深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
141	2025-04-03	Quantitative analysis of studies that use artificial intelligence on thyroid cancer: a 20-year bibliometric analysis 2025, Frontiers in oncology IF:3.5Q2 DOI:10.3389/fonc.2025.1525650 PMID:40171256	研究论文	通过文献计量分析评估人工智能在甲状腺癌领域的研究进展、热点和未来方向	首次对20年间人工智能在甲状腺癌领域的应用进行全面的文献计量分析，揭示了研究热点和趋势	仅基于Web of Science Core Collection数据库的数据，可能未涵盖所有相关研究	评估人工智能在甲状腺癌领域的应用进展和未来研究方向	2004至2024年间发表的956篇关于人工智能在甲状腺癌中应用的文献	数字病理	甲状腺癌	文献计量分析	NA	文献数据	956篇文章，来自70个国家/地区
142	2025-04-03	Knowledge graph and its application in the study of neurological and mental disorders 2025, Frontiers in psychiatry IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fpsyt.2025.1452557 PMID:40171303	综述	本文综述了知识图谱在神经和精神障碍研究中的应用，并讨论了医学知识图谱的现状及其面临的挑战	结合大数据和深度学习技术，探讨知识图谱在神经和精神障碍研究中的潜力	仍需克服知识图谱在医学领域应用中的障碍和限制	研究知识图谱在神经和精神障碍诊断和治疗中的应用	神经障碍（如阿尔茨海默病和帕金森病）和精神障碍（如抑郁症和焦虑症）	自然语言处理	神经和精神障碍	知识图谱（KG）	NA	医学数据	NA
143	2025-04-03	Bridging technology and ecology: enhancing applicability of deep learning and UAV-based flower recognition 2025, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2025.1498913 PMID:40171479	研究论文	本研究将无人机和深度学习技术应用于生态研究，特别是花卉识别，以简化这些技术的实际应用	更新了目标检测工具箱至TensorFlow 2，提高了性能并确保与新软件包的兼容性，同时评估了三种目标检测模型在无人机花卉图像上的应用潜力	在密集植被中检测花卉以及考虑环境变异性方面仍存在挑战	简化无人机和深度学习技术在生态研究中的应用，特别是花卉识别	无人机拍摄的花卉丰富草地图像	计算机视觉	NA	无人机图像采集和深度学习目标检测	Faster R-CNN, SSD, EfficientDet	图像	两个无人机花卉草地图像数据集
144	2025-04-03	Analysis of Deep Learning Techniques for Vehicle Detection and Reidentification Using Data from Multiple Drones and Public Datasets 2025, Anais da Academia Brasileira de Ciencias IF:1.1Q3 DOI:10.1590/0001-3765202520240623 PMID:40172334	研究论文	本文提出了一种结合多种CNN技术的车辆检测与重识别解决方案，用于无人机监控的动态环境	整合了VGG16、VGG19、ResNet50、InceptionV3和EfficientNetV2L等多种CNN技术，并采用YOLOv4进行检测和DeepSORT算法进行跟踪，以适应不同无人机拍摄的多样化图像	在第一个实验中，最佳网络ResNet50的平均准确率仅为55%，表明在某些情况下性能仍有提升空间	开发适用于无人机监控动态环境中车辆检测与重识别的计算方法	高速公路等动态环境中的车辆	计算机视觉	NA	CNN, YOLOv4, DeepSORT	VGG16, VGG19, ResNet50, InceptionV3, EfficientNetV2L	图像	两个数据集：一个来自Mendeley的公共数据集，另一个由无人机群收集的图像和数据
145	2025-04-03	[Identification of kidney stone types by deep learning integrated with radiomics features] 2024-Dec-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi DOI:10.7507/1001-5515.202310043 PMID:40000211	研究论文	本文提出了一种结合放射组学和深度学习的框架，用于术前高精度自动分类肾结石类型	结合放射组学特征和深度学习模型（3D CNN和LightGBM）进行肾结石类型分类，实现了84.5%的准确率	未提及样本量是否足够大或模型在其他数据集上的泛化能力	实现肾结石类型的自动化术前高精度分类	感染性和非感染性肾结石	数字病理学	肾结石	放射组学分析	3D CNN + LightGBM	医学影像数据	NA
146	2025-04-03	[Cardiac magnetic resonance image segmentation based on lightweight network and knowledge distillation strategy] 2024-Dec-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi DOI:10.7507/1001-5515.202312015 PMID:40000210	research paper	提出了一种轻量化的扩张并行卷积U-Net（DPU-Net）和多尺度适应向量知识蒸馏（MAVKD）训练策略，用于心脏磁共振图像分割	采用独特的卷积通道变化方式减少参数数量，并结合残差块和扩张卷积缓解梯度爆炸和空间信息丢失问题	NA	解决深度学习网络在心脏MRI图像分割中参数过多和浮点运算量大的问题	心脏磁共振图像	digital pathology	cardiovascular disease	MRI	DPU-Net, MAVKD	image	ACDC公共数据集
147	2025-04-03	[Coronary artery segmentation based on Transformer and convolutional neural networks dual parallel branch encoder neural network] 2024-Dec-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi DOI:10.7507/1001-5515.202403058 PMID:40000209	研究论文	提出了一种基于Transformer和CNN双并行分支编码器的新型神经网络DUNETR，用于冠状动脉CTA图像的分割	采用Transformer和CNN双编码器设计，结合噪声抑制特征融合模块，有效提取全局和局部特征，显著提升分割效果	仅在公开数据集上验证，未说明在临床实际应用中的表现	提升冠状动脉CTA图像分割的准确率	冠状动脉CTA图像	计算机视觉	心血管疾病	深度学习	DUNETR（Transformer+CNN双编码器U-Net）	3D医学图像	公开数据集（未说明具体样本量）
148	2025-04-03	[Research progress on endoscopic image diagnosis of gastric tumors based on deep learning] 2024-Dec-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi DOI:10.7507/1001-5515.202404004 PMID:40000222	综述	本文综述了基于深度学习的胃肿瘤内镜图像诊断研究进展	总结了深度学习在胃肿瘤内镜图像分类、目标检测和分割中的应用，以及相关CAD系统和多模态算法	指出了当前深度学习方法存在的问题，但未具体说明	促进深度学习方法在胃肿瘤内镜诊断中的临床应用	胃肿瘤内镜图像	数字病理	胃癌	深度学习	NA	图像	NA
149	2025-04-03	Development of a Deep Learning System for Intraoperative Identification of Cancer Metastases 2024-Dec-01, Annals of surgery IF:7.5Q1 DOI:10.1097/SLA.0000000000006294 PMID:38577794	研究论文	开发并测试了一种用于术中识别腹膜表面转移癌的深度学习手术引导系统原型	开发了一种深度学习手术引导系统（CASL），在模拟临床环境中表现优于肿瘤外科医生	需要进一步开发和未来在多机构临床环境中的验证	提高术中腹膜表面转移癌的识别准确性	胃肠道腺癌患者的腹膜表面病变	数字病理学	胃肠道腺癌	深度学习	CNN	图像	132名患者的4287个可见腹膜表面病变和365个活检腹膜表面病变的图像
150	2025-04-03	Understanding the role of machine learning in predicting progression of osteoarthritis 2024-Nov-01, The bone & joint journal DOI:10.1302/0301-620X.106B11.BJJ-2024-0453.R1 PMID:39481441	系统综述	本文通过系统综述探讨了机器学习在预测骨关节炎进展中的作用	揭示了机器学习模型在预测骨关节炎进展中的可行性及当前临床应用的局限性	评估指标缺乏标准化，外部验证有限，临床适用性受限	探讨机器学习在预测骨关节炎进展中的应用及其潜力	骨关节炎（OA）患者	机器学习	骨关节炎	机器学习算法	深度学习，自动化机器学习	临床、放射学和生化数据	39项研究（初始筛选1,160项）
151	2025-04-03	Sparse Annotation is Sufficient for Bootstrapping Dense Segmentation 2024-Oct-26, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.06.14.599135 PMID:38915491	research paper	提出了一种基于深度学习的新方法，从稀疏的2D注释快速生成密集的3D分割，用于生物成像数据的实例分割任务	开发了一种能够从稀疏注释快速生成密集3D分割的深度学习方法，显著减少了人工标注时间和非专家参与的可能性	未提及方法在非脑神经组织或其他生物成像数据上的适用性	解决生物成像数据中密集3D重建的实例分割任务，减少人工标注工作量	脑神经组织中的树突、轴突和胶质细胞过程	digital pathology	NA	serial section electron microscopy	deep learning-based method	3D image	未明确提及具体样本数量，但涉及大型图像体积
152	2025-04-03	MRI deep learning models for assisted diagnosis of knee pathologies: a systematic review 2024-Oct-18, European radiology IF:4.7Q1 DOI:10.1007/s00330-024-11105-8 PMID:39422725	系统综述	本文系统综述了深度学习模型在MRI辅助诊断膝关节病变中的应用现状	总结了不同CNN架构在膝关节MRI诊断中的表现，并比较了针对特定损伤与一般异常检测的模型性能差异	纳入研究的设计存在异质性，且需要更大规模的MRI数据集进行模型验证	评估深度学习模型在膝关节MRI辅助诊断中的临床潜力	膝关节病变（包括前交叉韧带损伤、骨关节炎、半月板损伤等）	数字病理学	膝关节疾病	MRI	CNN（包括ResNet、VGG、DenseNet、DarkNet等）	医学影像	54项研究（涉及多种膝关节病变）
153	2025-04-03	Assessing substrate scope of the cyclodehydratase LynD by mRNA display-enabled machine learning models 2024-Oct-14, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.10.14.618330 PMID:39464139	研究论文	该研究通过mRNA展示技术和深度学习模型评估了RiPP环脱水酶LynD的底物范围	利用mRNA展示技术进行高通量底物分析，并构建深度学习模型预测LynD的底物处理	研究仅针对LynD酶，未涉及其他RiPP酶	评估和预测RiPP环脱水酶LynD的底物范围	RiPP环脱水酶LynD及其底物	机器学习	NA	mRNA展示技术	深度学习模型	肽序列数据	大规模肽库
154	2025-04-03	Substrate recognition principles for the PP2A-B55 protein phosphatase 2024-Oct-04, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.adp5491 PMID:39356758	研究论文	本文通过整合AlphaFold建模和高分辨率突变扫描，揭示了PP2A-B55磷酸酶识别底物的机制，并设计了一种特异性肽抑制剂	发现了PP2A-B55通过保守机制识别底物α螺旋的关键氨基酸决定因素，并设计了特异性肽抑制剂	研究中使用的肽抑制剂可能需要在更多生物系统中验证其效果	阐明PP2A-B55磷酸酶识别底物的分子机制及其在细胞信号传导中的作用	PP2A-B55磷酸酶及其底物α螺旋结构	分子生物学	NA	AlphaFold建模、高分辨率突变扫描、深度学习蛋白设计	深度学习	蛋白质结构数据	NA
155	2025-04-03	Deep Learning for Grading Endometrial Cancer 2024-Sep, The American journal of pathology DOI:10.1016/j.ajpath.2024.05.003 PMID:38879079	研究论文	该研究介绍了EndoNet，一种结合卷积神经网络和视觉变换器的深度学习模型，用于子宫内膜癌的分级	结合CNN提取组织学特征和视觉变换器聚合特征进行分级，无需手动标注	需要进一步验证	开发自动分级子宫内膜癌的深度学习模型	子宫内膜癌组织切片	数字病理学	子宫内膜癌	深度学习	CNN + 视觉变换器	图像	929张全切片图像（内部数据集）和100例患者（外部数据集）
156	2025-04-03	Automated detection of Bornean white-bearded gibbon (Hylobates albibarbis) vocalizations using an open-source framework for deep learning 2024-09-01, The Journal of the Acoustical Society of America IF:2.1Q1 DOI:10.1121/10.0028268 PMID:39248557	research paper	本文介绍了一个开源深度学习框架，用于自动检测婆罗洲白须长臂猿的鸣叫，以解决大规模声学数据分析的瓶颈问题	采用开源深度学习框架自动检测特定物种的鸣叫，显著减少分析时间，且检测结果与人工标注无显著差异	未来需要将该模型应用于长期声学数据集以了解鸣叫活动的时空变化	开发一个自动检测濒危物种鸣叫的深度学习框架，以促进声学监测	婆罗洲白须长臂猿（Hylobates albibarbis）的鸣叫	bioacoustics	NA	deep learning	neural network	audio recordings	90小时的手动标注音频记录
157	2025-04-03	A systematic review of the application of machine learning techniques to ultrasound tongue imaging analysis 2024-09-01, The Journal of the Acoustical Society of America IF:2.1Q1 DOI:10.1121/10.0028610 PMID:39287468	review	本文系统回顾了机器学习技术在超声舌成像分析中的应用	深入探讨了深度学习在超声舌图像序列分析中的应用潜力，特别是在克服斑点噪声和视野遮挡方面的优势	未提及具体实验验证或实际应用效果的局限性	评估机器学习技术在超声舌成像分析中的研究现状和发展趋势	超声舌图像帧序列(UTIFs)	machine learning	NA	B-mode ultrasound	deep learning	image	NA
158	2025-04-03	Evaluating cell type deconvolution in FFPE breast tissue: application to benign breast disease 2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1 DOI:10.1093/nargab/lqae098 PMID:40162103	研究论文	评估FFPE乳腺组织中细胞类型去卷积方法的性能，并应用于良性乳腺疾病	构建了乳腺组织的单细胞RNA-seq参考数据，测试了多种去卷积方法，并发现深度学习为基础的Scaden方法在FFPE样本中表现最优	FFPE样本中的伪影显著影响了去卷积方法的性能	优化从FFPE样本中定义单个细胞类型组成的策略	良性乳腺疾病的FFPE组织样本	数字病理学	乳腺疾病	RNA-seq, 单细胞RNA-seq	深度学习	RNA-seq数据	62个良性乳腺疾病RNA-seq样本
159	2025-04-03	A Self-Sensing and Self-Powered Wearable System Based on Multi-Source Human Motion Energy Harvesting 2024-07, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany) DOI:10.1002/smll.202311036 PMID:38342584	研究论文	提出了一种基于多源人体运动能量收集的自感知自供电可穿戴系统	结合三自由度摩擦纳米发电机和负能量收集器，利用深度学习模型识别运动状态，实现自感知和自供电	未提及系统在极端环境下的稳定性和长期穿戴的舒适性	开发自感知自供电的可穿戴系统，提高能量利用效率	人体运动能量（腰部运动能量和膝盖负能量）	可穿戴技术	NA	摩擦纳米发电机（TENG）、深度学习	Gate Recurrent Unit (GRU)	运动信号	实验数据未明确说明具体样本数量，但涉及模型穿戴测试
160	2025-04-03	A Proof-of-Concept Computer Vision Approach for Measurement of Tympanic Membrane Perforations 2024-Jun, The Laryngoscope DOI:10.1002/lary.31270 PMID:38214334	研究论文	提出了一种基于计算机视觉的概念验证方法，用于测量鼓膜穿孔的大小	首次将计算机视觉技术应用于鼓膜穿孔大小的测量，相比传统视觉估计方法提高了准确性	研究样本量较小且穿孔类型较为单一，需要更大规模和多样化的数据集进行验证	开发一种更准确的鼓膜穿孔大小测量方法	鼓膜穿孔	计算机视觉	耳科疾病	深度学习	开源深度学习架构	内窥镜图像	少量鼓膜穿孔样本（主要为前部较小穿孔）