深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1721	2025-06-06	Investigating the Quality of DermaMNIST and Fitzpatrick17k Dermatological Image Datasets 2025-Feb-01, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-025-04382-5 PMID:39893183	research paper	本文对DermaMNIST、HAM10000和Fitzpatrick17k三个皮肤病图像数据集进行了细致分析，揭示了数据质量问题，并提出了修正方案	揭示了皮肤病数据集中存在的重复数据、数据泄漏、错误标签等问题，并提出了修正方法	仅分析了三个皮肤病数据集，可能无法涵盖所有数据质量问题	评估皮肤病图像数据集的质量，并提高深度学习模型的可靠性	DermaMNIST、HAM10000和Fitzpatrick17k数据集	digital pathology	dermatological disease	NA	deep neural network	image	三个皮肤病数据集（具体数量未提及）
1722	2025-06-06	Enhancing predictive accuracy for urinary tract infections post-pediatric pyeloplasty with explainable AI: an ensemble TabNet approach 2025-01-19, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-82282-1 PMID:39828726	research paper	本研究开发了一种结合机器学习和深度学习的集成模型，用于预测小儿肾盂成形术后尿路感染的风险	首次提出结合机器学习和深度学习的集成预测模型，利用SHAP解释模型提供临床风险因素新见解	研究证据等级为IV级，缺乏对照组比较	提高小儿肾盂成形术后尿路感染的预测准确性	764例接受单侧肾盂成形术的儿科患者	machine learning	urinary tract infection	ensemble learning, SHAP	TabNet, Logistic Regression, SVM, Random Forest, XGBoost, LightGBM	clinical features	764例儿科患者
1723	2025-06-06	Deep learning in Cobb angle automated measurement on X-rays: a systematic review and meta-analysis 2025-Jan, Spine deformity IF:1.6Q3 DOI:10.1007/s43390-024-00954-4 PMID:39320698	系统综述与荟萃分析	本文综述了深度学习算法在X光片上自动测量Cobb角的应用，并进行了荟萃分析	比较了基于分割和基于标志点的深度学习方法的准确性，并提出了改进模型设计的潜在方法	荟萃分析结果有限，存在高度异质性	评估深度学习算法在Cobb角自动测量中的性能	X光片上的Cobb角测量	计算机视觉	脊柱侧弯	深度学习算法	NA	X光图像	50项研究纳入系统综述，17项研究纳入荟萃分析（共3022例样本）
1724	2025-06-06	A Deep Learning-Based Method for Rapid 3D Whole-Heart Modeling in Congenital Heart Disease 2025, Cardiology IF:1.9Q3 DOI:10.1159/000541980 PMID:39396499	研究论文	开发了一种基于深度学习的快速三维心脏建模方法，用于先天性心脏病患者的术前规划和诊断支持	整合医学影像和临床诊断信息，通过深度学习自动生成3D打印和VR应用的心脏模型	研究样本量较小（110例患者），未来需在更大数据集和不同类型先天性心脏病上验证模型的广泛适用性	提高先天性心脏病手术规划和诊断的精确性	先天性心脏病患者	数字病理学	先天性心脏病	CT、心脏MRI	深度学习模型	医学影像、临床数据	110例患者
1725	2025-06-06	GCLmf: A Novel Molecular Graph Contrastive Learning Framework Based on Hard Negatives and Application in Toxicity Prediction 2025-Jan, Molecular informatics IF:2.8Q2 DOI:10.1002/minf.202400169 PMID:39421969	research paper	提出了一种基于硬负样本的分子图对比学习框架GCLmf，用于毒性预测	利用特定条件的分子片段作为硬负样本，提升负样本集质量，从而在预训练中学习更具信息量的分子表示	未明确提及模型在数据稀缺情况下的表现或泛化能力	提高化学毒性预测的准确性和鲁棒性	分子图数据	machine learning	NA	对比学习（自监督学习）	GCLmf（基于深度学习的分子图对比学习框架）	分子图数据	在33个毒性任务上进行评估，具体样本量未明确说明
1726	2025-06-06	Diagnostic accuracy of deep learning-based algorithms in laryngoscopy: a systematic review and meta-analysis 2025-Jan, European archives of oto-rhino-laryngology : official journal of the European Federation of Oto-Rhino-Laryngological Societies (EUFOS) : affiliated with the German Society for Oto-Rhino-Laryngology - Head and Neck Surgery IF:1.9Q2 DOI:10.1007/s00405-024-09049-2 PMID:39446141	meta-analysis	该研究通过系统综述和荟萃分析评估深度学习在喉镜检查中诊断喉癌的准确性	首次对深度学习在喉镜检查中的诊断效用进行系统评价和荟萃分析	仅纳入9项研究，样本量虽大但研究数量有限	评估深度学习算法在喉镜检查中诊断喉癌的准确性	喉镜检查图像	digital pathology	laryngeal cancer	深度学习	NA	image	106,175张内窥镜图像
1727	2025-06-06	Overcoming the preferred-orientation problem in cryo-EM with self-supervised deep learning 2025-Jan, Nature methods IF:36.1Q1 DOI:10.1038/s41592-024-02505-1 PMID:39558095	research paper	该论文开发了一种名为spIsoNet的自监督深度学习软件，用于解决冷冻电镜中的粒子取向偏差问题	提出了一种端到端的自监督深度学习方法，无需额外的样本制备过程即可解决冷冻电镜中的取向偏差问题	NA	解决冷冻电镜中粒子取向偏差导致的图像各向异性和粒子错位问题	冷冻电镜图像数据，包括核糖体、β-半乳糖苷酶和血凝素三聚体数据集	计算机视觉	NA	冷冻电镜	深度学习	图像	多个代表性生物系统数据集
1728	2025-06-06	Deep learning-based optical coherence tomography and retinal images for detection of diabetic retinopathy: a systematic and meta analysis 2025, Frontiers in endocrinology IF:3.9Q2 DOI:10.3389/fendo.2025.1485311 PMID:40171193	meta-analysis	本文通过系统综述和荟萃分析评估了深度学习算法在光学相干断层扫描（OCT）和视网膜图像中检测糖尿病视网膜病变（DR）的有效性	首次对深度学习在OCT和视网膜图像中检测DR的效果进行了全面的荟萃分析	数据集标准化不足，模型可解释性有待提高，且需在多样化人群中进一步验证性能	评估深度学习算法在糖尿病视网膜病变检测中的准确性和可靠性	光学相干断层扫描（OCT）和视网膜图像	digital pathology	diabetic retinopathy	deep learning	NA	image	188268张视网膜图像和OCT扫描
1729	2025-06-06	Ground-truth-free deep learning approach for accelerated quantitative parameter mapping with memory efficient learning 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0324496 PMID:40455714	研究论文	本研究评估了结合内存高效学习(MEL)的自监督学习(SSL)和零样本自监督学习(ZSSSL)框架，以加速定量MRI(qMRI)的图像重建	提出了不依赖全采样数据的自监督学习和零样本自监督学习方法，并结合内存高效学习技术降低GPU内存需求	在高度加速因子条件下，SSL和ZSSSL的性能略逊于监督学习(SL)	加速定量MRI图像重建过程并降低计算资源需求	定量MRI图像重建	医学影像分析	NA	定量MRI(qMRI), 自监督学习(SSL), 零样本自监督学习(ZSSSL)	深度学习(DL)	MRI图像	三个实验(2D T2映射/MSME, 3D T1映射/VFA-SPGR, 3D T2映射/DESS)
1730	2025-06-06	Utility of artificial intelligence-based conversation voice analysis for detecting cognitive decline 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0325177 PMID:40455724	研究论文	本研究开发了一种基于人工智能的对话语音分析模型，用于检测认知衰退	利用短对话语音样本通过AI模型检测认知衰退，无需专业环境或设备	样本量较小（263名患者），且仅基于Mini-Mental State Examination分数进行标签	开发一种便捷的认知衰退筛查工具	认知衰退患者和认知正常人群	自然语言处理	老年疾病	机器学习	全耦合神经网络	语音	263名患者的语音样本，其中20个样本用于准确性评估
1731	2025-06-06	Overlapping point cloud registration algorithm based on KNN and the channel attention mechanism 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0325261 PMID:40455723	研究论文	提出了一种基于KNN和通道注意力机制的重叠点云配准算法，显著提高了重叠区域的特征提取和匹配能力	结合KNN算法和通道注意力机制(CAM)，设计了有效性评分网络，提高了配准精度和系统鲁棒性	未提及算法在实时性方面的表现	提高重叠点云区域的特征提取和匹配能力，构建高精度环境模型	三维点云数据	计算机视觉	NA	KNN算法，通道注意力机制(CAM)	有效性评分网络	三维点云数据	ModelNet40数据集和Stanford数据集
1732	2025-06-06	A novel spectral analysis-based grading system for gastrointestinal activity 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0323440 PMID:40455773	研究论文	本文介绍了一种基于频谱分析的新型胃肠道活动分级系统，用于客观评估胃肠动力	提出了一种创新的无监督分级系统，通过频谱特征分析肠鸣音来评估胃肠动力，避免了传统方法依赖个人判断和大规模标注数据集的问题	虽然验证了方法的可靠性，但仍需进一步研究以确认其在更广泛临床环境中的适用性	开发一种客观评估胃肠动力的方法，辅助医生量化胃肠道活动	肠鸣音（由消化气体和液体在蠕动过程中产生的声音信号）	数字病理	胃肠道疾病	频谱特征分析	无监督学习	音频	NA
1733	2025-06-06	An efficient non-parametric feature calibration method for few-shot plant disease classification 2025, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2025.1541982 PMID:40458225	research paper	提出一种基于特征适应评分（FAS）度量的方法，用于少样本植物病害分类	利用FAS评分与测试准确率的严格正相关关系，无需训练网络即可确定适用于少样本植物病害分类的Swin-Transformer V2-F6网络结构，并设计了PDFC算法进行特征校准	NA	解决植物病害图像数据不足的问题，提高少样本植物病害分类的准确率	植物病害图像	computer vision	plant disease	few-shot learning	Swin-Transformer V2	image	PlantVillage数据集及其他数据集
1734	2025-06-06	Ventricular volume adjustment of brain regions depicts brain changes associated with HIV infection and aging better than intracranial volume adjustment 2025, Frontiers in neurology IF:2.7Q3 DOI:10.3389/fneur.2025.1516168 PMID:40458466	research paper	该研究探讨了在分析HIV感染和衰老相关的大脑结构变化时，采用侧脑室（LV）体积调整比颅内体积（ICV）调整更能揭示潜在的萎缩模式	提出了使用侧脑室体积调整作为新的分析方法，以更准确地识别HIV感染和衰老相关的大脑萎缩模式，尤其是在HIV相关神经认知障碍（HAND）的研究中	研究仅基于MRI T1图像数据，未考虑其他可能的神经影像学或临床数据	比较不同体积调整策略在识别HIV感染和衰老相关大脑萎缩模式中的效果	HIV感染者和健康对照者的大脑结构变化	digital pathology	HIV感染	MRI T1成像	deep learning models	image	NA
1735	2025-06-06	Artificial Intelligence and Radiomics Applied to Prostate Cancer Bone Metastasis Imaging: A Review 2024-Dec, iRadiology DOI:10.1002/ird3.99 PMID:40453356	review	本文综述了人工智能和放射组学在前列腺癌骨转移影像分析中的应用	综合分析了放射组学、机器学习和深度学习在前列腺癌骨转移影像分析中的应用，并提出了未来研究方向	文献中缺乏对各种方法的详细分析和未来方向的深入探讨	探讨定量方法在前列腺癌骨转移影像分析中的应用及其临床意义	前列腺癌骨转移的影像数据	digital pathology	prostate cancer	radiomics, machine learning, deep learning	NA	image	NA
1736	2025-06-06	Leveraging Artificial Intelligence and Data Science for Integration of Social Determinants of Health in Emergency Medicine: Scoping Review 2024-10-30, JMIR medical informatics IF:3.1Q2 DOI:10.2196/57124 PMID:39475815	综述	本文探讨了人工智能和数据科学在急诊医学中整合社会健康决定因素（SDOH）数据的潜力和应用	首次系统性地评估了AI和数据科学在急诊医学中SDOH数据整合的应用，突出了机器学习和自然语言处理技术的优势	研究仍处于初级阶段，纳入的研究数量有限（26篇），且主要集中在急诊科患者	探索AI和数据科学在急诊医学中SDOH数据建模、提取和整合的应用潜力	急诊科患者及其SDOH数据	医疗信息学	急诊医学相关疾病（如脓毒症、急性心肌梗死、哮喘等）	机器学习（ML）、自然语言处理（NLP）、深度学习、模式匹配	NLP模型（包括基于规则的NLP、深度学习模型）	文本数据（临床记录等）	26项符合条件的研究（其中9项专门针对急诊患者）
1737	2025-06-06	DEEP LEARNING FOR AUTOMATIC PREDICTION OF EARLY ACTIVATION OF TREATMENT-NAIVE NONEXUDATIVE MACULAR NEOVASCULARIZATIONS IN AGE-RELATED MACULAR DEGENERATION 2024-08-01, Retina (Philadelphia, Pa.) DOI:10.1097/IAE.0000000000004106 PMID:38489765	research paper	本研究开发了一种基于光学相干断层扫描（OCT）和OCT血管成像（OCTA）的深度学习分类器，用于预测年龄相关性黄斑变性患者中非渗出性黄斑新生血管的早期渗出风险	首次结合OCT和OCTA图像分析，使用多种CNN模型（ResNet-101、Inception-ResNet-v2和DenseNet-201）进行预测，并通过多数投票和软投票技术提升性能	样本量相对较小（89例患者），且为回顾性研究	开发AI工具预测非渗出性黄斑新生血管的早期渗出风险	年龄相关性黄斑变性患者的非渗出性黄斑新生血管	digital pathology	age-related macular degeneration	OCT, OCTA	CNN (ResNet-101, Inception-ResNet-v2, DenseNet-201)	image	89例患者（35例渗出组，54例非渗出组）
1738	2025-06-06	AUTOMATED DETECTION OF VITRITIS USING ULTRAWIDE-FIELD FUNDUS PHOTOGRAPHS AND DEEP LEARNING 2024-06-01, Retina (Philadelphia, Pa.) DOI:10.1097/IAE.0000000000004049 PMID:38261816	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的算法，用于自动检测和分级超广角眼底照片中的玻璃体炎	首次利用超广角眼底成像和深度学习技术进行玻璃体炎的自动检测和分级	六分类玻璃体炎分级的准确性有限（0.61），可能需要更大样本量来提高模型性能	评估深度学习算法在超广角成像上自动检测和分级玻璃体炎的性能	葡萄膜炎患者的超广角眼底视网膜照片	数字病理	葡萄膜炎	超广角眼底成像	DenseNet121 CNN	图像	1181张图像
1739	2025-06-06	OMERACT validation of a deep learning algorithm for automated absolute quantification of knee joint effusion versus manual semi-quantitative assessment 2024-06, Seminars in arthritis and rheumatism IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.semarthrit.2024.152420 PMID:38422727	研究论文	本文通过OMERACT过滤器评估深度学习算法在膝关节积液自动绝对量化中的应用	首次使用深度学习算法对膝关节积液进行自动绝对量化，并与人工半定量评估进行对比	需要进一步评估算法的区分能力和与临床结果的一致性，以完全满足OMERACT过滤器的要求	评估深度学习算法在膝关节积液量化中的有效性	53名OAI受试者的膝关节MRI数据	数字病理学	骨关节炎	深度学习	DL算法	MRI图像	53名受试者
1740	2025-06-06	OCTess: AN OPTICAL CHARACTER RECOGNITION ALGORITHM FOR AUTOMATED DATA EXTRACTION OF SPECTRAL DOMAIN OPTICAL COHERENCE TOMOGRAPHY REPORTS 2024-04-01, Retina (Philadelphia, Pa.) DOI:10.1097/IAE.0000000000003990 PMID:37948741	研究论文	开发了一种名为OCTess的光学字符识别算法，用于从Cirrus SD-OCT黄斑立方体报告中自动提取数据	结合了Tesseract OCR库和LSTM深度学习技术，实现了近乎完美的数据提取准确率，且在效率上超越了人工操作	研究仅基于单中心数据库，可能限制了算法的泛化能力	开发自动化工具以减少人工提取SD-OCT报告的时间和资源消耗	SD-OCT单眼黄斑立方体报告	计算机视觉	眼科疾病	光学字符识别(OCR)，深度学习	LSTM	图像	675份SD-OCT报告（训练集125份，测试集550份）