深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
19541	2024-08-27	End-to-end robust joint unsupervised image alignment and clustering 2021-Oct, Proceedings. IEEE International Conference on Computer Vision DOI:10.1109/iccv48922.2021.00383 PMID:35392630	研究论文	提出了一种名为Jim-Net的多任务模型，能够无监督地同时进行图像对齐和聚类	Jim-Net是首个能够同时进行图像对齐和聚类的端到端模型，显著提高了单独执行每个任务的性能	NA	开发一种能够直接学习图像聚类和对齐的多任务模型	图像对齐和聚类	计算机视觉	NA	NA	Jim-Net	图像	在七个数据集上进行了广泛评估
19542	2024-08-27	Convolutional neural networks for high throughput screening of catalyst layer inks for polymer electrolyte fuel cells 2021-Sep-27, RSC advances IF:3.9Q2 DOI:10.1039/d1ra05324h PMID:35495497	研究论文	本文首次应用深度卷积神经网络（ConvNets）于透射电子显微镜图像的高通量筛选催化剂层墨水阶段	首次将深度卷积神经网络应用于催化剂层墨水阶段的透射电子显微镜图像高通量筛选	NA	加速催化剂层设计和制造的进一步进展	聚合物电解质燃料电池的催化剂层墨水	机器学习	NA	深度学习算法	CNN	图像	NA
19543	2024-08-27	Transmol: repurposing a language model for molecular generation 2021-Jul-27, RSC advances IF:3.9Q2 DOI:10.1039/d1ra03086h PMID:35479483	研究论文	本文利用自然语言处理中的transformer架构变体Transmol模型，应用于分子生成任务，并展示了其在生成分子库方面的有效性	首次将注意力机制应用于分子生成问题，并开发了一种新的双种子方法，以探索化学空间的未开发区域	NA	探索和改进机器学习在分子生成领域的应用	分子生成和分子库的构建	机器学习	NA	transformer	transformer	分子数据	NA
19544	2024-08-27	Deep learning quantified mucus-tumor ratio predicting survival of patients with colorectal cancer using whole-slide images 2021-Mar, Precision clinical medicine IF:5.1Q1 DOI:10.1093/pcmedi/pbab002 PMID:35693123	研究论文	本文利用深度学习技术量化结直肠癌患者的粘液-肿瘤比例，并研究其对患者生存率的预测价值	首次使用深度学习技术量化粘液比例，并探讨其在结直肠癌中的预后价值	NA	量化粘液比例并研究其在结直肠癌患者中的预后价值	结直肠癌患者的粘液-肿瘤比例及其预后影响	数字病理	结直肠癌	深度学习	NA	图像	训练集419例，验证集315例
19545	2024-08-26	An XAI-enhanced efficientNetB0 framework for precision brain tumor detection in MRI imaging 2024-Oct, Journal of neuroscience methods IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.jneumeth.2024.110227 PMID:39038716	研究论文	本文提出了一种结合可解释AI技术的EfficientNetB0框架，用于提高MRI图像中脑肿瘤检测的精确度和可解释性	本文创新地将可解释AI技术与EfficientNetB0架构结合，提高了脑肿瘤分类的准确性和决策过程的透明度	NA	提高MRI图像中脑肿瘤诊断的准确性和可解释性	脑肿瘤的分类	计算机视觉	脑肿瘤	CNN	EfficientNetB0	图像	涉及四种脑肿瘤类别（胶质瘤、脑膜瘤、无肿瘤、垂体瘤）
19546	2024-08-26	Neuro-XAI: Explainable deep learning framework based on deeplabV3+ and bayesian optimization for segmentation and classification of brain tumor in MRI scans 2024-Oct, Journal of neuroscience methods IF:2.7Q3 DOI:10.1016/j.jneumeth.2024.110247 PMID:39128599	研究论文	本文提出了一种基于DeeplabV3+和贝叶斯优化的可解释深度学习框架，用于MRI扫描中脑肿瘤的分割和分类	引入贝叶斯优化来调整CNN的超参数，并使用可解释人工智能（XAI）工具提供对CNN评估的实际解释，以及量化预测中的不确定性	实时诊断中基于深度学习的系统的实施仍然罕见，部分原因是这些方法没有量化预测中的不确定性	开发一种能够辅助放射科医生进行脑肿瘤诊断的机器学习系统	脑肿瘤的分割和分类	机器学习	脑肿瘤	贝叶斯优化	CNN, SVM	图像	未明确提及具体样本数量
19547	2024-08-26	New liver window width in detecting hepatocellular carcinoma on dynamic contrast-enhanced computed tomography with deep learning reconstruction 2024-Sep, Radiological physics and technology IF:1.7Q3 DOI:10.1007/s12194-024-00817-7 PMID:38837119	研究论文	本研究探讨了调整窗口宽度（WW）对深度学习重建（DLR）CT图像中肝细胞癌（HCC）检测的影响	发现最优WW为120 HU，相比传统WW（150 HU）显著提高了HCC的检测性能	研究为回顾性，样本量较小，仅包括35名患者	研究调整WW对DLR CT图像中HCC检测的影响	肝细胞癌（HCC）的检测	计算机视觉	肝癌	深度学习重建（DLR）	NA	图像	35名患者
19548	2024-08-26	Enhancing colorectal cancer histology diagnosis using modified deep neural networks optimizer 2024-08-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-69193-x PMID:39174564	研究论文	本文提出了一种改进的Adagrad优化器SAdagrad，用于提高卷积神经网络在结直肠癌病理诊断中的性能	SAdagrad优化器避免了传统Adagrad在调整学习率方面的缺点，结合微调技术和权重衰减技术，提高了模型的准确性和稳定性	NA	提高结直肠癌病理诊断的准确性	结直肠癌病理图像	计算机视觉	结直肠癌	卷积神经网络	CNN	图像	Kather结直肠癌病理数据集
19549	2024-08-26	A veracity dissemination consistency-based few-shot fake news detection framework by synergizing adversarial and contrastive self-supervised learning 2024-Aug-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-70039-9 PMID:39174581	研究论文	本文提出了一种基于半监督对抗学习和自监督对比学习的新型少样本假新闻检测框架DetectYSF，通过协同对比自监督学习和对抗半监督学习，实现有限监督数据下的准确高效假新闻检测	DetectYSF框架结合了自监督对比学习和对抗半监督学习，通过邻近子图特征聚合算法引入新闻真实性传播一致性的外部监督信号，提高了假新闻检测的准确性	NA	开发和增强面向数据稀缺场景的假新闻检测方法	假新闻检测	自然语言处理	NA	Transformer, 生成对抗网络(GAN), 多层感知机(MLP)	BERT, RoBERTa	文本	有限监督数据
19550	2024-08-26	Infection Inspection: using the power of citizen science for image-based prediction of antibiotic resistance in Escherichia coli treated with ciprofloxacin 2024-08-22, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-69341-3 PMID:39174600	研究论文	本研究利用公民科学和图像特征分析来评估大肠杆菌对抗生素环丙沙星的耐药性	通过公民科学项目收集大量图像分类数据，并结合深度学习模型进行分析，以提高诊断方法的鲁棒性	用户图像分类准确率（66.8%）低于深度学习模型（75.3%），且在细胞特征与预期响应不一致时分类错误较多	开发快速诊断工具以应对抗生素耐药性的全球健康挑战	大肠杆菌对抗生素环丙沙星的耐药性	计算机视觉	NA	图像特征分析	深度学习模型	图像	5273名志愿者对来自五种大肠杆菌菌株的1,045,199张单细胞图像进行分类
19551	2024-08-26	Artificial intelligence in COPD CT images: identification, staging, and quantitation 2024-Aug-22, Respiratory research IF:4.7Q1 DOI:10.1186/s12931-024-02913-z PMID:39174978	综述	本文综述了人工智能（AI）在慢性阻塞性肺病（COPD）CT影像中的应用，包括识别、分期和量化	强调了AI在COPD诊断和管理中的创新应用，特别是在机器学习和深度学习方面	讨论了数据复杂性和AI在临床环境中整合的挑战	旨在全面理解AI在COPD诊断和管理中的当前状态和未来潜力	COPD的识别、分期和影像表型	计算机视觉	慢性阻塞性肺病	机器学习, 深度学习	NA	影像	NA
19552	2024-08-26	Super-resolution reconstruction for early cervical cancer magnetic resonance imaging based on deep learning 2024-Aug-22, Biomedical engineering online IF:2.9Q3 DOI:10.1186/s12938-024-01281-5 PMID:39175006	研究论文	本研究旨在开发一种专门针对早期宫颈癌磁共振成像图像质量和高分辨率增强的超分辨率算法	采用创新的SR算法，结合复杂架构和深度卷积核，通过多输入模型训练匹配的输入图像对，显著提高了图像质量和分辨率	NA	开发适用于早期宫颈癌磁共振成像的超分辨率算法，以提高图像质量和分辨率	早期宫颈癌磁共振成像图像	计算机视觉	宫颈癌	深度学习	CNN	图像	两个不同放大因子的独立数据集
19553	2024-08-26	A hybrid deep learning approach to solve optimal power flow problem in hybrid renewable energy systems 2024-Aug-21, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-69483-4 PMID:39169061	研究论文	本文提出了一种结合深度强化学习与量子启发遗传算法的新型混合模型，用于解决混合可再生能源系统中的最优潮流问题	该研究引入深度强化学习与量子启发遗传算法的结合，有效提高了全局搜索能力和适应实时环境的能力	文章未明确提及具体限制	确保电压稳定性，最小化功率损耗和燃料成本	混合可再生能源系统中的最优潮流问题	机器学习	NA	深度强化学习	DRL-QIGA	系统数据	使用修改后的IEEE 30总线系统进行实验评估
19554	2024-08-26	Context-embedded hypergraph attention network and self-attention for session recommendation 2024-Aug-21, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-66349-7 PMID:39169084	研究论文	本文提出了一种名为C-HAN的新型会话推荐模型，该模型包含上下文嵌入的超图注意力网络和自注意力两个并行模块，旨在捕捉项目间的内在一致性和顺序依赖性	C-HAN模型引入了不同类型的交互上下文以增强模型的上下文感知能力，并通过软注意力机制有效整合两种类型的信息	NA	解决会话推荐中用户意图建模的挑战，特别是在短历史序列中有限证据的情况下	会话推荐中的用户意图建模	机器学习	NA	超图注意力网络，自注意力机制	C-HAN	序列数据	三个真实世界数据集
19555	2024-08-26	Phosphorus prediction in the middle reaches of the Yangtze river based on GRA-CEEMDAN-CNLSTM-DBO 2024-Aug-21, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-70262-4 PMID:39169112	研究论文	本研究通过集成先进的建模技术，旨在提高长江中游总磷（TP）浓度的预测准确性	提出了GRA-CEEMDAN-CN1D-LSTM-DBO模型，该模型在预测TP浓度方面显著优于传统的BP、LSTM和GRU模型	随着与大坝距离的增加，预测精度逐渐下降，表明三峡大坝运营对下游TP浓度的影响减弱	提高长江中游总磷浓度的预测准确性，为洪水季节的动态水位控制提供有价值的见解	长江中游的总磷浓度	机器学习	NA	Grey Relational Analysis (GRA)	CN1D-LSTM-DBO	水质量参数数据	使用了三峡水库（TGR）的运营和排放数据，以及下游河段的水质参数
19556	2024-08-26	A comparison between machine and deep learning models on high stationarity data 2024-Aug-21, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-70341-6 PMID:39169110	研究论文	本文比较了机器学习和深度学习模型在高度平稳数据上的性能，特别是预测意大利收费站车辆通过数量的情况	研究发现某些机器学习算法在时间序列特征识别和预测准确性上优于深度学习模型	NA	研究时间序列特征，并比较机器学习和深度学习模型在预测任务上的表现	预测意大利收费站车辆通过数量	机器学习	NA	支持向量机、随机森林、极端梯度提升（XGBoost）、循环神经网络与长短期记忆（RNN-LSTM）	RNN-LSTM	时间序列数据	8766行数据，6列相关收费站信息
19557	2024-08-26	The combination of HSI and NMR techniques with deep learning for identification of geographical origin and GI markers of Lycium barbarum L 2024-Aug-21, Food chemistry IF:8.5Q1 DOI:10.1016/j.foodchem.2024.140903 PMID:39178543	研究论文	本研究提出了一种结合高光谱成像（HSI）、核磁共振（NMR）和改进的ResNet-34深度学习模型，用于准确识别枸杞的地理来源和地理标志（GI）标记	本研究通过SHapley Additive exPlanations（SHAP）基于特征选择提高了模型的准确性和效率，并通过Pearson相关性分析增强了HSI数据的解释性	NA	快速准确地识别枸杞的地理来源	枸杞的地理来源和地理标志标记	机器学习	NA	高光谱成像（HSI）、核磁共振（NMR）	ResNet-34	图像	未明确提及样本数量
19558	2024-08-26	Industry 4.0 Technologies in Maternal Health Care: Bibliometric Analysis and Research Agenda 2024-Aug-08, JMIR pediatrics and parenting IF:2.1Q2 DOI:10.2196/47848 PMID:39116433	文献计量分析	本研究探讨了工业4.0技术在孕产妇保健中的当前实施情况和影响，并进行了主题景观映射，提出了未来研究议程	提出了一个包含四个绩效因素的概念框架，用于流程改进，并建议了治理、采用、基础设施、隐私和安全方面的研究议程	NA	调查工业4.0技术在孕产妇保健中的应用和影响，并提出未来研究方向	工业4.0技术在孕产妇保健中的应用，包括护理流程、治疗方法和自动化妊娠监测	数字健康	孕产妇保健	文献计量分析	NA	文献	从1985年到2022年，共检索到1003篇英文论文，最终保留136篇
19559	2024-08-26	Deep Learning for Histopathological Assessment of Esophageal Adenocarcinoma Precursor Lesions 2024-Aug, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc IF:7.1Q1 DOI:10.1016/j.modpat.2024.100531 PMID:38830407	研究论文	本文开发了一种两阶段的AI系统，利用深度学习技术对Barrett食管相关异型增生进行组织病理学评估	该AI系统在评估Barrett食管相关异型增生的准确性上超过了55名国际胃肠病理学家中的53名	AI系统在实际临床环境中的表现尚未完全明确	提高病理工作流程的效率和准确性	Barrett食管相关异型增生的组织病理学评估	数字病理学	食管腺癌	深度学习	NA	图像	290张全切片图像
19560	2024-08-26	Extent and Topography of Subretinal Drusenoid Deposits Associate With Rod-Mediated Vision in Aging and AMD: ALSTAR2 Baseline 2024-Aug-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1 DOI:10.1167/iovs.65.10.25 PMID:39163034	研究论文	本研究使用监督深度学习量化了与年龄相关性黄斑变性（AMD）相关的亚视网膜硬性沉积物（SDDs）的负担，并探讨了其与视力和感光细胞地形的关系。	采用卷积神经网络对近红外反射图像进行SDD分割，并通过光学相干断层扫描进行手动校对，提高了SDD面积测量的准确性。	NA	研究SDD面积与杆状细胞介导的视力之间的关系，并探讨SDD形成的地形因素。	亚视网膜硬性沉积物（SDDs）及其与视力和感光细胞地形的关系。	数字病理学	年龄相关性黄斑变性	卷积神经网络	CNN	图像	428只眼睛，来自428名60岁以上的参与者