深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4061	2025-03-26	A differentiable Gillespie algorithm for simulating chemical kinetics, parameter estimation, and designing synthetic biological circuits 2025-Jan-21, ArXiv PMID:39398212	research paper	提出了一种可微分的Gillespie算法（DGA），用于模拟化学动力学、参数估计和设计合成生物电路	利用深度学习的最新突破，开发了Gillespie算法的完全可微分变体，通过平滑函数近似不连续操作，允许使用反向传播计算梯度	未明确提及具体限制	开发一种可微分的Gillespie算法，用于快速准确地学习动力学参数和设计具有所需特性的生化网络	化学反应网络和基因启动子的随机模型	合成生物学	NA	可微分Gillespie算法（DGA）	NA	实验测量的mRNA表达水平数据	两种不同的启动子
4062	2025-03-26	Automated CT image prescription of the gallbladder using deep learning: Development, evaluation, and health promotion 2025 Jan-Dec, Acute medicine & surgery IF:1.5Q2 DOI:10.1002/ams2.70049 PMID:40018053	研究论文	开发了一个基于深度学习的全自动系统，用于精确检测胆囊，帮助临床医生快速评估需要胆囊切除术的急性胆囊炎	首次利用CT图像而非超声图像进行急性胆囊炎的AI诊断，减少了由医生捕捉静态图像带来的选择偏差	需要进一步的临床验证	开发一个全自动系统，用于精确检测胆囊并辅助诊断急性胆囊炎	急性胆囊炎患者和对照参与者的CT图像	数字病理学	胆囊炎	深度学习	VGG-16, U-Net	CT图像	250名急性胆囊炎患者和270名对照参与者
4063	2025-03-26	ACP-DPE: A Dual-Channel Deep Learning Model for Anticancer Peptide Prediction 2025 Jan-Dec, IET systems biology IF:1.9Q3 DOI:10.1049/syb2.70010 PMID:40119615	研究论文	本文提出了一种基于双通道深度学习的抗癌肽预测模型ACP-DPE	提出了一种结合Bi-GRU模块和扩张卷积模块的双通道深度学习模型，用于抗癌肽预测，性能优于现有方法	未提及具体的数据集规模和模型在其他类型癌症肽预测上的泛化能力	开发一种高效的抗癌肽预测方法以辅助癌症治疗研究	抗癌肽(ACPs)	机器学习	癌症	深度学习	Bi-GRU, 扩张卷积	肽序列数据	NA
4064	2025-03-26	Gross tumor volume confidence maps prediction for soft tissue sarcomas from multi-modality medical images using a diffusion model 2025-Jan, Physics and imaging in radiation oncology DOI:10.1016/j.phro.2025.100734 PMID:40123775	研究论文	本研究开发了一种基于扩散模型的深度学习技术，用于从多模态医学图像中预测软组织肉瘤的肿瘤体积置信图	首次使用扩散模型预测软组织肉瘤的肿瘤体积置信图，并考虑了读者间的变异性	样本量较小（49例患者），且仅针对软组织肉瘤	开发高精度的自动分割技术以减少放疗计划中手动勾画肿瘤体积的变异性	软组织肉瘤患者的FDG-PET、CT和MRI图像	数字病理	软组织肉瘤	扩散模型	扩散模型	多模态医学图像（FDG-PET、CT、MRI）	49例患者的多模态影像数据
4065	2025-03-26	Artificial intelligence in obstructive sleep apnea: A bibliometric analysis 2025 Jan-Dec, Digital health IF:2.9Q2 DOI:10.1177/20552076251324446 PMID:40123882	研究论文	通过文献计量分析探讨人工智能在阻塞性睡眠呼吸暂停(OSA)中的应用现状、趋势及未来方向	首次使用VOSviewer和Citespace对OSA领域AI应用进行全面的文献计量分析，揭示了研究热点和发展趋势	仅基于Web of Science数据库，可能遗漏其他重要文献来源	探索人工智能在阻塞性睡眠呼吸暂停领域的应用现状和发展趋势	2011-2024年间发表的867篇关于AI在OSA中应用的文献	数字病理学	阻塞性睡眠呼吸暂停	文献计量分析	NA	文献数据	867篇文献
4066	2025-03-26	Artificial intelligence for Brugada syndrome diagnosis and gene variants interpretation 2025, American journal of cardiovascular disease DOI:10.62347/YQHQ1079 PMID:40124093	研究论文	本文综述了人工智能在Brugada综合征诊断和基因变异解释中的应用及其优势	AI能够检测ECG中几乎所有BrS模式，甚至超越专家视觉能力，并在处理复杂数据时发现未分类的基因变异	NA	比较AI与训练有素的心脏病专家在BrS诊断中的能力，并探讨AI在BrS基因变异分类中的应用	Brugada综合征（BrS）及其相关基因变异	机器学习	心血管疾病	深度学习	深度学习模型	ECG数据、基因数据	NA
4067	2025-03-26	Curvature estimation techniques for advancing neurodegenerative disease analysis: a systematic review of machine learning and deep learning approaches 2025, American journal of neurodegenerative disease DOI:10.62347/DZNQ2482 PMID:40124352	系统综述	本文系统评估了用于神经退行性疾病分析的曲率估计技术，包括经典数学方法、机器学习、深度学习和混合方法	突出了从经典方法向机器学习和深度学习的转变，特别是神经网络回归和卷积神经网络在复杂几何处理中的优势	仅分析了2010年至2023年的105篇研究论文，可能未涵盖早期或最新技术	评估曲率估计方法在神经退行性疾病分析中的应用，以支持诊断工具和干预措施的开发	神经退行性疾病中的脑结构变化	机器学习	神经退行性疾病	曲率估计技术	神经网络回归, CNN	神经影像数据	105篇研究论文
4068	2025-03-26	Improved food recognition using a refined ResNet50 architecture with improved fully connected layers 2025, Current research in food science IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.crfs.2025.101005 PMID:40124390	research paper	本研究通过改进的ResNet50架构和全连接层，提高了食物识别的准确性	开发了三种ResNet50变体（标准、微调和优化版本），其中带有定制全连接层的优化版本在食物识别任务中表现最佳	未明确说明模型在其他食物类别或不同环境下的泛化能力	评估食物识别系统在医院和餐厅环境中对人体健康的影响	16类食物（分为早餐、午餐和晚餐）	computer vision	NA	深度学习算法	ResNet50	image	初始12,000张图像，通过数据增强扩展到66,000张
4069	2025-03-26	Investigation of a deep learning-based reconstruction approach utilizing dual-view projection for myocardial perfusion SPECT imaging 2025, American journal of nuclear medicine and molecular imaging IF:2.0Q3 DOI:10.62347/MLFB9278 PMID:40124765	研究论文	提出一种基于深度学习的双视角投影重建方法，用于心肌灌注SPECT成像，以减少采集时间并实现非旋转成像	利用深度学习技术（U-Net）重建双视角投影，减少传统双头SPECT扫描仪的扫描时间和机架旋转需求	2D U-Net在轴向连续性上表现略逊于参考图像，3D U-Net虽有所改进但仍存在局部绝对百分比误差	优化心肌灌注SPECT成像的采集时间和成像质量	心肌灌注SPECT成像	数字病理	心血管疾病	SPECT/CT扫描	U-Net（2D和3D）	图像	116例SPECT/CT扫描（使用Tc-tetrofosmin示踪剂，GE NM/CT 640扫描仪采集）
4070	2025-03-26	Multimodal deep learning with MUF-net for noninvasive WHO/ISUP grading of renal cell carcinoma using CEUS and B-mode ultrasound 2025, Frontiers in physiology IF:3.2Q2 DOI:10.3389/fphys.2025.1558997 PMID:40124951	研究论文	本研究开发并验证了一种多模态深度学习模型MUF-Net，用于利用术前灰度超声和对比增强超声(CEUS)视频数据对肾细胞癌(RCC)进行无创WHO/ISUP核分级	提出了一种新型多模态超声融合网络(MUF-Net)，整合B型和CEUS模态，通过预测权重的加权和来提取和融合图像特征	研究为双中心回顾性研究，样本量相对有限(100例患者)	开发非侵入性肾细胞癌WHO/ISUP核分级方法	肾细胞癌患者	数字病理	肾细胞癌	CEUS和B型超声	MUF-Net(多模态深度学习模型)	超声视频和图像	100例患者的6293张超声图像
4071	2025-03-26	Development and Evaluation of a Deep Learning Algorithm to Differentiate Between Membranes Attached to the Optic Disc on Ultrasonography 2025, Clinical ophthalmology (Auckland, N.Z.) DOI:10.2147/OPTH.S501316 PMID:40125481	研究论文	开发并评估了一种基于深度学习的算法，用于在超声检查中区分附着于视盘的膜	首次使用基于Transformer的Vision Transformer (ViT)模型对眼部超声B扫描图像进行分类，以区分健康、视网膜脱离(RD)和玻璃体后脱离(PVD)	存在少量误分类情况，有7例RD被错误标记为PVD	提高在超声检查中识别和区分附着于视盘的膜的准确性	眼部超声B扫描图像	计算机视觉	眼科疾病	超声检查(USG)	Vision Transformer (ViT)	图像	训练和验证集505个样本，测试集212个样本
4072	2025-03-26	[Paper Review: Deep Learning-based PET Image Denoising and Reconstruction: A Review] 2025, Nihon Hoshasen Gijutsu Gakkai zasshi DOI:10.6009/jjrt.25-0303 PMID:40128957	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
4073	2025-03-26	Deep learning on CT scans to predict checkpoint inhibitor treatment outcomes in advanced melanoma 2024-12-30, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-81188-2 PMID:39738216	research paper	该研究首次探讨了利用深度学习分析CT影像预测晚期黑色素瘤免疫检查点抑制剂治疗结果的价值	首次将深度学习应用于CT影像分析以预测晚期黑色素瘤的免疫检查点抑制剂治疗效果	深度学习模型未能显著超越已知临床预测因子的预测效果	探索CT影像深度学习模型预测晚期黑色素瘤免疫治疗效果的可行性	接受免疫检查点抑制剂治疗的晚期黑色素瘤成年患者	digital pathology	melanoma	CT imaging	DLM (deep learning model)	CT images	730名患者共2722个病灶
4074	2025-03-26	Attention-guided convolutional network for bias-mitigated and interpretable oral lesion classification 2024-12-30, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-81724-0 PMID:39738228	research paper	提出了一种基于注意力引导的卷积网络，用于口腔病变的分类，旨在提高准确性、可解释性并减少数据集偏差	模型整合了分类流、引导流和解剖部位预测流，通过注意力机制提高病变定位准确性，并增强模型对数据集偏差的鲁棒性	研究依赖于单一来源的数据集，可能影响模型的泛化能力	开发一种深度学习模型，用于准确分类口腔病变并提高临床决策支持	口腔病变的16种类型	digital pathology	oral cancer	deep learning	CNN	image	2765张口腔内数字图像，来自1079名患者
4075	2025-03-26	Optimizing VGG16 deep learning model with enhanced hunger games search for logo classification 2024-12-30, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-82022-5 PMID:39738231	research paper	本文提出了一种基于VGG16模型和增强型Hunger Games Search（EHGS）算法的优化深度学习架构EHGS-VGG16，用于logo分类	通过改进的Hunger Games Search算法（EHGS）优化VGG16模型的超参数，提高了分类性能	标准HGS算法存在种群多样性受限和易陷入局部最优的问题	提高logo分类任务的准确率	logo图像	computer vision	NA	deep learning, swarm intelligence algorithm	VGG16, EHGS-VGG16	image	Flickr-27 logo分类数据集
4076	2025-03-26	DeepGOMeta for functional insights into microbial communities using deep learning-based protein function prediction 2024-12-30, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-82956-w PMID:39738309	研究论文	介绍了一种名为DeepGOMeta的深度学习模型，用于预测微生物蛋白质功能	开发了一种基于深度学习的蛋白质功能预测方法，专门针对微生物数据，克服了传统方法在预测新蛋白质和缺乏已知同源物的蛋白质功能时的局限性	模型主要针对微生物数据，可能不适用于其他类型的数据	提高从微生物样本中获取功能见解的能力	微生物蛋白质功能	机器学习	NA	深度学习	深度学习模型	蛋白质序列数据	多样化的微生物数据集
4077	2025-03-26	A lung nodule segmentation model based on the transformer with multiple thresholds and coordinate attention 2024-12-30, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-82877-8 PMID:39738386	研究论文	提出了一种基于transformer和多阈值坐标注意力的肺结节分割模型MCAT-Net，用于肺癌早期检测	构建了多阈值特征分离模块以提取不同层次的边缘和纹理特征，引入坐标注意力机制增强空间信息利用，并采用transformer捕获长程依赖关系	未提及模型在临床环境中的实际应用效果验证	提高肺结节分割的准确性以辅助肺癌早期诊断	肺部CT图像中的结节区域	计算机视觉	肺癌	深度学习	transformer	医学影像	LIDC-IDRI和LNDb数据集
4078	2025-03-26	IoT based intelligent pest management system for precision agriculture 2024-12-30, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-83012-3 PMID:39738391	research paper	本文提出了一种基于物联网的智能害虫管理系统，用于精准农业中的害虫检测和分类	开发了一种智能昆虫陷阱原型，结合嵌入式计算和CNN分类器，用于实时害虫检测和分类	数据集仅包含东方果蝇的图像，可能限制了模型对其他害虫类型的识别能力	通过技术驱动的精准农业方法提高作物保护和生产力	东方果蝇及其在番石榴果园中的检测	精准农业	NA	CNN, 机器学习, 深度学习	CNN	图像	1000+张东方果蝇图像，分为果蝇和非果蝇两类
4079	2025-03-26	A deep learning-based ADRPPA algorithm for the prediction of diabetic retinopathy progression 2024-12-30, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-82884-9 PMID:39738461	research paper	开发并验证了一种基于深度学习的糖尿病视网膜病变进展预测算法ADRPPA，用于预测非参考性糖尿病视网膜病变（NRDR）向参考性糖尿病视网膜病变（RDR）的进展	利用纵向视网膜成像数据和微动脉瘤量化，结合ResNeXt和Mask-RCNN模型，预测糖尿病视网膜病变的进展，为临床提供新的预测工具	研究为回顾性研究，可能受到数据质量和样本选择的限制，且模型在独立数据集上的泛化能力有待进一步验证	开发一种能够预测糖尿病视网膜病变进展的人工智能算法，以辅助临床决策	糖尿病视网膜病变患者的视网膜眼底图像	digital pathology	diabetic retinopathy	deep learning	ResNeXt, Mask-RCNN	image	6384只眼睛的12,768张图像（EyePACS数据集）和148张标注有微动脉瘤的图像（e-ophtha数据集）
4080	2025-03-26	Predicting patients' sentiments about medications using artificial intelligence techniques 2024-12-30, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-024-83222-9 PMID:39738528	研究论文	本研究利用人工智能技术预测患者对药物的情感倾向	首次采用技术解释结果以提高可解释性和可理解性，并开发了深度集成模型（DL_ENS）	未提及具体的数据集来源和样本的多样性限制	开发AI模型以预测患者对药物的情感倾向，辅助临床医生开药	药物相关文本数据	自然语言处理	NA	Word2Vec算法、预训练词嵌入	ML和DL模型（包括CNN、LSTM等）及集成学习模型	文本	大型药物评论数据集（未提及具体数量）