深度学习在生物医药领域中的应用

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
4361	2025-05-07	Efficacy of a deep learning system for automatic analysis of the comprehensive spatial relationship between the mandibular third molar and inferior alveolar canal on panoramic radiographs 2025-May, Oral surgery, oral medicine, oral pathology and oral radiology DOI:10.1016/j.oooo.2024.12.020 PMID:39915134	research paper	开发并评估一种深度学习系统，用于预测下颌第三磨牙与下牙槽神经管在全景X光片上的接触和相对位置关系，以用于术前评估	首次使用深度学习系统自动分析下颌第三磨牙与下牙槽神经管的全景X光片空间关系，并展示优于经验丰富的牙医的诊断效果	样本量相对较小（279例全景X光片），且年龄范围有限（18-32岁）	开发一种深度学习系统，用于术前评估下颌第三磨牙手术中与下牙槽神经管的空间关系	下颌第三磨牙（M3）与下牙槽神经管（IAC）的空间关系	digital pathology	dental disease	deep learning, panoramic radiographs, cone beam computed tomography (CBCT)	ResNet50	image	279张全景X光片，包含441颗下颌第三磨牙
4362	2025-05-07	Automatic future remnant segmentation in liver resection planning 2025-May, International journal of computer assisted radiology and surgery IF:2.3Q2 DOI:10.1007/s11548-025-03331-2 PMID:39961898	研究论文	本研究提出了一种用于自动肝脏切除规划的新方法，通过CT扫描中的肝脏、血管和肿瘤分割来预测未来肝脏残余量（FLR）	结合深度卷积和Transformer网络，利用解剖和病理分割掩码提高FLR分割的准确性	需要进一步研究以无缝集成到临床工作流程中	提高术前规划的准确性和患者预后	肝脏、血管和肿瘤的CT扫描图像	数字病理	肝脏疾病	CT扫描	深度卷积网络和Transformer	图像	NA
4363	2025-05-07	Exploring the modulation of phosphorylation and SUMOylation-dependent NPR1 conformational switching on immune regulators TGA3 and WRKY70 through molecular simulation 2025-May, Plant physiology and biochemistry : PPB IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.plaphy.2025.109711 PMID:40056739	研究论文	通过分子模拟探索磷酸化和SUMO化依赖的NPR1构象转换对免疫调节因子TGA3和WRKY70的调控机制	利用深度学习分子建模、对接和多纳秒模拟揭示了不同磷酸化状态对NPR1动态稳定性及TGA3-WRKY70结合的影响	研究仅基于计算模拟，缺乏实验验证	阐明NPR1的翻译后修饰在植物免疫中的调控机制	NPR1蛋白及其互作因子TGA3和WRKY70	计算生物学	植物免疫	深度学习分子建模、分子对接、分子动力学模拟	分子动力学模型	分子结构数据	NA
4364	2025-05-07	Development of DeepPQK and DeepQK sequence-based deep learning models to predict protein-ligand affinity and application in the directed evolution of ferulic esterase DLfae4 2025-May, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.141790 PMID:40054795	研究论文	开发了基于序列的深度学习模型DeepPQK和DeepQK，用于预测蛋白质-配体结合亲和力，并应用于阿魏酸酯酶DLfae4的定向进化	提出了不依赖高分辨率蛋白质晶体结构数据的预测方法，利用CNN整合局部和全局上下文特征预测亲和力	NA	预测蛋白质-配体结合亲和力并指导酶的定向进化	蛋白质序列、配体和阿魏酸酯酶DLfae4的变体	机器学习	NA	深度学习	CNN	蛋白质序列、配体	2016年核心数据集
4365	2025-05-07	In Situ Repair and Reconstruction of Copper Surface Enhanced Its Anti-Oxidation Properties and Stability for Deep Learning-Powered Anti-Counterfeiting Labels 2025-May, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.) DOI:10.1002/adma.202500920 PMID:40103452	研究论文	本文介绍了一种通过溶剂热处理原位修复氧化铜表面并构建有序(111)晶面抗氧化层的方法，显著提高了铜材料的抗氧化性能和稳定性	提出了一种简单溶剂热处理方法，可同时实现氧化铜表面的原位修复和(111)晶面抗氧化层的构建，使腐蚀速率降低五倍	NA	提高铜材料的抗氧化性能和稳定性，促进金属材料的可持续利用	铜箔、纳米线和纳米立方体等铜材料	材料科学	NA	溶剂热处理	NA	NA	NA
4366	2025-05-07	Toward Accurate Deep Learning-Based Prediction of Ki67, ER, PR, and HER2 Status From H&E-Stained Breast Cancer Images 2025-May-01, Applied immunohistochemistry & molecular morphology : AIMM IF:1.3Q3 DOI:10.1097/PAI.0000000000001258 PMID:40143808	研究论文	本文提出了一种基于深度学习的准确预测乳腺癌H&E染色图像中Ki67、ER、PR和HER2状态的方法	构建了一个包含185,538张乳腺癌H&E和IHC图像的大规模数据集，并采用ViT模型实现了90%的AUC-ROC预测性能	尽管ViT模型预测性能高，但其注意力热图与高诊断价值区域匹配不明显，未来需改进AI在整张切片图像中的注意力机制	提高从H&E染色图像预测乳腺癌分子标记物（Ki67、ER、PR、HER2）状态的准确性	乳腺癌H&E染色图像和对应的IHC图像	数字病理学	乳腺癌	免疫组织化学（IHC）	ViT（Vision Transformer）	图像	185,538张乳腺癌H&E和IHC图像
4367	2025-05-07	RaGeoSense for smart home gesture recognition using sparse millimeter wave radar point clouds 2025-May-01, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-00065-8 PMID:40312411	研究论文	本文提出了一种基于稀疏毫米波点云的智能家居手势识别系统RaGeoSense，结合多种先进的信号处理和深度学习方法，提高了识别性能和系统鲁棒性	结合K-均值聚类直通滤波、帧差滤波和中值滤波三种方法减少毫米波数据噪声，提出集成GBDT和XGBoost的模型架构，并利用LSTM门控循环单元对手势序列进行分类	未提及系统在复杂环境或多手势同时识别场景下的表现	提升智能家居场景下的手势识别准确率和系统鲁棒性	八种不同的单臂手势	计算机视觉	NA	毫米波雷达点云处理、深度学习	GBDT、XGBoost、LSTM	点云数据	未明确提及具体样本数量
4368	2025-05-07	A momentum-based adversarial training approach for generalization in underwater acoustic target recognition: An individual-vessel perspective 2025-May-01, The Journal of the Acoustical Society of America IF:2.1Q1 DOI:10.1121/10.0036456 PMID:40326792	研究论文	提出一种基于动量的对抗训练方法（MBAT），用于提高水下声学目标识别中的泛化能力	利用动量对抗策略和同方差不确定性算法，平衡类别相关和船舶特定特征的优化目标，从而更有效地提取类别区分性特征	实验仅在DeepShip和ShipsEar数据集上进行，未在其他数据集验证其泛化能力	提高水下被动声学目标识别的泛化能力	船舶辐射噪声	机器学习	NA	动量对抗训练（MBAT）	深度学习模型	声学信号	DeepShip和ShipsEar数据集
4369	2025-05-07	A digital photography dataset for Vaccinia Virus plaque quantification using Deep Learning 2025-Apr-30, Scientific data IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41597-025-05030-8 PMID:40307255	research paper	该研究提出了一个用于痘苗病毒斑块量化的数字摄影数据集，并展示了如何使用深度学习技术进行分析	提出了一个新型的痘苗病毒斑块量化数字摄影数据集，并开发了改进的HydraStarDist架构，实现了一步式分析	研究可能局限于痘苗病毒，未涉及其他病毒类型的验证	开发一种自动化的病毒斑块量化方法，以提高病毒研究的效率和准确性	痘苗病毒的斑块表型	digital pathology	NA	deep learning	StarDist, HydraStarDist	image	NA
4370	2025-05-07	Prediction of pink esthetic score using deep learning: A proof of concept 2025-Apr, Journal of dentistry IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.jdent.2025.105601 PMID:39892738	研究论文	本研究开发了一种深度学习模型，用于预测单颗种植体美学区的美学评分	首次将深度学习技术应用于预测单颗种植体美学区的粉红美学评分（PES）	样本量有限（226例），需要进一步收集更多样本和临床特征以提高模型性能	开发一个能够预测单颗种植体美学区美学效果的深度学习模型	单颗种植体美学区的美学效果评估	计算机视觉	NA	深度学习	DL	图像和临床数据	226个样本，每个样本包含3张口腔内照片和12个临床特征
4371	2025-05-07	Detecting living microalgae in ship ballast water based on stained microscopic images and deep learning 2025-Apr, Marine pollution bulletin IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.marpolbul.2025.117608 PMID:39893717	研究论文	本研究利用染色显微图像和深度学习技术，快速检测船舶压载水中的活微藻细胞	结合中性红染料的活细胞选择性染色与深度学习模型，实现了微藻活性的高精度检测	活微藻细胞的检测精度略低于不考虑活性的总体检测精度	开发船舶压载水中活微藻细胞的快速检测方法	青岛扁藻和链状亚历山大藻两种微藻	计算机视觉	NA	中性红染色显微成像	深度学习模型	显微图像	两种微藻样本（青岛扁藻和链状亚历山大藻）
4372	2025-05-07	Improving the thermostability of ulvan lyase from polysaccharide lyase family 25 based on multiple computational rational design strategies 2025-Apr, International journal of biological macromolecules IF:7.7Q1 DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.140468 PMID:39894113	研究论文	本研究提出了一种结合深度学习和多种能量函数方法的计算机辅助理性设计策略，用于提高ulvan裂解酶的热稳定性	结合深度学习和多种能量函数方法进行计算机辅助理性设计，显著提高了ulvan裂解酶的热稳定性，并发现了突变体的协同效应	未提及实验规模或实际工业应用验证	提高ulvan裂解酶的热稳定性以促进其工业应用	ulvan裂解酶	生物信息学	NA	ColabFold结构预测，FoldX、Rosetta和Schrödinger突变体筛选，分子动力学模拟	深度学习	蛋白质结构数据	三个单点突变体（A117V、K145L、A237V）和组合突变体（A117V/A237V、K145L/A237V）
4373	2025-05-07	Deep-ER: Deep Learning ECCENTRIC Reconstruction for fast high-resolution neurometabolic imaging 2025-Apr-01, NeuroImage IF:4.7Q1 DOI:10.1016/j.neuroimage.2025.121045 PMID:39894238	研究论文	提出一种名为Deep-ER的深度学习重建方法，用于快速高分辨率神经代谢成像	开发了一种嵌入物理模型的深度学习重建方法，实现了600倍于传统方法的重建速度，并提高了空间-光谱质量和代谢物定量	训练数据量相对较小（21例训练，6例测试），且仅在7T MRI扫描仪上验证	提高磁共振波谱成像（MRSI）的重建速度和图像质量，以促进神经科学和精准医学的应用	高分辨率幻影和27名人类参与者（22名健康志愿者和5名胶质瘤患者）	医学影像分析	脑癌（胶质瘤）	磁共振波谱成像（MRSI），ECCENTRIC脉冲序列	深度学习神经网络（使用循环交错卷积层和联合双空间特征表示）	MRI影像数据	27名参与者（22名健康志愿者和5名胶质瘤患者）
4374	2025-05-07	Multiscale deep learning radiomics for predicting recurrence-free survival in pancreatic cancer: A multicenter study 2025-Apr, Radiotherapy and oncology : journal of the European Society for Therapeutic Radiology and Oncology IF:4.9Q1 DOI:10.1016/j.radonc.2025.110770 PMID:39894259	研究论文	本研究开发并验证了一种多尺度深度学习放射组学列线图，用于预测胰腺导管腺癌患者的无复发生存期	结合手工放射组学和深度学习特征，构建多尺度列线图，显著优于AJCC分期系统	研究样本来自四家医院，可能存在选择偏倚；外部验证集的样本量相对较小	预测胰腺导管腺癌患者的无复发生存期，以改善术前临床决策	469名胰腺导管腺癌患者	数字病理学	胰腺癌	放射组学分析，深度学习	多尺度深度学习模型	医学影像	469名患者（来自四家医院）
4375	2025-05-07	Age and gender-related changes in choroidal thickness: Insights from deep learning analysis of swept-source OCT images 2025-Apr, Photodiagnosis and photodynamic therapy IF:3.1Q2 DOI:10.1016/j.pdpdt.2025.104511 PMID:39900214	research paper	通过深度学习分析扫频源OCT图像，研究年龄和性别对脉络膜厚度及其组成部分的影响	利用深度学习算法自动测量脉络膜厚度，揭示了年龄和性别对脉络膜厚度变化的特异性影响	研究排除了有眼部病理和系统性疾病的参与者，可能限制了结果的普遍性	探究年龄和性别对脉络膜厚度变化的影响	262名参与者（136名女性和126名男性）的扫频源OCT图像	digital pathology	age-related macular degeneration, high myopia, diabetes mellitus	swept-source optical coherence tomography (SS-OCT)	deep learning algorithms	image	262 participants (136 females and 126 males)
4376	2025-05-07	Revisiting therapeutic options against resistant klebsiella pneumoniae infection: Phage therapy is key 2025-Apr, Microbiological research IF:6.1Q1 DOI:10.1016/j.micres.2025.128083 PMID:39904002	综述	本文回顾了针对耐药肺炎克雷伯菌感染的治疗选择，重点探讨了噬菌体疗法的关键作用	强调了噬菌体疗法在应对耐药肺炎克雷伯菌感染中的潜力，并探讨了基因工程和人工智能在优化该疗法中的应用	指出了噬菌体疗法在临床广泛应用中的关键限制	探讨新型治疗策略以应对耐药肺炎克雷伯菌感染的全球威胁	耐药肺炎克雷伯菌及其感染	传染病学	肺炎克雷伯菌感染	噬菌体疗法、基因工程、人工智能和深度学习	NA	NA	NA
4377	2025-05-07	The prediction of RNA-small-molecule ligand binding affinity based on geometric deep learning 2025-Apr, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2025.108367 PMID:39904171	研究论文	提出了一种基于几何深度学习的RNA-小分子配体结合亲和力预测方法RLASIF	首次利用分子表面的几何和化学特征创建RNA-配体相互作用指纹来表征结合亲和力	未明确提及样本量以外的具体限制	预测RNA-小分子配体的结合亲和力	RNA和小分子配体	机器学习	NA	几何深度学习	RLASIF	分子表面几何和化学特征	来自PDBbind NL2020的十个不同测试集
4378	2025-05-07	Online and Cross-User Finger Movement Pattern Recognition by Decoding Neural Drive Information from Surface Electromyogram 2025-Apr, International journal of neural systems IF:6.6Q1 DOI:10.1142/S0129065725500145 PMID:39907499	研究论文	提出了一种结合神经解码方法和无监督域适应学习的肌电识别新方法，用于识别手指运动模式	采用微观特征提取神经驱动信息并结合无监督域适应学习，提高了跨用户场景下的识别准确率	研究样本量较小（15名受试者），且仅针对手指伸肌	解决肌电控制系统在跨用户场景下的性能下降问题	手指运动模式	神经接口与控制	NA	表面肌电图（SEMG）分解	深度学习模型	SEMG信号	15名受试者的手指伸肌SEMG信号
4379	2025-05-07	Adjacent point aided vertebral landmark detection and Cobb angle measurement for automated AIS diagnosis 2025-Apr, Computerized medical imaging and graphics : the official journal of the Computerized Medical Imaging Society IF:5.4Q1 DOI:10.1016/j.compmedimag.2025.102496 PMID:39908630	研究论文	提出了一种新的脊柱关键点检测框架，用于自动化青少年特发性脊柱侧弯（AIS）的诊断	设计了LAD-Net深度学习架构，结合脊柱刚性结构信息，通过ACIC和CFOF模块有效校正错误检测的标志点	未提及具体样本量及跨中心验证结果	提高基于脊柱X光图像的参数测量和诊断准确性	青少年特发性脊柱侧弯（AIS）患者的脊柱X光图像	计算机视觉	青少年特发性脊柱侧弯	深度学习	LAD-Net（基于CNN的变体）	X光图像	NA
4380	2025-05-07	Fast In Vivo Two-Photon Fluorescence Imaging via Lateral and Axial Resolution Restoration With Self-Supervised Learning 2025-Apr, Journal of biophotonics IF:2.0Q3 DOI:10.1002/jbio.202400489 PMID:39909559	research paper	提出了一种基于自监督学习的横向和轴向分辨率恢复（LARR）深度学习框架，用于解决双光子荧光（TPF）成像中分辨率与速度之间的矛盾	开发了LARR框架，通过自监督训练方案计算恢复稀疏采样的TPF图像，实现4倍轴向和16倍横向分辨率增强，显著提升成像速度和分辨率	未提及具体临床应用验证或大规模样本测试结果	解决双光子荧光成像中高分辨率与高速度之间的矛盾	双光子荧光（TPF）成像系统	生物医学成像	NA	双光子荧光成像（TPF）	自监督学习框架（LARR）	图像	未明确说明具体样本数量