深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1581	2025-08-10	A deep learning model for preoperative risk stratification of pancreatic ductal adenocarcinoma based on genomic predictors of liver metastasis 2025-Aug-26, European journal of cancer (Oxford, England : 1990) DOI:10.1016/j.ejca.2025.115608 PMID:40628176	研究论文	开发并验证了一个基于深度学习的风险模型PanScore，用于胰腺导管腺癌（PDAC）术前风险分层	利用基因组特征和深度学习模型PanScore对PDAC患者进行风险分层，特别是在可切除病例中识别出隐匿性转移风险	研究为回顾性设计，需要前瞻性研究进一步验证模型的临床实用性	提高胰腺导管腺癌术前风险分层的准确性，以指导个性化治疗决策	胰腺导管腺癌（PDAC）患者	数字病理学	胰腺癌	基因组测序	深度神经网络（DNN）	基因组数据	训练队列1779例（MSK-MET数据集），验证队列2181例（MSK-IMPACT队列）
1582	2025-08-10	A 2025 perspective on the role of machine learning for biomarker discovery in clinical proteomics 2025-Aug-09, Expert review of proteomics IF:3.8Q1 DOI:10.1080/14789450.2025.2545828 PMID:40772544	观点文章	本文探讨了机器学习在临床蛋白质组学生物标志物发现中的应用及其面临的挑战	批判性地分析了机器学习在临床蛋白质组学中的应用，强调算法创新不能弥补样本量小、批次效应等问题	未提出具体解决方案，主要侧重于问题分析和建议	评估机器学习在临床蛋白质组学生物标志物发现中的实际应用潜力	临床蛋白质组学数据	机器学习	NA	临床蛋白质组学	深度学习架构	蛋白质组学数据	小样本量
1583	2025-08-10	DDoS classification of network traffic in software defined networking SDN using a hybrid convolutional and gated recurrent neural network 2025-Aug-09, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-13754-1 PMID:40781265	研究论文	本文提出了一种混合CNN-GRU模型，用于软件定义网络(SDN)中DDoS攻击的网络流量分类	提出了一种结合1D卷积层和GRU层的混合模型，用于空间模式提取和时间序列学习，实现了完美的测试性能	实验仅在特定SDN流量数据集上进行，未在其他网络环境中验证模型的泛化能力	开发一种高效的深度学习方法，用于SDN中DDoS攻击的检测	SDN网络流量数据	机器学习	NA	SMOTE, StandardScaler	混合CNN-GRU模型	网络流量数据	24,500个样本（12,250个良性样本和12,250个攻击样本）
1584	2025-08-10	Automated 3D segmentation of rotator cuff muscle and fat from longitudinal CT for shoulder arthroplasty evaluation 2025-Aug-09, Skeletal radiology IF:1.9Q3 DOI:10.1007/s00256-025-04991-6 PMID:40782188	研究论文	开发并验证了一种用于自动3D分割肩袖肌肉的深度学习模型，以量化接受全肩关节置换术(TSA)患者的肌肉体积和脂肪分数	采用DeepLabV3+与ResNet50结合的模型，首次在纵向CT扫描上实现肩袖肌肉和脂肪的自动3D分割	研究样本量相对较小，仅包含53名TSA患者用于模型训练和验证	开发自动化工具以评估肩关节置换术患者的肩袖肌肉健康状况	接受全肩关节置换术的患者	数字病理	肩关节疾病	CT扫描	DeepLabV3+ with ResNet50	3D CT图像	53名TSA患者用于模型开发，172名患者用于量化分析
1585	2025-08-10	Reducing motion artifacts in the aorta: super-resolution deep learning reconstruction with motion reduction algorithm 2025-Aug-09, Japanese journal of radiology IF:2.9Q2 DOI:10.1007/s11604-025-01849-8 PMID:40782239	research paper	评估超分辨率深度学习重建结合运动减少算法在减少主动脉运动伪影方面的效果	结合超分辨率深度学习重建与运动减少算法，显著提升CT图像质量	研究为回顾性设计，样本量有限（86例患者）	评估SR-DLR-M在减少主动脉运动伪影方面的效能	主动脉CT图像	digital pathology	cardiovascular disease	contrast-enhanced CT	deep learning reconstruction	image	86例患者（平均年龄65.0±14.1岁，53名男性）
1586	2025-08-10	Multi-scale Autoencoder Suppression Strategy for Hyperspectral Image Anomaly Detection 2025-Aug-08, IEEE transactions on image processing : a publication of the IEEE Signal Processing Society IF:10.8Q1 DOI:10.1109/TIP.2025.3595408 PMID:40779374	研究论文	本文提出了一种名为多尺度自编码器抑制策略（MASS）的新方法，用于高光谱图像异常检测，通过优先重建背景信息并抑制异常像素的影响来提高检测精度	提出MASS方法，结合局部特征提取器（集成卷积和全维动态卷积）与基于Transformer的全局特征提取器，设计自注意力抑制模块（SAS）以减少异常像素的影响，并在网络学习中引入掩码机制	未明确提及具体局限性	提高高光谱图像异常检测的精度	高光谱图像	计算机视觉	NA	自编码器（AEs）、卷积、全维动态卷积（ODConv）、Transformer、自注意力抑制模块（SAS）	自编码器（AE）、Transformer	高光谱图像	八个数据集
1587	2025-08-10	An Anisotropic Cross-View Texture Transfer with Multi-Reference Non-Local Attention for CT Slice Interpolation 2025-Aug-08, IEEE transactions on medical imaging IF:8.9Q1 DOI:10.1109/TMI.2025.3596957 PMID:40779378	研究论文	提出了一种基于多参考非局部注意力的各向异性跨视图纹理转移方法，用于CT切片插值	充分利用3D CT体积的各向异性特性，设计了一个独特的框架，将高分辨率平面内纹理细节作为参考，并将其转移到低分辨率平面外图像中	未明确提及	提高CT切片插值的质量，改善疾病诊断的准确性	CT图像	数字病理	NA	深度学习	多参考非局部注意力模块	图像	公共CT数据集，包括一个真实配对基准
1588	2025-08-10	Automatic Choroid Segmentation and Thickness Measurement Based on Mixed Attention-guided Multiscale Feature Fusion Network 2025-Aug-08, IEEE transactions on medical imaging IF:8.9Q1 DOI:10.1109/TMI.2025.3597026 PMID:40779377	研究论文	提出了一种基于混合注意力引导的多尺度特征融合网络（MAMFF-Net），用于自动分割OCT图像中的脉络膜并测量其厚度	结合混合注意力编码器（MAE）、可变形多尺度特征融合路径（DMFFP）和多尺度金字塔层聚合（MPLA）模块，提高了脉络膜分割的准确性	公共OCT数据集中涉及脉络膜厚度变化的疾病类型较少，且缺乏公开可用的标注数据集	开发一种自动分割和测量脉络膜厚度的方法，以辅助临床诊断和疾病进展监测	OCT图像中的脉络膜	数字病理学	眼科疾病	OCT成像	MAMFF-Net（混合注意力引导的多尺度特征融合网络）	图像	徐州医科大学附属医院（XZMH）-脉络膜数据集，包含正常和八种脉络膜相关疾病的标注OCT图像
1589	2025-08-10	A neural network model enables worm tracking in challenging conditions and increases signal-to-noise ratio in phenotypic screens 2025-Aug-08, PLoS computational biology IF:3.8Q1 DOI:10.1371/journal.pcbi.1013345 PMID:40779582	research paper	该研究开发了一种名为DeepTangleCrawl（DTC）的神经网络模型，用于在复杂条件下追踪线虫（C. elegans）的姿态，并提高表型筛选中的信噪比	DTC模型在追踪线虫时减少了失败率，并生成更连续、无间隙的轨迹，能够分析以往难以捕捉的行为，提高了表型筛选的信噪比	NA	改进线虫在复杂环境中的高分辨率姿态追踪技术，以应用于遗传学、神经科学和药物筛选	线虫（C. elegans）	computer vision	NA	deep learning	DeepTangle algorithm (DTC)	image	NA
1590	2025-08-10	A Deep Learning Model to Detect Acute MCA Occlusion on High Resolution Non-Contrast Head CT 2025-Aug-08, AJNR. American journal of neuroradiology DOI:10.3174/ajnr.A8954 PMID:40780878	研究论文	本研究开发了一种深度学习模型，用于通过高分辨率非对比头部CT检测急性大脑中动脉闭塞	该模型首次利用高分辨率非对比CT数据进行急性大脑中动脉闭塞的自动检测，准确率接近CTA	模型在M2段闭塞检测时性能略有下降	评估深度学习模型在非对比CT上识别急性大脑中动脉闭塞的可行性和准确性	急性大脑中动脉闭塞患者	数字病理学	心血管疾病	高分辨率非对比CT成像	3D深度学习模型	医学影像	训练验证集4,648例，独立测试集1,011例
1591	2025-08-10	Land use classification using multi-year Sentinel-2 images with deep learning ensemble network 2025-Aug-08, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-12512-7 PMID:40781103	研究论文	本研究提出了一种名为IRUNet的深度学习集成网络，用于多年度Sentinel-2影像的土地利用分类	IRUNet结合了InceptionResNetV2与UNet框架，并采用多尺度特征融合和测试时间增强（TTA）来提高预测的鲁棒性	虽然数据跨越多年，但每年被视为独立输入，未建模时间序列	提高土地利用分类的准确性，以支持城市规划、环境监测和农业管理	Katpadi地区2017-2024年的Sentinel-2卫星影像	计算机视觉	NA	深度学习	IRUNet（集成InceptionResNetV2与UNet框架）	卫星影像	Katpadi地区2017-2024年的Sentinel-2影像数据
1592	2025-08-10	Deep neural network approach integrated with reinforcement learning for forecasting exchange rates using time series data and influential factors 2025-Aug-08, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-12516-3 PMID:40781102	research paper	该研究提出了一种结合LSTM网络和深度Q网络(DQN)的创新混合框架，用于预测汇率时间序列数据	首次将LSTM与强化学习机制(DQN)相结合，实现基于实时反馈的自适应预测优化	仅针对USD/INR汇率数据进行验证，未测试其他货币对的适用性	提高金融时间序列预测的准确性和适应性	USD/INR汇率时间序列数据	machine learning	NA	时间序列分析, 强化学习	LSTM, DQN	时间序列数据	USD/INR汇率数据集
1593	2025-08-10	Advanced dynamic ensemble framework with explainability driven insights for precision brain tumor classification across datasets 2025-Aug-08, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-14917-w PMID:40781137	研究论文	本研究提出了一种新颖的集成深度学习系统，用于通过MRI数据准确分类脑肿瘤	提出了一种动态集成框架，结合了微调的CNN、ResNet-50和EfficientNet-B5，并采用自适应动态权重分配策略优化各网络的贡献，同时通过XAI技术提高模型的可解释性	NA	提高脑肿瘤分类的准确性和可解释性	脑肿瘤MRI数据	计算机视觉	脑肿瘤	MRI	CNN, ResNet-50, EfficientNet-B5	图像	NA
1594	2025-08-10	Towards scalable screening for the early detection of Parkinson's disease: validation of an iPad-based eye movement assessment system against a clinical-grade eye tracker 2025-Aug-08, NPJ Parkinson's disease DOI:10.1038/s41531-025-01079-9 PMID:40781252	研究论文	本文介绍了一种基于iPad的眼动评估系统，用于帕金森病的早期筛查和监测，并通过与临床级眼动仪的对比验证其有效性	开发了一种基于iPad的便携式眼动评估系统，利用深度学习算法提取眼跳指标，并与临床级眼动仪EyeLink 1000 Plus进行对比验证	样本量较小（25名参与者），且仅针对特定类型的眼跳任务进行了验证	开发一种可扩展、经济高效的帕金森病筛查和监测工具	帕金森病患者和健康对照者的眼动数据	数字病理学	帕金森病	深度学习	NA	眼动数据	25名参与者（10名帕金森病患者，15名健康对照者）
1595	2025-08-10	Deep learning approach for automated hMPV classification 2025-Aug-08, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-14467-1 PMID:40781468	研究论文	提出了一种名为hMPV-Net的深度学习框架，用于自动分类人类偏肺病毒（hMPV）感染	利用CNN进行hMPV感染的精确检测和分类，并通过数据增强、加权损失函数和dropout正则化等技术解决数据集不平衡问题	使用模拟图像数据集而非真实患者数据进行训练和评估	开发一种快速准确的hMPV诊断方法	人类偏肺病毒（hMPV）感染	计算机视觉	呼吸道疾病	深度学习	CNN	图像	10000个样本（hMPV阳性和阴性各半）
1596	2025-08-10	Deep learning-based image enhancement for improved black blood imaging in brain metastasis 2025-Aug-08, European radiology IF:4.7Q1 DOI:10.1007/s00330-025-11920-7 PMID:40781512	research paper	评估基于深度学习的图像增强技术在提高脑转移瘤3D对比增强T1加权黑血MR成像图像质量和诊断性能方面的效用	首次应用深度学习技术提升黑血MR成像的图像质量，并显著提高了对小脑转移瘤（小于5毫米）的检测灵敏度	研究为回顾性设计，且未与其他深度学习方法的处理效果进行直接比较	提升脑转移瘤MR成像的诊断准确性和图像质量	126名脑转移瘤患者和121名非脑转移瘤患者的3-T MRI影像数据	digital pathology	brain metastasis	深度学习图像增强技术	DL-based model	MRI影像	247名患者的MRI影像数据
1597	2025-08-10	ADAM-DETR: an intelligent rice disease detection method based on adaptive multi-scale feature fusion 2025-Aug-08, Plant methods IF:4.7Q1 DOI:10.1186/s13007-025-01429-x PMID:40781641	研究论文	提出了一种基于改进RT-DETR的水稻病害检测算法ADAM-DETR，用于复杂田间环境下的病害识别	创新设计了三个核心模块：自适应视觉网络（AVN）骨干网络、双域增强Transformer（DDET）模块和自适应多尺度特征模型（AMFM），以提高特征提取和融合能力	NA	解决复杂田间环境下现有深度学习方法特征提取不足和多尺度病害适应性差的问题	水稻病害	计算机视觉	水稻病害	深度学习	RT-DETR	图像	9,303张图像，覆盖五大病害类别
1598	2025-08-10	Predicting expression-altering promoter mutations with deep learning 2025-Aug-07, Science (New York, N.Y.) DOI:10.1126/science.ads7373 PMID:40440429	研究论文	介绍了一种名为PromoterAI的深度神经网络，用于准确识别非编码启动子变异，这些变异会失调基因表达	开发了PromoterAI深度神经网络，首次能够准确预测非编码启动子变异对基因表达的影响	仅关注启动子区域的变异，未考虑其他非编码区域的潜在致病变异	预测非编码启动子变异对基因表达的影响，以帮助诊断罕见遗传疾病	非编码启动子变异及其对基因表达的影响	机器学习	罕见遗传疾病	深度神经网络	深度神经网络	基因组数据	数千名个体的RNA和蛋白质水平数据
1599	2025-08-10	Enhancing image retrieval through optimal barcode representation 2025-Aug-07, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-14576-x PMID:40770058	research paper	该研究通过优化特征序列提升二进制条形码表示，从而增强图像检索效果	提出基于检索性能指标优化特征序列的方法，显著提高了检索效果	方法性能高度依赖于输入特征的排序，存在显著的组合挑战	优化二进制条形码表示以提升图像检索的效率和准确性	医学和非医学图像数据集	computer vision	NA	deep barcoding, difference-based binarization	NA	image	包括TCGA医学图像数据集、COVID-19胸部X光数据集以及CIFAR-10、CIFAR-100和Fashion-MNIST等非医学基准图像数据集
1600	2025-08-10	An effectiveness of deep learning with fox optimizer-based feature selection model for securing cyberattack detection in IoT environments 2025-Aug-06, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-13134-9 PMID:40764727	research paper	提出了一种基于狐狸优化器特征选择和深度学习的网络安全攻击检测模型（FOFSDL-SCD），用于增强物联网环境中的网络威胁检测能力	结合狐狸优化器算法（FOA）进行特征选择，并采用时序卷积网络（TCN）进行分类，进一步通过蜣螂优化（DBO）方法优化超参数，提高了检测准确率	模型性能仅在Edge-IIoT数据集上验证，未在其他物联网环境中测试泛化能力	提升物联网网络的抗攻击能力和威胁检测能力	物联网环境中的网络安全攻击	machine learning	NA	深度学习（DL）、狐狸优化器算法（FOA）、时序卷积网络（TCN）、蜣螂优化（DBO）	TCN	网络安全数据	Edge-IIoT数据集