深度学习在生物医药领域的应用
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当前共找到 32372 篇文献，本页显示第 1721 - 1740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 算法框架 | 模型架构 | 性能指标 | 计算资源 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1721 | 2025-10-06 |
Reconstructing the 3D genome organization of Neanderthals reveals that chromatin folding shaped phenotypic and sequence divergence
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.02.07.479462
PMID:40949959
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研究论文 | 本研究利用深度学习从DNA序列重建尼安德特人和丹尼索瓦人的三维基因组结构，揭示染色质折叠对表型和序列分化的影响 | 首次应用深度学习从古DNA序列推断已灭绝古人类的三维基因组结构，突破了古样本降解无法实验测定三维基因组的技术限制 | 基于序列预测的三维基因组结构需要实验验证，古DNA样本质量限制预测准确性 | 探究三维基因组结构在古人类与现代人类分化过程中的作用 | 尼安德特人、丹尼索瓦人和现代人类的基因组 | 计算生物学 | NA | 深度学习，DNA序列分析，Hi-C验证 | 深度学习 | DNA序列数据，三维接触图谱 | 多个古人类和现代人类基因组 | NA | NA | NA | NA |
| 1722 | 2025-10-06 |
Enhancer-targeting CRISPR screens at coronary artery disease loci suggest shared mechanisms of disease risk
2025-Sep-02, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.08.28.25334684
PMID:40950476
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研究论文 | 本研究通过CRISPR筛选系统识别冠状动脉疾病风险位点中的增强子-基因调控机制 | 结合深度学习模型与CRISPRi靶向技术，首次在血管平滑肌细胞中建立全基因组变异-增强子-基因联系图谱 | 研究主要聚焦于血管平滑肌细胞，未涵盖其他可能参与CAD发病的细胞类型 | 系统识别冠状动脉疾病GWAS位点中的因果遗传机制 | 血管平滑肌细胞中的增强子-基因调控网络 | 基因组学 | 冠状动脉疾病 | CRISPRi, DC-TAP-seq, 染色质可及性分析 | 深度学习模型 | 基因组数据, 染色质特征数据 | 108个CAD位点中的470个基因 | NA | NA | NA | NA |
| 1723 | 2025-10-05 |
Colorectal Liver Metastasis Pathomics Model: Integrating Single-Cell and Spatial Transcriptome Analysis With Pathomics for Predicting Liver Metastasis in Colorectal Cancer
2025-Sep, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100805
PMID:40473111
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研究论文 | 本研究开发了一种结合单细胞转录组、空间转录组和病理图像分析的深度学习模型，用于预测结直肠癌肝转移风险 | 首次识别了肝转移触发恶性细胞(LMTMCs)，并通过多组学细胞通讯分析发现成纤维细胞与LMTMCs通过COL1A1-CD44/SDC4和LAMA4-CD44信号轴促进肝转移的机制 | 模型在外部验证集表现存在差异(0.72-0.89)，需要更多样化的数据集验证 | 开发能够早期识别和预测结直肠癌肝转移风险的计算模型 | 结直肠癌患者 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组分析, 批量RNA测序 | 深度学习 | 全切片图像, 基因表达数据 | TCGA-CRC内部测试集和两个外部验证队列(西南医科大学附属医院及附属中医医院) | PyTorch | ResNet18 | AUC | NA |
| 1724 | 2025-10-05 |
AI-based large-scale screening of gastric cancer from noncontrast CT imaging
2025-Sep, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-025-03785-6
PMID:40555751
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研究论文 | 开发基于非对比CT影像和深度学习的大规模胃癌筛查系统GRAPE | 首次利用常规非对比CT影像结合深度学习实现大规模胃癌筛查，在多个中心验证中表现优异 | 研究主要基于中国人群数据，需要在更广泛人群中验证普适性 | 开发高效的大规模胃癌筛查方法 | 胃癌患者和非胃癌人群 | 医学影像分析 | 胃癌 | 非对比CT成像 | 深度学习 | CT影像 | 开发队列6,720例（3,470例GC和3,250例非GC），验证队列19,458例，真实世界评估78,593例 | NA | NA | AUC, 敏感性, 特异性 | NA |
| 1725 | 2025-10-06 |
Analog optical computer for AI inference and combinatorial optimization
2025-Sep, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-09430-z
PMID:40903585
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研究论文 | 提出一种结合模拟电子学和三维光学的模拟光学计算机，用于加速AI推理和组合优化 | 首次在单一平台上实现AI推理和组合优化的双重加速，采用快速定点搜索避免数字转换并增强噪声鲁棒性 | 未明确说明具体性能指标和与传统系统的定量比较 | 开发能同时处理AI推理和组合优化的节能计算平台 | 图像分类、非线性回归、医学图像重建和金融交易结算 | 机器学习, 光学计算 | NA | 模拟光学计算, 三维光学技术 | 递归推理神经网络模型, 梯度下降优化 | 图像数据, 金融交易数据 | NA | NA | 基于定点抽象的神经网络架构 | NA | 可扩展的消费级技术构建的模拟光学计算机 |
| 1726 | 2025-10-06 |
Current Trends and Future Directions of Statistical Methods in Medical Research: A Scientometric Analysis
2025-Sep, Journal of evaluation in clinical practice
IF:2.1Q2
DOI:10.1111/jep.70257
PMID:40916916
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研究论文 | 通过科学计量分析探讨医学研究中统计方法的当前趋势和未来方向 | 使用CiteSpace进行双图叠加和文献共引分析，揭示医学统计学与其他学科间的知识流动和主题演变 | 基于Web of Science的4919篇文献，可能存在数据库收录偏差 | 探索医学统计学的研究热点、发展趋势和未来方向 | 医学统计学领域的4919篇相关出版物 | 机器学习 | NA | 科学计量分析，文献计量分析 | NA | 文献数据，引用数据 | 4919篇相关出版物 | CiteSpace | NA | 中介中心性，sigma值 | NA |
| 1727 | 2025-10-06 |
High-Performance Deep Learning for Instant Pest and Disease Detection in Precision Agriculture
2025-Sep, Food science & nutrition
IF:3.5Q2
DOI:10.1002/fsn3.70963
PMID:40964151
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研究论文 | 提出一种基于MobileNetV2和EfficientNetB0的高性能深度学习融合模型，用于精准农业中的实时病虫害检测 | 首次将MobileNetV2和EfficientNetB0融合用于农业病虫害检测，并采用量化、剪枝和知识蒸馏技术实现边缘设备部署 | 仅针对22类特定作物（腰果、木薯、玉米、番茄）进行验证，未涵盖更广泛的农作物种类 | 开发实时、高精度的病虫害检测系统以支持精准农业和全球粮食安全 | 农作物病虫害图像检测 | 计算机视觉 | 农作物病虫害 | 深度学习图像分类 | CNN | 图像 | 24,881张原始图像和102,976张增强图像，共22个类别 | TensorFlow, TensorFlow Lite | MobileNetV2, EfficientNetB0 | 准确率, 精确率, 召回率, F1分数, ROC-AUC | 智能手机, Raspberry Pi, 农场无人机等低功耗边缘设备 |
| 1728 | 2025-10-05 |
Deep Learning-Based Retinal Layer Segmentation in Optical Coherence Tomography Scans of Patients with Inherited Retinal Diseases
2025-Sep, Klinische Monatsblatter fur Augenheilkunde
IF:0.8Q4
DOI:10.1055/a-2227-3742
PMID:38086412
|
研究论文 | 开发基于深度学习的算法用于遗传性视网膜疾病患者光学相干断层扫描图像中的视网膜层分割 | 使用U-net模型结合领域自适应技术，首次实现对遗传性视网膜疾病患者OCT扫描中外核层的可靠自动分割 | 需要健康患者数据提供训练数据，算法在特定疾病群体中的泛化能力需进一步验证 | 开发能够准确分割遗传性视网膜疾病患者OCT图像中视网膜层的自动算法 | 遗传性视网膜疾病患者和健康对照者的光学相干断层扫描图像 | 计算机视觉 | 遗传性视网膜疾病 | 光学相干断层扫描 | CNN | 图像 | 遗传性视网膜疾病患者和健康对照者的OCT扫描数据 | NA | U-net | Dice系数 | NA |
| 1729 | 2025-10-06 |
Impact of deep learning model uncertainty on manual corrections to MRI-based auto-segmentation in prostate cancer radiotherapy
2025-Sep, Journal of applied clinical medical physics
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/acm2.70221
PMID:40849835
|
研究论文 | 评估深度学习生成的不确定性地图对经验丰富放射肿瘤科医生在前列腺癌放疗中手动修正自动分割结果的影响 | 首次系统评估不确定性地图对临床医生在放疗计划中修正自动分割结果时的决策影响 | 样本量有限（35例测试病例），仅涉及4名肿瘤科医生 | 评估深度学习不确定性地图对放射肿瘤科医生手动修正自动分割的影响 | 前列腺癌患者MRI图像中的临床靶区（CTV）和直肠分割 | 医学影像分析 | 前列腺癌 | MRI影像分析 | nnUNet | 医学影像（MRI） | 434例患者病例用于训练，35例独立测试病例 | nnUNet | nnUNet | Dice系数, Likert量表评分, 分割编辑时间 | NA |
| 1730 | 2025-10-06 |
Pathway information on methylation analysis using deep neural network (PROMINENT): An interpretable deep learning method with pathway prior for phenotype prediction using gene-level DNA methylation
2025-Aug-29, Artificial intelligence in medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.artmed.2025.103236
PMID:40972407
|
研究论文 | 提出一种名为PROMINENT的可解释深度学习新方法，整合基因水平DNA甲基化数据和生物通路信息进行表型预测 | 首次将基因和通路水平先验知识整合到DNA甲基化分析的深度神经网络中，同时提高预测准确性和可解释性 | NA | 开发能够准确预测表型并具有良好可解释性的DNA甲基化数据分析方法 | 儿童哮喘、特发性肺纤维化(IPF)和首发精神病(FEP)患者的DNA甲基化数据 | 机器学习 | 呼吸系统疾病,精神疾病 | DNA甲基化分析 | 深度神经网络 | 基因水平DNA甲基化数据 | NA | NA | 深度神经网络 | 预测准确性,计算效率 | NA |
| 1731 | 2025-10-06 |
Accelerating Biomolecular Modeling with AtomWorks and RF3
2025-Aug-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.14.670328
PMID:40832246
|
研究论文 | 介绍AtomWorks数据框架和RF3结构预测网络，用于加速生物分子建模开发 | 提出通用的AtomWorks数据框架和具有改进手性处理的RF3结构预测网络，缩小与闭源AlphaFold3的性能差距 | NA | 促进新型生物分子机器学习模型的开发，改进生物分子结构预测 | 生物分子复合物 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 神经网络 | 蛋白质结构数据 | NA | NA | RosettaFold-3 | NA | NA |
| 1732 | 2025-10-05 |
Evaluation of calcaneal inclusion angle in the diagnosis of pes planus with pretrained deep learning networks: An observational study
2025-Aug-01, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000043639
PMID:40760538
|
研究论文 | 本研究使用预训练深度学习网络通过跟骨包容角评估扁平足诊断 | 首次将预训练深度学习模型应用于扁平足的X射线图像自动诊断，实现了高精度分类 | 研究人群在年龄和性别方面同质化，缺乏足够异质性代表一般人群 | 开发基于深度学习的扁平足自动诊断方法 | 289名患者的左右足部侧位X射线图像 | 计算机视觉 | 足部畸形 | X射线成像 | CNN | 图像 | 289名患者的足部X射线图像 | NA | AlexNet, GoogleNet, SqueezeNet | 准确率 | NA |
| 1733 | 2025-10-05 |
Specific Contribution of the Cerebellar Inferior Posterior Lobe to Motor Learning in Degenerative Cerebellar Ataxia
2025-Jul-16, Cerebellum (London, England)
DOI:10.1007/s12311-025-01887-y
PMID:40668493
|
研究论文 | 本研究利用深度学习算法CerebNet探究小脑亚区体积与退行性小脑共济失调患者运动学习能力的关系 | 首次使用深度学习算法CerebNet精确分割小脑亚区，并发现小脑后下叶体积与运动学习能力存在特异性关联 | 样本量较小（37例患者和18例健康对照），且为横断面研究无法确定因果关系 | 探究小脑不同亚区体积与运动学习能力及共济失调严重程度的关系 | 退行性小脑共济失调患者和健康对照者 | 医学影像分析 | 退行性小脑共济失调 | 深度学习分割算法 | 深度学习 | 医学影像数据 | 37例患者和18例健康对照 | NA | CerebNet | 回归系数(B值), 置信区间(CI) | NA |
| 1734 | 2025-10-05 |
Preserving noise texture through training data curation for deep learning denoising of high-resolution cardiac EID-CT
2025-Jul, Medical physics
IF:3.2Q1
DOI:10.1002/mp.17938
PMID:40660962
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研究论文 | 本研究开发了基于图像的噪声估计方法训练U-net CNN模型，用于高分辨率心脏EID-CT图像去噪并保持噪声纹理 | 提出了两种直接从患者图像估计噪声的方法来监督CNN训练，无需专用软件或专有信息，有效保留了去噪后CT图像的天然噪声纹理 | 相邻切片相减训练模型有时会移除小的解剖结构，样本量相对较小（7例患者cCTA检查） | 开发图像去噪方法以提升能量积分探测器CT的高空间分辨率重建图像质量，使其噪声水平与光子计数探测器CT相当 | 心脏EID-CT冠状动脉CT血管造影图像和均匀水模CT图像 | 医学影像处理 | 心血管疾病 | CT成像，冠状动脉CT血管造影 | CNN | 医学影像 | 7例患者cCTA检查和水模数据 | NA | U-net | 噪声功率谱，噪声幅度，峰值频率，平均频率，10%峰值频率 | NA |
| 1735 | 2025-10-05 |
Structural assembly of the PAS domain drives the catalytic activation of metazoan PASK
2025-Mar-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2409685122
PMID:40106358
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研究论文 | 本研究揭示了后生动物PASK激酶中PAS结构域通过结构组装驱动催化激活的新机制 | 发现PASK激酶中PAS-C结构域的PAS折叠和PAC基序被非结构化连接子空间分离，但通过分子内相互作用组装成功能性模块 | NA | 阐明后生动物PASK激酶的PAS结构域组装机制及其对催化活性的调控作用 | 后生动物PAS结构域调控激酶（PASK） | 结构生物学 | NA | 进化尺度结构域定位、深度学习结构建模 | 深度学习 | 结构数据、序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1736 | 2025-10-05 |
Fine-Tuned Deep Transfer Learning Models for Large Screenings of Safer Drugs Targeting Class A GPCRs
2025-03-18, Biochemistry
IF:2.9Q3
DOI:10.1021/acs.biochem.4c00832
PMID:40056143
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研究论文 | 开发基于深度迁移学习的模型用于筛选靶向A类GPCRs的安全药物 | 采用迁移学习策略，结合靶点序列自然语言处理和受体突变效应，构建可预测低效能化合物和偏向性激动剂的专用模型 | 高质量数据可用性有限可能影响模型性能 | 预测具有改善安全性特征的GPCR配体，推进药物开发 | A类G蛋白偶联受体及其配体 | 自然语言处理, 机器学习 | NA | 深度迁移学习, 自然语言处理 | 神经网络 | 蛋白质序列, 配体数据, 突变效应数据 | 所有A类GPCRs的受体序列和配体数据集 | NA | 神经网络 | NA | NA |
| 1737 | 2025-10-05 |
A deep learning pipeline for three-dimensional brain-wide mapping of local neuronal ensembles in teravoxel light-sheet microscopy
2025-Mar, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02583-1
PMID:39870865
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研究论文 | 开发了一种基于深度学习的端到端计算流程，用于在太体素光片显微镜图像中实现全脑局部神经元集群的三维映射 | 提出了ACE管道，结合三维深度学习分割模型和先进的聚类统计算法，能够实现无偏见的局部神经元活动和连接性映射，超越了基于图谱定义区域的分析方法 | NA | 开发能够泛化不同实验协议的计算管道，在层状和亚群特异性水平上映射神经元活动 | 清除的啮齿类动物大脑图像中的神经元活动 | 数字病理学 | NA | 光片荧光显微镜 | 深度学习分割模型 | 三维图像 | NA | NA | NA | 泛化性, 性能 | NA |
| 1738 | 2025-10-05 |
Characteristics of left ventricular dysfunction in repaired tetralogy of Fallot: A multi-institutional deep learning analysis of regional strain and dyssynchrony
2025, Journal of cardiovascular magnetic resonance : official journal of the Society for Cardiovascular Magnetic Resonance
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.jocmr.2025.101886
PMID:40122390
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研究论文 | 本研究使用深度学习合成应变技术分析修复型法洛四联症患者的左心室功能障碍模式 | 首次应用深度学习算法自动测量区域左心室应变和不同步性，并识别出四种独特的左心室收缩模式 | 回顾性研究设计，样本量相对有限（198例患者） | 表征修复型法洛四联症患者左心室功能障碍的特征模式 | 修复型法洛四联症患者（198例）和健康对照者（21例） | 数字病理 | 心血管疾病 | 心血管磁共振成像，稳态自由进动电影MRI | 深度学习算法 | MRI图像 | 198例rTOF患者和21例健康对照 | NA | 深度学习合成应变 | 应变值，应变率，不同步性测量，心室容积，射血分数 | NA |
| 1739 | 2025-10-05 |
Automatic flow planning for fetal cardiovascular magnetic resonance imaging
2025, Journal of cardiovascular magnetic resonance : official journal of the Society for Cardiovascular Magnetic Resonance
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.jocmr.2025.101888
PMID:40180124
|
研究论文 | 开发用于胎儿心血管磁共振成像的自动流程规划系统OWL | 首次实现胎儿二维相位对比血流成像的实时自动规划 | 仅在7例前瞻性病例中测试，样本量有限 | 通过自动化流程扩大胎儿血流成像的可及性 | 胎儿心血管系统 | 医学影像分析 | 胎儿心血管疾病 | 二维相位对比血流成像，心血管磁共振成像 | 深度学习网络 | 磁共振图像 | 167个胎儿数据集用于身体定位，71个用于心脏标志点检测，10个回顾性数据集，7个前瞻性病例 | NA | NA | Dice系数，定位精度(mm)，规划质量评分，流量测量差异百分比 | NA |
| 1740 | 2025-10-06 |
Intelligent Alzheimer's diagnosis and disability assessment: robust medical imaging analysis using ensemble learning with ResNet-50 and EfficientNet-B3
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1619228
PMID:40963573
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研究论文 | 提出一种基于ResNet-50和EfficientNet-B3集成学习的医学影像分析系统，用于阿尔茨海默病的智能诊断和残疾评估 | 首次将ResNet-50特征提取与EfficientNet-B3分类器结合的集成学习框架应用于阿尔茨海默病诊断，在大型MRI数据集上实现高精度分类 | 需要在更多临床环境中验证模型性能以满足真实世界诊断需求 | 开发自动化阿尔茨海默病诊断和残疾评估系统 | 阿尔茨海默病患者MRI影像 | 医学影像分析 | 阿尔茨海默病 | 磁共振成像(MRI) | 集成学习,CNN | 医学影像 | 33,984张MRI图像，涵盖轻度、中度、非痴呆和极轻度痴呆四个疾病阶段 | NA | ResNet-50,EfficientNet-B3 | 准确率,精确率,召回率,F1分数,ROC曲线面积 | NA |