深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
1881	2025-05-06	Deep learning-based EEG source imaging is robust under varying electrode configurations 2025-Apr-16, Clinical neurophysiology : official journal of the International Federation of Clinical Neurophysiology IF:3.7Q2 DOI:10.1016/j.clinph.2025.04.009 PMID:40318257	research paper	该研究探讨了基于深度学习的EEG源成像方法在不同电极配置下的稳健性能	提出了一种新的深度学习源成像框架DeepSIF，能够在低密度EEG下实现准确的源定位和范围估计	研究主要基于计算机模拟和27名耐药性癫痫患者的临床数据，样本量相对较小	评估不同电极数量对深度学习EEG源成像性能的影响	EEG源成像方法和不同电极配置下的性能比较	machine learning	epilepsy	EEG source imaging	DeepSIF	EEG信号	27名耐药性癫痫患者
1882	2025-05-06	A CT-based deep learning-driven tool for automatic liver tumor detection and delineation in patients with cancer 2025-Apr-15, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102032 PMID:40118052	研究论文	介绍了一种基于CT扫描的深度学习工具SALSA，用于自动检测和描绘癌症患者的肝脏肿瘤	SALSA工具在肿瘤识别和体积量化方面表现出色，优于现有最先进模型和放射科专家之间的一致性	未提及具体局限性	开发一种自动化工具，用于癌症患者的肝脏肿瘤检测和描绘，以改善诊断、预后和治疗评估	肝脏肿瘤（原发性和转移性）	数字病理学	癌症	CT扫描	深度学习	图像	1,598例CT扫描和4,908个肝脏肿瘤
1883	2025-05-06	Deep Learning Approach Readily Differentiates Papilledema, Non-Arteritic Anterior Ischemic Optic Neuropathy, and Healthy Eyes 2025-Apr-11, American journal of ophthalmology IF:4.1Q1 DOI:10.1016/j.ajo.2025.04.006 PMID:40220884	research paper	使用深度学习模型通过眼底照片区分视乳头水肿、非动脉炎性前部缺血性视神经病变和健康眼睛	开发了一个基于ResNet-50的深度学习模型，能够高准确度地区分IIH、NAION和健康眼睛的眼底照片	外部验证集的样本量相对较小，可能影响模型的泛化能力	开发一种能够准确区分视乳头水肿、非动脉炎性前部缺血性视神经病变和健康眼睛的深度学习诊断工具	眼底照片	digital pathology	ophthalmic conditions	深度学习	ResNet-50	image	训练和验证集包含15 088张眼底照片（5866只眼睛），外部验证集包含1126张照片（928只眼睛）
1884	2025-05-06	Quantifying axonal features of human superficial white matter from three-dimensional multibeam serial electron microscopy data assisted by deep learning 2025-Apr-11, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2025.121212 PMID:40222502	research paper	该研究利用深度学习辅助的三维多束串行电子显微镜数据，量化了人类浅表白质的轴突特征	首次在纳米级分辨率下对人类浅表白质中的短程联合纤维进行详细的形态学表征，并提供了大型3D人类电子显微镜数据集	研究仅针对浅表白质区域，未涉及其他脑区	探索人类大脑皮层-皮层连接的轴突特征	人类浅表白质中的短程联合纤维	digital pathology	NA	multi-beam scanning electron microscopy (EM)	CNN	3D electron microscopy images	一个200×200×112μm的人类浅表白质体积样本，共分割了128,285个有髓鞘轴突
1885	2025-05-06	AI analysis of medical images at scale as a health disparities probe: a feasibility demonstration using chest radiographs 2025-Apr-08, ArXiv PMID:40297238	研究论文	本文探讨了利用医学影像数据作为健康差异研究新数据源的可行性	开发了一种从医学影像中自动提取定量指标并用于计算健康差异指数的流程	研究仅基于1,571例患者的胸部X光片，样本量有限	探索医学影像数据在健康差异研究中的应用潜力	1,571例患者的胸部X光片	数字病理学	NA	深度学习	深度学习模型	医学影像	1,571例患者
1886	2025-05-06	Manifold Topological Deep Learning for Biomedical Data 2025-Apr-07, Research square DOI:10.21203/rs.3.rs-6149503/v1 PMID:40297704	研究论文	本文首次提出流形拓扑深度学习（MTDL），将代数拓扑与深度神经网络结合，用于处理可微分流形上的数据，包括图像	首次将拓扑深度学习扩展到可微分流形数据，利用Hodge理论分解向量场并构建CNN输入	未明确提及具体局限性	开发适用于可微分流形数据的拓扑深度学习方法	可微分流形上的数据（包括图像）	机器学习	NA	Hodge理论	CNN	图像	717,287张生物医学图像（来自11个2D和6个3D数据集）
1887	2025-05-06	Fine extraction of multi-crop planting area based on deep learning with Sentinel- 2 time-series data 2025-Apr, Environmental science and pollution research international DOI:10.1007/s11356-025-36405-4 PMID:40257731	研究论文	基于深度学习和Sentinel-2时间序列数据，提出了一种高效的多作物种植面积精细提取方法	设计了基于CNN-LSTM和Bi-LSTM的深度学习模型，结合月度合成的NDVI时间序列数据，实现了高精度的多作物分类	研究仅针对山东省的西北、西南和东部地区，可能在其他地区的适用性有待验证	为多作物分类提供一种基于高分辨率遥感时间序列数据的有效模型	山东省西北、西南和东部地区的多作物种植面积	计算机视觉	NA	NDVI时间序列分析	CNN-LSTM, Bi-LSTM	遥感时间序列数据	山东省西北、西南和东部地区的多作物种植面积数据
1888	2025-05-06	Unsupervised Range-Nullspace Learning Prior for Multispectral Images Reconstruction 2025, IEEE transactions on image processing : a publication of the IEEE Signal Processing Society IF:10.8Q1 DOI:10.1109/TIP.2025.3560430 PMID:40249693	研究论文	提出了一种新型的无监督范围-零空间学习先验方法（UnNull），用于多光谱图像重建	通过子空间分解显式建模数据，提高了可解释性和泛化能力，将光谱图像分解为范围和零子空间	未提及具体计算效率或实际应用场景的限制	解决快照光谱成像（SSI）中光谱图像重建的逆问题	多光谱图像	计算机视觉	NA	快照光谱成像（SSI）	UnNull（无监督范围-零空间学习）	多光谱图像数据	NA
1889	2025-05-06	Traffic accident risk prediction based on deep learning and spatiotemporal features of vehicle trajectories 2025, PloS one IF:2.9Q1 DOI:10.1371/journal.pone.0320656 PMID:40315419	research paper	提出一种结合CNN、LSTM和GNN的深度学习模型，用于基于车辆时空轨迹数据的交通事故风险预测	创新性地提出了一种综合考虑时空特征和道路网络关系的组合模型，显著提高了预测精度	NA	提高复杂交通环境下交通事故风险的预测准确性	车辆时空轨迹数据	machine learning	NA	深度学习	CNN, LSTM, GNN	时空轨迹数据	NA
1890	2025-05-06	DEEP LEARNING FOR AUTOMATED DETECTION OF BREAST CANCER IN DEEP ULTRAVIOLET FLUORESCENCE IMAGES WITH DIFFUSION PROBABILISTIC MODEL 2024-May, Proceedings. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging DOI:10.1109/ISBI56570.2024.10635349 PMID:40313564	研究论文	本文提出了一种利用扩散概率模型（DPM）增强深度紫外荧光（DUV）图像数据集的方法，以提高乳腺癌分类的准确性	首次将扩散概率模型（DPM）应用于深度紫外荧光（DUV）图像数据增强，显著提高了乳腺癌检测的准确率	研究依赖于有限的数据集，可能影响模型的泛化能力	提高乳腺癌在深度紫外荧光图像中的自动检测性能	深度紫外荧光（DUV）图像	计算机视觉	乳腺癌	扩散概率模型（DPM）	ResNet, XGBoost	图像	未明确提及具体样本数量
1891	2025-05-04	Attentive Recurrent Network for Low-Latency Active Noise Control 2022-Sep, Interspeech DOI:10.21437/interspeech.2022-811 PMID:40313355	研究论文	本文提出了一种基于注意力循环网络的低延迟主动噪声控制方法	采用时间域方法和注意力循环网络，结合延迟补偿训练策略和修订的重叠相加方法，实现了低延迟甚至负延迟的主动噪声控制	NA	解决主动噪声控制(ANC)系统中的处理延迟问题	主动噪声控制系统	机器学习	NA	深度学习框架	注意力循环网络	音频信号	NA
1892	2025-05-04	Metal Suppression Magnetic Resonance Imaging Techniques in Orthopaedic and Spine Surgery 2025-May-15, The Journal of the American Academy of Orthopaedic Surgeons IF:2.6Q1 DOI:10.5435/JAAOS-D-24-01057 PMID:40063737	review	本文综述了骨科和脊柱手术中金属抑制磁共振成像技术的应用和发展	探讨了最新的金属伪影抑制成像技术及未来方向，如深度学习和人工智能	未提及具体实验数据或样本量的支持	评估骨科和脊柱手术后金属植入物周围软组织的病理情况	骨科和脊柱手术中的金属植入物及其周围软组织	医学影像	骨科和脊柱疾病	磁共振成像（MRI）	NA	医学影像	NA
1893	2025-05-04	Automated Quantification of Cerebral Microbleeds in SWI: Association with Vascular Risk Factors, White Matter Hyperintensity Burden, and Cognitive Function 2025-May-02, AJNR. American journal of neuroradiology DOI:10.3174/ajnr.A8552 PMID:39443150	研究论文	本研究开发了一种基于深度学习的脑微出血自动量化模型，并探讨了脑微出血与血管风险因素、白质高信号负荷及认知功能之间的关联	使用nnU-Net框架开发了首个用于SWI序列的脑微出血自动分割模型，并首次在多中心数据集中验证了其性能	外部验证数据集的模型性能相对较低(Dice评分=0.46)，且样本量有限(n=68)	建立脑微出血自动量化方法并研究其与认知功能障碍的关系	脑微出血(CMB)患者	数字病理学	脑血管疾病	SWI(磁敏感加权成像)	nnU-Net	医学影像(MRI)	训练集287例，内部验证集67例，外部验证集68例，临床数据集448例
1894	2025-05-04	Deep Learning-Based Algorithm for Automatic Quantification of Nigrosome-1 and Parkinsonism Classification Using Susceptibility Map-Weighted MRI 2025-May-02, AJNR. American journal of neuroradiology DOI:10.3174/ajnr.A8585 PMID:39547802	research paper	该研究开发并验证了一种基于深度学习的自动量化黑质高信号和神经退行性帕金森病分类算法	首次探索了使用深度学习和SMwI技术同时检测和量化nigrosome-1异常的诊断性能	需要在不同的临床环境中进一步验证研究结果	开发并验证一种用于神经退行性帕金森病诊断的深度学习模型	450名参与者（210名特发性帕金森病患者和240名对照组个体）用于训练数据，237名参与者（168名IPD患者、58名原发性震颤患者和11名药物诱导的帕金森病患者）用于验证数据	digital pathology	Parkinson disease	susceptibility map-weighted imaging (SMwI)	deep learning-based automatic quantification (Heuron NI) and classification (Heuron IPD) models	MRI	687 participants (450 for training and 237 for validation)
1895	2025-05-04	Empowering Data Sharing in Neuroscience: A Deep Learning Deidentification Method for Pediatric Brain MRIs 2025-May-02, AJNR. American journal of neuroradiology DOI:10.3174/ajnr.A8581 PMID:39532533	research paper	开发一种基于深度学习的自动去识别工具，用于儿科脑部MRI数据的面部区域去除	针对儿科病例和多种MRI序列定制开发的去识别工具，解决了现有工具在儿科病例和多样化图像类型上的不足	耳朵区域的去除准确率较低（73%）	解决儿科神经影像数据共享中的隐私问题，促进神经科学研究	儿科脑部MRI图像	digital pathology	brain tumor	MRI	nnU-Net	image	208名脑肿瘤患者和36名临床对照患者，共976张图像
1896	2025-05-04	Enhancing privacy in biosecurity with watermarked protein design 2025-May-02, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btaf141 PMID:40315154	研究论文	提出了一种在蛋白质序列中添加水印的通用框架，以增强生物安全性和数据隐私	相比现有监管程序，该框架不仅确保生物安全的可追溯性，还通过本地验证保护设计序列的隐私，并显著提高了水印检测效率	未提及具体性能指标或与其他方法的详细对比	解决基于深度学习的蛋白质设计中的生物安全和数据隐私问题	由自回归深度学习模型设计的蛋白质序列	生物信息学	NA	蛋白质水印技术	自回归深度学习模型	蛋白质序列	NA
1897	2025-05-04	Cangrelor and AVN-944 as repurposable candidate drugs for hMPV: analysis entailed by AI-driven in silico approach 2025-May-02, Molecular diversity IF:3.9Q2 DOI:10.1007/s11030-025-11206-6 PMID:40316857	研究论文	通过AI驱动的计算机模拟方法，筛选出Cangrelor和AVN-944作为hMPV的可再利用候选药物	利用深度学习构建药效团模型筛选FDA批准药物和抗病毒药物，并通过分子对接和分子动力学模拟验证药物与hMPV F蛋白的结合稳定性	需要进一步的体外和体内实验验证候选药物的疗效	寻找针对人类偏肺病毒(hMPV)的可再利用药物	人类偏肺病毒(hMPV)的F蛋白	生物信息学	呼吸道感染	深度学习、分子对接、分子动力学模拟	深度学习模型	分子结构数据	2400种FDA批准药物和255种抗病毒药物
1898	2025-05-04	On-Device Deep Learning: Survey on Techniques Improving Energy Efficiency of DNNs 2025-May, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2024.3430028 PMID:39046860	综述	本文综述了提高深度神经网络（DNNs）能源效率的流行技术	提出了方法的分类，并讨论了不同类别的比较，同时概述了能源测量技术	研究中发现的局限性以及一些有趣的方向，如神经形态和储备池计算（RC）	提高神经网络的能源效率，特别是在训练和推理阶段	深度神经网络（DNNs）	机器学习	NA	NA	DNNs	NA	NA
1899	2025-05-04	Role Exchange-Based Self-Training Semi-Supervision Framework for Complex Medical Image Segmentation 2025-May, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2024.3432877 PMID:39093682	research paper	提出了一种基于角色交换的自训练半监督框架，用于复杂医学图像分割	创新性地提出了双向自训练范式，通过模型级可靠性估计动态交换教师和学生的角色，并引入非对称监督策略和分层双学生结构以防止网络崩溃	未明确提及具体的数据集规模限制或计算资源需求	解决复杂医学图像分割中标注数据不足的问题	血管网络和肺气管网络等复杂医学图像	digital pathology	NA	半监督学习	双向自训练模型	3-D医学图像	两个公共数据集和一个私有数据集
1900	2025-05-04	Neurosymbolic AI for Reasoning Over Knowledge Graphs: A Survey 2025-May, IEEE transactions on neural networks and learning systems IF:10.2Q1 DOI:10.1109/TNNLS.2024.3420218 PMID:39024082	综述	本文综述了神经符号人工智能（AI）在知识图谱（KGs）推理任务中的应用方法，并提出了一种新的分类法	提出了一种新的分类法，将神经符号推理方法分为三大类：逻辑信息嵌入方法、带逻辑约束的嵌入方法和规则学习方法	讨论了这些方法的独特特性和局限性，并提出了未来研究方向	探讨神经符号AI在知识图谱推理任务中的应用和发展	知识图谱（KGs）	自然语言处理	NA	神经符号人工智能	NA	图结构数据	NA