深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
17721	2024-09-10	TLCoV- An automated Covid-19 screening model using Transfer Learning from chest X-ray images 2021-Mar, Chaos, solitons, and fractals DOI:10.1016/j.chaos.2021.110713 PMID:33526961	研究论文	本文设计了一种基于迁移学习的自动化Covid-19筛查模型，通过胸部X光图像识别患者是否感染Covid-19	本文提出的模型使用VGG-16架构，在Covid-19筛查中表现优于现有的CNN和ResNet-50模型	NA	开发一种高精度的自动化Covid-19筛查模型，以减少疾病的快速传播	Covid-19感染患者、其他肺炎感染患者和无感染者	计算机视觉	Covid-19	迁移学习	VGG-16	图像	使用来自Kaggle仓库的标准Covid-19放射影像数据集中的胸部X光图像
17722	2024-09-10	The effect of confounding data features on a deep learning algorithm to predict complete coronary occlusion in a retrospective observational setting 2021-Mar, European heart journal. Digital health DOI:10.1093/ehjdh/ztab002 PMID:36711180	研究论文	研究了深度学习算法在预测冠状动脉完全闭塞中的效果，并探讨了混杂数据特征的影响	首次探讨了数据泄露对深度学习模型预测冠状动脉闭塞结果的影响	数据集过小导致模型性能不佳，且存在数据泄露问题	评估深度学习算法在检测冠状动脉闭塞中的可行性	冠状动脉闭塞的ECG样本	机器学习	心血管疾病	深度学习	深度卷积神经网络	ECG数据	NA
17723	2024-09-10	Integrative analysis for COVID-19 patient outcome prediction 2021-01, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2020.101844 PMID:33091743	研究论文	本文提出了一种综合分析方法，结合影像学和非影像学特征来预测COVID-19患者的预后	首次使用包括影像和非影像数据的全面信息进行患者预后预测	NA	提高COVID-19患者预后预测的准确性，以辅助临床决策	COVID-19患者的预后预测	计算机视觉	COVID-19	深度学习	NA	影像和非影像数据	295名COVID-19阳性患者
17724	2024-09-10	Self-supervised learning for medical image analysis using image context restoration 2019-12, Medical image analysis IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.media.2019.101539 PMID:31374449	研究论文	本文提出了一种基于图像上下文恢复的自监督学习策略，用于医学图像分析	提出了一种新的自监督学习策略，通过上下文恢复来更好地利用未标记图像，该策略具有学习语义图像特征、适用于不同类型的后续图像分析任务以及实现简单的特点	未明确提及	提高机器学习模型在医学图像分析中的性能，特别是在标记数据不足的情况下	胎儿2D超声图像的扫描平面检测、CT图像中腹部器官的定位以及多模态MR图像中脑肿瘤的分割	计算机视觉	NA	自监督学习	NA	图像	未明确提及
17725	2024-09-09	Psychological resilience is positively correlated with Habenula volume 2024-Nov-15, Journal of affective disorders IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.jad.2024.08.012 PMID:39151760	研究论文	研究心理韧性与人脑Habenula体积之间的正相关关系	首次探讨了Habenula体积与心理韧性之间的关系，并发现这种关系在女性中更为显著	由于横断面设计，无法分析Habenula体积在韧性适应过程中的动态变化	探讨心理韧性、Habenula体积与抑郁倾向之间的关系	健康成年人的心理韧性、Habenula体积及抑郁倾向	NA	NA	深度学习技术	NA	图像	110名健康参与者
17726	2024-09-09	Low energy virtual monochromatic CT with deep learning image reconstruction to improve delineation of endoleaks 2024-Oct, Clinical radiology IF:2.1Q2 DOI:10.1016/j.crad.2024.07.002 PMID:39079807	研究论文	研究低能量虚拟单色CT与深度学习图像重建在增强双能量CT中对内漏轮廓的改进效果	结合40-keV虚拟单色成像与深度学习图像重建，显著提高了内漏的对比噪声比和可视性	研究样本量较小，且仅限于特定类型的内漏	探讨低能量虚拟单色成像与深度学习图像重建在增强双能量CT中对内漏轮廓的改进效果	内漏（EL）在血管内主动脉修复（EVAR）后的轮廓	计算机视觉	心血管疾病	深度学习图像重建（DLIR）	深度学习模型	图像	61名接受血管内主动脉修复并进行增强双能量CT的患者
17727	2024-09-09	A Deep Learning Application of Capsule Endoscopic Gastric Structure Recognition Based on a Transformer Model 2024-Oct-01, Journal of clinical gastroenterology IF:2.8Q2 DOI:10.1097/MCG.0000000000001972 PMID:38457410	研究论文	本文研究了基于Transformer模型的胶囊内窥镜胃结构识别的深度学习应用	首次将Transformer模型应用于胶囊内窥镜胃结构识别，提高了诊断准确性	NA	建立一个胶囊内窥镜胃结构识别模型，以提高深度学习在内窥镜图像识别中的临床适用性	胶囊内窥镜视频中的胃结构	计算机视觉	NA	深度学习	Transformer	视频	3343个胶囊内窥镜视频用于无监督预训练，2433个用于训练，118个用于验证
17728	2024-09-09	AI-based seagrass morphology measurement 2024-Sep-05, Journal of environmental management IF:8.0Q1 DOI:10.1016/j.jenvman.2024.122246 PMID:39241598	研究论文	本文开发了一种基于人工智能的机器学习模型，用于自动测量海草的形态参数	利用YOLO-v6深度学习模型自动分类和测量海草的形态参数，提高了测量效率和准确性	NA	研究海草的表型可塑性及其对环境压力的形态适应能力，以评估生态系统健康并制定保护策略	海草的形态参数，包括叶片、根茎和根的长度和宽度	计算机视觉	NA	机器学习	YOLO-v6	图像	三种不同类型的海草对象
17729	2024-09-09	Deep learning meets histones at the replication fork 2024-Sep-05, Cell IF:45.5Q1 DOI:10.1016/j.cell.2024.07.055 PMID:39241742	研究论文	本文探讨了在复制叉处，异染色质的表观遗传继承需要将亲代H3-H4四聚体转移到两个子代双链中，并揭示了复制体组件Mrc1/CLASPIN作为H3-H4四聚体伴侣在亲代组蛋白向子代转移中的重要作用	利用酵母遗传学与继承分析以及AlphaFold2-多聚体预测与生物化学相结合的方法，揭示了Mrc1/CLASPIN在组蛋白转移中的新角色	NA	探讨异染色质表观遗传继承的机制	H3-H4四聚体在复制过程中的转移	数字病理学	NA	AlphaFold2-多聚体预测	NA	NA	NA
17730	2024-09-09	Recent trends in AI applications for pelvic MRI: a comprehensive review 2024-Sep, La Radiologia medica DOI:10.1007/s11547-024-01861-4 PMID:39096356	综述	本文综述了人工智能在盆腔MRI中的应用及其在诊断路径各个阶段的发展	重点介绍了多中心研究的趋势，以提高AI的通用性	NA	探讨人工智能在盆腔MRI诊断中的应用及其进展	盆腔MRI在前列腺、膀胱、子宫、卵巢和直肠等器官的诊断	计算机视觉	NA	MRI	机器学习和深度学习算法	图像	NA
17731	2024-09-09	Diabetic retinopathy screening through artificial intelligence algorithms: A systematic review 2024 Sep-Oct, Survey of ophthalmology IF:5.1Q1 DOI:10.1016/j.survophthal.2024.05.008 PMID:38885761	综述	本文综述了使用人工智能算法进行糖尿病视网膜病变筛查的现状和方法	本文提出了将卷积神经网络和U-Net架构集成以提高诊断和分类准确性的创新点	主要挑战包括高质量标注数据的获取困难、模型复杂性管理以及在实际临床环境中确保模型输出的可靠性	指导未来在自动糖尿病视网膜病变筛查领域的研究方向	糖尿病视网膜病变及其不同阶段的筛查和分类	计算机视觉	糖尿病	深度学习	卷积神经网络、U-Net	图像	IDRiD数据集包含516张彩色眼底图像
17732	2024-09-09	Classification of gait variation under mental workload in big five personalities 2024-Sep, Gait & posture IF:2.2Q2 DOI:10.1016/j.gaitpost.2024.06.004 PMID:38878610	研究论文	研究通过惯性传感器捕捉步态变化，揭示人格、心理负荷与步态模式之间的关系	首次通过深度学习模型对不同人格维度和心理负荷下的步态进行分类，并评估了不同身体部位传感器数据对分类性能的影响	研究样本量较小，且仅限于走廊行走场景，未来需在更多样化的环境中验证模型性能	揭示人格、心理负荷与步态模式之间的相互关系，并构建步态分类模型	60名参与者在不同心理负荷下的步态数据及其五大人格特质	机器学习	NA	惯性测量单元 (IMU)	滑动窗口长短期记忆网络 (LSTM)	步态数据	60名参与者
17733	2024-09-09	Development and validation of a fully automated tool to quantify 3D foot and ankle alignment using weight-bearing CT 2024-Sep, Gait & posture IF:2.2Q2 DOI:10.1016/j.gaitpost.2024.05.029 PMID:38850852	研究论文	开发并验证了一种全自动工具，用于使用负重CT量化3D足踝对齐	结合负重CT成像和深度学习技术，自动化并增强3D足踝对齐的量化	在某些角度（如距舟覆盖角和远端跖骨关节角）的测量中存在一定的误差	开发一种全自动工具，用于量化3D足踝对齐，并验证其准确性和可靠性	32名接受足踝负重CT的患者	计算机视觉	NA	深度学习	3D nnU-Net	图像	45例用于模型训练和验证，32例用于研究
17734	2024-09-09	Fully Automated Hippocampus Segmentation using T2-informed Deep Convolutional Neural Networks 2024-Sep, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120767 PMID:39103064	研究论文	本文提出了一种利用T2加权MR图像和深度卷积神经网络实现全自动海马体分割的方法	本文创新性地利用高分辨率T2加权图像来增强临床T1加权图像的海马体分割效果	本文未提及具体的局限性	旨在提高海马体分割的准确性和可靠性，以便在阿尔茨海默病临床试验中更精确地估计海马体体积和追踪其体积损失	海马体及其在阿尔茨海默病中的萎缩情况	计算机视觉	阿尔茨海默病	深度学习	3D卷积神经网络	医学影像	包含T1和T2加权图像的多对比度数据集
17735	2024-09-09	RS2-Net: An end-to-end deep learning framework for rodent skull stripping in multi-center brain MRI 2024-Sep, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120769 PMID:39122056	研究论文	本文提出了一种基于Swin-UNETR的轻量级深度学习框架RS2-Net，用于自动化小鼠和大鼠脑部MRI扫描中的颅骨剥离	该框架旨在消除预处理需求，减少工作量，并提供一个能够适应各种MRI图像分辨率的即插即用解决方案	NA	开发一种自动化的小鼠和大鼠脑部MRI扫描颅骨剥离方法	小鼠和大鼠的脑部MRI图像	计算机视觉	NA	MRI	Swin-UNETR	图像	1,037只啮齿动物和1,142张图像，来自89个中心
17736	2024-09-09	A comprehensive overview of diffuse correlation spectroscopy: Theoretical framework, recent advances in hardware, analysis, and applications 2024-Sep, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2024.120793 PMID:39153520	综述	本文全面概述了扩散相关光谱（DCS）的理论框架、硬件、分析方法和应用的最新进展	介绍了高度集成的硅单光子雪崩二极管（SPAD）传感器在DCS中的新应用，并比较了SPAD与现有传感器的性能	NA	帮助新进入者更好地理解和应用扩散相关光谱技术	扩散相关光谱（DCS）的理论框架、硬件架构、数据分析工具及其在医学诊断中的应用	生物医学工程	NA	扩散相关光谱（DCS）	NA	光谱数据	NA
17737	2024-09-08	Real-world video superresolution enhancement method based on the adaptive down-sampling model 2024-Sep-04, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-69674-z PMID:39231992	研究论文	本文提出了一种基于自适应下采样模型的真实世界视频超分辨率增强方法	结合了传统的BM3D算法和自适应下采样模型，提高了视频超分辨率的效果	未提及具体的局限性	提高视频超分辨率技术的性能和真实感	视频超分辨率技术	计算机视觉	NA	深度学习	GAN	视频	未提及具体样本数量
17738	2024-09-08	Optimal techno-economic assessment of isolated microgrid integrated with fast charging stations using radial basis deep learning 2024-Sep-04, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-70063-9 PMID:39232001	研究论文	本文提出了一种优化模型，用于评估与快速充电站集成的孤立微电网的技术经济性能	采用基于径向基网络的深度学习方法，相比传统优化方法，能在较短时间内获得最优解	NA	评估快速充电站的技术经济性能，并优化其组件和容量选择	快速充电站、光伏和风力发电机、各种储能设备	机器学习	NA	径向基网络	深度学习	NA	NA
17739	2024-09-08	APIS: a paired CT-MRI dataset for ischemic stroke segmentation - methods and challenges 2024-09-04, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-71273-x PMID:39232010	研究论文	本文介绍了一个公开挑战，科学家们应用顶级计算策略在CT扫描上描绘中风病变，利用配对的ADC信息	首次构建了一个包含急性缺血性中风患者的NCCT和ADC研究的配对数据集	尽管所有团队都使用了专门的深度学习工具，但结果显示计算方法在支持异质密度小病变分割方面的局限性	研究如何通过整合ADC中风病变发现到CT中，以增强分析并加速中风患者的管理	急性缺血性中风患者的CT和MRI图像	计算机视觉	中风	深度学习	NA	图像	36名患者
17740	2024-09-08	Skin cancer classification leveraging multi-directional compact convolutional neural network ensembles and gabor wavelets 2024-09-04, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-69954-8 PMID:39232043	研究论文	本文介绍了一种名为SCaLiNG的创新计算机辅助诊断工具，用于皮肤癌分类	SCaLiNG利用多方向紧凑型卷积神经网络集合和Gabor小波，获取包含空间-纹理-频率属性的综合特征向量，并通过特征选择方法进一步提高模型性能	NA	开发一种能够提高皮肤癌分类准确性的计算机辅助诊断工具	皮肤癌及其亚类	计算机视觉	皮肤癌	Gabor小波	卷积神经网络（CNN）	图像	NA