深度学习在生物医药领域的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量	算法框架	模型架构	性能指标	计算资源
161	2025-12-14	Single-nucleus transcriptome atlas of orbitofrontal cortex in ALS with a deep learning-based decoding of alternative polyadenylation mechanisms 2025-Dec-10, Cell genomics IF:11.1Q1 DOI:10.1016/j.xgen.2025.101007 PMID:40967225	研究论文	本研究通过单核转录组测序构建了肌萎缩侧索硬化症（ALS）患者眶额叶皮层的转录组图谱，并利用深度学习模型APA-Net解码了替代性多聚腺苷酸化（APA）机制	首次在ALS/FTLD背景下构建了眶额叶皮层的单核转录组图谱，并开发了多模态深度学习模型APA-Net来预测细胞类型特异性的APA模式	研究样本量相对有限，且主要聚焦于C9orf72相关ALS和散发性ALS，未涵盖所有ALS亚型	揭示ALS和FTLD的细胞类型特异性分子病理机制，特别是替代性多聚腺苷酸化（APA）的调控作用	C9orf72相关ALS（伴或不伴FTLD）和散发性ALS患者的眶额叶皮层组织	数字病理学	肌萎缩侧索硬化症	单核RNA测序	深度学习模型	转录组序列数据, RNA结合蛋白表达谱	未明确指定样本数量，但涉及C9orf72相关ALS和散发性ALS患者的前额叶皮层组织	未明确指定	APA-Net（替代性多聚腺苷酸化网络）	NA	NA
162	2025-12-14	The Application of Deep Learning Human Pose Estimation in Sport: A Systematic Review 2025-Dec-10, Sports medicine - open DOI:10.1186/s40798-025-00953-3 PMID:41369858	综述	本文首次从体育科学视角，系统回顾了基于深度学习的人体姿态估计在体育领域的应用现状、数据集特点、算法方法及面临的挑战	首次从体育科学视角对基于深度学习的人体姿态估计进行系统性评估，并提出了针对未来研究和应用的实际指导建议	大多数研究依赖私有数据集进行算法训练和验证，限制了研究的可重复性和泛化能力；缺乏开放数据集和标准化实践	系统评估基于深度学习的人体姿态估计在体育领域的应用，分析其数据集可用性、方法可重复性及人为因素的影响	体育运动中的人体姿态估计相关研究	计算机视觉	NA	深度学习	深度学习模型	2D和3D视觉数据	371篇相关文章	NA	NA	NA	NA
163	2025-12-14	Transformer-based deep learning enhances discovery in migraine GWAS 2025-Dec-10, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-65991-7 PMID:41372126	研究论文	本研究开发了一种基于Transformer的深度学习模型InsightGWAS，通过整合功能注释并利用来自重度抑郁症GWAS数据的迁移学习，增强了偏头痛的遗传发现	首次将Transformer模型应用于GWAS数据，结合功能注释和跨疾病迁移学习，显著提高了偏头痛相关基因座的发现能力	模型依赖于现有GWAS数据集和功能注释的完整性，可能受限于数据质量和样本代表性	增强偏头痛的遗传发现，揭示新的遗传位点和相关生物学通路	偏头痛患者与对照组的GWAS数据	机器学习	偏头痛	GWAS, 迁移学习	Transformer	基因组关联数据	53,109例病例和230,876例对照	NA	Transformer	验证位点准确性	NA
164	2025-12-14	A hybrid CNN-transformer framework optimized by Grey Wolf Algorithm for accurate sign language recognition 2025-Dec-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-27390-2 PMID:41372241	研究论文	本文提出了一种结合CNN、Transformer和灰狼优化算法的深度学习框架，用于准确高效地识别动态手语手势，特别是在美国手语中	提出了一种新颖的混合CNN-Transformer框架，并利用灰狼优化算法进行超参数调优，以提高模型性能和收敛速度	NA	开发一个高精度、高效率的手语识别系统，以辅助沟通技术	美国手语中的动态手势识别	计算机视觉	NA	深度学习	CNN, Transformer	图像	两个基准数据集：ASL Alphabet和ASL MNIST	NA	CNN-Transformer混合架构	准确率, F1分数, Matthews相关系数, AUC	NA
165	2025-12-14	Deep learning-based artificial intelligence models predict survival in patients with oral cavity squamous cell carcinoma 2025-Dec-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-27428-5 PMID:41372262	研究论文	本研究应用深度学习人工智能模型整合多种临床因素，预测口腔鳞状细胞癌患者的生存期	开发了用于多组分类的深度神经网络，整合了传统TNM分期中未充分代表的个体化临床因素，如生活方式和ASA分类，并通过最小二乘和多任务学习处理类别不平衡问题	研究为回顾性分析，可能存在选择偏倚；样本量相对有限（1,018例），且未在外部验证集中测试模型泛化能力	提高口腔鳞状细胞癌患者生存预测的准确性，实现个体化预后评估和治疗规划	1996年至2020年间手术治疗的1,018名口腔鳞状细胞癌患者	机器学习	口腔癌	深度学习	深度神经网络	临床变量（包括人口统计学、生活方式、病理特征等）	1,018名患者	NA	深度神经网络	AUC, 敏感性, 特异性, 一致性指数	NA
166	2025-12-14	AI learning for pediatric right ventricular assessment: development and validation across multiple centers 2025-Dec-09, NPJ digital medicine IF:12.4Q1 DOI:10.1038/s41746-025-02123-x PMID:41366000	研究论文	本文开发并验证了一种基于视频的深度学习框架，用于自动评估儿科患者的右心室功能	提出了一种跨多中心验证的视频深度学习框架，首次实现了儿科右心室功能的实时自动化评估，并在左心室射血分数预测上超越了先前方法	模型在资源有限环境中的泛化能力仍需进一步验证，且依赖于特定超声心动图视图（A4C和PSAX）	开发自动化工具以准确评估儿科患者的右心室功能，提高诊断一致性并支持早期干预	患有先天性或获得性心脏病的儿科患者，特别是存在右心室功能障碍风险的儿童	计算机视觉	心血管疾病	超声心动图	深度学习	视频	来自3993名儿童的24,984份超声心动图，涵盖北美和亚洲的四个三级中心	NA	U²-Net	Dice系数, AUC	NA
167	2025-12-14	Gradient-based optimization of complex nanoparticle heterostructures enabled by deep learning on heterogeneous graphs 2025-Dec-08, Nature computational science IF:12.0Q1 DOI:10.1038/s43588-025-00917-3 PMID:41361025	研究论文	本文利用深度学习优化核壳结构上转换纳米粒子的非线性光学性质	采用异构图神经网络结合物理驱动的纳米结构表示，并通过梯度优化方法实现了纳米材料的高效逆设计	训练数据依赖于计算成本高昂的动力学蒙特卡洛模拟，可能限制数据集的进一步扩展	优化上转换纳米粒子的非线性光学性能以实现逆设计	核壳结构上转换纳米粒子	机器学习	NA	动力学蒙特卡洛模拟	图神经网络	光谱数据	超过6000个模拟样本	NA	异构图神经网络	预测发射强度	NA
168	2025-12-14	Cerebellar subregional atrophy in relapsing-remitting multiple sclerosis: Stage-dependent dynamics and pharmacological modulation 2025-Dec-07, Brain research bulletin IF:3.5Q2 DOI:10.1016/j.brainresbull.2025.111679 PMID:41365399	研究论文	本研究探讨了复发缓解型多发性硬化症（RRMS）中不同疾病阶段小脑亚区体积变化的特异性模式，并评估了不同疾病修饰疗法（DMTs）对小脑萎缩和临床结局的影响	揭示了RRMS中小脑萎缩的阶段依赖性动态变化，并首次系统评估了不同DMT类别（特别是S1P受体调节剂与非S1P DMTs）对小脑亚区体积的异质性、阶段依赖性调节作用，识别出小脑IX和VIIIb小叶作为连接药物治疗与认知结局的关键区域	样本量相对有限（181名患者和99名健康对照），且研究为横断面设计，无法确定因果关系；DMTs分组基于药理机制，但具体药物种类和剂量可能影响结果；认知评估与体积变化的相关性较弱	研究RRMS中小脑亚区体积的阶段依赖性变化，并评估不同DMTs对小脑萎缩和临床结局的影响	复发缓解型多发性硬化症（RRMS）患者（n=181）和健康对照（n=99）	数字病理学	多发性硬化症	基于深度学习的脑影像分析工具（CerebNet）用于小脑亚区体积量化	深度学习模型	脑部MRI影像	280名参与者（181名RRMS患者和99名健康对照）	NA	CerebNet	统计显著性（p值），体积变化的相关性分析	NA
169	2025-12-14	An investigation of race bias in deep learning-based segmentation of prostate MRI images 2025-Dec-06, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-26189-5 PMID:41353223	研究论文	本研究探讨了基于深度学习的MRI前列腺分割模型中存在的种族偏见问题	首次系统性地研究了MRI前列腺分割深度学习模型中的种族偏见，揭示了训练数据种族不平衡对模型性能的影响	研究仅关注白人和黑人种族群体，未涵盖其他种族；样本量相对有限；仅使用T2加权MRI数据	调查深度学习在前列腺MRI分割中是否存在种族偏见	前列腺MRI图像	数字病理学	前列腺癌	磁共振成像	深度学习模型	医学图像	五个临床T2加权MRI数据集（种族比例不同）加一个公共数据集，测试集包含32名白人和黑人匹配受试者	NA	NA	Dice相似系数	NA
170	2025-12-14	3D FusionNet for synthetic CT based lung cancer segmentation 2025-Dec-03, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-29703-x PMID:41339453	研究论文	本研究提出了一种结合生成对抗网络与三维分割网络的混合框架，用于肺癌CT图像分割	首次将DCGAN与3D-TDUnet++架构结合，并集成非局部特征聚合模块，通过生成合成CT数据解决标注数据不足问题	未明确说明模型在外部验证集上的泛化性能，且合成数据的质量对最终效果的影响未深入分析	开发一种能够在标注数据有限情况下实现高精度肺癌分割的深度学习系统	肺癌CT扫描图像	计算机视觉	肺癌	CT扫描	GAN, CNN	三维医学图像	使用公开的Kaggle胸部CT扫描数据集，并通过DCGAN生成合成图像进行数据增强	未明确说明	DCGAN, 3D-TDUnet++, 非局部特征聚合模块	Dice系数, F1分数, 准确率, 敏感性, 特异性	未明确说明
171	2025-12-14	Epicardial adipose tissue measurement is an interesting biomarker for cardiovascular health in a case control study of patients with familial partial type 2 lipodystrophy 2025-Dec-03, Diabetes & metabolism IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.diabet.2025.101719 PMID:41349713	研究论文	本研究评估了心外膜脂肪组织体积作为2型家族性部分性脂肪营养不良患者心血管健康新标志物的潜力	首次在2型家族性部分性脂肪营养不良患者中证明心外膜脂肪组织体积显著升高，并提议将其作为冠状动脉钙化和临床评分之外的补充生物标志物	研究为回顾性病例对照设计，样本量相对较小（126名受试者），且依赖于半自动化测量技术	评估心外膜脂肪组织体积作为2型家族性部分性脂肪营养不良患者心血管风险新标志物的临床价值	2型家族性部分性脂肪营养不良患者及匹配的对照组患者	数字病理学	心血管疾病	深度学习与人工智能辅助的半自动化测量技术	NA	医学影像数据	126名受试者（包括病例组与对照组）	NA	NA	P值（统计显著性）	NA
172	2025-12-14	Nanocarrier imaging at single-cell resolution across entire mouse bodies with deep learning 2025-Dec, Nature biotechnology IF:33.1Q1 DOI:10.1038/s41587-024-02528-1 PMID:39809933	研究论文	本研究开发了一种名为SCP-Nano的实验与深度学习集成流程，用于在全小鼠体内以单细胞分辨率全面量化纳米载体的靶向分布	首次实现了在全生物体范围内以单细胞分辨率分析纳米载体的生物分布，其检测剂量远低于传统全身成像技术的检测极限	目前研究主要在小鼠模型中进行，尚未在更大动物或人体中验证	开发精确分析纳米载体在生物体内单细胞水平靶向分布的方法，以加速靶向药物递送系统的开发	小鼠模型	数字病理学	NA	单细胞精确纳米载体识别（SCP-Nano）	深度学习	图像	NA	NA	NA	灵敏度	NA
173	2025-12-14	Comparative Analysis of U-Net and U-Net3 + for Retinal Exudate Segmentation: Performance Evaluation Across Regions 2025-Dec, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-025-01419-4 PMID:39904940	研究论文	本研究比较了U-Net和U-Net3+在视网膜渗出物分割中的性能，并评估了它们在不同视网膜区域的检测效果	首次对U-Net和U-Net3+模型在视网膜渗出物分割中进行跨区域（如血管周围与血管外区域、中心凹周围与中心凹外区域以及象限划分）的详细性能比较，并发现U-Net3+在特定区域表现更优	未提及样本量的具体大小或数据集的多样性限制，可能影响模型的泛化能力	评估深度学习模型在视网膜渗出物检测中的性能，以提升糖尿病视网膜病变的诊断准确性和效率	视网膜渗出物（糖尿病视网膜病变的特征性病变）	计算机视觉	糖尿病视网膜病变	深度学习	CNN	图像（眼底图像）	NA	NA	U-Net, U-Net3+	准确率, 灵敏度, 特异性, Dice系数	NA
174	2025-12-14	Preoperatively Predicting PIT1 Expression in Pituitary Adenomas Using Habitat, Intra-tumoral and Peri-tumoral Radiomics Based on MRI 2025-Dec, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-024-01376-4 PMID:39904941	研究论文	本研究旨在利用基于MRI的栖息地、瘤内及瘤周影像组学模型，术前预测垂体腺瘤中PIT1的表达	首次结合栖息地影像组学、瘤内及瘤周影像组学特征，并构建了融合临床特征的深度学习影像组学列线图（DLRN）用于预测PIT1表达	研究为回顾性设计，样本量相对较小（共129例患者），且仅基于单一中心的MRI数据	术前预测垂体腺瘤中垂体转录因子1（PIT1）的表达	垂体腺瘤患者	数字病理	垂体腺瘤	MRI影像组学	逻辑回归, 支持向量机, 多层感知机	MRI图像	129例垂体腺瘤患者（训练集103例，测试集26例）	NA	NA	AUC	NA
175	2025-12-14	Automatic Identification of Fetal Abdominal Planes from Ultrasound Images Based on Deep Learning 2025-Dec, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-025-01409-6 PMID:39909994	研究论文	本研究探索了基于深度学习的AI架构在自动识别胎儿腹部标准扫描平面和结构（特别是腹围）方面的潜力	首次将Xception和MobileNetV3Large等六种深度学习神经网络应用于胎儿腹部超声图像平面分类，并采用十折交叉验证进行评估	数据集分布非正态，且需要进一步研究比较AI模型与传统自动腹围测量方法的整体性能	探索人工智能在自动识别胎儿腹部超声标准扫描平面中的应用，以优化产前超声诊断流程	胎儿腹部超声图像	计算机视觉	NA	超声成像	CNN	图像	NA	Keras-OCR, CV2	Xception, MobileNetV3Large, EfficientV2S	准确率	NA
176	2025-12-14	Automating Prostate Cancer Grading: A Novel Deep Learning Framework for Automatic Prostate Cancer Grade Assessment using Classification and Segmentation 2025-Dec, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-025-01429-2 PMID:39913023	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的三阶段框架，用于自动评估前列腺癌的严重程度	提出了一种结合分类、分割和机器学习分类器的三阶段创新框架，并采用基于Self-ONN的DeepLabV3架构来增强分割性能	需要进一步研究以评估该框架在不同临床场景中的适应性和有效性	开发自动化系统以提高前列腺癌分级的诊断精度并减少人为误差	前列腺癌组织样本	数字病理学	前列腺癌	全切片图像分析	DNN, 机器学习分类器	图像	从初始5160个病例中筛选出2699个可用病例	NA	EfficientNet_b0, DeepLabV3, Self-ONN	F1-score, Dice Similarity Coefficient, 二次加权Kappa	NA
177	2025-12-14	Ischemic Stroke Lesion Core Segmentation from CT Perfusion Scans Using Attention ResUnet Deep Learning 2025-Dec, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-025-01407-8 PMID:39953256	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的创新系统，用于从CT灌注扫描中自动分割缺血性卒中病灶核心	将边缘增强扩散滤波作为预处理步骤（一种硬注意力机制）与改进的Attention ResUnet架构相结合，利用空间和通道注意力机制捕获长程依赖关系	未明确说明模型在更广泛数据集上的泛化能力，或与其他最先进方法的详细比较	开发自动化缺血性卒中病灶分割工具，以提升临床诊断、预后和治疗规划的效率和准确性	缺血性卒中患者的CT灌注扫描图像	计算机视觉	心血管疾病	CT灌注扫描	CNN	医学图像	使用ISLES 2018挑战赛数据集，采用五折交叉验证	未明确指定	Attention ResUnet	Dice相似系数	NA
178	2025-12-14	Impact of Combined Deep Learning Image Reconstruction and Metal Artifact Reduction Algorithm on CT Image Quality in Different Scanning Conditions for Maxillofacial Region with Metal Implants: A Phantom Study 2025-Dec, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-024-01287-4 PMID:39953255	研究论文	本研究探讨了结合深度学习图像重建（DLIR）和金属伪影减少（MAR）算法在不同扫描条件下对含金属植入物的CT图像质量的影响	首次在体模研究中结合DLIR和MAR算法，评估其对颌面部区域金属植入物CT图像质量的综合改善效果	研究基于猪体模，未涉及人体临床数据；样本量较小（四个体模）；仅评估了颌面部区域，可能不适用于其他身体部位	评估DLIR与MAR算法结合在不同扫描条件下对含金属植入物CT图像质量的提升效果	含金属植入物的猪颌面部体模	医学影像	颌面部疾病	CT扫描	深度学习图像重建（DLIR）	CT图像	四个猪颌面部体模，使用不同金属植入物，在三个剂量水平（20/10/5 mGy）下扫描	NA	NA	标准偏差（SD）、信噪比（SNR）、对比噪声比（CNR）、金属伪影指数（MAI）、主观图像质量评分（5点Likert量表）	NA
179	2025-12-14	Hybrid Approach to Classifying Histological Subtypes of Non-small Cell Lung Cancer (NSCLC): Combining Radiomics and Deep Learning Features from CT Images 2025-Dec, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-025-01442-5 PMID:39953259	研究论文	本研究开发了一种结合CT图像放射组学和深度学习特征的混合模型，用于分类非小细胞肺癌的组织学亚型	提出了一种结合放射组学和深度学习特征的混合方法，用于非小细胞肺癌亚型分类，通过特征选择和融合提升了分类性能	样本量相对有限（内部数据集235例，外部验证48例），且仅针对腺癌和鳞状细胞癌两种亚型	开发一种基于CT图像的混合模型，以提高非小细胞肺癌组织学亚型分类的准确性和可靠性	非小细胞肺癌患者的CT图像，包括腺癌和鳞状细胞癌两种亚型	计算机视觉	肺癌	CT成像	深度学习	图像	内部数据集235例（110例腺癌，112例鳞状细胞癌），外部验证数据集48例（各24例）	NA	NA	AUC, 准确率	NA
180	2025-12-14	Dual-Domain Self-Supervised Deep Learning with Graph Convolution for Low-Dose Computed Tomography Reconstruction 2025-Dec, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-024-01314-4 PMID:39966223	研究论文	提出一种用于低剂量CT重建的双域自监督深度学习框架，结合图卷积进行降噪	提出首个同时处理正弦图域和图像域降噪的双域自监督框架，并设计结合图卷积与通道注意力模块的混合架构	未明确说明模型在极端低剂量条件下的性能表现，也未讨论临床部署的计算效率问题	提升低剂量CT图像的信噪比以满足诊断需求	低剂量CT图像	计算机视觉	NA	CT成像	深度学习	医学图像（CT正弦图及重建图像）	两个大规模低剂量CT数据集	NA	图卷积网络, 通道注意力模块	NA	NA