深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1801	2025-04-17	Can Super Resolution via Deep Learning Improve Classification Accuracy in Dental 2025-Apr-15, Dento maxillo facial radiology DOI:10.1093/dmfr/twaf029 PMID:40233244	研究论文	本研究探讨了深度学习驱动的超分辨率技术对牙科图像分类准确性的影响	首次研究了通过超分辨率技术提高分辨率的牙科X光片的分类性能	仅使用了开源牙科图像数据集，可能无法代表所有临床场景	评估超分辨率技术对牙科图像分类性能的影响	牙科X光片	计算机视觉	牙科疾病	深度学习超分辨率技术	深度学习模型（未指定具体类型）	图像	开源牙科图像数据集（具体数量未说明）
1802	2025-04-17	Integrating genetic variation with deep learning provides context for variants impacting transcription factor binding during embryogenesis 2025-Apr-15, Genome research IF:6.2Q1 DOI:10.1101/gr.279652.124 PMID:40234030	研究论文	该研究通过整合遗传变异与深度学习技术，探讨了胚胎发生过程中影响转录因子结合的遗传变异背景	结合高度控制的F杂交系统与深度学习模型Basenji，提高了等位基因特异性结合的检测能力，并重建了功能化结合基序	研究仅关注了四种转录因子在胚胎发生过程中的结合情况，可能无法全面反映所有转录因子的行为	理解遗传变异如何影响转录因子结合，以更好地模拟疾病相关变异	四种转录因子在胚胎发生过程中的等位基因特异性结合	机器学习	NA	WASP扩展用于检测indels，等位基因特异性读段映射	CNN (Basenji)	DNA序列数据	高度控制的F杂交系统产生的遗传多样性样本
1803	2025-04-17	Application of Deep Learning for Detection of Nasal Bone Fracture on X-Ray Nasal Bone Lateral View 2025-Apr-15, Dento maxillo facial radiology DOI:10.1093/dmfr/twaf028 PMID:40234238	研究论文	本研究评估了深度学习在X射线鼻骨侧位片上检测鼻骨骨折的效果	应用多种深度学习模型（如VGG16、Swin Transformer等）进行鼻骨骨折检测，并比较了它们的性能	研究仅基于单一放射中心的回顾性数据，可能存在样本偏差	评估深度学习在鼻骨骨折X射线图像检测中的效能	X射线鼻骨侧位片图像	计算机视觉	鼻骨骨折	高斯滤波、Canny边缘检测、GLCM、HOG、LBP	CNN、VGG16、VGG19、MobileNet、Xception、ResNet50V2、InceptionV3、Swin Transformer	X射线图像	2,968张X射线鼻骨侧位片
1804	2025-04-17	A Novel Ensemble Learning Approach for Grouping the State-of-the-Art YOLOV10 and YOLOV11 Models for Kidney Stone Detection in CT and Ultrasound Images 2025-Apr-15, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-025-01499-2 PMID:40234345	research paper	提出一种新颖的集成学习方法，结合YOLOV10和YOLOV11模型，用于CT和超声图像中的肾结石检测	首次将YOLOV10和YOLOV11模型集成，用于肾结石检测，显著降低假阴性和假阳性错误	未提及具体的数据集规模限制或模型泛化能力的详细测试	提高肾结石在医学图像中的检测准确性和效率	肾结石在CT和超声图像中的检测	computer vision	kidney stone	deep learning, ensemble learning	YOLOV10, YOLOV11	image	NA
1805	2025-04-17	Study on Ultrasound-Assisted Diagnosis of CHB Complicated with NAFLD Hepatic Fibrosis Based on Deep Learning 2025-Apr-15, Journal of imaging informatics in medicine DOI:10.1007/s10278-024-01331-3 PMID:40234347	research paper	本研究旨在开发和评估一种基于深度学习的自动分类模型，用于诊断慢性乙型肝炎（CHB）并发非酒精性脂肪性肝病（NAFLD）的肝纤维化	利用深度学习技术对二维肝脏影像进行自动分类，显著提高了肝纤维化诊断的准确性	研究为回顾性分析，可能存在选择偏倚，且样本量虽大但来自单一中心	开发并评估一种基于深度学习的自动分类模型，用于诊断CHB并发NAFLD的肝纤维化	2803名CHB并发NAFLD患者及150名有肝活检结果的同类患者	digital pathology	liver disease	deep learning	CNN	image	2803名患者（20540张二维肝脏影像）用于训练，150名患者（922张影像）用于验证
1806	2025-04-17	Correction: Deep learning approach for discrimination of liver lesions using nine time-phase images of contrast-enhanced ultrasound 2025-Apr-15, Journal of medical ultrasonics (2001) DOI:10.1007/s10396-025-01544-1 PMID:40234354	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1807	2025-04-17	Depth-of-interaction encoding techniques for pixelated PET detectors enabled by machine learning methods and fast waveform digitization 2025-Apr-14, Physics in medicine and biology IF:3.3Q1 DOI:10.1088/1361-6560/adc96d PMID:40185124	研究论文	本研究开发了一种利用机器学习和快速波形数字化技术，从像素化PET探测器中提取深度交互(DOI)信息的方法	无需修改探测器设计即可实现多级DOI分类，且保持了探测器的时间性能	研究仅针对20mm长晶体进行了验证，未涉及其他尺寸晶体的性能评估	开发一种从商用像素化探测器中获取DOI信息的技术	像素化PET探测器及其DOI信息	医学影像处理	NA	机器学习方法、快速波形数字化技术(DRS4)	LSTM网络、经典机器学习算法	闪烁波形数据	2×2×20mm长窄晶体
1808	2025-04-17	Molecular endotypes and theratypes in osteoarthritis: transforming a concept into reality with deep learning and multiomics 2025-Apr-14, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1 DOI:10.1016/j.ard.2025.03.009 PMID:40234175	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
1809	2025-04-17	Basin-informed flood frequency analysis using deep learning exhibits consistent projected regional patterns over CONUS 2025-Apr-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-97610-2 PMID:40222992	研究论文	利用深度学习进行基于流域的洪水频率分析，展示了美国本土未来洪水趋势的一致区域模式	使用LSTM模型结合气候模型数据预测洪水趋势，揭示了美国本土洪水变化的区域一致性模式	研究仅基于CMIP5气候模型数据，可能未涵盖所有气候不确定性	分析气候变化对未来洪水趋势的影响	美国本土638个河流站点的长期流量	机器学习	NA	LSTM模型，CMIP5气候模型数据	LSTM	气象数据，流量数据	美国本土638个河流站点
1810	2025-04-17	The satisfaction of ecological environment in sports public services by artificial intelligence and big data 2025-Apr-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-97927-y PMID:40222989	研究论文	本研究结合基于残差模块和注意力机制的CNN方法与SERVQUAL评估模型，探讨人工智能和大数据对体育公共服务中居民健身生态环境满意度的影响	结合CNN与SERVQUAL模型分析AI驱动的体育公共服务对健身生态环境满意度的影响	研究主要依赖问卷调查、文献综述和访谈数据，可能受限于样本的代表性和数据的全面性	探讨AI驱动的体育公共服务与健身生态环境满意度之间的关系	体育公共服务中的健身生态环境和居民满意度	机器学习	NA	问卷调查、文献综述、访谈	CNN	问卷数据、文献数据、访谈数据	未明确说明样本数量
1811	2025-04-17	MODAMS: design of a multimodal object-detection based augmentation model for satellite image sets 2025-Apr-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-93766-z PMID:40223115	research paper	提出了一种基于多模态目标检测的卫星图像增强模型，旨在提高分类性能	结合了YOLO目标检测、cdGAN、EHO和FFO等多种技术，实现了动态和图像特定的增强	未提及模型在大规模数据集上的表现或计算资源消耗	提高卫星图像的分类准确性和效率	高光谱卫星图像	computer vision	NA	YOLO, cdGAN, EHO, FFO, Incremental Learning	YOLO, GAN	image	NA
1812	2025-04-17	Impact of hypertension on cerebral small vessel disease: A post-mortem study of microvascular pathology from normal-appearing white matter into white matter hyperintensities 2025-Apr-12, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism IF:4.9Q1 DOI:10.1177/0271678X251333256 PMID:40219923	research paper	该研究探讨了高血压对脑小血管病的影响，通过尸检研究从正常表现白质到白质高信号的微血管病理变化	揭示了内皮功能障碍、血脑屏障破坏和神经血管炎症在高血压患者白质高信号发病机制中的关键作用	未观察到沿着NAWM-WMH过渡的渐进性血脑屏障损伤或神经血管炎症	阐明慢性高血压与最早的白质高信号发病机制之间的关联	高血压与非高血压个体的死后脑组织	digital pathology	cardiovascular disease	MRI, deep learning	deep learning	image	未明确说明样本数量
1813	2025-04-17	Deep learning tools predict variants in disordered regions with lower sensitivity 2025-Apr-12, BMC genomics IF:3.5Q2 DOI:10.1186/s12864-025-11534-9 PMID:40221640	research paper	该研究探讨了深度学习工具在预测无序区域变异时的敏感性较低的问题	揭示了AlphaMissense和VARITY等工具在预测无序区域变异时的敏感性不足，并指出需要开发针对无序区域的新特征和范式	研究主要关注无序区域的变异预测，未涉及其他可能影响预测准确性的因素	评估当前最先进的变异效应预测工具在无序区域的效能	人类蛋白质组中的无序区域及其变异	machine learning	NA	AlphaFold2, Variant Effect Predictor (VEP), AlphaMissense, VARITY	深度学习模型	蛋白质序列和结构数据	涉及人类蛋白质组中30%的无序区域
1814	2025-04-17	Lag-Net: Lag correction for cone-beam CT via a convolutional neural network 2025-Apr-12, Computer methods and programs in biomedicine IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.cmpb.2025.108753 PMID:40233441	研究论文	提出了一种名为Lag-Net的卷积神经网络方法，用于校正锥束CT中的滞后信号，以减少重建图像中的伪影	利用深度学习技术Lag-Net校正滞后信号，避免了传统线性时不变校正方法的不足，并在低曝光条件下表现更优	硬件校正方法操作复杂，对CT仪器要求高	提高锥束CT图像质量，减少滞后伪影	锥束CT中的滞后信号及其伪影	计算机视觉	NA	卷积神经网络	CNN	图像	模拟和真实数据集
1815	2025-04-17	CMTNet: a hybrid CNN-transformer network for UAV-based hyperspectral crop classification in precision agriculture 2025-Apr-11, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-97052-w PMID:40216979	研究论文	提出了一种结合CNN和Transformer的深度学习框架CMTNet，用于无人机获取的高光谱作物分类	CMTNet结合了光谱-空间特征提取模块、双分支架构和多输出约束模块，能同时捕获局部和全局特征，提高分类精度	未提及模型在更广泛作物类型或更复杂环境中的泛化能力	提高无人机高光谱成像在精准农业中作物分类的精度和可靠性	无人机获取的高光谱作物图像	计算机视觉	NA	高光谱成像	CNN-Transformer混合模型	图像	三个无人机获取的数据集（WHU-Hi-LongKou、WHU-Hi-HanChuan和WHU-Hi-HongHu）
1816	2025-04-17	Bearing fault diagnosis based on efficient cross space multiscale CNN transformer parallelism 2025-Apr-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-95895-x PMID:40210923	研究论文	提出了一种基于高效跨空间多尺度CNN Transformer并行性的风力涡轮机轴承故障诊断模型	采用并行分支结构同时提取时空特征，结合多尺度特征提取模块和高效多尺度注意力机制，提升了局部和全局特征提取能力	未提及模型在极端噪声环境下的表现	提高风力涡轮机轴承故障诊断的准确性和噪声鲁棒性	风力涡轮机轴承	机器学习	NA	Continuous Wavelet Transform (CWT)	CNN, Transformer, BiGRU	一维振动信号转换的二维时频图像	两个公开的轴承数据集
1817	2025-04-17	pC-SAC: A method for high-resolution 3D genome reconstruction from low-resolution Hi-C data 2025-Apr-10, Nucleic acids research IF:16.6Q1 DOI:10.1093/nar/gkaf289 PMID:40226920	研究论文	提出了一种名为pC-SAC的计算方法，用于从低分辨率Hi-C数据中重建高分辨率3D基因组	pC-SAC采用自适应重要性采样与顺序蒙特卡洛方法，生成满足低分辨率Hi-C数据物理约束的3D染色质链集合，实现了超过95%的高分辨率染色质图谱重建准确率	未提及具体样本量或实验验证的局限性	提高Hi-C数据的分辨率，以更深入地了解3D基因组组织及其在基因调控和疾病中的作用	3D基因组组织	计算生物学	NA	Hi-C技术	probabilistically Constrained Self-Avoiding Chromatin (pC-SAC)	Hi-C数据	NA
1818	2025-04-17	Physically grounded deep learning-enabled gold nanoparticle localization and quantification in photonic resonator absorption microscopy for digital resolution molecular diagnostics 2025-Apr-09, Biosensors & bioelectronics IF:10.7Q1 DOI:10.1016/j.bios.2025.117455 PMID:40233489	研究论文	本文介绍了一种名为LOCA-PRAM的深度学习方法，结合光子谐振吸收显微镜（PRAM），利用金纳米颗粒（AuNPs）作为分子标签，实现生物分子的数字分辨率检测	LOCA-PRAM利用光子晶体（PC）-AuNP共振耦合增强信号对比度，无需将样品分割成液滴或进行酶扩增，即可实现目标分子的精确量化	NA	实现分子生物标志物的数字分辨率检测，用于疾病诊断、治疗研究和生物医学研究	金纳米颗粒（AuNPs）作为分子标签	数字病理学	NA	光子谐振吸收显微镜（PRAM）、扫描电子显微镜（SEM）	深度学习	图像	NA
1819	2025-04-17	From prediction to design: Revealing the mechanisms of umami peptides using interpretable deep learning, quantum chemical simulations, and module substitution 2025-Apr-09, Food chemistry IF:8.5Q1 DOI:10.1016/j.foodchem.2025.144301 PMID:40233511	研究论文	本研究利用深度学习模型和模块替换策略筛选和设计鲜味肽	结合预训练、增强特征和对比学习模块的预测模型准确率达到0.94，优于其他模型2-9%，并通过模块替换策略揭示了鲜味肽的作用机制	NA	快速筛选和设计鲜味肽	鲜味肽	自然语言处理	NA	深度学习、量子化学模拟、分子对接	深度学习模型	NA	NA
1820	2025-04-17	Tumor Bud Classification in Colorectal Cancer Using Attention-Based Deep Multiple Instance Learning and Domain-Specific Foundation Models 2025-Apr-07, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17071245 PMID:40227783	研究论文	本文提出了一种基于深度学习和注意力机制的多实例学习方法，用于自动分类结直肠癌中的肿瘤芽	采用注意力机制的多实例学习和领域特定基础模型，提高了肿瘤芽分类的准确性和可解释性	样本量相对较小，训练集仅包含29张WSIs，测试集70张WSIs	提高结直肠癌中肿瘤芽的自动分类准确性，以改善预后评估	结直肠癌中的肿瘤芽	数字病理学	结直肠癌	深度学习，注意力机制的多实例学习（ABMIL）	Phikon-v2, UNI, CtransPath	全切片图像（WSIs）	训练集29张WSIs，测试集70张WSIs