深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
16661	2024-09-16	Deep learning and social network analysis elucidate drivers of HIV transmission in a high-incidence cohort of people who inject drugs 2022-Oct-21, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.abf0158 PMID:36260674	研究论文	本文通过深度学习和社交网络分析揭示了注射毒品人群中HIV传播的驱动因素，并识别出最佳干预点	利用图神经网络（GNNs）进行社区检测，揭示了HIV传播与注射场所之间的关联，并提出了针对性的干预策略	研究样本仅限于印度新德里的注射毒品人群，可能限制了结果的普适性	理解并对抗注射毒品人群中的HIV传播	注射毒品人群及其社交和空间网络	机器学习	HIV	图神经网络（GNNs）	图神经网络（GNNs）	社交网络数据	2512名注射毒品人群
16662	2024-09-16	Deep learning-based molecular dynamics simulation for structure-based drug design against SARS-CoV-2 2022, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.csbj.2022.09.002 PMID:36091720	综述	本文综述了基于深度学习和分子动力学模拟的结构药物设计方法在SARS-CoV-2中的最新进展	本文介绍了深度学习和基于深度学习的分子动力学模拟在结构药物设计中的应用，解决了蛋白质结构和结合预测、药物虚拟筛选、分子对接和复合物演化等问题	本文主要讨论了当前方法的挑战和未来方向，未提供具体的实验数据或模型评估	探讨深度学习和分子动力学模拟在SARS-CoV-2结构药物设计中的应用	SARS-CoV-2的蛋白质结构和药物设计	机器学习	COVID-19	分子动力学模拟	深度神经网络	蛋白质结构	NA
16663	2024-09-16	Future stem cell analysis: progress and challenges towards state-of-the art approaches in automated cells analysis 2022, PeerJ IF:2.3Q2 DOI:10.7717/peerj.14513 PMID:36573241	综述	本文综述了从细胞发现到最先进方法的细胞和干细胞分析方法	探讨了当前技术在减少劳动强度、成本效益和降低错误率方面的潜力	未详细讨论具体的技术实现和实验验证	提供细胞和干细胞分析方法的概述，并探讨自动化分析的潜力	细胞和干细胞的分析方法	数字病理学	NA	人工智能和深度学习	NA	图像	NA
16664	2024-09-15	Transcranial ultrafast ultrasound Doppler imaging: A phantom study 2024-Dec, Ultrasonics IF:3.8Q1 DOI:10.1016/j.ultras.2024.107430 PMID:39173276	研究论文	本文提出了一种结合深度学习与射线理论的畸变校正方法，用于实现经颅平面波成像和超快多普勒成像	提出了结合深度学习与射线理论的畸变校正方法，显著提高了经颅超声多普勒成像的质量和准确性	仅通过仿真实验验证了方法的有效性，尚未在临床环境中进行验证	开发一种新的方法来提高经颅超声多普勒成像的质量和准确性	颅内血流速度和方向的量化	医学影像	NA	超声多普勒成像	深度学习模型	图像	使用了一个中心频率为6.25 MHz、128个元素、间距为0.3 mm的线性阵列进行仿真实验
16665	2024-09-15	DepressionEmo: A novel dataset for multilabel classification of depression emotions 2024-Dec-01, Journal of affective disorders IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.jad.2024.08.013 PMID:39214375	研究论文	本文介绍了一个名为DepressionEmo的新数据集，用于检测与抑郁症相关的8种情绪	提出了一个包含6037个Reddit用户长帖的新数据集DepressionEmo，用于多标签分类抑郁症情绪	尽管数据集在识别自杀意图方面表现良好，但其他情绪的F1 Macro值相对较低	研究抑郁症情绪的检测及其对个体的影响	抑郁症相关的8种情绪	自然语言处理	NA	文本分类	BERT, BART, GAN-BERT, T5	文本	6037个Reddit用户长帖
16666	2024-09-15	The improved integrated Exponential Smoothing based CNN-LSTM algorithm to forecast the day ahead electricity price 2024-Dec, MethodsX IF:1.6Q2 DOI:10.1016/j.mex.2024.102923 PMID:39263362	研究论文	提出了一种改进的基于指数平滑和CNN-LSTM的算法，用于预测次日电力价格	结合了指数平滑方法提取水平和季节性特征，以及CNN-LSTM模型处理时间序列中的复杂空间和时间依赖性	未提及具体限制	预测次日电力价格以支持短期电力市场参与者的准确竞价	次日电力价格	机器学习	NA	指数平滑、卷积神经网络（CNN）、长短期记忆网络（LSTM）	CNN-LSTM	时间序列	从印度能源交易所（IEX）收集的次日电力市场数据
16667	2024-09-15	Clinical applications of radiomics and deep learning in breast and lung cancer: A narrative literature review on current evidence and future perspectives 2024-Nov, Critical reviews in oncology/hematology DOI:10.1016/j.critrevonc.2024.104479 PMID:39151838	综述	本文综述了放射组学和深度学习在乳腺癌和肺癌中的临床应用现状及未来展望	本文总结了放射组学在高发癌症（乳腺癌和肺癌）中的应用证据，并讨论了放射组学方法的优缺点，提出了可能的解决方案和未来展望	放射组学在临床决策中的应用仍受限于数据可重复性和研究变异性，需要前瞻性验证和标准化	总结放射组学在乳腺癌和肺癌中的应用证据，并讨论其优缺点及未来发展方向	放射组学在乳腺癌和肺癌中的临床应用	机器学习	肺癌	放射组学	NA	影像	NA
16668	2024-09-15	Noninvasive Technologies for the Diagnosis of Squamous Cell Carcinoma: A Systematic Review and Meta-Analysis 2024-Nov, JID innovations : skin science from molecules to population health DOI:10.1016/j.xjidi.2024.100303 PMID:39263563	meta-analysis	本文通过系统综述和荟萃分析评估了非侵入性技术在皮肤鳞状细胞癌诊断中的性能	本文首次系统性地评估了多种非侵入性技术在皮肤鳞状细胞癌诊断中的性能，并探讨了深度学习在该领域的潜在应用	研究中缺乏标准化诊断标准，且深度学习研究较少，限制了进一步的应用	评估非侵入性技术在皮肤鳞状细胞癌早期诊断中的性能	皮肤鳞状细胞癌的非侵入性诊断技术	NA	皮肤鳞状细胞癌	高频超声、光学相干断层扫描、反射共聚焦显微镜	NA	临床诊断数据	1144名患者，224个皮肤鳞状细胞癌病变，1729个临床诊断
16669	2024-09-15	Image dataset for cattle biometric detection and analysis 2024-Oct, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.110835 PMID:39263231	研究论文	本文介绍了一个用于牛生物特征检测和分析的图像数据集	该数据集包含了72头霍林郭勒黄牛的侧面和背面图像，并附有详细的生物特征标注，可用于构建深度学习模型以实现自动化牲畜监测系统	NA	提高畜牧业管理效率和运营效果，促进农业智能化和可持续发展	霍林郭勒黄牛的生物特征	计算机视觉	NA	深度学习	NA	图像	72头霍林郭勒黄牛
16670	2024-09-15	Radiographic imaging and diagnosis of spinal bone tumors: AlexNet and ResNet for the classification of tumor malignancy 2024-Oct, Journal of bone oncology IF:3.1Q2 DOI:10.1016/j.jbo.2024.100629 PMID:39257652	研究论文	研究探讨了放射影像和图像识别算法在脊柱骨肿瘤恶性分类中的应用，特别是AlexNet和ResNet模型的应用	研究首次将AlexNet和ResNet模型应用于脊柱骨肿瘤的恶性分类，展示了深度学习和卷积神经网络在医学影像分析中的潜力	研究仅限于脊柱骨肿瘤的恶性分类，且样本量相对较小，未来需扩大样本量和研究范围	探索放射影像和图像识别算法在脊柱骨肿瘤恶性分类中的应用	脊柱骨肿瘤的恶性分类	计算机视觉	NA	卷积神经网络 (CNN)	AlexNet, ResNet	图像	580名患者，1532张图像（679张良性肿瘤图像，853张恶性肿瘤图像）
16671	2024-09-15	Create distinctive databases of ancient languages and using a computer vision model to accurately recognize and classify them 2024-Oct, Data in brief IF:1.0Q3 DOI:10.1016/j.dib.2024.110809 PMID:39257691	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的楔形文字识别方法，通过计算机视觉模型快速识别和分类楔形文字图像	利用预先存在的音译和拉丁字母表示法，解决了希伯来字母数据收集困难的问题，并使用Yolov8预训练模型进行对象识别	NA	加速楔形文字的识别和分类过程	楔形文字图像和希伯来字母	计算机视觉	NA	深度学习	Yolov8	图像	约500张希伯来语书籍插图和超过1000张伊拉克发现的古代文档图像
16672	2024-09-15	Personalized Deep Learning Model for Clinical Target Volume on Daily Cone Beam Computed Tomography in Breast Cancer Patients 2024-Oct, Advances in radiation oncology IF:2.2Q2 DOI:10.1016/j.adro.2024.101580 PMID:39258144	研究论文	开发了一种深度学习算法，用于在乳腺癌患者的每日锥形束CT扫描中改进临床靶区体积的分割	利用Intentional Deep Overfit Learning (IDOL)框架，实现了基于患者特异性学习的个性化图像引导放射治疗	未来研究应探索IDOL框架在不同深度学习模型、数据集和癌症部位的适应性	提高乳腺癌放射治疗中每日锥形束CT扫描的临床靶区体积分割精度	乳腺癌患者的每日锥形束CT扫描	计算机视觉	乳腺癌	深度学习	Swin UNETR, UNET, SegResNET	图像	240次CBCT扫描，来自100名乳腺癌患者
16673	2024-09-15	An ensemble deep learning model for predicting minimum inhibitory concentrations of antimicrobial peptides against pathogenic bacteria 2024-Sep-20, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2024.110718 PMID:39262770	研究论文	本研究开发了一种集成深度学习模型，用于预测抗菌肽对特定病原菌的最小抑制浓度	本研究创新性地结合了抗菌肽序列和基因组特征，并使用多种AI架构创建了一个集成模型，显著提高了预测精度	NA	旨在开发一种有效的模型来预测抗菌肽对特定病原菌的最小抑制浓度，以应对抗生素耐药性问题	抗菌肽对ATCC 25923、ATCC 25922和ATCC 27853三种病原菌的最小抑制浓度	机器学习	NA	NA	集成模型，包括双向长短期记忆网络（BiLSTM）、卷积神经网络（CNN）和多分支模型（MBM）	抗菌肽序列和基因组特征	涉及三种病原菌
16674	2024-09-15	Analysis of child development facts and myths using text mining techniques and classification models 2024-Sep-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36652 PMID:39263104	研究论文	本研究利用文本挖掘技术和分类模型区分儿童发展中的事实与谣言	填补了分析儿童发展谣言与事实的空白	NA	通过文本挖掘技术和分类模型区分儿童发展信息中的事实与谣言	儿童发展信息中的事实与谣言	自然语言处理	NA	文本挖掘	Logistic Regression (LR)	文本	从公开网站收集的新数据
16675	2024-09-13	Emerging research trends in artificial intelligence for cancer diagnostic systems: A comprehensive review 2024-Sep-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36743 PMID:39263113	综述	本文综述了机器学习在癌症诊断系统中的应用现状	强调了可解释人工智能（XAI）在癌症诊断中的新兴应用，包括模型决策的交互式可视化和特征重要性分析	讨论了数据集限制、模型可解释性、多组学整合和伦理考虑等挑战	评估现代机器学习技术在癌症诊断中的应用，并指导研究人员、临床医生和政策制定者开发高效且可解释的机器学习癌症诊断系统	癌症诊断系统中的机器学习技术	机器学习	NA	机器学习	监督学习、无监督学习、深度学习和联邦学习	影像、基因组学和临床记录	NA
16676	2024-09-15	Human sleeping pose estimation from IR images for in-bed patient monitoring using image processing and deep learning techniques 2024-Sep-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2024.e36823 PMID:39263111	研究论文	本文开发了一种基于深度学习的框架，用于从红外图像中估计人类睡眠姿势，并应用于床上的患者监测	提出了使用未覆盖图像进行训练的深度学习框架，并通过图像增强和迁移学习策略提高了模型精度	主要限制是覆盖样本的缺乏，这些样本收集和标注成本高且耗时	开发一种从红外图像中估计人类睡眠姿势的方法，以实现对床上患者的监测	研究对象是床上的患者，特别是他们的睡眠姿势	计算机视觉	NA	图像处理和深度学习	GAN	红外图像	使用了少量标注数据和大量未标注数据
16677	2024-09-15	4 × 4 differential index modulation for optical orthogonal frequency division multiplexing 2024-Sep-15, Optics letters IF:3.1Q2 DOI:10.1364/OL.530280 PMID:39270253	研究论文	本文提出并演示了一种用于光正交频分复用系统的4×4差分索引调制方案	该方案通过在时频域进行差分索引调制，避免了复杂的信道估计，并设计了一种基于深度学习的DIMFormer检测器来解决最大似然检测的高解码复杂度问题	NA	研究光正交频分复用系统中的调制技术	4×4差分索引调制方案及其在光正交频分复用系统中的应用	通信技术	NA	差分索引调制	DIMFormer	时频域数据	NA
16678	2024-09-15	Wavefront sensing with optical differentiation powered by deep learning 2024-Sep-15, Optics letters IF:3.1Q2 DOI:10.1364/OL.530559 PMID:39270269	研究论文	本文报道了一种基于深度学习的二进制像素化线性和非线性振幅滤波的远场光学微分波前传感器（ODWS）的实验演示	本文提出了一种基于卷积神经网络（CNN）的非线性滤波ODWS数据重建空间相位图的方法，该方法在没有解析重建算法的情况下实现了精确的波前恢复	NA	实现同时具有高灵敏度、高动态范围和高分辨率的波前传感	波前传感器的重建算法	计算机视觉	NA	NA	卷积神经网络（CNN）	图像	不同幅值和随机形状的波前
16679	2024-09-15	An hetero-modal deep learning framework for medical image synthesis applied to contrast and non-contrast MRI 2024-Sep-13, Biomedical physics & engineering express IF:1.3Q3 DOI:10.1088/2057-1976/ad72f9 PMID:39178886	研究论文	本文提出了一种用于医学图像合成的异模态深度学习框架，应用于对比和非对比MRI图像	本文提出了一种基于注意力网络的深度学习架构，能够从任何可用图像子集中合成所有缺失的成像序列，并通过注意力引导的融合操作优化多分辨率表示的组合	本文仅在MRI图像合成上进行了验证，未涉及其他成像模态	研究如何通过深度学习技术减少医学成像时间或避免对比剂注射的需求	癌症和痴呆等病理的多模态成像合成	计算机视觉	NA	深度学习	3D U-Net	图像	未明确提及具体样本数量
16680	2024-09-15	Semi-supervised lung adenocarcinoma histopathology image classification based on multi-teacher knowledge distillation 2024-Sep-13, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/ad7454 PMID:39191290	研究论文	本文提出了一种基于多教师知识蒸馏的半监督学习方案，用于高精度分类肺腺癌的七种生长模式	引入了动态置信度阈值机制和多教师知识蒸馏技术，提高了模型的泛化能力和分类准确性	NA	解决医学图像分析中对大量标注数据的依赖问题，提高分类精度	肺腺癌的七种生长模式	计算机视觉	肺腺癌	深度学习	多教师知识蒸馏	图像	150张全切片图像