深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
18241	2024-08-31	Retinopathy grading with deep learning and wavelet hyper-analytic activations 2022-Apr-25, The Visual computer DOI:10.1007/s00371-022-02489-z PMID:35493724	研究论文	本文通过结合多分辨率分析（MRA）和卷积神经网络（CNN）框架，利用超分析小波激活函数增强输入图像的特征，提高了糖尿病视网膜病变（DR）分级的准确性	提出了一种新颖的超分析小波激活函数，该函数能够转换负系数以保留重要的边缘特征图，并通过选择合适的激活函数超参数，产生单调且有效的激活	NA	提高糖尿病视网膜病变分级的准确性	糖尿病视网膜病变（DR）的图像分级	计算机视觉	糖尿病视网膜病变	卷积神经网络（CNN）	CNN	图像	未明确提及具体样本数量
18242	2024-08-31	Fully Automated Wound Tissue Segmentation Using Deep Learning on Mobile Devices: Cohort Study 2022-04-22, JMIR mHealth and uHealth IF:5.4Q1 DOI:10.2196/36977 PMID:35451982	研究论文	本研究利用深度学习技术在移动设备上实现全自动伤口组织分割，以减少临床评估中的主观性。	开发了两种深度卷积神经网络架构用于伤口和组织分割，并在大量多样化的图像数据集上进行训练，模型在多种成像条件下表现稳健，且对肤色无偏见。	研究中报告了临床医生在识别组织类型时的中等到较差的一致性，以及在识别上皮化时的非常低的Krippendorff α值。	旨在测量伤口护理临床医生在手动组织分割和量化中的相互和内部评分者变异性，并确定是否可以使用深度神经网络实现对组织类型的客观评估。	研究对象包括58张不同类型的慢性伤口图像，以及4种不同的伤口床组织类型（上皮、肉芽、腐肉和焦痂）。	计算机视觉	NA	深度学习	深度卷积神经网络	图像	465,187和17,000对图像标签用于训练模型，58张伤口图像用于评估。
18243	2024-08-31	Research and Application of Artificial Intelligence Based on Electronic Health Records of Patients With Cancer: Systematic Review 2022-Apr-20, JMIR medical informatics IF:3.1Q2 DOI:10.2196/33799 PMID:35442195	综述	本文系统回顾了基于电子健康记录的人工智能在癌症患者护理中的应用现状和局限性	首次系统分析了基于电子健康记录的人工智能在癌症护理中的应用及其意义	现有研究主要使用英文电子病历数据，且数据来源多为私人机构数据库	旨在介绍基于电子健康记录的人工智能在癌症患者护理中的当前状态、局限性及其对癌症护理的影响	癌症患者的电子健康记录及其在癌症护理中的应用	机器学习	癌症	NA	集成方法和深度学习	文本	148篇符合条件的论文
18244	2024-08-31	Yuel: Improving the Generalizability of Structure-Free Compound-Protein Interaction Prediction 2022-02-14, Journal of chemical information and modeling IF:5.6Q1 DOI:10.1021/acs.jcim.1c01531 PMID:35103472	研究论文	本文开发了一种新的化合物-蛋白质相互作用预测器Yuel，旨在提高结构自由的化合物-蛋白质相互作用预测的泛化能力	Yuel在各种数据集上表现出比现有深度学习方法更好的未知化合物和未知蛋白质间相互作用的预测能力	现有深度学习方法在预测未知蛋白质和未知小分子间的相互作用时存在泛化能力不足的问题	提高化合物-蛋白质相互作用预测的泛化能力	化合物和蛋白质的相互作用	机器学习	NA	深度学习	NA	数据集	NA
18245	2024-08-31	Simultaneous prediction of antibody backbone and side-chain conformations with deep learning 2022, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0258173 PMID:35704640	研究论文	本文介绍了一种名为DeepSCAb的深度学习方法，用于同时预测抗体骨架和侧链构象	DeepSCAb方法能够预测抗体变异片段的残基间几何结构以及侧链二面角，且仅需要序列作为输入，适用于无已知骨架构象的抗体	NA	提高抗体结构预测的准确性，特别是在侧链建模方面	抗体骨架和侧链构象	机器学习	NA	深度学习	自注意力层	序列	NA
18246	2024-08-31	Deep learning empowered COVID-19 diagnosis using chest CT scan images for collaborative edge-cloud computing platform 2022, Multimedia tools and applications IF:3.0Q2 DOI:10.1007/s11042-021-11158-7 PMID:34220289	研究论文	本文开发了一种基于MobileNet V2架构的微调深度学习模型，用于在边缘云协同计算平台上进行COVID-19的胸部CT扫描图像诊断	提出的模型在准确性和诊断时间上优于现有的深度学习模型，且适用于资源受限环境	NA	提高COVID-19诊断的效率和可及性	COVID-19的胸部CT扫描图像	计算机视觉	COVID-19	深度学习	MobileNet V2	图像	2482张胸部CT扫描图像
18247	2024-08-31	A Tensorized Multitask Deep Learning Network for Progression Prediction of Alzheimer's Disease 2022, Frontiers in aging neuroscience IF:4.1Q2 DOI:10.3389/fnagi.2022.810873 PMID:35601611	研究论文	本研究提出了一种基于模态融合、核化和张量化的深度神经网络，用于阿尔茨海默病（AD）的进展预测，同时进行多类分类和纵向回归	该研究通过统一的多任务框架，同时进行多类分类和纵向回归，利用多模态特征的互补性，提高了模型的整体效能	研究发现，优化预测结果的超参数集可能与优化多类分类的超参数集不同，存在一个临界点，超过该点进一步提高一个过程的结果可能导致另一个过程的准确性下降	旨在提高早期诊断的前景和预测未来疾病状态的能力	阿尔茨海默病（AD）的进展预测	机器学习	阿尔茨海默病	深度神经网络	CNN	多模态数据	未明确提及具体样本数量
18248	2024-08-31	Potential drug discovery for COVID-19 treatment targeting Cathepsin L using a deep learning-based strategy 2022, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2 DOI:10.1016/j.csbj.2022.05.023 PMID:35602976	研究论文	本研究利用基于深度学习的策略，通过Chemprop模型识别能够抑制Cathepsin L活性的小分子和FDA批准的药物，以发现治疗COVID-19的新药物	首次应用Chemprop模型预测酶抑制剂，并发现daptomycin这一FDA批准的抗生素具有显著的Cathepsin L抑制作用	NA	发现和开发针对Cathepsin L的新型抑制剂，用于COVID-19的治疗	Cathepsin L、SARS-CoV-2病毒、FDA批准的药物	机器学习	COVID-19	深度学习	深度神经网络	分子数据	5种小分子和多种FDA批准的药物
18249	2024-08-31	Application of Convolutional Neural Network-Based Detection Methods in Fresh Fruit Production: A Comprehensive Review 2022, Frontiers in plant science IF:4.1Q1 DOI:10.3389/fpls.2022.868745 PMID:35651761	综述	本文全面回顾了卷积神经网络（CNN）在新鲜水果生产中的应用	首次全面回顾了CNN在新鲜水果生产全过程中的应用	NA	探讨CNN在新鲜水果生产各环节中的应用及效果	新鲜水果生产的各个环节，包括花果检测、果实检测、采摘和分级	计算机视觉	NA	卷积神经网络（CNN）	CNN	图像	大量文章
18250	2024-08-31	Design of Machine Learning Algorithm for Tourism Demand Prediction 2022, Computational and mathematical methods in medicine DOI:10.1155/2022/6352381 PMID:35720035	研究论文	本文构建了一个基于机器学习的旅游需求预测模型，通过引入LSTM自动编码器的深度堆叠方法，提高了深度学习模型的性能，并进行了四年的旅游人数预测实验。	提出了基于LSTM的自动编码器深度堆叠方法，采用分层贪婪预训练方法替代深度网络中的随机权重初始化方法，结合预训练阶段和微调网络，形成SAE-LSTM预测模型。	NA	提高旅游需求预测的准确性，帮助政府做出关于基础设施发展和住宿地点规划的明智决策。	旅游需求预测	机器学习	NA	LSTM	SAE-LSTM	数据集	使用城市A的月度搜索引擎强度数据及其相关影响因素作为数据集，进行了四年的旅游人数预测。
18251	2024-08-31	Unsupervised Black-Box Model Domain Adaptation for Brain Tumor Segmentation 2022, Frontiers in neuroscience IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fnins.2022.837646 PMID:35720708	研究论文	本文提出了一种无监督领域自适应框架，用于脑肿瘤分割，该框架使用仅在源域训练的黑盒分割模型，无需依赖源数据或可访问网络参数的白盒源模型	提出了一种知识蒸馏方案，以逐步学习目标特定表示，并通过无监督熵最小化来规范目标域标签的置信度	未提及具体的局限性	解决跨中心合作中因隐私问题导致的数据和标签共享困难，实现无监督领域自适应	脑肿瘤分割	计算机视觉	脑肿瘤	无监督领域自适应 (UDA)	黑盒模型	图像	未提及具体样本数量
18252	2024-08-31	O-Net: A Novel Framework With Deep Fusion of CNN and Transformer for Simultaneous Segmentation and Classification 2022, Frontiers in neuroscience IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fnins.2022.876065 PMID:35720715	研究论文	本文提出了一种名为O-Net的新型网络框架，结合CNN和Transformer的优势，用于医学图像的分割和分类	O-Net框架融合了CNN和Transformer，能够同时学习全局和局部信息，提高医学图像分割和分类的性能	NA	改进医学图像分割和分类的准确性	医学图像的分割和分类	计算机视觉	NA	CNN, Transformer	O-Net	图像	使用了synapse多器官CT数据集和ISIC 2017挑战数据集
18253	2024-08-31	A Complete Process of Text Classification System Using State-of-the-Art NLP Models 2022, Computational intelligence and neuroscience DOI:10.1155/2022/1883698 PMID:35720939	研究论文	本文总结了用于文本分类的多种机器学习和深度学习算法，并讨论了它们的优缺点	本文汇总了最新的学习模型用于解决各种自然语言处理问题，并提供了对文本分类过程中所需的各种子任务和文献的深入理解	未明确提及具体的技术限制	旨在帮助读者理解文本分类过程中的各种子任务和文献，并探索文本分类领域的进一步改进或提出新的技术	文本分类算法及其在不同领域的应用	自然语言处理	NA	机器学习和深度学习模型	监督学习、半监督学习和无监督学习模型	文本	未明确提及具体样本数量
18254	2024-08-31	Multiclass Cancer Prediction Based on Copy Number Variation Using Deep Learning 2022, Computational intelligence and neuroscience DOI:10.1155/2022/4742986 PMID:35720914	研究论文	本文通过开发三种端到端的深度学习模型（DNN、CNN和RNN），利用24,174个基因的CNV数据对六种癌症类型进行分类	首次尝试使用端到端深度学习模型进行多类别癌症预测，避免了传统机器学习中手工特征提取和选择的步骤	目前仅针对六种癌症类型进行研究，未来计划扩展到其他类型的癌症	探索不同人类癌症之间的差异，并比较不同深度学习架构在CNV数据上的表现	六种癌症类型	机器学习	NA	深度学习	DNN, CNN, RNN	CNV数据	24,174个基因
18255	2024-08-31	Chest L-Transformer: Local Features With Position Attention for Weakly Supervised Chest Radiograph Segmentation and Classification 2022, Frontiers in medicine IF:3.1Q1 DOI:10.3389/fmed.2022.923456 PMID:35721071	研究论文	本文提出了一种名为Chest L-Transformer的弱监督模型，用于胸部X光片的分割和分类，该模型利用局部特征和位置注意力机制来处理胸部X光片的全球对称性和病灶与其位置的依赖关系	Chest L-Transformer通过分类基于局部特征的图像来避免由全局对称性引起的误分类，并结合Transformer注意力机制来模拟病灶与其位置之间的依赖关系，重点关注疾病易发区域	NA	解决胸部X光片弱监督分割的问题	胸部X光片的分割和分类	计算机视觉	NA	Transformer注意力机制	Chest L-Transformer	图像	NA
18256	2024-08-31	Quantum readout and gradient deep learning model for secure and sustainable data access in IWSN 2022, PeerJ. Computer science DOI:10.7717/peerj-cs.983 PMID:35721415	研究论文	本文提出了一种新的量子读出梯度安全深度学习（QR-GSDL）模型，以确保只有可信传感器能够访问工业无线传感器网络（IWSN）数据	引入量子读出和哈希函数进行注册，采用梯度安全深度学习方法进行认证和授权，提高了能源效率和数据访问的安全性	NA	旨在创建安全、能源高效的IWSN，实现绿色可持续性并减少工业对环境的影响	工业无线传感器网络（IWSN）中的数据访问安全性和能源效率	机器学习	NA	量子读出，哈希函数，梯度安全深度学习	深度学习模型	NA	NA
18257	2024-08-31	Intelligent wearable allows out-of-the-lab tracking of developing motor abilities in infants 2022, Communications medicine IF:5.4Q1 DOI:10.1038/s43856-022-00131-6 PMID:35721830	研究论文	本文构建并验证了一种通用的、可扩展且有效的方法，用于测量婴儿从仰卧到流畅行走的所有运动里程碑的自发运动能力	开发了一种多传感器婴儿穿戴设备，并使用深度学习分类器来模仿人类对姿势和运动的视觉分类，提供了一种新的神经发育测量指标Baba Infant Motor Score (BIMS)	NA	探索使用智能穿戴设备在医院外评估婴儿运动能力的可能性	59名5至19个月大的婴儿的自发运动行为	NA	NA	深度学习	深度学习分类器	运动数据	59名婴儿
18258	2024-08-31	SparNet: A Convolutional Neural Network for EEG Space-Frequency Feature Learning and Depression Discrimination 2022, Frontiers in neuroinformatics IF:2.5Q3 DOI:10.3389/fninf.2022.914823 PMID:35722169	研究论文	本文提出了一种名为SparNet的卷积神经网络，用于学习EEG的空间-频率特征并区分抑郁症与正常对照	SparNet模型结合了五个并行的卷积滤波器和SENet，专门设计用于学习不同脑区的空间和频率域特征	NA	提高抑郁症识别的分类准确性	抑郁症与正常对照的区分	机器学习	抑郁症	卷积神经网络	CNN	EEG信号	NA
18259	2024-08-31	Deep Learning in Neuroimaging: Overcoming Challenges With Emerging Approaches 2022, Frontiers in psychiatry IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fpsyt.2022.912600 PMID:35722548	研究论文	本文介绍了三种新兴的深度学习方法，旨在克服神经影像学中的挑战，加速其在精神病学研究中的应用	提出了两种减少训练数据需求的方法：深度学习者跨数据源的知识迁移能力和自监督学习技术，以及可解释人工智能工具，以揭示深度学习决策的特征组合	NA	探索深度学习在精神病学中的应用，特别是利用多维数据集如fMRI数据预测临床结果	深度学习方法在神经影像学中的应用	机器学习	精神疾病	深度学习	DL	fMRI数据	NA
18260	2024-08-31	Accuracy of two deep learning-based reconstruction methods compared with an adaptive statistical iterative reconstruction method for solid and ground-glass nodule volumetry on low-dose and ultra-low-dose chest computed tomography: A phantom study 2022, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0270122 PMID:35737734	研究论文	本研究评估了两种基于深度学习的重建方法与自适应统计迭代重建方法在低剂量和高剂量胸部CT上对实性和磨玻璃结节体积测量的准确性。	首次评估了基于深度学习的算法在低剂量和高剂量胸部CT上对实性和磨玻璃结节体积测量的准确性。	研究仅限于使用模拟器进行的实验，未涉及临床患者数据。	研究旨在比较两种基于深度学习的图像重建算法与迭代重建方法在低剂量和高剂量设置下对实性和磨玻璃结节体积测量的准确性。	实性和磨玻璃结节在低剂量和高剂量胸部CT上的体积测量。	计算机视觉	肺部疾病	CT扫描	深度学习算法	图像	不同直径的实性和磨玻璃结节放置在模拟器中，进行了四种辐射剂量的CT扫描。