两种深度学习架构在三种大规模分子库上的应用	机器学习	NA	主动学习	深度学习	分子库	三种大规模分子库
15937	2024-10-27	Generalizing deep learning electronic structure calculation to the plane-wave basis 2024-Oct, Nature computational science IF:12.0Q1 DOI:10.1038/s43588-024-00701-9 PMID:39363113	研究论文	本文提出了一种从平面波密度泛函理论结果中直接计算原子轨道哈密顿矩阵的实空间重构方法	克服了先前神经网络仅兼容原子轨道基的局限性，实现了与平面波基的兼容	NA	旨在将平面波方法的优势整合到深度学习电子结构方法中	电子结构计算中的哈密顿矩阵	机器学习	NA	密度泛函理论 (DFT)	深度神经网络	电子结构数据	NA
15938	2024-10-13	Effectively detecting anomalous diffusion via deep learning 2024-Oct, Nature computational science IF:12.0Q1 DOI:10.1038/s43588-024-00705-5 PMID:39394500	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
15939	2024-10-27	Subject-aware PET Denoising with Contrastive Adversarial Domain Generalization 2024 Oct-Nov, IEEE Nuclear Science Symposium conference record. Nuclear Science Symposium DOI:10.1109/nss/mic/rtsd57108.2024.10656150 PMID:39445307	研究论文	本文提出了一种对比对抗学习框架，用于PET图像的去噪和领域泛化	引入了对比对抗学习框架，结合UNet去噪模块和对比判别器，以提取与受试者无关的特征	未提及具体限制	提高PET图像去噪性能，减少受试者间的变异性	PET图像的去噪和领域泛化	计算机视觉	NA	深度学习	UNet	图像	97个F-MK6240 tau PET研究，每个研究有20个噪声实现，训练、验证和测试分别使用1400、120和420对3D图像体积
15940	2024-10-27	A Lesion-aware Edge-based Graph Neural Network for Predicting Language Ability in Patients with Post-stroke Aphasia 2024-Sep-03, ArXiv PMID:39279836	研究论文	本文提出了一种基于病灶感知的图神经网络（LEGNet），用于预测中风后失语症患者的语言能力	该模型整合了边缘学习模块、病灶编码模块和子图学习模块，利用功能相似性进行预测，并在两个不同的数据集上展示了优越的泛化能力	NA	旨在通过静息态功能磁共振成像（rs-fMRI）连接预测中风后失语症患者的语言能力	中风后失语症患者的语言能力	计算机视觉	中风	静息态功能磁共振成像（rs-fMRI）	图神经网络（GNN）	图像	使用来自人类连接组项目（HCP）的合成数据进行超参数调优和模型预训练，并在一个包含中风后失语症患者的内部神经影像数据集上进行10折交叉验证评估